Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A2V1DZZ9

Protein Details
Accession A0A2V1DZZ9    Localization Confidence Low Confidence Score 6.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
70-93PTPPTTPPSSKKHRHRHRTAATTTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 15, cyto 6, nucl 3, plas 1, extr 1, pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR005576  Rpb7-like_N  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
PF03876  SHS2_Rpb7-N  
Amino Acid Sequences MAPIQPSPSRGSLFHRERISQYVSLPAASLTSALPSISANVFSPLLLTYHPPVRGVVLAYTDVSLSSHAPTPPTTPPSSKKHRHRHRTAATTTTPQAAEEEEQHQQQNGTTVLLTQIDEYTSPFLWATATLLVWRPLANARITASITHQSSTHMTLSYLNLFAVTVLRKDMPDDWRWHEEGVGKKRKGWDGRIEDLGGWWVDGEGRRVGGGGGGEVKVREEVEVRILEWDARPAGGGAKGRGFLKIEGSFLGEGERVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.5
3 0.5
4 0.5
5 0.54
6 0.52
7 0.43
8 0.38
9 0.37
10 0.33
11 0.3
12 0.27
13 0.21
14 0.16
15 0.14
16 0.13
17 0.07
18 0.07
19 0.07
20 0.07
21 0.07
22 0.07
23 0.09
24 0.09
25 0.1
26 0.09
27 0.11
28 0.12
29 0.11
30 0.11
31 0.1
32 0.1
33 0.09
34 0.11
35 0.12
36 0.17
37 0.18
38 0.18
39 0.18
40 0.19
41 0.19
42 0.18
43 0.15
44 0.12
45 0.12
46 0.12
47 0.12
48 0.1
49 0.09
50 0.08
51 0.08
52 0.07
53 0.08
54 0.11
55 0.11
56 0.12
57 0.13
58 0.17
59 0.21
60 0.24
61 0.26
62 0.28
63 0.34
64 0.41
65 0.5
66 0.57
67 0.63
68 0.69
69 0.77
70 0.83
71 0.86
72 0.88
73 0.88
74 0.87
75 0.8
76 0.75
77 0.67
78 0.6
79 0.52
80 0.43
81 0.34
82 0.25
83 0.21
84 0.16
85 0.14
86 0.12
87 0.14
88 0.13
89 0.15
90 0.15
91 0.15
92 0.14
93 0.13
94 0.13
95 0.11
96 0.09
97 0.08
98 0.08
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.06
103 0.06
104 0.05
105 0.06
106 0.06
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.06
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.08
124 0.11
125 0.1
126 0.11
127 0.11
128 0.12
129 0.13
130 0.12
131 0.13
132 0.15
133 0.15
134 0.15
135 0.14
136 0.14
137 0.15
138 0.17
139 0.16
140 0.12
141 0.11
142 0.12
143 0.14
144 0.13
145 0.12
146 0.1
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.07
152 0.06
153 0.07
154 0.08
155 0.08
156 0.1
157 0.14
158 0.17
159 0.22
160 0.26
161 0.3
162 0.34
163 0.35
164 0.33
165 0.31
166 0.32
167 0.36
168 0.41
169 0.46
170 0.42
171 0.44
172 0.49
173 0.55
174 0.56
175 0.53
176 0.53
177 0.51
178 0.55
179 0.55
180 0.5
181 0.42
182 0.36
183 0.32
184 0.21
185 0.14
186 0.09
187 0.06
188 0.08
189 0.09
190 0.11
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.09
198 0.07
199 0.08
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.1
204 0.1
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.11
209 0.15
210 0.16
211 0.15
212 0.16
213 0.16
214 0.17
215 0.16
216 0.18
217 0.14
218 0.13
219 0.13
220 0.12
221 0.14
222 0.16
223 0.19
224 0.18
225 0.2
226 0.23
227 0.23
228 0.26
229 0.26
230 0.23
231 0.27
232 0.26
233 0.24
234 0.22
235 0.25
236 0.22
237 0.2
238 0.2