Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T6ZT90

Protein Details
Accession A0A2T6ZT90    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-41SPPMLKRKARSPTPPLEKRLKEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
25-42KRKARSPTPPLEKRLKEQ
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11.5, cyto 7.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010347  Tdp1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008081  F:phosphoric diester hydrolase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF06087  Tyr-DNA_phospho  
CDD cd09123  PLDc_Tdp1_2  
cd09194  PLDc_yTdp1_1  
Amino Acid Sequences MSKEPSPGQLPVESLRAPVSPPMLKRKARSPTPPLEKRLKEQKARVEDERSVVKPRVGVASPFQLTRIDELPESENVGAVGIRDILRRGPLKEVWIFNYLFDLDWVMNQFDPEVKDIVKVRIVHGSWRREDTNRIRIHNQAESYPNVKLVCAFMPEPYGTHHSKMFVLFRADDHAQIIIHTANMIPFDWQNMTQAAWQSPLLSLLPQDHGSPSPQTFNSIGQTFKTDILAYFSAYGEGRTDFLTAQLSKYSFDPVKAVFVGSVPGKFHIDASNGKGYEWGWRRLASVLRKVPLRSPNVKGCIVVQVSSIATLGSKDTWLSPVLFASLKTSKLTGSAEPKFHVMFPTPNEIRESLNGYKSGSSLHMKFQSPAQLAQLGYMRRHLTHWDSNPPPNNQPSSSSALKDAGRARAAPHIKTYIRFSDADCTHIDWALLTSANISIQAWGSTEKDPIGSTSRREVRICSYEAGVLVYPEILDVKEMVPTFKKDIPDEVGNEGTAGLRMPYGLPLRKYASNEMPWSASKSYSDVDWLGQKWEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.24
3 0.21
4 0.21
5 0.21
6 0.24
7 0.25
8 0.31
9 0.4
10 0.47
11 0.52
12 0.56
13 0.62
14 0.66
15 0.7
16 0.74
17 0.73
18 0.74
19 0.8
20 0.83
21 0.81
22 0.81
23 0.77
24 0.76
25 0.78
26 0.77
27 0.75
28 0.75
29 0.77
30 0.77
31 0.79
32 0.76
33 0.72
34 0.65
35 0.61
36 0.6
37 0.53
38 0.49
39 0.45
40 0.4
41 0.35
42 0.34
43 0.35
44 0.3
45 0.3
46 0.28
47 0.33
48 0.33
49 0.32
50 0.31
51 0.27
52 0.26
53 0.27
54 0.25
55 0.19
56 0.17
57 0.2
58 0.22
59 0.2
60 0.22
61 0.18
62 0.16
63 0.14
64 0.13
65 0.11
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.09
70 0.1
71 0.11
72 0.12
73 0.18
74 0.21
75 0.22
76 0.26
77 0.27
78 0.32
79 0.37
80 0.39
81 0.36
82 0.37
83 0.36
84 0.3
85 0.3
86 0.25
87 0.19
88 0.16
89 0.14
90 0.09
91 0.1
92 0.12
93 0.11
94 0.1
95 0.1
96 0.11
97 0.12
98 0.13
99 0.13
100 0.13
101 0.13
102 0.16
103 0.19
104 0.21
105 0.24
106 0.23
107 0.23
108 0.28
109 0.28
110 0.34
111 0.39
112 0.43
113 0.41
114 0.45
115 0.47
116 0.43
117 0.51
118 0.51
119 0.53
120 0.52
121 0.54
122 0.52
123 0.54
124 0.56
125 0.52
126 0.45
127 0.38
128 0.36
129 0.34
130 0.34
131 0.29
132 0.27
133 0.22
134 0.2
135 0.17
136 0.16
137 0.14
138 0.15
139 0.14
140 0.12
141 0.14
142 0.15
143 0.14
144 0.15
145 0.2
146 0.18
147 0.2
148 0.2
149 0.2
150 0.21
151 0.23
152 0.22
153 0.21
154 0.22
155 0.2
156 0.2
157 0.24
158 0.23
159 0.2
160 0.18
161 0.16
162 0.13
163 0.12
164 0.13
165 0.08
166 0.07
167 0.07
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.07
172 0.07
173 0.06
174 0.08
175 0.09
176 0.1
177 0.1
178 0.1
179 0.11
180 0.12
181 0.14
182 0.12
183 0.13
184 0.12
185 0.11
186 0.11
187 0.11
188 0.1
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.11
197 0.13
198 0.14
199 0.14
200 0.15
201 0.15
202 0.17
203 0.17
204 0.18
205 0.2
206 0.19
207 0.18
208 0.15
209 0.18
210 0.16
211 0.15
212 0.14
213 0.11
214 0.1
215 0.13
216 0.13
217 0.11
218 0.11
219 0.1
220 0.1
221 0.1
222 0.1
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.08
228 0.06
229 0.07
230 0.1
231 0.09
232 0.1
233 0.11
234 0.11
235 0.11
236 0.11
237 0.15
238 0.12
239 0.13
240 0.14
241 0.12
242 0.14
243 0.13
244 0.13
245 0.09
246 0.08
247 0.1
248 0.09
249 0.09
250 0.07
251 0.08
252 0.09
253 0.09
254 0.1
255 0.1
256 0.12
257 0.13
258 0.16
259 0.19
260 0.19
261 0.18
262 0.18
263 0.17
264 0.22
265 0.24
266 0.24
267 0.21
268 0.21
269 0.22
270 0.24
271 0.3
272 0.26
273 0.31
274 0.31
275 0.32
276 0.34
277 0.34
278 0.37
279 0.39
280 0.4
281 0.37
282 0.39
283 0.43
284 0.45
285 0.45
286 0.39
287 0.33
288 0.32
289 0.27
290 0.22
291 0.16
292 0.13
293 0.12
294 0.12
295 0.11
296 0.06
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.04
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.07
305 0.08
306 0.08
307 0.08
308 0.08
309 0.09
310 0.09
311 0.09
312 0.12
313 0.13
314 0.14
315 0.14
316 0.14
317 0.13
318 0.15
319 0.17
320 0.16
321 0.22
322 0.25
323 0.26
324 0.27
325 0.28
326 0.27
327 0.25
328 0.23
329 0.17
330 0.16
331 0.17
332 0.25
333 0.24
334 0.25
335 0.26
336 0.26
337 0.25
338 0.23
339 0.27
340 0.21
341 0.23
342 0.22
343 0.21
344 0.21
345 0.19
346 0.19
347 0.16
348 0.17
349 0.17
350 0.21
351 0.26
352 0.27
353 0.27
354 0.29
355 0.33
356 0.3
357 0.3
358 0.26
359 0.23
360 0.22
361 0.23
362 0.25
363 0.19
364 0.18
365 0.22
366 0.21
367 0.19
368 0.2
369 0.23
370 0.25
371 0.32
372 0.36
373 0.4
374 0.44
375 0.51
376 0.56
377 0.55
378 0.54
379 0.51
380 0.5
381 0.42
382 0.42
383 0.39
384 0.38
385 0.37
386 0.33
387 0.29
388 0.3
389 0.29
390 0.3
391 0.29
392 0.28
393 0.27
394 0.27
395 0.26
396 0.31
397 0.35
398 0.31
399 0.31
400 0.33
401 0.34
402 0.36
403 0.39
404 0.35
405 0.34
406 0.34
407 0.31
408 0.34
409 0.33
410 0.32
411 0.28
412 0.26
413 0.24
414 0.23
415 0.22
416 0.12
417 0.12
418 0.11
419 0.11
420 0.08
421 0.08
422 0.08
423 0.08
424 0.08
425 0.07
426 0.07
427 0.07
428 0.08
429 0.08
430 0.09
431 0.12
432 0.13
433 0.14
434 0.14
435 0.14
436 0.14
437 0.16
438 0.2
439 0.21
440 0.23
441 0.31
442 0.38
443 0.42
444 0.42
445 0.43
446 0.45
447 0.47
448 0.47
449 0.39
450 0.34
451 0.3
452 0.3
453 0.28
454 0.2
455 0.14
456 0.12
457 0.1
458 0.08
459 0.07
460 0.07
461 0.06
462 0.06
463 0.07
464 0.07
465 0.11
466 0.11
467 0.14
468 0.17
469 0.21
470 0.26
471 0.29
472 0.32
473 0.3
474 0.36
475 0.39
476 0.4
477 0.39
478 0.39
479 0.36
480 0.32
481 0.3
482 0.25
483 0.18
484 0.13
485 0.11
486 0.07
487 0.06
488 0.06
489 0.07
490 0.12
491 0.19
492 0.25
493 0.26
494 0.31
495 0.36
496 0.4
497 0.45
498 0.47
499 0.48
500 0.49
501 0.51
502 0.48
503 0.47
504 0.44
505 0.45
506 0.39
507 0.33
508 0.27
509 0.27
510 0.25
511 0.22
512 0.24
513 0.2
514 0.22
515 0.26
516 0.26