FuNGI

Q2UTR1

Protein Details

Accession

Q2UTR1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-31	MRAKWRKKRVRRLKRKRRKMRARSDQYVLFN	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
3-23	AKWRKKRVRRLKRKRRKMRAR
465-494	KGGKAEANARRVARLRVPVEFPKVSRGGKR

Subcellular Location(s)

mito 20, nucl 4, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007836 Ribosomal_L41 IPR009668 RNA_pol-assoc_fac_A49-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:1990904 C:ribonucleoprotein complex GO:0005840 C:ribosome GO:0003677 F:DNA binding GO:0003735 F:structural constituent of ribosome GO:0006351 P:DNA-templated transcription GO:0006412 P:translation
Pfam	View protein in Pfam PF05162 Ribosomal_L41 PF06870 RNA_pol_I_A49

Amino Acid Sequences

MRAKWRKKRVRRLKRKRRKMRARSDQYVLFNCWTILAISVYRKLIAPLVTTPGVNVPQNLHLKPYLKDRADGSLSGRSTRNKGIVSSELLLQTSEHPKMDFVGREAEDDADSQLKHYIAVVDPEKKSWQFVEVRKVTLRGAVRRTKAAADEEEEVESEDEEMKTMRAQRTELTNTFGTKQSRKAAQSMAENAQLSNAPAGAASAAESAILSSMPLDSATDIATKTAAVQAQVQANKPLPQANLAASHPSDVYPIDVLVPGGLSTLQQLPGTNEWQETVNSGEAVATTSRYVSRRVEAVVNSTNATQLQVLRFIFLLLELARALRSGKDSKSSGPGSKRLPPRDELRRILSSPTGAKTDSAETLPDPVIDAIRRKFAPQGTHITKNDITFLHTTICALSLHIPPQPAKDGGSSSLGGNAPNELATDPSDLRDDLRLDNTVITQYFRELGCRVDKPRETEFAKWGIKGGKAEANARRVARLRVPVEFPKVSRGGKR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.97
2	0.98
3	0.98
4	0.98
5	0.98
6	0.97
7	0.97
8	0.97
9	0.96
10	0.92
11	0.87
12	0.83
13	0.78
14	0.72
15	0.64
16	0.55
17	0.45
18	0.37
19	0.31
20	0.24
21	0.17
22	0.14
23	0.12
24	0.13
25	0.16
26	0.2
27	0.2
28	0.21
29	0.21
30	0.2
31	0.22
32	0.21
33	0.2
34	0.18
35	0.23
36	0.23
37	0.23
38	0.22
39	0.22
40	0.24
41	0.22
42	0.21
43	0.18
44	0.25
45	0.31
46	0.31
47	0.31
48	0.32
49	0.34
50	0.36
51	0.43
52	0.45
53	0.4
54	0.43
55	0.41
56	0.43
57	0.43
58	0.42
59	0.36
60	0.33
61	0.33
62	0.33
63	0.35
64	0.32
65	0.33
66	0.37
67	0.39
68	0.33
69	0.33
70	0.35
71	0.35
72	0.35
73	0.32
74	0.3
75	0.25
76	0.24
77	0.23
78	0.18
79	0.19
80	0.21
81	0.21
82	0.19
83	0.19
84	0.19
85	0.21
86	0.25
87	0.22
88	0.18
89	0.23
90	0.23
91	0.24
92	0.25
93	0.23
94	0.19
95	0.18
96	0.17
97	0.13
98	0.12
99	0.12
100	0.13
101	0.12
102	0.12
103	0.12
104	0.13
105	0.11
106	0.17
107	0.2
108	0.24
109	0.25
110	0.27
111	0.3
112	0.28
113	0.29
114	0.25
115	0.27
116	0.28
117	0.33
118	0.41
119	0.4
120	0.43
121	0.43
122	0.43
123	0.37
124	0.35
125	0.35
126	0.31
127	0.37
128	0.4
129	0.41
130	0.43
131	0.44
132	0.4
133	0.37
134	0.35
135	0.29
136	0.24
137	0.25
138	0.23
139	0.21
140	0.2
141	0.18
142	0.14
143	0.12
144	0.09
145	0.08
146	0.07
147	0.07
148	0.07
149	0.07
150	0.09
151	0.14
152	0.17
153	0.17
154	0.18
155	0.2
156	0.27
157	0.32
158	0.31
159	0.3
160	0.29
161	0.28
162	0.29
163	0.32
164	0.29
165	0.26
166	0.3
167	0.32
168	0.36
169	0.36
170	0.38
171	0.36
172	0.36
173	0.37
174	0.37
175	0.33
176	0.3
177	0.29
178	0.25
179	0.22
180	0.18
181	0.15
182	0.1
183	0.08
184	0.05
185	0.04
186	0.05
187	0.04
188	0.03
189	0.04
190	0.04
191	0.03
192	0.03
193	0.03
194	0.03
195	0.03
196	0.03
197	0.03
198	0.03
199	0.03
200	0.03
201	0.03
202	0.03
203	0.03
204	0.04
205	0.05
206	0.05
207	0.05
208	0.05
209	0.05
210	0.05
211	0.05
212	0.07
213	0.07
214	0.07
215	0.08
216	0.1
217	0.14
218	0.16
219	0.16
220	0.17
221	0.17
222	0.19
223	0.19
224	0.19
225	0.15
226	0.15
227	0.16
228	0.15
229	0.16
230	0.14
231	0.15
232	0.12
233	0.13
234	0.11
235	0.1
236	0.09
237	0.07
238	0.07
239	0.05
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.05
244	0.04
245	0.04
246	0.03
247	0.03
248	0.03
249	0.03
250	0.04
251	0.05
252	0.06
253	0.06
254	0.07
255	0.09
256	0.1
257	0.12
258	0.11
259	0.11
260	0.11
261	0.11
262	0.11
263	0.1
264	0.1
265	0.09
266	0.08
267	0.08
268	0.07
269	0.06
270	0.07
271	0.06
272	0.05
273	0.05
274	0.06
275	0.09
276	0.1
277	0.13
278	0.13
279	0.15
280	0.16
281	0.18
282	0.2
283	0.18
284	0.22
285	0.22
286	0.21
287	0.2
288	0.19
289	0.18
290	0.14
291	0.14
292	0.11
293	0.09
294	0.09
295	0.12
296	0.12
297	0.12
298	0.12
299	0.12
300	0.1
301	0.09
302	0.09
303	0.05
304	0.06
305	0.05
306	0.06
307	0.06
308	0.06
309	0.07
310	0.06
311	0.11
312	0.14
313	0.15
314	0.21
315	0.22
316	0.24
317	0.31
318	0.33
319	0.35
320	0.36
321	0.4
322	0.39
323	0.46
324	0.52
325	0.52
326	0.52
327	0.51
328	0.54
329	0.59
330	0.62
331	0.59
332	0.57
333	0.54
334	0.52
335	0.5
336	0.43
337	0.36
338	0.31
339	0.28
340	0.24
341	0.2
342	0.2
343	0.19
344	0.19
345	0.18
346	0.15
347	0.14
348	0.13
349	0.15
350	0.15
351	0.13
352	0.11
353	0.1
354	0.11
355	0.13
356	0.18
357	0.16
358	0.22
359	0.22
360	0.23
361	0.27
362	0.3
363	0.33
364	0.33
365	0.42
366	0.43
367	0.51
368	0.5
369	0.51
370	0.49
371	0.44
372	0.42
373	0.32
374	0.29
375	0.22
376	0.23
377	0.19
378	0.17
379	0.16
380	0.14
381	0.14
382	0.11
383	0.1
384	0.13
385	0.13
386	0.16
387	0.17
388	0.2
389	0.2
390	0.23
391	0.26
392	0.23
393	0.22
394	0.22
395	0.22
396	0.22
397	0.24
398	0.21
399	0.18
400	0.21
401	0.2
402	0.18
403	0.17
404	0.15
405	0.12
406	0.12
407	0.12
408	0.08
409	0.09
410	0.1
411	0.13
412	0.12
413	0.13
414	0.15
415	0.15
416	0.16
417	0.19
418	0.19
419	0.19
420	0.21
421	0.22
422	0.21
423	0.22
424	0.21
425	0.2
426	0.19
427	0.18
428	0.16
429	0.15
430	0.18
431	0.17
432	0.19
433	0.17
434	0.2
435	0.26
436	0.32
437	0.35
438	0.42
439	0.46
440	0.49
441	0.54
442	0.58
443	0.55
444	0.54
445	0.54
446	0.53
447	0.52
448	0.46
449	0.45
450	0.41
451	0.4
452	0.38
453	0.37
454	0.33
455	0.33
456	0.41
457	0.43
458	0.44
459	0.46
460	0.45
461	0.47
462	0.45
463	0.48
464	0.47
465	0.5
466	0.48
467	0.48
468	0.54
469	0.54
470	0.58
471	0.57
472	0.51
473	0.49
474	0.52

Q2UTR1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer