Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R2S3

Protein Details
Accession C4R2S3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-38HIKQHGRRLDHDEKKRKKAAREGHRIAKDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
20-80HDEKKRKKAAREGHRIAKDAQNLKGWKGKMFAKKRYSEKVEMKKKIKAHEESKIKGPSKPK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12, cyto 7.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039411  NSA2_fam  
IPR022309  Ribosomal_S8e/biogenesis_NSA2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG ppa:PAS_chr2-2_0129  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01201  Ribosomal_S8e  
CDD cd11381  NSA2  
Amino Acid Sequences MPQNEYIEQHIKQHGRRLDHDEKKRKKAAREGHRIAKDAQNLKGWKGKMFAKKRYSEKVEMKKKIKAHEESKIKGPSKPKEDDGEALPTYLLDRQTTNTAKAISSSIKQKRLEKASKFQVPLPKVRGITEEEMFKVIKTGKSKSKSWKRMITKHTFVGEGFTRNPVKMERIIRPSALRQKKANVTHPELGVTVFLPILAVKKNPQSPMYTKLGVLTKGTIIEVNVSDLGLVTAGGKVVWGKYAQITNEPDRDGCVNAVLLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.51
3 0.56
4 0.6
5 0.63
6 0.66
7 0.74
8 0.76
9 0.79
10 0.83
11 0.86
12 0.83
13 0.81
14 0.81
15 0.81
16 0.81
17 0.82
18 0.81
19 0.82
20 0.8
21 0.74
22 0.67
23 0.63
24 0.6
25 0.54
26 0.49
27 0.47
28 0.44
29 0.44
30 0.47
31 0.42
32 0.36
33 0.36
34 0.4
35 0.42
36 0.5
37 0.56
38 0.59
39 0.66
40 0.7
41 0.75
42 0.75
43 0.74
44 0.75
45 0.76
46 0.78
47 0.79
48 0.77
49 0.74
50 0.71
51 0.7
52 0.68
53 0.66
54 0.62
55 0.62
56 0.66
57 0.62
58 0.65
59 0.66
60 0.58
61 0.54
62 0.56
63 0.55
64 0.54
65 0.55
66 0.51
67 0.47
68 0.48
69 0.46
70 0.4
71 0.37
72 0.3
73 0.26
74 0.22
75 0.17
76 0.15
77 0.15
78 0.13
79 0.08
80 0.09
81 0.1
82 0.17
83 0.19
84 0.2
85 0.19
86 0.19
87 0.18
88 0.19
89 0.19
90 0.15
91 0.16
92 0.24
93 0.28
94 0.34
95 0.37
96 0.42
97 0.47
98 0.54
99 0.6
100 0.56
101 0.58
102 0.59
103 0.62
104 0.58
105 0.54
106 0.52
107 0.46
108 0.46
109 0.42
110 0.38
111 0.33
112 0.32
113 0.3
114 0.26
115 0.26
116 0.23
117 0.19
118 0.16
119 0.16
120 0.16
121 0.13
122 0.12
123 0.11
124 0.13
125 0.15
126 0.19
127 0.26
128 0.31
129 0.36
130 0.45
131 0.54
132 0.6
133 0.65
134 0.7
135 0.7
136 0.75
137 0.78
138 0.76
139 0.7
140 0.64
141 0.58
142 0.49
143 0.41
144 0.36
145 0.28
146 0.22
147 0.19
148 0.19
149 0.19
150 0.18
151 0.19
152 0.17
153 0.18
154 0.22
155 0.26
156 0.28
157 0.33
158 0.35
159 0.35
160 0.37
161 0.41
162 0.46
163 0.49
164 0.47
165 0.44
166 0.49
167 0.56
168 0.6
169 0.62
170 0.59
171 0.58
172 0.57
173 0.54
174 0.48
175 0.4
176 0.34
177 0.25
178 0.17
179 0.11
180 0.07
181 0.06
182 0.05
183 0.05
184 0.06
185 0.08
186 0.09
187 0.12
188 0.19
189 0.23
190 0.27
191 0.29
192 0.33
193 0.36
194 0.41
195 0.43
196 0.38
197 0.34
198 0.35
199 0.36
200 0.32
201 0.29
202 0.24
203 0.19
204 0.18
205 0.19
206 0.15
207 0.11
208 0.13
209 0.12
210 0.12
211 0.11
212 0.1
213 0.1
214 0.09
215 0.09
216 0.06
217 0.06
218 0.04
219 0.04
220 0.05
221 0.04
222 0.05
223 0.06
224 0.06
225 0.09
226 0.09
227 0.1
228 0.14
229 0.19
230 0.21
231 0.26
232 0.32
233 0.36
234 0.4
235 0.4
236 0.36
237 0.35
238 0.35
239 0.3
240 0.25
241 0.2