FuNGI

A0A2V1DTH2

Protein Details

Accession

A0A2V1DTH2

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
420-442	AQFKREAREKKKDLKRKANGDDH	Basic
630-662	QGRHQPSQQSPPRGKKNRKRHHRGTPDRSSQPP	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
424-436	REAREKKKDLKRK
516-558	RRGAMRGRGGWGDRGRGFRGRGAMGGGRGDRFDRGGMHNGGGR
640-653	PPRGKKNRKRHHRG

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 14.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR038664 Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf IPR007504 H/ACA_rnp_Gar1/Naf1 IPR040309 Naf1 IPR009000 Transl_B-barrel_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005732 C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0000493 P:box H/ACA snoRNP assembly GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0042254 P:ribosome biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04410 Gar1

Amino Acid Sequences

MLQTKRSSPEAHLKQFAPMAEPPAKKARLDGDSPSGEPVVQADAPASPVDDSDDDFYETPQLDNAGGAKLETVMPSTSTAAAQPNNAASALIPGLGFWTAPPPTDTKPAPQPSSLDAEAGDELEDGEVSDTDVFYGGDKSDAQASVTATEDALQHNANDAPDTIAPAVPAIVPPTSSDTQPNPDANSSTIPVATESDAVDEGKIEFLQAAEANKDNTQAEWQLDSEASDSSDSSSDDSSSDSDSDSDGELLTTEEAIKRMLAEDPEDGDAPAPKAKVKTQNEVDEQYQKPDITVTETMQITELGQVENIVDNLILIKANVSGDYHVLESGSVVCLANREVVGQISETIGRVQDPRYSVGFATAEEIAASEITKGTRIYYVNDHSTFVYTEPLRAEKHTDASGQYDEETNAKEFSDDEEEAQFKREAREKKKDLKRKANGDDHDDAQPASYPNLPYGNETTNDSRGSAAPSSYQSAPLKYSDDEDEDLGMYRPLARPDRFEDVVGAGAPLEDRSHVRRGAMRGRGGWGDRGRGFRGRGAMGGGRGDRFDRGGMHNGGGRGDRFDRGGANHNGGRGDRGGQNNRGRGDRSNRGQNDRQGRHQQQERQMSGPPQDNRQGGRGAYSPSPARQNQGRHQPSQQSPPRGKKNRKRHHRGTPDRSSQPPAPAAGTSMANANMNAYSTNNAQSGADWNASYSTTTPASYTTPGTNAPAPTAAYGNPAYYPQQAQTAAQAQANMAQWIQLAAALQQAQAQQQAVPPPPQPAQQPAQAQYPYPYQYQQASAPNAGQASNQPAGTTPSLQDILRALGNGTGN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.54
2	0.54
3	0.49
4	0.42
5	0.34
6	0.34
7	0.36
8	0.36
9	0.37
10	0.43
11	0.45
12	0.41
13	0.43
14	0.44
15	0.41
16	0.44
17	0.44
18	0.43
19	0.44
20	0.44
21	0.42
22	0.34
23	0.28
24	0.25
25	0.2
26	0.16
27	0.13
28	0.12
29	0.11
30	0.11
31	0.12
32	0.12
33	0.12
34	0.08
35	0.08
36	0.12
37	0.12
38	0.13
39	0.15
40	0.16
41	0.18
42	0.18
43	0.18
44	0.19
45	0.18
46	0.17
47	0.15
48	0.14
49	0.12
50	0.13
51	0.13
52	0.11
53	0.11
54	0.1
55	0.1
56	0.1
57	0.1
58	0.1
59	0.11
60	0.09
61	0.11
62	0.12
63	0.14
64	0.13
65	0.13
66	0.15
67	0.18
68	0.18
69	0.18
70	0.19
71	0.18
72	0.18
73	0.18
74	0.16
75	0.11
76	0.12
77	0.11
78	0.1
79	0.08
80	0.07
81	0.08
82	0.08
83	0.08
84	0.06
85	0.11
86	0.11
87	0.12
88	0.14
89	0.17
90	0.2
91	0.27
92	0.29
93	0.3
94	0.4
95	0.47
96	0.48
97	0.46
98	0.46
99	0.42
100	0.47
101	0.41
102	0.31
103	0.23
104	0.22
105	0.2
106	0.18
107	0.15
108	0.08
109	0.07
110	0.07
111	0.07
112	0.05
113	0.05
114	0.05
115	0.06
116	0.06
117	0.06
118	0.06
119	0.06
120	0.06
121	0.06
122	0.08
123	0.07
124	0.08
125	0.08
126	0.09
127	0.12
128	0.12
129	0.12
130	0.13
131	0.14
132	0.14
133	0.15
134	0.14
135	0.11
136	0.12
137	0.12
138	0.11
139	0.12
140	0.11
141	0.1
142	0.12
143	0.13
144	0.12
145	0.12
146	0.12
147	0.12
148	0.12
149	0.14
150	0.13
151	0.11
152	0.11
153	0.1
154	0.1
155	0.08
156	0.08
157	0.08
158	0.07
159	0.07
160	0.08
161	0.15
162	0.16
163	0.16
164	0.2
165	0.22
166	0.26
167	0.31
168	0.32
169	0.28
170	0.28
171	0.29
172	0.26
173	0.25
174	0.22
175	0.18
176	0.16
177	0.14
178	0.13
179	0.13
180	0.12
181	0.11
182	0.09
183	0.1
184	0.1
185	0.1
186	0.09
187	0.08
188	0.08
189	0.08
190	0.07
191	0.06
192	0.06
193	0.05
194	0.07
195	0.08
196	0.09
197	0.1
198	0.11
199	0.13
200	0.13
201	0.15
202	0.14
203	0.13
204	0.15
205	0.15
206	0.15
207	0.15
208	0.15
209	0.14
210	0.14
211	0.13
212	0.11
213	0.1
214	0.09
215	0.08
216	0.08
217	0.08
218	0.09
219	0.08
220	0.09
221	0.09
222	0.09
223	0.09
224	0.1
225	0.09
226	0.1
227	0.1
228	0.09
229	0.09
230	0.09
231	0.09
232	0.09
233	0.08
234	0.07
235	0.06
236	0.06
237	0.06
238	0.06
239	0.05
240	0.05
241	0.06
242	0.07
243	0.07
244	0.07
245	0.06
246	0.07
247	0.09
248	0.09
249	0.1
250	0.11
251	0.12
252	0.13
253	0.13
254	0.12
255	0.11
256	0.11
257	0.11
258	0.12
259	0.11
260	0.11
261	0.13
262	0.19
263	0.28
264	0.32
265	0.39
266	0.43
267	0.5
268	0.52
269	0.53
270	0.5
271	0.48
272	0.44
273	0.38
274	0.34
275	0.27
276	0.23
277	0.21
278	0.18
279	0.15
280	0.16
281	0.14
282	0.17
283	0.17
284	0.17
285	0.17
286	0.16
287	0.12
288	0.12
289	0.11
290	0.07
291	0.07
292	0.07
293	0.06
294	0.07
295	0.06
296	0.05
297	0.04
298	0.04
299	0.04
300	0.04
301	0.04
302	0.03
303	0.04
304	0.04
305	0.05
306	0.05
307	0.05
308	0.06
309	0.06
310	0.07
311	0.07
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.06
316	0.06
317	0.05
318	0.05
319	0.05
320	0.05
321	0.05
322	0.06
323	0.07
324	0.06
325	0.06
326	0.06
327	0.07
328	0.07
329	0.07
330	0.06
331	0.06
332	0.06
333	0.06
334	0.06
335	0.06
336	0.06
337	0.07
338	0.08
339	0.11
340	0.12
341	0.14
342	0.15
343	0.16
344	0.15
345	0.16
346	0.15
347	0.12
348	0.12
349	0.1
350	0.09
351	0.07
352	0.08
353	0.05
354	0.05
355	0.05
356	0.03
357	0.04
358	0.04
359	0.05
360	0.05
361	0.06
362	0.09
363	0.1
364	0.12
365	0.16
366	0.19
367	0.23
368	0.23
369	0.24
370	0.21
371	0.21
372	0.19
373	0.15
374	0.16
375	0.11
376	0.12
377	0.12
378	0.14
379	0.13
380	0.14
381	0.17
382	0.15
383	0.17
384	0.17
385	0.17
386	0.15
387	0.17
388	0.17
389	0.13
390	0.12
391	0.1
392	0.1
393	0.1
394	0.1
395	0.08
396	0.08
397	0.08
398	0.07
399	0.07
400	0.09
401	0.12
402	0.11
403	0.11
404	0.13
405	0.13
406	0.13
407	0.15
408	0.14
409	0.11
410	0.13
411	0.2
412	0.27
413	0.34
414	0.44
415	0.49
416	0.58
417	0.68
418	0.75
419	0.78
420	0.8
421	0.81
422	0.8
423	0.81
424	0.79
425	0.72
426	0.69
427	0.61
428	0.52
429	0.45
430	0.36
431	0.27
432	0.19
433	0.18
434	0.12
435	0.1
436	0.11
437	0.09
438	0.1
439	0.13
440	0.13
441	0.13
442	0.15
443	0.16
444	0.15
445	0.18
446	0.19
447	0.19
448	0.19
449	0.17
450	0.16
451	0.14
452	0.16
453	0.14
454	0.12
455	0.11
456	0.12
457	0.15
458	0.14
459	0.18
460	0.17
461	0.17
462	0.18
463	0.18
464	0.19
465	0.16
466	0.18
467	0.15
468	0.16
469	0.16
470	0.14
471	0.13
472	0.12
473	0.12
474	0.1
475	0.08
476	0.06
477	0.07
478	0.08
479	0.12
480	0.18
481	0.18
482	0.21
483	0.26
484	0.32
485	0.31
486	0.3
487	0.27
488	0.21
489	0.21
490	0.18
491	0.13
492	0.07
493	0.06
494	0.05
495	0.05
496	0.04
497	0.05
498	0.07
499	0.1
500	0.14
501	0.15
502	0.17
503	0.21
504	0.26
505	0.33
506	0.37
507	0.36
508	0.33
509	0.35
510	0.36
511	0.33
512	0.34
513	0.27
514	0.27
515	0.27
516	0.3
517	0.3
518	0.31
519	0.32
520	0.28
521	0.29
522	0.25
523	0.22
524	0.21
525	0.2
526	0.17
527	0.18
528	0.16
529	0.13
530	0.13
531	0.14
532	0.12
533	0.11
534	0.11
535	0.12
536	0.14
537	0.19
538	0.2
539	0.2
540	0.21
541	0.21
542	0.21
543	0.2
544	0.17
545	0.15
546	0.15
547	0.15
548	0.14
549	0.14
550	0.15
551	0.16
552	0.24
553	0.23
554	0.26
555	0.26
556	0.26
557	0.27
558	0.25
559	0.24
560	0.17
561	0.18
562	0.18
563	0.25
564	0.29
565	0.36
566	0.42
567	0.45
568	0.47
569	0.46
570	0.44
571	0.43
572	0.46
573	0.47
574	0.47
575	0.53
576	0.55
577	0.6
578	0.64
579	0.65
580	0.68
581	0.63
582	0.65
583	0.65
584	0.65
585	0.67
586	0.68
587	0.68
588	0.67
589	0.72
590	0.66
591	0.57
592	0.56
593	0.51
594	0.48
595	0.48
596	0.41
597	0.37
598	0.41
599	0.42
600	0.4
601	0.39
602	0.37
603	0.29
604	0.3
605	0.27
606	0.24
607	0.23
608	0.25
609	0.24
610	0.24
611	0.31
612	0.29
613	0.32
614	0.35
615	0.42
616	0.46
617	0.55
618	0.57
619	0.54
620	0.59
621	0.63
622	0.62
623	0.65
624	0.64
625	0.63
626	0.66
627	0.72
628	0.77
629	0.79
630	0.85
631	0.85
632	0.88
633	0.9
634	0.92
635	0.93
636	0.92
637	0.93
638	0.93
639	0.94
640	0.92
641	0.92
642	0.9
643	0.85
644	0.79
645	0.74
646	0.66
647	0.6
648	0.52
649	0.43
650	0.36
651	0.3
652	0.27
653	0.23
654	0.2
655	0.15
656	0.14
657	0.14
658	0.13
659	0.13
660	0.12
661	0.1
662	0.1
663	0.1
664	0.09
665	0.11
666	0.12
667	0.15
668	0.14
669	0.15
670	0.14
671	0.14
672	0.17
673	0.18
674	0.17
675	0.14
676	0.14
677	0.15
678	0.15
679	0.15
680	0.12
681	0.13
682	0.13
683	0.13
684	0.13
685	0.14
686	0.16
687	0.18
688	0.19
689	0.18
690	0.18
691	0.19
692	0.22
693	0.24
694	0.22
695	0.22
696	0.2
697	0.19
698	0.18
699	0.19
700	0.16
701	0.16
702	0.16
703	0.15
704	0.15
705	0.16
706	0.17
707	0.19
708	0.21
709	0.18
710	0.22
711	0.22
712	0.22
713	0.26
714	0.28
715	0.28
716	0.27
717	0.26
718	0.21
719	0.24
720	0.25
721	0.21
722	0.15
723	0.13
724	0.12
725	0.12
726	0.12
727	0.08
728	0.07
729	0.06
730	0.1
731	0.1
732	0.1
733	0.12
734	0.13
735	0.14
736	0.16
737	0.16
738	0.14
739	0.17
740	0.23
741	0.25
742	0.27
743	0.28
744	0.31
745	0.33
746	0.36
747	0.37
748	0.38
749	0.38
750	0.41
751	0.46
752	0.44
753	0.49
754	0.46
755	0.44
756	0.4
757	0.42
758	0.38
759	0.34
760	0.33
761	0.29
762	0.31
763	0.33
764	0.35
765	0.36
766	0.38
767	0.37
768	0.36
769	0.35
770	0.32
771	0.29
772	0.25
773	0.21
774	0.23
775	0.24
776	0.23
777	0.2
778	0.21
779	0.25
780	0.27
781	0.26
782	0.2
783	0.22
784	0.25
785	0.24
786	0.25
787	0.22
788	0.22
789	0.2
790	0.2
791	0.15

A0A2V1DTH2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer