FuNGI

Q2UB16

Protein Details

Accession

Q2UB16

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
403-434	PDVVLVKKHYTRKKNKSRNWRVKRMAREHEEE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
413-426	TRKKNKSRNWRVKR

Subcellular Location(s)

cysk 10, cyto 8.5, cyto_nucl 8.5, nucl 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039768 Nmd3 IPR007064 Nmd3_N
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0005634 C:nucleus GO:0070180 F:large ribosomal subunit rRNA binding GO:0043023 F:ribosomal large subunit binding GO:0015031 P:protein transport GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus
KEGG	aor:AO090102000150 -
Pfam	View protein in Pfam PF04981 NMD3

Amino Acid Sequences

MSMDLDAPVPIAAQDHIAATILCCNCGAPIDGTTAAGALCQDCVRSTVDISEGIQREAVVHTCRDCERWLLPPNSWVSAALESKELLALCLRKLRGLTKVRIIDASFIWTEPHSRRIKVKITIQQEVAAGTILQQAFVVEYVVHYQQCSDCLRSFSPHTWVASVQVRQKVPHKRTFLYLEQLILRHRAHQETNNIKEAKDGLDFYFSQRSHAEKMVEFLSSVVPVKVKKASELISMDIHTSTKSYKFSYSVEIVPICKDDLVAIPIKLARSIGNISPLTLCYRIGTTIQLLDPNTLQTAEVPGATYWRSPFKNLADVTELVEFIVMDIEPVGRSNGRFHLAEATVARASDLGSNDQTYFTRTHLGGILHVGDSVLGYHLTGSMFNDPNYDAIEASSQYSSTIPDVVLVKKHYTRKKNKSRNWRVKRMAREHEEEALQASTGGSRKQEQERERLEADFEMFLRDVEEDQELRGTIELYKARKNQNAGGMEMDEDSDDEDVPKINMDELLDDFDELNMNDDE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.09
2	0.09
3	0.09
4	0.1
5	0.09
6	0.09
7	0.16
8	0.15
9	0.14
10	0.14
11	0.14
12	0.14
13	0.15
14	0.17
15	0.11
16	0.13
17	0.16
18	0.16
19	0.16
20	0.16
21	0.14
22	0.12
23	0.1
24	0.09
25	0.06
26	0.07
27	0.07
28	0.08
29	0.08
30	0.11
31	0.13
32	0.14
33	0.14
34	0.14
35	0.16
36	0.16
37	0.17
38	0.23
39	0.22
40	0.21
41	0.21
42	0.19
43	0.18
44	0.19
45	0.22
46	0.17
47	0.18
48	0.19
49	0.22
50	0.24
51	0.25
52	0.25
53	0.26
54	0.26
55	0.31
56	0.39
57	0.39
58	0.38
59	0.42
60	0.43
61	0.4
62	0.38
63	0.31
64	0.24
65	0.26
66	0.26
67	0.21
68	0.19
69	0.17
70	0.17
71	0.17
72	0.15
73	0.1
74	0.13
75	0.14
76	0.15
77	0.21
78	0.21
79	0.21
80	0.24
81	0.26
82	0.32
83	0.38
84	0.41
85	0.44
86	0.48
87	0.47
88	0.48
89	0.45
90	0.38
91	0.31
92	0.3
93	0.21
94	0.17
95	0.17
96	0.14
97	0.19
98	0.19
99	0.27
100	0.27
101	0.3
102	0.36
103	0.43
104	0.5
105	0.52
106	0.58
107	0.57
108	0.6
109	0.61
110	0.56
111	0.51
112	0.43
113	0.36
114	0.27
115	0.2
116	0.13
117	0.09
118	0.12
119	0.1
120	0.09
121	0.09
122	0.08
123	0.08
124	0.09
125	0.08
126	0.04
127	0.05
128	0.07
129	0.09
130	0.09
131	0.09
132	0.1
133	0.1
134	0.14
135	0.16
136	0.17
137	0.17
138	0.21
139	0.22
140	0.25
141	0.28
142	0.27
143	0.3
144	0.29
145	0.28
146	0.26
147	0.25
148	0.25
149	0.27
150	0.28
151	0.29
152	0.31
153	0.32
154	0.33
155	0.41
156	0.47
157	0.49
158	0.53
159	0.53
160	0.49
161	0.53
162	0.57
163	0.52
164	0.48
165	0.42
166	0.35
167	0.31
168	0.31
169	0.27
170	0.25
171	0.21
172	0.2
173	0.21
174	0.23
175	0.24
176	0.28
177	0.37
178	0.41
179	0.45
180	0.48
181	0.46
182	0.42
183	0.4
184	0.36
185	0.29
186	0.22
187	0.19
188	0.12
189	0.15
190	0.15
191	0.16
192	0.23
193	0.2
194	0.21
195	0.21
196	0.23
197	0.23
198	0.25
199	0.25
200	0.18
201	0.2
202	0.19
203	0.17
204	0.15
205	0.13
206	0.1
207	0.09
208	0.09
209	0.07
210	0.08
211	0.08
212	0.1
213	0.14
214	0.13
215	0.14
216	0.16
217	0.17
218	0.2
219	0.21
220	0.21
221	0.18
222	0.19
223	0.18
224	0.15
225	0.14
226	0.09
227	0.09
228	0.08
229	0.1
230	0.11
231	0.12
232	0.14
233	0.15
234	0.17
235	0.2
236	0.21
237	0.19
238	0.19
239	0.18
240	0.17
241	0.16
242	0.15
243	0.11
244	0.08
245	0.07
246	0.06
247	0.06
248	0.07
249	0.08
250	0.08
251	0.08
252	0.09
253	0.09
254	0.09
255	0.09
256	0.07
257	0.08
258	0.1
259	0.1
260	0.14
261	0.14
262	0.15
263	0.15
264	0.15
265	0.15
266	0.14
267	0.13
268	0.08
269	0.09
270	0.09
271	0.09
272	0.09
273	0.08
274	0.09
275	0.09
276	0.11
277	0.11
278	0.11
279	0.1
280	0.1
281	0.1
282	0.08
283	0.08
284	0.06
285	0.07
286	0.06
287	0.06
288	0.06
289	0.06
290	0.07
291	0.08
292	0.08
293	0.09
294	0.14
295	0.15
296	0.16
297	0.21
298	0.22
299	0.29
300	0.28
301	0.29
302	0.26
303	0.26
304	0.25
305	0.22
306	0.19
307	0.12
308	0.12
309	0.09
310	0.06
311	0.06
312	0.04
313	0.03
314	0.03
315	0.04
316	0.04
317	0.04
318	0.06
319	0.06
320	0.07
321	0.1
322	0.12
323	0.15
324	0.15
325	0.16
326	0.2
327	0.19
328	0.21
329	0.18
330	0.18
331	0.16
332	0.15
333	0.15
334	0.09
335	0.09
336	0.1
337	0.11
338	0.11
339	0.12
340	0.13
341	0.13
342	0.15
343	0.14
344	0.14
345	0.14
346	0.12
347	0.15
348	0.14
349	0.15
350	0.17
351	0.17
352	0.16
353	0.16
354	0.16
355	0.12
356	0.12
357	0.1
358	0.07
359	0.06
360	0.06
361	0.05
362	0.04
363	0.04
364	0.04
365	0.05
366	0.05
367	0.06
368	0.07
369	0.12
370	0.14
371	0.14
372	0.15
373	0.15
374	0.15
375	0.16
376	0.15
377	0.1
378	0.09
379	0.1
380	0.1
381	0.11
382	0.1
383	0.09
384	0.09
385	0.09
386	0.1
387	0.09
388	0.1
389	0.08
390	0.11
391	0.13
392	0.14
393	0.18
394	0.19
395	0.23
396	0.29
397	0.38
398	0.44
399	0.53
400	0.62
401	0.69
402	0.78
403	0.85
404	0.88
405	0.91
406	0.94
407	0.94
408	0.94
409	0.93
410	0.92
411	0.9
412	0.91
413	0.9
414	0.88
415	0.84
416	0.79
417	0.72
418	0.66
419	0.58
420	0.47
421	0.39
422	0.29
423	0.22
424	0.16
425	0.12
426	0.11
427	0.12
428	0.13
429	0.14
430	0.17
431	0.23
432	0.32
433	0.41
434	0.43
435	0.51
436	0.55
437	0.59
438	0.57
439	0.51
440	0.45
441	0.37
442	0.34
443	0.26
444	0.21
445	0.18
446	0.16
447	0.15
448	0.14
449	0.13
450	0.11
451	0.11
452	0.14
453	0.12
454	0.13
455	0.14
456	0.14
457	0.13
458	0.13
459	0.12
460	0.1
461	0.16
462	0.21
463	0.23
464	0.31
465	0.38
466	0.46
467	0.51
468	0.55
469	0.54
470	0.58
471	0.57
472	0.5
473	0.46
474	0.39
475	0.34
476	0.29
477	0.23
478	0.15
479	0.12
480	0.11
481	0.09
482	0.08
483	0.08
484	0.08
485	0.09
486	0.09
487	0.11
488	0.11
489	0.11
490	0.12
491	0.12
492	0.14
493	0.14
494	0.18
495	0.16
496	0.16
497	0.16
498	0.14
499	0.16
500	0.13

Q2UB16

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer