Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2V1D9E6

Protein Details
Accession A0A2V1D9E6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
101-125GKVAQEEKKKPKAPKAPKKDSAGPSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
107-121EKKKPKAPKAPKKDS
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 12.333, cyto 10.5, mito_nucl 7.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019544  Tetratricopeptide_SHNi-TPR_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF10516  SHNi-TPR  
Amino Acid Sequences MSEQSPIVLDTPEPPAAAAATAAAEVEELPKTKEKLEELTKAASLQYTLKNFSASADHYADAVEIQAELNGEMAPENAELLFYYGRALYKVAIAKSDVLGGKVAQEEKKKPKAPKAPKKDSAGPSNGAEKEAEKSAGVASKPYFQLTGDENWTDSEDEEEGDGEQQQEEEQDDFADAYEVFEIARVLYSKQLEALEATESADKGKGKAELTSEARAIKEKLADCHGFLVEISLENERFHDAVTDAQSAVTLQEELHPIEHENVTEAYYSLSLALEFASTSKAFEDNGEKTDAPKEDAPPQIDWDLRKEASKHTQLAVEGLEKRLKIEEAALSSDTLTAEQKKEKEAVIEDKKGLLEDLKTRINDLKADPTQQPVDSLDPSLFQGLIGGLLGADAATQKAKLAEAKSTANDISGLVKTKKKEQVPALVPATSSTADDAGSGKRKLEVEEQGANGKRAKTEEMQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.15
4 0.15
5 0.12
6 0.07
7 0.06
8 0.06
9 0.06
10 0.05
11 0.05
12 0.05
13 0.07
14 0.09
15 0.09
16 0.13
17 0.18
18 0.2
19 0.23
20 0.28
21 0.29
22 0.36
23 0.42
24 0.46
25 0.44
26 0.46
27 0.44
28 0.39
29 0.37
30 0.29
31 0.23
32 0.21
33 0.24
34 0.24
35 0.27
36 0.27
37 0.28
38 0.27
39 0.27
40 0.26
41 0.22
42 0.24
43 0.23
44 0.22
45 0.21
46 0.21
47 0.19
48 0.15
49 0.13
50 0.07
51 0.05
52 0.05
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.06
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.06
67 0.08
68 0.08
69 0.06
70 0.08
71 0.09
72 0.09
73 0.1
74 0.1
75 0.09
76 0.14
77 0.18
78 0.18
79 0.18
80 0.19
81 0.19
82 0.19
83 0.23
84 0.19
85 0.15
86 0.15
87 0.14
88 0.14
89 0.16
90 0.19
91 0.19
92 0.25
93 0.33
94 0.41
95 0.51
96 0.57
97 0.61
98 0.67
99 0.74
100 0.79
101 0.82
102 0.83
103 0.84
104 0.85
105 0.85
106 0.84
107 0.8
108 0.76
109 0.7
110 0.61
111 0.53
112 0.51
113 0.45
114 0.36
115 0.3
116 0.23
117 0.21
118 0.2
119 0.18
120 0.11
121 0.12
122 0.12
123 0.15
124 0.14
125 0.15
126 0.14
127 0.18
128 0.19
129 0.19
130 0.18
131 0.15
132 0.18
133 0.17
134 0.2
135 0.18
136 0.18
137 0.17
138 0.17
139 0.18
140 0.16
141 0.13
142 0.11
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.05
154 0.06
155 0.07
156 0.07
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.07
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.04
168 0.05
169 0.05
170 0.04
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.09
175 0.1
176 0.09
177 0.11
178 0.11
179 0.11
180 0.11
181 0.11
182 0.09
183 0.08
184 0.09
185 0.08
186 0.07
187 0.08
188 0.1
189 0.09
190 0.09
191 0.1
192 0.13
193 0.12
194 0.14
195 0.16
196 0.19
197 0.22
198 0.23
199 0.22
200 0.2
201 0.2
202 0.2
203 0.19
204 0.15
205 0.16
206 0.16
207 0.16
208 0.2
209 0.2
210 0.19
211 0.19
212 0.18
213 0.14
214 0.12
215 0.11
216 0.06
217 0.06
218 0.07
219 0.06
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.08
224 0.08
225 0.07
226 0.07
227 0.06
228 0.08
229 0.1
230 0.1
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.08
236 0.06
237 0.04
238 0.04
239 0.06
240 0.07
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.09
245 0.11
246 0.11
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.08
253 0.07
254 0.06
255 0.06
256 0.05
257 0.05
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.09
271 0.14
272 0.14
273 0.15
274 0.18
275 0.17
276 0.18
277 0.22
278 0.21
279 0.2
280 0.2
281 0.21
282 0.25
283 0.29
284 0.3
285 0.27
286 0.28
287 0.28
288 0.28
289 0.26
290 0.24
291 0.24
292 0.22
293 0.24
294 0.23
295 0.26
296 0.33
297 0.37
298 0.35
299 0.32
300 0.34
301 0.31
302 0.31
303 0.27
304 0.22
305 0.18
306 0.19
307 0.2
308 0.17
309 0.18
310 0.18
311 0.17
312 0.13
313 0.14
314 0.15
315 0.14
316 0.17
317 0.17
318 0.15
319 0.15
320 0.15
321 0.13
322 0.11
323 0.11
324 0.12
325 0.14
326 0.19
327 0.2
328 0.22
329 0.24
330 0.24
331 0.25
332 0.27
333 0.34
334 0.37
335 0.4
336 0.37
337 0.37
338 0.36
339 0.33
340 0.29
341 0.21
342 0.16
343 0.17
344 0.22
345 0.25
346 0.25
347 0.27
348 0.3
349 0.3
350 0.31
351 0.29
352 0.33
353 0.31
354 0.35
355 0.34
356 0.34
357 0.35
358 0.32
359 0.31
360 0.24
361 0.24
362 0.21
363 0.21
364 0.17
365 0.15
366 0.16
367 0.15
368 0.13
369 0.09
370 0.09
371 0.07
372 0.07
373 0.06
374 0.05
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.03
379 0.03
380 0.03
381 0.04
382 0.05
383 0.05
384 0.06
385 0.07
386 0.1
387 0.14
388 0.16
389 0.2
390 0.24
391 0.27
392 0.28
393 0.31
394 0.29
395 0.25
396 0.23
397 0.19
398 0.18
399 0.17
400 0.22
401 0.22
402 0.27
403 0.29
404 0.38
405 0.46
406 0.48
407 0.54
408 0.56
409 0.62
410 0.62
411 0.68
412 0.62
413 0.54
414 0.49
415 0.41
416 0.37
417 0.27
418 0.22
419 0.15
420 0.12
421 0.11
422 0.12
423 0.13
424 0.16
425 0.23
426 0.23
427 0.23
428 0.27
429 0.28
430 0.31
431 0.37
432 0.39
433 0.38
434 0.43
435 0.44
436 0.48
437 0.5
438 0.48
439 0.45
440 0.39
441 0.36
442 0.33