FuNGI

A0A2T6ZUH8

Protein Details

Accession

A0A2T6ZUH8

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
240-264	NKESSSTKREKRRLEKSRAKGKERE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
235-265	RTEKPNKESSSTKREKRRLEKSRAKGKERES
367-374	EKGRERRR
438-453	ARPRRRGGRGNGGRRP
537-548	KGSGRHRRGGPP
577-605	KGRRNGGGRGGGGFRGGRGRGGGGPPKRG

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto_nucl 11, mito 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MASPSPTIAKAKPRGGGPLLKASSGNNPATIRLKVVVRHLPSLMREDEFKSAMAEYINEETVEWAAWIQGKIPEERTKAPKDSRCVIRFKTPLQITALSEGLRLHGPFTDSKGNTTNPQMEYSPFQKVPKKSGRTDARAGTIESDPDFIAFVTSLKAASTPTPTADGTAPDTSTSIHPGETVGTPTTIPANDPLSVPLPLVEKVDKPKTTPLIEYLRTHKNGSSDKSGSSKASLRTEKPNKESSSTKREKRRLEKSRAKGKERESRIEEKEEWAIELAPQAIDMEATTILKRENSIGGSLSRQNTNTTILSRQSTGISSTVLSRQNSGLAGSLSRQNSGQPGTSVRQGSNLASNSSRSEKGQSQEKEKGRERRRDRGGVSSVAAILQRDLGITPSTRRSRNSAKTPSTIETASTTTDGAPTATVTPPTPVNPEPQSPARPRRRGGRGNGGRRPEREDSIASNSSTTTPRPAVAPVAILKKLPSNASTPSVPTPITESPPATPNLLKREGSAAGLAPPTGPAASIAGPDREGVPTAPKGSGRHRRGGPPRSGAVSAAAQAAMALAGVPTAPAGDSQQKGRRNGGGRGGGGFRGGRGRGGGGPPKRGSVSDA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.52
2	0.53
3	0.56
4	0.5
5	0.52
6	0.48
7	0.44
8	0.43
9	0.38
10	0.41
11	0.4
12	0.37
13	0.31
14	0.3
15	0.34
16	0.37
17	0.36
18	0.31
19	0.28
20	0.3
21	0.29
22	0.36
23	0.4
24	0.39
25	0.42
26	0.41
27	0.41
28	0.4
29	0.42
30	0.37
31	0.31
32	0.29
33	0.29
34	0.31
35	0.28
36	0.26
37	0.22
38	0.19
39	0.19
40	0.17
41	0.15
42	0.13
43	0.15
44	0.16
45	0.14
46	0.14
47	0.13
48	0.13
49	0.12
50	0.09
51	0.07
52	0.07
53	0.1
54	0.1
55	0.12
56	0.15
57	0.17
58	0.2
59	0.26
60	0.32
61	0.33
62	0.41
63	0.46
64	0.5
65	0.56
66	0.62
67	0.63
68	0.63
69	0.68
70	0.71
71	0.69
72	0.69
73	0.65
74	0.66
75	0.64
76	0.6
77	0.61
78	0.52
79	0.5
80	0.47
81	0.46
82	0.38
83	0.36
84	0.34
85	0.24
86	0.23
87	0.2
88	0.17
89	0.16
90	0.14
91	0.12
92	0.12
93	0.14
94	0.14
95	0.19
96	0.27
97	0.25
98	0.28
99	0.32
100	0.32
101	0.33
102	0.38
103	0.39
104	0.31
105	0.34
106	0.32
107	0.3
108	0.32
109	0.32
110	0.34
111	0.3
112	0.34
113	0.39
114	0.41
115	0.49
116	0.54
117	0.58
118	0.55
119	0.63
120	0.67
121	0.66
122	0.69
123	0.63
124	0.58
125	0.52
126	0.48
127	0.41
128	0.32
129	0.27
130	0.22
131	0.19
132	0.14
133	0.12
134	0.12
135	0.08
136	0.08
137	0.07
138	0.06
139	0.06
140	0.06
141	0.06
142	0.06
143	0.07
144	0.07
145	0.09
146	0.13
147	0.13
148	0.14
149	0.16
150	0.16
151	0.18
152	0.18
153	0.17
154	0.17
155	0.17
156	0.16
157	0.14
158	0.14
159	0.14
160	0.14
161	0.15
162	0.12
163	0.11
164	0.1
165	0.11
166	0.12
167	0.12
168	0.13
169	0.1
170	0.1
171	0.1
172	0.1
173	0.12
174	0.1
175	0.1
176	0.1
177	0.12
178	0.12
179	0.13
180	0.14
181	0.14
182	0.14
183	0.13
184	0.12
185	0.12
186	0.12
187	0.14
188	0.13
189	0.14
190	0.21
191	0.28
192	0.27
193	0.28
194	0.33
195	0.36
196	0.37
197	0.35
198	0.35
199	0.34
200	0.37
201	0.38
202	0.37
203	0.39
204	0.39
205	0.39
206	0.35
207	0.34
208	0.36
209	0.37
210	0.39
211	0.33
212	0.33
213	0.35
214	0.35
215	0.3
216	0.27
217	0.28
218	0.25
219	0.31
220	0.33
221	0.34
222	0.43
223	0.51
224	0.55
225	0.55
226	0.58
227	0.52
228	0.52
229	0.56
230	0.52
231	0.54
232	0.56
233	0.59
234	0.61
235	0.67
236	0.73
237	0.76
238	0.8
239	0.79
240	0.82
241	0.84
242	0.84
243	0.87
244	0.85
245	0.81
246	0.77
247	0.75
248	0.74
249	0.69
250	0.66
251	0.62
252	0.61
253	0.58
254	0.57
255	0.49
256	0.42
257	0.38
258	0.31
259	0.25
260	0.18
261	0.15
262	0.1
263	0.1
264	0.08
265	0.05
266	0.05
267	0.05
268	0.04
269	0.04
270	0.04
271	0.04
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.05
276	0.05
277	0.06
278	0.06
279	0.06
280	0.08
281	0.08
282	0.09
283	0.09
284	0.1
285	0.12
286	0.15
287	0.15
288	0.15
289	0.15
290	0.15
291	0.15
292	0.17
293	0.16
294	0.14
295	0.15
296	0.15
297	0.16
298	0.16
299	0.15
300	0.13
301	0.13
302	0.12
303	0.11
304	0.09
305	0.09
306	0.09
307	0.12
308	0.16
309	0.15
310	0.15
311	0.15
312	0.16
313	0.16
314	0.15
315	0.11
316	0.08
317	0.08
318	0.08
319	0.12
320	0.12
321	0.12
322	0.12
323	0.11
324	0.13
325	0.14
326	0.14
327	0.1
328	0.13
329	0.15
330	0.19
331	0.19
332	0.17
333	0.18
334	0.19
335	0.18
336	0.2
337	0.19
338	0.17
339	0.16
340	0.17
341	0.17
342	0.19
343	0.2
344	0.15
345	0.19
346	0.21
347	0.24
348	0.32
349	0.33
350	0.37
351	0.45
352	0.48
353	0.52
354	0.56
355	0.63
356	0.62
357	0.69
358	0.69
359	0.71
360	0.74
361	0.73
362	0.68
363	0.66
364	0.61
365	0.53
366	0.46
367	0.37
368	0.29
369	0.22
370	0.2
371	0.12
372	0.08
373	0.07
374	0.06
375	0.05
376	0.05
377	0.06
378	0.07
379	0.08
380	0.1
381	0.18
382	0.23
383	0.25
384	0.27
385	0.33
386	0.42
387	0.5
388	0.57
389	0.59
390	0.58
391	0.6
392	0.62
393	0.57
394	0.5
395	0.42
396	0.33
397	0.25
398	0.21
399	0.18
400	0.15
401	0.13
402	0.1
403	0.11
404	0.1
405	0.08
406	0.07
407	0.07
408	0.08
409	0.08
410	0.09
411	0.09
412	0.11
413	0.12
414	0.13
415	0.17
416	0.16
417	0.21
418	0.23
419	0.25
420	0.28
421	0.32
422	0.37
423	0.41
424	0.51
425	0.55
426	0.59
427	0.61
428	0.66
429	0.71
430	0.72
431	0.72
432	0.73
433	0.72
434	0.76
435	0.78
436	0.77
437	0.72
438	0.66
439	0.65
440	0.58
441	0.51
442	0.44
443	0.4
444	0.36
445	0.38
446	0.39
447	0.32
448	0.28
449	0.25
450	0.24
451	0.24
452	0.2
453	0.18
454	0.16
455	0.17
456	0.18
457	0.19
458	0.19
459	0.17
460	0.19
461	0.19
462	0.22
463	0.22
464	0.21
465	0.21
466	0.22
467	0.24
468	0.23
469	0.21
470	0.19
471	0.22
472	0.26
473	0.27
474	0.26
475	0.26
476	0.27
477	0.25
478	0.22
479	0.24
480	0.23
481	0.25
482	0.25
483	0.24
484	0.24
485	0.28
486	0.29
487	0.25
488	0.26
489	0.27
490	0.32
491	0.36
492	0.34
493	0.31
494	0.34
495	0.33
496	0.31
497	0.26
498	0.2
499	0.17
500	0.17
501	0.16
502	0.11
503	0.11
504	0.1
505	0.09
506	0.08
507	0.06
508	0.08
509	0.08
510	0.11
511	0.12
512	0.13
513	0.13
514	0.14
515	0.14
516	0.13
517	0.14
518	0.12
519	0.16
520	0.18
521	0.2
522	0.22
523	0.24
524	0.27
525	0.36
526	0.46
527	0.47
528	0.53
529	0.56
530	0.64
531	0.71
532	0.76
533	0.74
534	0.7
535	0.68
536	0.64
537	0.59
538	0.5
539	0.43
540	0.35
541	0.27
542	0.21
543	0.17
544	0.13
545	0.11
546	0.1
547	0.07
548	0.05
549	0.04
550	0.03
551	0.03
552	0.03
553	0.03
554	0.03
555	0.03
556	0.04
557	0.04
558	0.09
559	0.16
560	0.19
561	0.27
562	0.35
563	0.41
564	0.45
565	0.5
566	0.54
567	0.53
568	0.57
569	0.58
570	0.57
571	0.52
572	0.51
573	0.48
574	0.4
575	0.37
576	0.31
577	0.24
578	0.23
579	0.23
580	0.2
581	0.2
582	0.22
583	0.24
584	0.31
585	0.38
586	0.38
587	0.46
588	0.46
589	0.49
590	0.48

A0A2T6ZUH8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer