FuNGI

A0A2K1QKY1

Protein Details

Accession

A0A2K1QKY1

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
22-53	QRKRAKANPFVVKKKPLQKKEPLRKPNGITSG	Hydrophilic
110-132	TSQFTRPMRLHRRFPRDQKNDIV	Hydrophilic
162-186	QIAPTDKNQQKKKLPNFKKKVEDVY	Hydrophilic
391-421	EEEKEKKKADEERRRQRKLRRALVKNERKFE	Basic
617-638	HELAHIFKKHIPKKNKDAQVAF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
23-47	RKRAKANPFVVKKKPLQKKEPLRKP
298-316	RAARLHRGRVGMRGERAGP
394-416	KEKKKADEERRRQRKLRRALVKN
514-517	KRIK

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSASPAGPPSGPPSNTSNGVVQRKRAKANPFVVKKKPLQKKEPLRKPNGITSGPGAITQSSTAGTVADPDDDPSTFTEYPLVASKKSILQSLRHHAMRLNSEQEVNPYDTSQFTRPMRLHRRFPRDQKNDIVPENGIDDKEREREEIRRAERQAQKEANQAQIAPTDKNQQKKKLPNFKKKVEDVYYPQDTPEAQKRAKLRYEEGRHWHLEDFDGKNTWIGTYEEPLSENHAMFVLDTNGSFRMVPLEKWYRFQPTGRYKTMDLDEAEKHMAQKIKSSRWFLENAMSDDQRKRVEAERAARLHRGRVGMRGERAGPRRADDEEAEAPELAEDADEIDFDAEDEFQDDDEGKLFGGDDDDVKESEKKIRQEMLGANIFAGTGVKEEKDWDAEEEKEKKKADEERRRQRKLRRALVKNERKFEYESESDHPYSEESEDEESADLTKEEDIKKEGEKNGKVNGDVPMSGTSSVGTNTPSGRTEKHSDQSRSKHAAASLKRPGSPNLSEASGSESSRKRIKKEANGSFPRPMSPSIEGSAAALRRRGAGSGSDTEASGTERSRPKIKISASRGGSPTTSAPASRPGSPPPRPASAVPPSALSLPDPEEVRAAIPPEGITVHELAHIFKKHIPKKNKDAQVAFINIVKQVGRTVKDGDKSYIIRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.39
3	0.4
4	0.39
5	0.4
6	0.49
7	0.5
8	0.53
9	0.57
10	0.61
11	0.66
12	0.67
13	0.66
14	0.66
15	0.72
16	0.75
17	0.75
18	0.77
19	0.78
20	0.79
21	0.8
22	0.81
23	0.81
24	0.81
25	0.8
26	0.82
27	0.86
28	0.89
29	0.91
30	0.91
31	0.89
32	0.88
33	0.84
34	0.82
35	0.79
36	0.69
37	0.61
38	0.53
39	0.49
40	0.41
41	0.35
42	0.27
43	0.2
44	0.19
45	0.16
46	0.14
47	0.1
48	0.1
49	0.09
50	0.09
51	0.08
52	0.09
53	0.1
54	0.11
55	0.11
56	0.12
57	0.14
58	0.13
59	0.14
60	0.14
61	0.2
62	0.18
63	0.18
64	0.19
65	0.17
66	0.19
67	0.25
68	0.26
69	0.2
70	0.21
71	0.23
72	0.26
73	0.28
74	0.31
75	0.27
76	0.32
77	0.4
78	0.48
79	0.54
80	0.5
81	0.49
82	0.47
83	0.49
84	0.48
85	0.46
86	0.41
87	0.34
88	0.35
89	0.35
90	0.35
91	0.33
92	0.29
93	0.24
94	0.21
95	0.2
96	0.2
97	0.23
98	0.22
99	0.26
100	0.25
101	0.32
102	0.34
103	0.44
104	0.52
105	0.57
106	0.64
107	0.67
108	0.75
109	0.77
110	0.85
111	0.86
112	0.83
113	0.8
114	0.78
115	0.77
116	0.73
117	0.65
118	0.57
119	0.46
120	0.39
121	0.36
122	0.29
123	0.21
124	0.16
125	0.16
126	0.17
127	0.21
128	0.22
129	0.22
130	0.24
131	0.29
132	0.36
133	0.43
134	0.45
135	0.48
136	0.51
137	0.57
138	0.62
139	0.61
140	0.63
141	0.59
142	0.57
143	0.57
144	0.57
145	0.52
146	0.46
147	0.41
148	0.32
149	0.31
150	0.3
151	0.23
152	0.22
153	0.26
154	0.29
155	0.38
156	0.44
157	0.49
158	0.56
159	0.65
160	0.74
161	0.75
162	0.83
163	0.85
164	0.87
165	0.87
166	0.87
167	0.81
168	0.79
169	0.73
170	0.68
171	0.63
172	0.62
173	0.57
174	0.48
175	0.43
176	0.36
177	0.31
178	0.29
179	0.32
180	0.31
181	0.27
182	0.31
183	0.36
184	0.42
185	0.47
186	0.46
187	0.44
188	0.47
189	0.54
190	0.58
191	0.6
192	0.58
193	0.54
194	0.52
195	0.47
196	0.37
197	0.32
198	0.3
199	0.26
200	0.22
201	0.21
202	0.2
203	0.19
204	0.19
205	0.16
206	0.13
207	0.12
208	0.11
209	0.12
210	0.13
211	0.13
212	0.13
213	0.14
214	0.17
215	0.17
216	0.16
217	0.13
218	0.12
219	0.12
220	0.11
221	0.12
222	0.08
223	0.07
224	0.07
225	0.08
226	0.08
227	0.08
228	0.08
229	0.07
230	0.11
231	0.12
232	0.12
233	0.18
234	0.26
235	0.27
236	0.29
237	0.31
238	0.33
239	0.34
240	0.36
241	0.39
242	0.41
243	0.47
244	0.48
245	0.48
246	0.43
247	0.45
248	0.44
249	0.38
250	0.28
251	0.25
252	0.22
253	0.21
254	0.22
255	0.18
256	0.16
257	0.16
258	0.19
259	0.15
260	0.21
261	0.25
262	0.32
263	0.37
264	0.41
265	0.39
266	0.39
267	0.41
268	0.35
269	0.35
270	0.31
271	0.28
272	0.27
273	0.26
274	0.25
275	0.25
276	0.27
277	0.21
278	0.19
279	0.18
280	0.2
281	0.26
282	0.29
283	0.33
284	0.37
285	0.39
286	0.41
287	0.43
288	0.39
289	0.35
290	0.32
291	0.31
292	0.24
293	0.26
294	0.3
295	0.28
296	0.29
297	0.28
298	0.27
299	0.29
300	0.31
301	0.31
302	0.26
303	0.24
304	0.25
305	0.25
306	0.25
307	0.2
308	0.21
309	0.18
310	0.18
311	0.17
312	0.15
313	0.13
314	0.11
315	0.1
316	0.05
317	0.04
318	0.03
319	0.03
320	0.03
321	0.03
322	0.03
323	0.03
324	0.03
325	0.03
326	0.04
327	0.03
328	0.03
329	0.04
330	0.04
331	0.04
332	0.04
333	0.05
334	0.05
335	0.05
336	0.05
337	0.04
338	0.04
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.05
343	0.04
344	0.06
345	0.07
346	0.07
347	0.08
348	0.09
349	0.1
350	0.16
351	0.21
352	0.21
353	0.24
354	0.27
355	0.27
356	0.3
357	0.31
358	0.3
359	0.27
360	0.25
361	0.21
362	0.18
363	0.17
364	0.13
365	0.11
366	0.05
367	0.04
368	0.04
369	0.05
370	0.05
371	0.06
372	0.07
373	0.09
374	0.09
375	0.11
376	0.13
377	0.14
378	0.2
379	0.27
380	0.28
381	0.31
382	0.32
383	0.3
384	0.33
385	0.41
386	0.47
387	0.5
388	0.59
389	0.66
390	0.76
391	0.83
392	0.85
393	0.84
394	0.83
395	0.82
396	0.82
397	0.81
398	0.78
399	0.81
400	0.85
401	0.86
402	0.83
403	0.78
404	0.7
405	0.62
406	0.56
407	0.48
408	0.44
409	0.35
410	0.32
411	0.29
412	0.31
413	0.29
414	0.27
415	0.25
416	0.19
417	0.18
418	0.15
419	0.12
420	0.09
421	0.11
422	0.11
423	0.11
424	0.1
425	0.09
426	0.09
427	0.09
428	0.07
429	0.06
430	0.07
431	0.11
432	0.12
433	0.13
434	0.15
435	0.16
436	0.19
437	0.25
438	0.29
439	0.34
440	0.37
441	0.38
442	0.43
443	0.42
444	0.4
445	0.36
446	0.34
447	0.27
448	0.23
449	0.21
450	0.16
451	0.15
452	0.15
453	0.13
454	0.1
455	0.09
456	0.09
457	0.08
458	0.08
459	0.09
460	0.09
461	0.11
462	0.13
463	0.15
464	0.17
465	0.22
466	0.27
467	0.32
468	0.39
469	0.46
470	0.51
471	0.57
472	0.62
473	0.65
474	0.65
475	0.6
476	0.54
477	0.49
478	0.51
479	0.47
480	0.49
481	0.49
482	0.46
483	0.48
484	0.47
485	0.46
486	0.44
487	0.41
488	0.35
489	0.28
490	0.26
491	0.24
492	0.22
493	0.25
494	0.21
495	0.19
496	0.23
497	0.24
498	0.27
499	0.35
500	0.39
501	0.37
502	0.45
503	0.54
504	0.58
505	0.66
506	0.71
507	0.74
508	0.78
509	0.78
510	0.75
511	0.66
512	0.58
513	0.49
514	0.41
515	0.35
516	0.31
517	0.29
518	0.24
519	0.24
520	0.22
521	0.21
522	0.23
523	0.21
524	0.19
525	0.18
526	0.17
527	0.18
528	0.19
529	0.18
530	0.16
531	0.17
532	0.2
533	0.22
534	0.24
535	0.22
536	0.21
537	0.21
538	0.2
539	0.19
540	0.15
541	0.13
542	0.18
543	0.23
544	0.28
545	0.34
546	0.36
547	0.4
548	0.46
549	0.53
550	0.55
551	0.57
552	0.62
553	0.59
554	0.62
555	0.58
556	0.52
557	0.46
558	0.38
559	0.32
560	0.27
561	0.24
562	0.19
563	0.19
564	0.25
565	0.27
566	0.29
567	0.31
568	0.35
569	0.43
570	0.49
571	0.56
572	0.52
573	0.55
574	0.54
575	0.53
576	0.53
577	0.51
578	0.5
579	0.42
580	0.39
581	0.35
582	0.32
583	0.31
584	0.23
585	0.18
586	0.17
587	0.2
588	0.19
589	0.18
590	0.18
591	0.18
592	0.18
593	0.18
594	0.17
595	0.14
596	0.14
597	0.13
598	0.13
599	0.13
600	0.13
601	0.13
602	0.12
603	0.11
604	0.13
605	0.14
606	0.15
607	0.21
608	0.22
609	0.23
610	0.27
611	0.37
612	0.44
613	0.53
614	0.62
615	0.65
616	0.73
617	0.81
618	0.85
619	0.84
620	0.79
621	0.75
622	0.73
623	0.67
624	0.58
625	0.5
626	0.42
627	0.33
628	0.31
629	0.25
630	0.18
631	0.2
632	0.24
633	0.24
634	0.26
635	0.32
636	0.36
637	0.43
638	0.46
639	0.44
640	0.45

A0A2K1QKY1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer