FuNGI

Q6U7S2

Protein Details

Accession

Q6U7S2

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
33-57	YIYIHKMRYLKNKIKFKKLNISNLE	Hydrophilic
300-326	KWDYHFTLKKRVKKRLRKIYITNKIGL	Hydrophilic
373-393	MINKIKFRRITRKLIKNSVVK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
308-317	KKRVKKRLRK
381-388	RITRKLIK
395-402	IKKFDNKK

Subcellular Location(s)

mito 13, nucl 11.5, cyto_nucl 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007980 Ribosomal_VAR1
Gene Ontology	GO:0005739 C:mitochondrion GO:0005840 C:ribosome GO:0003735 F:structural constituent of ribosome GO:0006412 P:translation
Pfam	View protein in Pfam PF05316 VAR1

Amino Acid Sequences

MMKSVVKFLFITIAKQSVVTVATDTYKIIILLYIYIHKMRYLKNKIKFKKLNISNLENTNKKDIYLEITSQQSADQSMILLRNKDIEGVLTENKIKIEETIKSITKSSSPSGVKSIEDSSITFLNSNRFSDAELRSKEGVAAAASFGKEVSSLQDKGIFTKKFDCELDTISLNSNPVDLLYFNNNINQPVINQYLKSMSSYNMITNGTIMYFSNIIGYNFYNNNLRPEAQNIYKLLYSSFRSMNCLISKPIFVIKSNKIIIQLFYYLLGPKQFKGKKYNFIKWSSSLNNALKNYVWFNKKWDYHFTLKKRVKKRLRKIYITNKIGLSKSYPLKLKKLSEVLNNFFKKPVELELIRLHYPYNDSNILARLLAFMINKIKFRRITRKLIKNSVVKTIKKFDNKKIKASSASSLHPEGKKGSVPTALQRKGSNILPAFLTGLTIKVAGRLLTYKAVPRRTVKMIDKGSSSIGKINYTDLSRYTNKNKRGAFTILVKSSQNFF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.24
3	0.23
4	0.17
5	0.17
6	0.15
7	0.13
8	0.12
9	0.14
10	0.14
11	0.14
12	0.13
13	0.13
14	0.12
15	0.11
16	0.1
17	0.08
18	0.09
19	0.11
20	0.13
21	0.14
22	0.16
23	0.17
24	0.19
25	0.24
26	0.3
27	0.39
28	0.47
29	0.54
30	0.62
31	0.72
32	0.77
33	0.84
34	0.85
35	0.83
36	0.83
37	0.82
38	0.83
39	0.79
40	0.79
41	0.74
42	0.74
43	0.73
44	0.66
45	0.61
46	0.58
47	0.5
48	0.43
49	0.38
50	0.31
51	0.3
52	0.29
53	0.29
54	0.25
55	0.28
56	0.28
57	0.26
58	0.25
59	0.19
60	0.16
61	0.14
62	0.1
63	0.08
64	0.1
65	0.15
66	0.18
67	0.18
68	0.18
69	0.21
70	0.21
71	0.21
72	0.19
73	0.15
74	0.14
75	0.17
76	0.19
77	0.18
78	0.19
79	0.19
80	0.2
81	0.19
82	0.17
83	0.16
84	0.18
85	0.18
86	0.22
87	0.27
88	0.29
89	0.3
90	0.31
91	0.29
92	0.28
93	0.29
94	0.26
95	0.29
96	0.28
97	0.29
98	0.32
99	0.32
100	0.29
101	0.28
102	0.28
103	0.21
104	0.2
105	0.19
106	0.17
107	0.16
108	0.16
109	0.15
110	0.14
111	0.18
112	0.2
113	0.2
114	0.19
115	0.18
116	0.19
117	0.24
118	0.27
119	0.29
120	0.29
121	0.32
122	0.31
123	0.31
124	0.3
125	0.24
126	0.2
127	0.12
128	0.11
129	0.08
130	0.09
131	0.08
132	0.08
133	0.07
134	0.06
135	0.06
136	0.06
137	0.09
138	0.13
139	0.13
140	0.14
141	0.19
142	0.2
143	0.23
144	0.31
145	0.28
146	0.25
147	0.32
148	0.33
149	0.32
150	0.33
151	0.31
152	0.25
153	0.27
154	0.27
155	0.21
156	0.2
157	0.17
158	0.17
159	0.15
160	0.13
161	0.11
162	0.08
163	0.07
164	0.07
165	0.06
166	0.07
167	0.1
168	0.12
169	0.12
170	0.16
171	0.16
172	0.16
173	0.17
174	0.15
175	0.12
176	0.14
177	0.18
178	0.15
179	0.14
180	0.14
181	0.16
182	0.16
183	0.17
184	0.14
185	0.11
186	0.13
187	0.14
188	0.13
189	0.14
190	0.14
191	0.12
192	0.11
193	0.11
194	0.08
195	0.08
196	0.07
197	0.06
198	0.06
199	0.06
200	0.07
201	0.08
202	0.08
203	0.08
204	0.09
205	0.1
206	0.11
207	0.12
208	0.14
209	0.14
210	0.17
211	0.17
212	0.17
213	0.15
214	0.18
215	0.21
216	0.19
217	0.21
218	0.19
219	0.19
220	0.19
221	0.18
222	0.16
223	0.15
224	0.15
225	0.15
226	0.17
227	0.15
228	0.19
229	0.19
230	0.22
231	0.21
232	0.2
233	0.19
234	0.17
235	0.17
236	0.14
237	0.17
238	0.14
239	0.14
240	0.19
241	0.2
242	0.25
243	0.25
244	0.25
245	0.24
246	0.24
247	0.23
248	0.19
249	0.17
250	0.11
251	0.11
252	0.11
253	0.09
254	0.09
255	0.12
256	0.11
257	0.1
258	0.19
259	0.22
260	0.26
261	0.35
262	0.39
263	0.46
264	0.53
265	0.61
266	0.58
267	0.6
268	0.59
269	0.52
270	0.53
271	0.46
272	0.41
273	0.4
274	0.36
275	0.36
276	0.33
277	0.32
278	0.26
279	0.25
280	0.25
281	0.24
282	0.24
283	0.2
284	0.25
285	0.32
286	0.35
287	0.37
288	0.4
289	0.4
290	0.46
291	0.54
292	0.55
293	0.58
294	0.61
295	0.67
296	0.69
297	0.74
298	0.76
299	0.78
300	0.84
301	0.84
302	0.87
303	0.86
304	0.87
305	0.88
306	0.87
307	0.8
308	0.72
309	0.63
310	0.57
311	0.49
312	0.4
313	0.32
314	0.28
315	0.27
316	0.29
317	0.33
318	0.33
319	0.38
320	0.44
321	0.44
322	0.43
323	0.46
324	0.45
325	0.47
326	0.5
327	0.49
328	0.52
329	0.51
330	0.46
331	0.41
332	0.38
333	0.3
334	0.25
335	0.24
336	0.22
337	0.2
338	0.24
339	0.27
340	0.31
341	0.3
342	0.29
343	0.26
344	0.2
345	0.23
346	0.2
347	0.2
348	0.17
349	0.17
350	0.19
351	0.2
352	0.19
353	0.16
354	0.14
355	0.1
356	0.09
357	0.11
358	0.09
359	0.1
360	0.16
361	0.18
362	0.23
363	0.24
364	0.3
365	0.34
366	0.42
367	0.51
368	0.52
369	0.61
370	0.68
371	0.76
372	0.78
373	0.81
374	0.81
375	0.78
376	0.73
377	0.72
378	0.7
379	0.63
380	0.6
381	0.6
382	0.6
383	0.62
384	0.66
385	0.66
386	0.7
387	0.7
388	0.74
389	0.72
390	0.69
391	0.65
392	0.62
393	0.59
394	0.52
395	0.5
396	0.46
397	0.42
398	0.43
399	0.39
400	0.37
401	0.33
402	0.31
403	0.32
404	0.29
405	0.29
406	0.28
407	0.28
408	0.35
409	0.43
410	0.44
411	0.43
412	0.43
413	0.43
414	0.42
415	0.42
416	0.42
417	0.33
418	0.3
419	0.28
420	0.27
421	0.25
422	0.2
423	0.19
424	0.11
425	0.11
426	0.1
427	0.1
428	0.09
429	0.1
430	0.11
431	0.1
432	0.12
433	0.13
434	0.15
435	0.18
436	0.21
437	0.26
438	0.32
439	0.38
440	0.43
441	0.46
442	0.5
443	0.52
444	0.59
445	0.59
446	0.62
447	0.62
448	0.6
449	0.58
450	0.53
451	0.51
452	0.45
453	0.39
454	0.35
455	0.3
456	0.28
457	0.26
458	0.28
459	0.28
460	0.27
461	0.28
462	0.24
463	0.29
464	0.32
465	0.39
466	0.46
467	0.51
468	0.57
469	0.63
470	0.66
471	0.64
472	0.64
473	0.62
474	0.58
475	0.57
476	0.58
477	0.53
478	0.51
479	0.48

Q6U7S2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer