Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T6ZIW9

Protein Details
Accession A0A2T6ZIW9    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
244-263GESRDKTRIRERKQKNLLEIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
101-111GGGRGGGRGGR
251-259RIRERKQKN
264-299GARYSEPRENRRGGDRGGRGRGPRGGGGGRGGGGGG
Subcellular Location(s) cyto_nucl 14, nucl 11.5, cyto 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSASVASKNLFDLLGNDIEDPDAPPPPQPREVIKNSTTSKKREGKPTTGDFSASSEFAPRDNTAGGRGRPYSGNERAFRDRDAGRQNNLSKDTAEGAAPRGGGRGGGRGGRREYDRHSATGRTDSDKKYNQGWGGTGGSSEWNDEIVGQELAQNDATGADLADPNAVAPVDAPPGDEEAEEAAEPEEEKVKTLDEYHAELEQRRDGLGPPTEVRRPNEGNQNDKKWAGKELSRKEEEEGVFFAGESRDKTRIRERKQKNLLEIGARYSEPRENRRGGDRGGRGRGPRGGGGGRGGGGGGGYNGGGSRPSRRDDYHGGQDSGGHVNVADKSAFPDLGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.16
3 0.15
4 0.14
5 0.14
6 0.15
7 0.14
8 0.12
9 0.13
10 0.12
11 0.17
12 0.23
13 0.29
14 0.33
15 0.36
16 0.41
17 0.47
18 0.53
19 0.56
20 0.53
21 0.56
22 0.56
23 0.62
24 0.62
25 0.59
26 0.62
27 0.63
28 0.67
29 0.7
30 0.72
31 0.71
32 0.73
33 0.75
34 0.7
35 0.62
36 0.56
37 0.46
38 0.42
39 0.36
40 0.27
41 0.2
42 0.17
43 0.17
44 0.16
45 0.19
46 0.15
47 0.15
48 0.16
49 0.17
50 0.19
51 0.25
52 0.25
53 0.27
54 0.27
55 0.27
56 0.28
57 0.32
58 0.35
59 0.37
60 0.43
61 0.42
62 0.47
63 0.52
64 0.51
65 0.48
66 0.45
67 0.39
68 0.39
69 0.45
70 0.44
71 0.41
72 0.47
73 0.49
74 0.5
75 0.51
76 0.44
77 0.35
78 0.31
79 0.29
80 0.22
81 0.19
82 0.14
83 0.14
84 0.14
85 0.14
86 0.12
87 0.11
88 0.1
89 0.1
90 0.1
91 0.11
92 0.11
93 0.15
94 0.17
95 0.2
96 0.22
97 0.25
98 0.27
99 0.27
100 0.31
101 0.36
102 0.36
103 0.35
104 0.35
105 0.34
106 0.33
107 0.36
108 0.32
109 0.28
110 0.32
111 0.32
112 0.38
113 0.4
114 0.4
115 0.37
116 0.39
117 0.36
118 0.31
119 0.29
120 0.24
121 0.21
122 0.18
123 0.15
124 0.11
125 0.1
126 0.09
127 0.09
128 0.06
129 0.06
130 0.05
131 0.05
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.07
137 0.07
138 0.08
139 0.08
140 0.07
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.03
155 0.03
156 0.04
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.06
162 0.07
163 0.06
164 0.06
165 0.05
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.05
173 0.08
174 0.07
175 0.08
176 0.08
177 0.09
178 0.09
179 0.11
180 0.13
181 0.11
182 0.13
183 0.14
184 0.16
185 0.16
186 0.17
187 0.17
188 0.16
189 0.15
190 0.13
191 0.12
192 0.11
193 0.15
194 0.16
195 0.16
196 0.17
197 0.2
198 0.25
199 0.28
200 0.29
201 0.32
202 0.34
203 0.36
204 0.44
205 0.45
206 0.49
207 0.53
208 0.55
209 0.51
210 0.48
211 0.46
212 0.38
213 0.38
214 0.33
215 0.32
216 0.37
217 0.43
218 0.49
219 0.5
220 0.49
221 0.47
222 0.49
223 0.44
224 0.36
225 0.28
226 0.21
227 0.18
228 0.17
229 0.16
230 0.1
231 0.11
232 0.12
233 0.14
234 0.19
235 0.2
236 0.25
237 0.35
238 0.44
239 0.52
240 0.61
241 0.66
242 0.7
243 0.8
244 0.81
245 0.77
246 0.74
247 0.68
248 0.63
249 0.56
250 0.47
251 0.4
252 0.33
253 0.28
254 0.24
255 0.26
256 0.27
257 0.33
258 0.37
259 0.39
260 0.42
261 0.48
262 0.5
263 0.49
264 0.51
265 0.53
266 0.54
267 0.56
268 0.57
269 0.53
270 0.53
271 0.53
272 0.47
273 0.4
274 0.36
275 0.32
276 0.29
277 0.28
278 0.24
279 0.2
280 0.17
281 0.15
282 0.1
283 0.08
284 0.07
285 0.05
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.05
291 0.07
292 0.08
293 0.16
294 0.2
295 0.25
296 0.3
297 0.33
298 0.41
299 0.47
300 0.54
301 0.57
302 0.59
303 0.56
304 0.5
305 0.48
306 0.44
307 0.38
308 0.31
309 0.2
310 0.14
311 0.15
312 0.16
313 0.17
314 0.15
315 0.11
316 0.15
317 0.18