FuNGI

A0A2K1QJ44

Protein Details

Accession

A0A2K1QJ44

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
5-42	TMKVDTPEKSKKTRERLDNSSSKKRRREREEQSQSGHV	Hydrophilic
51-75	AEESSTPKPSKKRRKSEEAKVNGAG	Hydrophilic
97-119	QPATLQNLKKKQRKSDKDESISE	Hydrophilic
121-145	LSEDAPKDVRKKKTRSKDNGVGPEQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
15-32	KKTRERLDNSSSKKRRRE
58-66	KPSKKRRKS
131-133	KKK
496-501	RDKGKR

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 13.5, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB

Amino Acid Sequences

MSNDTMKVDTPEKSKKTRERLDNSSSKKRRREREEQSQSGHVQEPADSKHAEESSTPKPSKKRRKSEEAKVNGAGNLTTSSPTKDIKGSKAVDSAEQPATLQNLKKKQRKSDKDESISELLSEDAPKDVRKKKTRSKDNGVGPEQRAQSPSIAVPSTPEPEITIASSSTAYLNKGQIQANTPFVHETTSLLLPLAPSSFDFPIQGLCAEHLSPHLLTYYAPLDGILLSYSRPRLGNTGTSDPTYVKAPQAARQPPTSRSPSPAPSDISQPLSTAASDISMDLVINGAVQKDEEGNVVRTHVPHRAYSGPLALATVVDEYNTPFVWLTADFVLLRPQRGVYLQGVVQVQNPSWLGLVCWNYFNAGIPRRRLPQSWRWVDTARRKRVPATADGEAMDVEAHEGEEEQEQEQEQEQEQELAEGEDGMEVDREGVVVDATEGFWVDEAGRKVQGMLEFRLVDFESAPSTERERGFVSFTGTLLSEEEDRKVDSEEKDRGRDKGKRAVRGVE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.61
2	0.67
3	0.74
4	0.79
5	0.82
6	0.81
7	0.83
8	0.85
9	0.84
10	0.83
11	0.84
12	0.83
13	0.82
14	0.84
15	0.85
16	0.85
17	0.85
18	0.87
19	0.87
20	0.88
21	0.9
22	0.87
23	0.83
24	0.78
25	0.7
26	0.63
27	0.55
28	0.45
29	0.35
30	0.3
31	0.29
32	0.26
33	0.28
34	0.24
35	0.23
36	0.27
37	0.27
38	0.25
39	0.23
40	0.26
41	0.3
42	0.39
43	0.41
44	0.4
45	0.5
46	0.6
47	0.69
48	0.74
49	0.77
50	0.77
51	0.87
52	0.9
53	0.92
54	0.92
55	0.88
56	0.84
57	0.76
58	0.68
59	0.57
60	0.48
61	0.37
62	0.27
63	0.2
64	0.14
65	0.13
66	0.12
67	0.13
68	0.16
69	0.17
70	0.18
71	0.23
72	0.27
73	0.3
74	0.37
75	0.38
76	0.38
77	0.41
78	0.4
79	0.36
80	0.34
81	0.34
82	0.27
83	0.24
84	0.22
85	0.18
86	0.2
87	0.21
88	0.23
89	0.26
90	0.34
91	0.44
92	0.52
93	0.58
94	0.66
95	0.73
96	0.8
97	0.82
98	0.83
99	0.84
100	0.83
101	0.79
102	0.74
103	0.65
104	0.55
105	0.45
106	0.34
107	0.24
108	0.18
109	0.15
110	0.1
111	0.09
112	0.1
113	0.12
114	0.2
115	0.28
116	0.37
117	0.47
118	0.56
119	0.64
120	0.74
121	0.83
122	0.85
123	0.87
124	0.86
125	0.85
126	0.85
127	0.8
128	0.75
129	0.66
130	0.63
131	0.54
132	0.47
133	0.39
134	0.31
135	0.26
136	0.21
137	0.2
138	0.16
139	0.15
140	0.13
141	0.14
142	0.15
143	0.16
144	0.15
145	0.14
146	0.12
147	0.13
148	0.14
149	0.12
150	0.11
151	0.08
152	0.09
153	0.09
154	0.08
155	0.09
156	0.09
157	0.1
158	0.11
159	0.13
160	0.15
161	0.19
162	0.2
163	0.2
164	0.23
165	0.25
166	0.27
167	0.26
168	0.23
169	0.2
170	0.19
171	0.18
172	0.14
173	0.13
174	0.11
175	0.11
176	0.1
177	0.1
178	0.1
179	0.08
180	0.09
181	0.08
182	0.05
183	0.05
184	0.08
185	0.08
186	0.08
187	0.09
188	0.08
189	0.09
190	0.09
191	0.09
192	0.07
193	0.07
194	0.07
195	0.07
196	0.07
197	0.07
198	0.08
199	0.08
200	0.08
201	0.07
202	0.07
203	0.07
204	0.08
205	0.09
206	0.07
207	0.07
208	0.06
209	0.06
210	0.06
211	0.06
212	0.05
213	0.04
214	0.04
215	0.06
216	0.07
217	0.08
218	0.08
219	0.09
220	0.11
221	0.13
222	0.18
223	0.2
224	0.24
225	0.24
226	0.24
227	0.24
228	0.22
229	0.21
230	0.18
231	0.15
232	0.1
233	0.13
234	0.14
235	0.18
236	0.26
237	0.29
238	0.29
239	0.33
240	0.36
241	0.35
242	0.39
243	0.4
244	0.33
245	0.34
246	0.35
247	0.35
248	0.36
249	0.35
250	0.32
251	0.28
252	0.3
253	0.28
254	0.27
255	0.23
256	0.19
257	0.18
258	0.15
259	0.14
260	0.1
261	0.08
262	0.06
263	0.05
264	0.05
265	0.05
266	0.04
267	0.04
268	0.04
269	0.04
270	0.03
271	0.03
272	0.04
273	0.03
274	0.03
275	0.03
276	0.04
277	0.04
278	0.05
279	0.06
280	0.07
281	0.09
282	0.09
283	0.11
284	0.11
285	0.12
286	0.14
287	0.18
288	0.18
289	0.17
290	0.2
291	0.21
292	0.22
293	0.22
294	0.21
295	0.16
296	0.14
297	0.14
298	0.1
299	0.08
300	0.07
301	0.06
302	0.05
303	0.05
304	0.05
305	0.05
306	0.07
307	0.06
308	0.07
309	0.06
310	0.06
311	0.07
312	0.07
313	0.08
314	0.07
315	0.08
316	0.08
317	0.08
318	0.15
319	0.15
320	0.16
321	0.15
322	0.14
323	0.15
324	0.15
325	0.18
326	0.12
327	0.14
328	0.13
329	0.16
330	0.17
331	0.16
332	0.18
333	0.16
334	0.15
335	0.15
336	0.15
337	0.11
338	0.11
339	0.1
340	0.08
341	0.12
342	0.15
343	0.14
344	0.14
345	0.14
346	0.14
347	0.14
348	0.17
349	0.18
350	0.22
351	0.26
352	0.29
353	0.34
354	0.39
355	0.42
356	0.43
357	0.45
358	0.48
359	0.54
360	0.58
361	0.57
362	0.55
363	0.57
364	0.61
365	0.65
366	0.65
367	0.65
368	0.62
369	0.61
370	0.61
371	0.62
372	0.58
373	0.54
374	0.5
375	0.42
376	0.38
377	0.36
378	0.33
379	0.26
380	0.22
381	0.15
382	0.08
383	0.06
384	0.05
385	0.04
386	0.04
387	0.04
388	0.05
389	0.07
390	0.08
391	0.08
392	0.09
393	0.09
394	0.1
395	0.12
396	0.13
397	0.12
398	0.14
399	0.14
400	0.14
401	0.14
402	0.14
403	0.12
404	0.11
405	0.1
406	0.07
407	0.07
408	0.06
409	0.06
410	0.05
411	0.05
412	0.05
413	0.05
414	0.05
415	0.05
416	0.05
417	0.05
418	0.04
419	0.04
420	0.05
421	0.05
422	0.05
423	0.05
424	0.05
425	0.05
426	0.05
427	0.06
428	0.06
429	0.1
430	0.13
431	0.15
432	0.15
433	0.15
434	0.16
435	0.19
436	0.23
437	0.22
438	0.23
439	0.26
440	0.26
441	0.26
442	0.28
443	0.26
444	0.21
445	0.18
446	0.16
447	0.13
448	0.13
449	0.14
450	0.14
451	0.17
452	0.23
453	0.23
454	0.25
455	0.25
456	0.26
457	0.29
458	0.28
459	0.29
460	0.24
461	0.24
462	0.22
463	0.2
464	0.19
465	0.16
466	0.17
467	0.15
468	0.16
469	0.18
470	0.18
471	0.19
472	0.19
473	0.22
474	0.26
475	0.27
476	0.33
477	0.4
478	0.45
479	0.52
480	0.55
481	0.57
482	0.61
483	0.64
484	0.64
485	0.65
486	0.67
487	0.68

A0A2K1QJ44

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer