Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T6ZU87

Protein Details
Accession A0A2T6ZU87    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
320-339ARLARKKLSHFPPRRRKESVBasic
478-497RGDRRVVRERLPRPRGERGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
324-336RKKLSHFPPRRRK
468-498RDRRRGSSTARGDRRVVRERLPRPRGERGDG
Subcellular Location(s) mito 12.5, cyto_mito 9.833, cyto_nucl 6.333, cyto 6, nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045030  LYSM1-4  
IPR018392  LysM_dom  
IPR036779  LysM_dom_sf  
CDD cd00118  LysM  
Amino Acid Sequences MNSTSSSPSLPISVASAASKSHQPLPAKHPSRTNPQKSNGSATATAATTVTTTTTNGGGSGGSVGSEWGVQWSALQGLANSVLGSSAAAAGSDSPPTQPHEPAAAAVRRRRRPTDGTTPTGSVGGGGRRSHSSGSWLGEIPFTEADASKSAGSSGSGEARPHPTRRLNLDEPSSRNSTRSRKMPHKRSTSPDPTDGPAPLSVPEAERDALAYVHHVKPTDTLEGVVIMYNIHTSALRRANGMWPNDNVQRRKILLLPVEDCGVKGKPVGLLNLELTCDQQANLPSPPKEPTSEEKAAAEERGYRHESYVIIDGIGQVEIARLARKKLSHFPPRRRKESVSTNATAGFGTPPPDDESSVFRGMTPGVGTLGGSGSGAGVELHAEESITKALMEFAHGTSAGLENVGGVIEGFVRKWTAKAQDFATHDLIELTQRLGFEIEEGESGGSSGGRNGGGNANSGDGSGERATRDRRRGSSTARGDRRVVRERLPRPRGERGDGAKNGYKLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.14
4 0.14
5 0.16
6 0.2
7 0.21
8 0.26
9 0.31
10 0.35
11 0.41
12 0.49
13 0.57
14 0.59
15 0.6
16 0.63
17 0.63
18 0.69
19 0.73
20 0.75
21 0.73
22 0.75
23 0.8
24 0.74
25 0.76
26 0.68
27 0.63
28 0.53
29 0.46
30 0.4
31 0.31
32 0.28
33 0.2
34 0.16
35 0.11
36 0.1
37 0.1
38 0.08
39 0.08
40 0.09
41 0.1
42 0.1
43 0.1
44 0.1
45 0.09
46 0.08
47 0.08
48 0.07
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.06
54 0.05
55 0.06
56 0.07
57 0.06
58 0.07
59 0.08
60 0.08
61 0.09
62 0.09
63 0.07
64 0.08
65 0.09
66 0.09
67 0.08
68 0.07
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.05
73 0.05
74 0.04
75 0.04
76 0.04
77 0.06
78 0.07
79 0.08
80 0.08
81 0.09
82 0.1
83 0.15
84 0.18
85 0.18
86 0.19
87 0.21
88 0.21
89 0.22
90 0.27
91 0.28
92 0.31
93 0.36
94 0.44
95 0.49
96 0.55
97 0.59
98 0.59
99 0.61
100 0.64
101 0.69
102 0.67
103 0.64
104 0.61
105 0.56
106 0.5
107 0.43
108 0.34
109 0.23
110 0.18
111 0.15
112 0.16
113 0.15
114 0.17
115 0.18
116 0.2
117 0.21
118 0.19
119 0.2
120 0.2
121 0.22
122 0.22
123 0.21
124 0.2
125 0.2
126 0.19
127 0.17
128 0.13
129 0.11
130 0.1
131 0.09
132 0.1
133 0.1
134 0.11
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.12
143 0.14
144 0.14
145 0.16
146 0.24
147 0.27
148 0.28
149 0.33
150 0.35
151 0.38
152 0.44
153 0.5
154 0.47
155 0.48
156 0.52
157 0.51
158 0.48
159 0.48
160 0.46
161 0.38
162 0.36
163 0.39
164 0.4
165 0.42
166 0.47
167 0.51
168 0.57
169 0.67
170 0.75
171 0.78
172 0.79
173 0.79
174 0.78
175 0.8
176 0.78
177 0.72
178 0.66
179 0.58
180 0.5
181 0.45
182 0.38
183 0.3
184 0.21
185 0.17
186 0.13
187 0.12
188 0.11
189 0.09
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.09
194 0.09
195 0.08
196 0.08
197 0.07
198 0.09
199 0.11
200 0.13
201 0.14
202 0.14
203 0.14
204 0.16
205 0.18
206 0.17
207 0.13
208 0.12
209 0.11
210 0.11
211 0.11
212 0.09
213 0.06
214 0.05
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.05
221 0.1
222 0.15
223 0.15
224 0.16
225 0.17
226 0.23
227 0.27
228 0.29
229 0.25
230 0.22
231 0.25
232 0.3
233 0.35
234 0.31
235 0.28
236 0.29
237 0.27
238 0.28
239 0.26
240 0.24
241 0.22
242 0.23
243 0.23
244 0.21
245 0.21
246 0.19
247 0.17
248 0.15
249 0.12
250 0.09
251 0.08
252 0.08
253 0.1
254 0.11
255 0.12
256 0.1
257 0.11
258 0.12
259 0.12
260 0.12
261 0.09
262 0.09
263 0.08
264 0.07
265 0.06
266 0.08
267 0.09
268 0.11
269 0.13
270 0.16
271 0.17
272 0.19
273 0.21
274 0.2
275 0.21
276 0.22
277 0.25
278 0.3
279 0.31
280 0.3
281 0.29
282 0.29
283 0.27
284 0.24
285 0.19
286 0.14
287 0.13
288 0.17
289 0.2
290 0.18
291 0.18
292 0.19
293 0.19
294 0.17
295 0.19
296 0.14
297 0.11
298 0.11
299 0.1
300 0.09
301 0.09
302 0.07
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.05
307 0.07
308 0.08
309 0.1
310 0.13
311 0.15
312 0.2
313 0.29
314 0.38
315 0.46
316 0.56
317 0.65
318 0.73
319 0.8
320 0.82
321 0.79
322 0.75
323 0.72
324 0.73
325 0.72
326 0.68
327 0.61
328 0.54
329 0.49
330 0.44
331 0.35
332 0.25
333 0.17
334 0.1
335 0.12
336 0.11
337 0.11
338 0.14
339 0.15
340 0.16
341 0.16
342 0.19
343 0.21
344 0.22
345 0.21
346 0.18
347 0.17
348 0.16
349 0.16
350 0.12
351 0.08
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.06
356 0.06
357 0.05
358 0.05
359 0.04
360 0.04
361 0.03
362 0.04
363 0.03
364 0.03
365 0.03
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.05
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.05
376 0.07
377 0.07
378 0.09
379 0.1
380 0.1
381 0.11
382 0.11
383 0.11
384 0.11
385 0.12
386 0.09
387 0.07
388 0.07
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.04
393 0.03
394 0.03
395 0.04
396 0.05
397 0.05
398 0.06
399 0.08
400 0.09
401 0.1
402 0.16
403 0.24
404 0.27
405 0.31
406 0.34
407 0.4
408 0.42
409 0.45
410 0.43
411 0.34
412 0.3
413 0.26
414 0.23
415 0.18
416 0.16
417 0.12
418 0.1
419 0.1
420 0.11
421 0.11
422 0.1
423 0.09
424 0.1
425 0.1
426 0.09
427 0.09
428 0.08
429 0.08
430 0.08
431 0.07
432 0.06
433 0.05
434 0.06
435 0.07
436 0.08
437 0.08
438 0.1
439 0.15
440 0.16
441 0.18
442 0.17
443 0.17
444 0.16
445 0.16
446 0.15
447 0.1
448 0.13
449 0.12
450 0.13
451 0.14
452 0.19
453 0.28
454 0.36
455 0.45
456 0.49
457 0.53
458 0.6
459 0.65
460 0.68
461 0.7
462 0.72
463 0.74
464 0.73
465 0.72
466 0.7
467 0.71
468 0.72
469 0.71
470 0.65
471 0.63
472 0.66
473 0.71
474 0.77
475 0.77
476 0.77
477 0.75
478 0.8
479 0.79
480 0.75
481 0.74
482 0.7
483 0.72
484 0.67
485 0.67
486 0.62