Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T6ZHS5

Protein Details
Accession A0A2T6ZHS5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
102-122DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQHydrophilic
403-425QIFKNRKRVDDRREQNNKRRKLEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
420-422KRR
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto 8, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLTNKYPKIVSSVIEEQPQEIDGVVGVVDITQPNPNGEADNLYLDMNGIVHPCSHPEEGEPPETEEAMMLAVFAYTERVVNMVRPRKLLMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQEAKEKEDETAQLIEQMEKRQGSSFDDVLKNKKVWDSNAITPGTPFMDILAASLKYWIAKKLNDDPAWAKLKIVISDSTVPGEGEHKIMEFIRSQRLSTEYDPNTRHVIYGLDADLIMLGLGTHEPHFRVLREDVFAKEARAKTCKICGQKGHRAEECTGKAKEKQGEFDEKDNALPLKPFVWLHVSILREYLEVELQVSGQPFKFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLEIRENGIDTLIAVWKDNIPLMEGYVTKDGTVDLKRVQYILDGLAKQEDQIFKNRKRVDDRREQNNKRRKLEEEARAASGSRGDNFASGGFDSPTVAPAGRGRGRGVPNSAPPPMIPLFKPGDVSKDTKKMNYDMVMNREGIRKANLQNKSAAQALKAQLLTGSPGTAVESLGDSSKTDTSTPEKLSTAASANVSYVIPMKRKSDIMEGGETSKTPGSESEVEDPERDPVRLWEPGYRERYYEQKFHVSPDDAEFRNKVAASYVEGLCWVLLYYFQGCPSWTWYYPYHYAPFAQDFKDVGTLDIKFEKGKPFKPFEQLMGVLPAASKHALPEPFQKLMTEEDSEIIDFYPESFPIDLNGKKFAWQGVALLPFIDEERLLDAAAKIYPKLSAEDTARNAMGHDFLYCADSNPMYDDVTTQLYHKRQISDEYTLDPSTSQGLTGKVIKDPSFIPHGTVPFPLSENGKPKIEGDKSLCVFYEFPKHTHVHKSLLLRGVKPDPPVLSRTDLELVKCKAQGSGRSYGGAPLYRSNSGRGRGRGGGDFQGSYQSNRGPSQGYPGHNHTPSYGNGTWQPPPPPPALSGWGGWGRQNNQPPGGYGNPPPYIAPGPYQRGGQYPAHPPPPPPPPTFPHRGTFGRGQPQPPYNGPGHNYNSSPRDDRYRPGGGGENRYNGHNNDRRDDRSRAGGSGGYRGGRGGAGGNNNRGRGGDNRDLWRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.47
3 0.49
4 0.47
5 0.41
6 0.39
7 0.41
8 0.4
9 0.39
10 0.38
11 0.33
12 0.31
13 0.3
14 0.23
15 0.15
16 0.12
17 0.07
18 0.07
19 0.06
20 0.05
21 0.04
22 0.04
23 0.05
24 0.06
25 0.07
26 0.11
27 0.12
28 0.13
29 0.15
30 0.15
31 0.16
32 0.16
33 0.19
34 0.17
35 0.18
36 0.18
37 0.16
38 0.15
39 0.14
40 0.13
41 0.1
42 0.09
43 0.08
44 0.08
45 0.09
46 0.1
47 0.12
48 0.17
49 0.18
50 0.18
51 0.2
52 0.26
53 0.29
54 0.33
55 0.32
56 0.3
57 0.3
58 0.3
59 0.27
60 0.2
61 0.16
62 0.12
63 0.1
64 0.06
65 0.05
66 0.04
67 0.04
68 0.04
69 0.06
70 0.06
71 0.07
72 0.07
73 0.08
74 0.09
75 0.15
76 0.25
77 0.32
78 0.35
79 0.37
80 0.39
81 0.4
82 0.41
83 0.39
84 0.32
85 0.29
86 0.27
87 0.25
88 0.24
89 0.21
90 0.2
91 0.18
92 0.15
93 0.1
94 0.13
95 0.19
96 0.26
97 0.37
98 0.46
99 0.55
100 0.66
101 0.74
102 0.8
103 0.82
104 0.79
105 0.76
106 0.77
107 0.77
108 0.75
109 0.77
110 0.72
111 0.68
112 0.7
113 0.63
114 0.53
115 0.46
116 0.38
117 0.3
118 0.28
119 0.23
120 0.2
121 0.2
122 0.23
123 0.22
124 0.24
125 0.26
126 0.25
127 0.26
128 0.25
129 0.26
130 0.28
131 0.3
132 0.29
133 0.31
134 0.37
135 0.39
136 0.42
137 0.46
138 0.41
139 0.39
140 0.42
141 0.39
142 0.36
143 0.42
144 0.42
145 0.43
146 0.49
147 0.48
148 0.42
149 0.38
150 0.36
151 0.28
152 0.22
153 0.16
154 0.09
155 0.09
156 0.09
157 0.1
158 0.11
159 0.1
160 0.1
161 0.11
162 0.11
163 0.12
164 0.14
165 0.19
166 0.2
167 0.22
168 0.29
169 0.37
170 0.47
171 0.45
172 0.48
173 0.45
174 0.48
175 0.51
176 0.45
177 0.35
178 0.3
179 0.32
180 0.29
181 0.29
182 0.23
183 0.21
184 0.25
185 0.25
186 0.22
187 0.2
188 0.18
189 0.16
190 0.17
191 0.14
192 0.11
193 0.11
194 0.1
195 0.11
196 0.11
197 0.13
198 0.15
199 0.17
200 0.25
201 0.25
202 0.25
203 0.26
204 0.29
205 0.31
206 0.31
207 0.38
208 0.33
209 0.39
210 0.41
211 0.41
212 0.42
213 0.38
214 0.34
215 0.25
216 0.22
217 0.16
218 0.17
219 0.15
220 0.11
221 0.11
222 0.1
223 0.09
224 0.08
225 0.06
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.04
231 0.05
232 0.07
233 0.08
234 0.11
235 0.14
236 0.14
237 0.18
238 0.2
239 0.22
240 0.24
241 0.25
242 0.23
243 0.25
244 0.25
245 0.22
246 0.26
247 0.27
248 0.28
249 0.3
250 0.31
251 0.3
252 0.38
253 0.43
254 0.43
255 0.46
256 0.51
257 0.57
258 0.64
259 0.68
260 0.68
261 0.65
262 0.61
263 0.57
264 0.56
265 0.51
266 0.48
267 0.42
268 0.38
269 0.39
270 0.42
271 0.46
272 0.4
273 0.41
274 0.4
275 0.48
276 0.48
277 0.48
278 0.45
279 0.39
280 0.37
281 0.34
282 0.29
283 0.21
284 0.18
285 0.15
286 0.12
287 0.13
288 0.13
289 0.12
290 0.16
291 0.16
292 0.18
293 0.21
294 0.21
295 0.19
296 0.2
297 0.19
298 0.14
299 0.14
300 0.12
301 0.09
302 0.08
303 0.08
304 0.07
305 0.07
306 0.08
307 0.08
308 0.09
309 0.08
310 0.09
311 0.09
312 0.1
313 0.11
314 0.1
315 0.13
316 0.16
317 0.17
318 0.18
319 0.2
320 0.19
321 0.18
322 0.17
323 0.15
324 0.11
325 0.09
326 0.08
327 0.05
328 0.05
329 0.06
330 0.07
331 0.06
332 0.06
333 0.08
334 0.07
335 0.08
336 0.08
337 0.08
338 0.07
339 0.08
340 0.12
341 0.16
342 0.16
343 0.16
344 0.16
345 0.16
346 0.16
347 0.15
348 0.1
349 0.06
350 0.06
351 0.08
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.08
356 0.09
357 0.09
358 0.08
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.09
363 0.09
364 0.1
365 0.12
366 0.12
367 0.1
368 0.1
369 0.1
370 0.12
371 0.13
372 0.13
373 0.14
374 0.15
375 0.16
376 0.16
377 0.16
378 0.13
379 0.12
380 0.13
381 0.14
382 0.12
383 0.12
384 0.13
385 0.13
386 0.13
387 0.15
388 0.16
389 0.13
390 0.22
391 0.31
392 0.34
393 0.43
394 0.46
395 0.49
396 0.55
397 0.63
398 0.63
399 0.65
400 0.69
401 0.71
402 0.79
403 0.82
404 0.82
405 0.82
406 0.83
407 0.77
408 0.73
409 0.66
410 0.64
411 0.64
412 0.63
413 0.61
414 0.54
415 0.5
416 0.46
417 0.43
418 0.34
419 0.28
420 0.2
421 0.13
422 0.12
423 0.11
424 0.11
425 0.11
426 0.11
427 0.08
428 0.08
429 0.08
430 0.07
431 0.06
432 0.07
433 0.07
434 0.07
435 0.07
436 0.06
437 0.06
438 0.07
439 0.13
440 0.15
441 0.16
442 0.17
443 0.23
444 0.25
445 0.27
446 0.3
447 0.26
448 0.28
449 0.3
450 0.29
451 0.23
452 0.21
453 0.22
454 0.2
455 0.19
456 0.15
457 0.16
458 0.18
459 0.18
460 0.2
461 0.16
462 0.19
463 0.2
464 0.23
465 0.23
466 0.28
467 0.28
468 0.29
469 0.31
470 0.28
471 0.28
472 0.27
473 0.28
474 0.24
475 0.28
476 0.27
477 0.25
478 0.25
479 0.25
480 0.24
481 0.19
482 0.18
483 0.18
484 0.22
485 0.29
486 0.31
487 0.3
488 0.32
489 0.32
490 0.31
491 0.3
492 0.25
493 0.18
494 0.2
495 0.19
496 0.19
497 0.18
498 0.16
499 0.13
500 0.13
501 0.13
502 0.08
503 0.07
504 0.04
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.04
510 0.04
511 0.05
512 0.05
513 0.05
514 0.05
515 0.06
516 0.07
517 0.07
518 0.08
519 0.09
520 0.13
521 0.17
522 0.18
523 0.18
524 0.18
525 0.18
526 0.18
527 0.17
528 0.15
529 0.12
530 0.11
531 0.1
532 0.09
533 0.1
534 0.09
535 0.08
536 0.1
537 0.1
538 0.12
539 0.14
540 0.15
541 0.16
542 0.18
543 0.19
544 0.21
545 0.23
546 0.23
547 0.23
548 0.22
549 0.22
550 0.21
551 0.19
552 0.15
553 0.12
554 0.09
555 0.08
556 0.08
557 0.1
558 0.12
559 0.15
560 0.18
561 0.19
562 0.2
563 0.2
564 0.2
565 0.19
566 0.18
567 0.16
568 0.12
569 0.12
570 0.14
571 0.17
572 0.17
573 0.18
574 0.21
575 0.28
576 0.33
577 0.32
578 0.3
579 0.29
580 0.36
581 0.36
582 0.37
583 0.32
584 0.35
585 0.34
586 0.35
587 0.38
588 0.31
589 0.28
590 0.27
591 0.29
592 0.22
593 0.23
594 0.21
595 0.18
596 0.19
597 0.18
598 0.14
599 0.1
600 0.1
601 0.11
602 0.14
603 0.14
604 0.12
605 0.12
606 0.12
607 0.1
608 0.09
609 0.07
610 0.03
611 0.03
612 0.04
613 0.06
614 0.06
615 0.07
616 0.08
617 0.08
618 0.09
619 0.13
620 0.16
621 0.15
622 0.19
623 0.2
624 0.25
625 0.28
626 0.3
627 0.27
628 0.24
629 0.24
630 0.22
631 0.25
632 0.22
633 0.2
634 0.18
635 0.17
636 0.17
637 0.19
638 0.17
639 0.13
640 0.13
641 0.13
642 0.13
643 0.14
644 0.14
645 0.12
646 0.14
647 0.21
648 0.24
649 0.29
650 0.34
651 0.39
652 0.42
653 0.47
654 0.47
655 0.41
656 0.4
657 0.36
658 0.3
659 0.26
660 0.22
661 0.15
662 0.14
663 0.12
664 0.08
665 0.08
666 0.07
667 0.06
668 0.11
669 0.12
670 0.14
671 0.22
672 0.25
673 0.27
674 0.27
675 0.26
676 0.23
677 0.24
678 0.25
679 0.19
680 0.15
681 0.14
682 0.14
683 0.14
684 0.12
685 0.1
686 0.07
687 0.06
688 0.07
689 0.07
690 0.06
691 0.08
692 0.08
693 0.08
694 0.09
695 0.14
696 0.15
697 0.16
698 0.2
699 0.18
700 0.2
701 0.21
702 0.2
703 0.17
704 0.15
705 0.15
706 0.15
707 0.17
708 0.15
709 0.14
710 0.13
711 0.11
712 0.11
713 0.09
714 0.06
715 0.04
716 0.06
717 0.06
718 0.06
719 0.07
720 0.07
721 0.08
722 0.09
723 0.09
724 0.08
725 0.08
726 0.09
727 0.09
728 0.11
729 0.12
730 0.15
731 0.17
732 0.22
733 0.24
734 0.26
735 0.25
736 0.23
737 0.22
738 0.18
739 0.16
740 0.11
741 0.09
742 0.07
743 0.07
744 0.1
745 0.1
746 0.1
747 0.1
748 0.1
749 0.1
750 0.12
751 0.13
752 0.1
753 0.1
754 0.1
755 0.1
756 0.13
757 0.13
758 0.12
759 0.17
760 0.19
761 0.24
762 0.27
763 0.28
764 0.27
765 0.33
766 0.36
767 0.36
768 0.35
769 0.33
770 0.33
771 0.3
772 0.28
773 0.22
774 0.18
775 0.15
776 0.14
777 0.11
778 0.09
779 0.1
780 0.13
781 0.16
782 0.17
783 0.17
784 0.2
785 0.2
786 0.2
787 0.2
788 0.21
789 0.23
790 0.22
791 0.22
792 0.22
793 0.24
794 0.23
795 0.24
796 0.21
797 0.17
798 0.18
799 0.17
800 0.18
801 0.21
802 0.25
803 0.28
804 0.29
805 0.28
806 0.29
807 0.36
808 0.34
809 0.36
810 0.35
811 0.4
812 0.39
813 0.4
814 0.38
815 0.31
816 0.29
817 0.26
818 0.31
819 0.24
820 0.25
821 0.29
822 0.31
823 0.33
824 0.41
825 0.42
826 0.37
827 0.4
828 0.44
829 0.44
830 0.49
831 0.49
832 0.41
833 0.42
834 0.42
835 0.4
836 0.37
837 0.35
838 0.31
839 0.3
840 0.31
841 0.3
842 0.29
843 0.26
844 0.27
845 0.28
846 0.27
847 0.27
848 0.31
849 0.31
850 0.3
851 0.31
852 0.28
853 0.27
854 0.3
855 0.35
856 0.34
857 0.38
858 0.36
859 0.36
860 0.36
861 0.34
862 0.33
863 0.28
864 0.24
865 0.22
866 0.25
867 0.27
868 0.28
869 0.31
870 0.34
871 0.38
872 0.43
873 0.41
874 0.43
875 0.43
876 0.45
877 0.43
878 0.41
879 0.38
880 0.33
881 0.3
882 0.25
883 0.28
884 0.26
885 0.24
886 0.24
887 0.23
888 0.24
889 0.25
890 0.26
891 0.22
892 0.22
893 0.29
894 0.32
895 0.33
896 0.35
897 0.41
898 0.47
899 0.46
900 0.46
901 0.39
902 0.36
903 0.34
904 0.36
905 0.31
906 0.26
907 0.29
908 0.32
909 0.34
910 0.35
911 0.38
912 0.33
913 0.37
914 0.37
915 0.34
916 0.32
917 0.32
918 0.31
919 0.3
920 0.26
921 0.27
922 0.28
923 0.27
924 0.28
925 0.3
926 0.29
927 0.34
928 0.42
929 0.41
930 0.41
931 0.41
932 0.4
933 0.4
934 0.41
935 0.37
936 0.34
937 0.36
938 0.33
939 0.33
940 0.32
941 0.3
942 0.29
943 0.27
944 0.28
945 0.28
946 0.33
947 0.34
948 0.36
949 0.33
950 0.34
951 0.38
952 0.37
953 0.35
954 0.38
955 0.43
956 0.48
957 0.48
958 0.47
959 0.49
960 0.54
961 0.55
962 0.51
963 0.5
964 0.49
965 0.56
966 0.62
967 0.59
968 0.54
969 0.54
970 0.52
971 0.52
972 0.55
973 0.55
974 0.57
975 0.57
976 0.56
977 0.57
978 0.59
979 0.59
980 0.53
981 0.51
982 0.44
983 0.45
984 0.44
985 0.45
986 0.45
987 0.44
988 0.43
989 0.44
990 0.45
991 0.45
992 0.46
993 0.42
994 0.46
995 0.45
996 0.48
997 0.49
998 0.51
999 0.46
1000 0.46
1001 0.51
1002 0.48
1003 0.54
1004 0.53
1005 0.51
1006 0.46
1007 0.49
1008 0.49
1009 0.43
1010 0.47
1011 0.45
1012 0.45
1013 0.47
1014 0.53
1015 0.57
1016 0.59
1017 0.62
1018 0.56
1019 0.59
1020 0.56
1021 0.49
1022 0.45
1023 0.41
1024 0.36
1025 0.37
1026 0.36
1027 0.27
1028 0.25
1029 0.24
1030 0.22
1031 0.19
1032 0.18
1033 0.15
1034 0.16
1035 0.24
1036 0.29
1037 0.37
1038 0.41
1039 0.41
1040 0.41
1041 0.38
1042 0.37
1043 0.35
1044 0.39
1045 0.39
1046 0.42