Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2V1DHK6

Protein Details
Accession A0A2V1DHK6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
269-293IRIKAAPPKDRKGKKNNRDRGARDGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
109-131KAPKKEEGRGEKEKTNKEGKKNE
271-302IKAAPPKDRKGKKNNRDRGARDGRDPDPGRRR
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 14, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR001656  PsdUridine_synth_TruD  
IPR011760  PsdUridine_synth_TruD_insert  
IPR042214  TruD_catalytic  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF01142  TruD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50984  TRUD  
CDD cd02576  PseudoU_synth_ScPUS7  
Amino Acid Sequences MHDDADARPAKRARLDSPSSTPAADPATTSTSTPAPVKSGPLGSDKPSSVDEDLEREIRAGITEYVCAENAGFRGVLKQRYTDFLVNEIGLDGEVVRLTVVGVEEEKDKAPKKEEGRGEKEKTNKEGKKNEGKVAEHQEKVTLVVEDGNEAAPVKQPKKIEIRIEDDVEENGTEKAEVKEENGEEAAGDTQLSEEDLATLHSIFGEQTTKEILSLVQAIRKHDHKKAKDFKAVIVPPITDKDIRTQAHRSLRNMFPNLLESGMEADQSIRIKAAPPKDRKGKKNNRDRGARDGRDPDPGRRRGQLAWDELGGEFLHFTLYKENKDTMEVVGFLGSKLGGGSKPFGFAGTKDRRACTVQRVCIKRQTAERMSHFNKLLYNAAIGNFTYRNHDIRLGDLKGNEFHITLRDCHFNGEEGLDSAQRLKLANDVVSKAITDFSEKGFINYYGLQRFGSFAASTDTIGLKMLQGDLKGAVEDLLAYTDSALEAANSTDENKSTVLVSQDDKNRAKALHLWRTTGSGKAVLDMLPRKFTAERNIIQHLSSRNSKSGARDRKSDWQGALMCIPRNLRLMYVHAYQSLVWNTVAGQRWATYGARVVEGDLVLVHEHADKLPSATTTDNTTIDQDGETIINPTGTDSALAHEAQFDRARALTAAEAASGLYTVYDVVLPQPGFDVEYPANEIGTFYSTFMKSERGGGLDPHHMRRSWREVSLSGGYRKFLAKPLRPLEYQVKEYTKPDEQFVETDLERVKKAGTVLGPEPREKEGGDTPMKDAADTAAEEVKDEESSKKIATVIKLQLGSSQYATIALRELMKAGGVQAYKPEFMGGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.57
3 0.56
4 0.6
5 0.6
6 0.54
7 0.49
8 0.43
9 0.36
10 0.33
11 0.26
12 0.2
13 0.19
14 0.22
15 0.21
16 0.22
17 0.21
18 0.19
19 0.22
20 0.24
21 0.22
22 0.22
23 0.22
24 0.25
25 0.27
26 0.28
27 0.28
28 0.32
29 0.34
30 0.34
31 0.38
32 0.35
33 0.33
34 0.32
35 0.33
36 0.28
37 0.28
38 0.26
39 0.25
40 0.28
41 0.27
42 0.25
43 0.22
44 0.21
45 0.17
46 0.17
47 0.15
48 0.14
49 0.13
50 0.14
51 0.16
52 0.16
53 0.16
54 0.16
55 0.13
56 0.12
57 0.12
58 0.12
59 0.1
60 0.09
61 0.16
62 0.21
63 0.28
64 0.28
65 0.31
66 0.32
67 0.37
68 0.42
69 0.4
70 0.35
71 0.32
72 0.32
73 0.28
74 0.26
75 0.22
76 0.16
77 0.11
78 0.1
79 0.07
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.04
84 0.04
85 0.04
86 0.05
87 0.06
88 0.06
89 0.07
90 0.08
91 0.1
92 0.12
93 0.14
94 0.18
95 0.22
96 0.26
97 0.3
98 0.37
99 0.41
100 0.48
101 0.56
102 0.6
103 0.65
104 0.7
105 0.71
106 0.69
107 0.72
108 0.7
109 0.68
110 0.69
111 0.67
112 0.67
113 0.71
114 0.74
115 0.76
116 0.75
117 0.75
118 0.72
119 0.67
120 0.66
121 0.67
122 0.65
123 0.56
124 0.5
125 0.45
126 0.38
127 0.37
128 0.3
129 0.2
130 0.13
131 0.13
132 0.13
133 0.12
134 0.12
135 0.1
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.12
140 0.19
141 0.2
142 0.24
143 0.26
144 0.32
145 0.41
146 0.48
147 0.51
148 0.51
149 0.56
150 0.56
151 0.57
152 0.51
153 0.43
154 0.36
155 0.28
156 0.22
157 0.16
158 0.11
159 0.09
160 0.08
161 0.09
162 0.1
163 0.11
164 0.11
165 0.12
166 0.17
167 0.18
168 0.19
169 0.18
170 0.16
171 0.14
172 0.14
173 0.13
174 0.08
175 0.07
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.04
182 0.04
183 0.05
184 0.05
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.07
192 0.08
193 0.08
194 0.09
195 0.11
196 0.11
197 0.11
198 0.11
199 0.1
200 0.09
201 0.13
202 0.13
203 0.15
204 0.17
205 0.2
206 0.24
207 0.31
208 0.34
209 0.39
210 0.48
211 0.52
212 0.61
213 0.68
214 0.72
215 0.74
216 0.7
217 0.65
218 0.66
219 0.59
220 0.52
221 0.43
222 0.35
223 0.28
224 0.29
225 0.28
226 0.19
227 0.18
228 0.21
229 0.27
230 0.28
231 0.31
232 0.33
233 0.38
234 0.46
235 0.5
236 0.47
237 0.46
238 0.51
239 0.54
240 0.52
241 0.45
242 0.37
243 0.35
244 0.32
245 0.25
246 0.2
247 0.12
248 0.12
249 0.11
250 0.1
251 0.08
252 0.07
253 0.09
254 0.1
255 0.1
256 0.08
257 0.08
258 0.11
259 0.16
260 0.25
261 0.32
262 0.38
263 0.47
264 0.57
265 0.66
266 0.71
267 0.78
268 0.8
269 0.81
270 0.85
271 0.86
272 0.85
273 0.85
274 0.8
275 0.79
276 0.78
277 0.71
278 0.65
279 0.61
280 0.53
281 0.54
282 0.52
283 0.5
284 0.49
285 0.52
286 0.5
287 0.46
288 0.48
289 0.4
290 0.45
291 0.42
292 0.37
293 0.32
294 0.29
295 0.27
296 0.24
297 0.24
298 0.16
299 0.1
300 0.06
301 0.05
302 0.06
303 0.05
304 0.06
305 0.12
306 0.15
307 0.16
308 0.19
309 0.2
310 0.2
311 0.21
312 0.22
313 0.16
314 0.14
315 0.13
316 0.11
317 0.1
318 0.1
319 0.08
320 0.07
321 0.06
322 0.05
323 0.04
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.08
328 0.08
329 0.09
330 0.09
331 0.1
332 0.1
333 0.1
334 0.19
335 0.24
336 0.31
337 0.32
338 0.32
339 0.34
340 0.37
341 0.39
342 0.39
343 0.39
344 0.39
345 0.45
346 0.49
347 0.49
348 0.53
349 0.52
350 0.46
351 0.44
352 0.46
353 0.44
354 0.45
355 0.46
356 0.47
357 0.48
358 0.49
359 0.44
360 0.37
361 0.32
362 0.28
363 0.27
364 0.18
365 0.16
366 0.12
367 0.12
368 0.11
369 0.1
370 0.09
371 0.08
372 0.08
373 0.12
374 0.13
375 0.14
376 0.14
377 0.18
378 0.16
379 0.19
380 0.23
381 0.21
382 0.21
383 0.2
384 0.2
385 0.18
386 0.19
387 0.16
388 0.11
389 0.1
390 0.11
391 0.12
392 0.12
393 0.14
394 0.15
395 0.15
396 0.16
397 0.16
398 0.14
399 0.13
400 0.12
401 0.1
402 0.08
403 0.08
404 0.07
405 0.06
406 0.06
407 0.07
408 0.07
409 0.07
410 0.07
411 0.09
412 0.09
413 0.12
414 0.13
415 0.13
416 0.13
417 0.12
418 0.12
419 0.1
420 0.1
421 0.07
422 0.08
423 0.08
424 0.08
425 0.13
426 0.13
427 0.14
428 0.14
429 0.14
430 0.14
431 0.16
432 0.18
433 0.14
434 0.14
435 0.14
436 0.12
437 0.13
438 0.12
439 0.1
440 0.08
441 0.07
442 0.09
443 0.09
444 0.09
445 0.09
446 0.09
447 0.08
448 0.08
449 0.08
450 0.06
451 0.06
452 0.06
453 0.06
454 0.06
455 0.06
456 0.07
457 0.07
458 0.06
459 0.06
460 0.05
461 0.04
462 0.04
463 0.04
464 0.04
465 0.04
466 0.04
467 0.04
468 0.03
469 0.03
470 0.04
471 0.04
472 0.03
473 0.03
474 0.03
475 0.04
476 0.04
477 0.06
478 0.06
479 0.06
480 0.08
481 0.07
482 0.08
483 0.08
484 0.09
485 0.09
486 0.11
487 0.12
488 0.16
489 0.22
490 0.28
491 0.29
492 0.29
493 0.3
494 0.29
495 0.28
496 0.31
497 0.35
498 0.37
499 0.37
500 0.38
501 0.36
502 0.4
503 0.4
504 0.34
505 0.26
506 0.19
507 0.17
508 0.16
509 0.16
510 0.12
511 0.15
512 0.18
513 0.18
514 0.17
515 0.17
516 0.19
517 0.2
518 0.22
519 0.26
520 0.28
521 0.3
522 0.33
523 0.37
524 0.35
525 0.34
526 0.36
527 0.31
528 0.28
529 0.31
530 0.29
531 0.27
532 0.28
533 0.3
534 0.34
535 0.41
536 0.47
537 0.44
538 0.47
539 0.5
540 0.57
541 0.6
542 0.57
543 0.47
544 0.42
545 0.4
546 0.37
547 0.36
548 0.29
549 0.25
550 0.24
551 0.24
552 0.2
553 0.21
554 0.2
555 0.18
556 0.16
557 0.19
558 0.21
559 0.23
560 0.21
561 0.19
562 0.19
563 0.18
564 0.2
565 0.18
566 0.15
567 0.12
568 0.11
569 0.12
570 0.16
571 0.18
572 0.15
573 0.14
574 0.13
575 0.14
576 0.17
577 0.16
578 0.12
579 0.14
580 0.14
581 0.15
582 0.14
583 0.14
584 0.13
585 0.12
586 0.11
587 0.07
588 0.07
589 0.06
590 0.06
591 0.06
592 0.06
593 0.06
594 0.06
595 0.07
596 0.07
597 0.08
598 0.09
599 0.09
600 0.11
601 0.11
602 0.12
603 0.16
604 0.18
605 0.18
606 0.18
607 0.19
608 0.17
609 0.16
610 0.15
611 0.11
612 0.1
613 0.09
614 0.08
615 0.08
616 0.08
617 0.08
618 0.07
619 0.08
620 0.08
621 0.07
622 0.08
623 0.07
624 0.08
625 0.1
626 0.1
627 0.1
628 0.12
629 0.12
630 0.15
631 0.17
632 0.16
633 0.15
634 0.15
635 0.16
636 0.14
637 0.14
638 0.11
639 0.11
640 0.1
641 0.09
642 0.09
643 0.08
644 0.07
645 0.06
646 0.05
647 0.03
648 0.03
649 0.03
650 0.04
651 0.04
652 0.04
653 0.05
654 0.1
655 0.1
656 0.1
657 0.11
658 0.11
659 0.12
660 0.12
661 0.17
662 0.12
663 0.14
664 0.17
665 0.16
666 0.16
667 0.14
668 0.14
669 0.1
670 0.12
671 0.11
672 0.1
673 0.14
674 0.14
675 0.15
676 0.16
677 0.18
678 0.16
679 0.2
680 0.21
681 0.19
682 0.19
683 0.21
684 0.24
685 0.3
686 0.34
687 0.36
688 0.37
689 0.37
690 0.39
691 0.44
692 0.49
693 0.45
694 0.45
695 0.43
696 0.4
697 0.44
698 0.48
699 0.46
700 0.43
701 0.39
702 0.36
703 0.34
704 0.35
705 0.31
706 0.32
707 0.36
708 0.38
709 0.46
710 0.52
711 0.56
712 0.55
713 0.59
714 0.61
715 0.57
716 0.55
717 0.51
718 0.5
719 0.47
720 0.49
721 0.49
722 0.47
723 0.42
724 0.41
725 0.38
726 0.35
727 0.34
728 0.33
729 0.32
730 0.24
731 0.26
732 0.27
733 0.25
734 0.23
735 0.22
736 0.21
737 0.18
738 0.19
739 0.21
740 0.19
741 0.22
742 0.27
743 0.35
744 0.37
745 0.37
746 0.39
747 0.36
748 0.36
749 0.31
750 0.31
751 0.28
752 0.33
753 0.37
754 0.35
755 0.35
756 0.39
757 0.38
758 0.33
759 0.28
760 0.21
761 0.18
762 0.17
763 0.16
764 0.15
765 0.15
766 0.16
767 0.16
768 0.16
769 0.15
770 0.16
771 0.16
772 0.15
773 0.18
774 0.18
775 0.19
776 0.21
777 0.25
778 0.27
779 0.33
780 0.37
781 0.41
782 0.41
783 0.4
784 0.41
785 0.38
786 0.36
787 0.29
788 0.24
789 0.18
790 0.19
791 0.19
792 0.15
793 0.15
794 0.14
795 0.15
796 0.14
797 0.15
798 0.13
799 0.13
800 0.12
801 0.12
802 0.15
803 0.14
804 0.14
805 0.2
806 0.23
807 0.23
808 0.23