Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q2UPX4

Protein Details
Accession Q2UPX4    Localization Confidence High Confidence Score 16.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-27IERWQKQHGKRLDHDERVRKRQAREBasic
130-152KVVNTGKKTHKKSWKRMITKPTFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
51-61HAEKIQMRKRI
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039411  NSA2_fam  
IPR022309  Ribosomal_S8e/biogenesis_NSA2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF01201  Ribosomal_S8e  
CDD cd11381  NSA2  
Amino Acid Sequences MYIERWQKQHGKRLDHDERVRKRQAREAHQQSKDAQNLRGLRAKLYQQKRHAEKIQMRKRIKAQEEKNVKSSAPDEPSKTPLPQYLLDRSQATNAKALSSAIKDKRKEQAAKFAVPLPKVKGISEEEMFKVVNTGKKTHKKSWKRMITKPTFVGNDFTRVNPKRERFIRPMGLRYKKANVTHPELGVTVQLPIISVKKNPQNPLYTSLGVLTKGTIVEVNVSELGLVTTSGRVVWGKYAQISNNPENDGCVNAVLLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.78
3 0.8
4 0.81
5 0.82
6 0.82
7 0.85
8 0.81
9 0.76
10 0.74
11 0.75
12 0.73
13 0.74
14 0.76
15 0.77
16 0.74
17 0.73
18 0.68
19 0.67
20 0.65
21 0.57
22 0.49
23 0.46
24 0.45
25 0.46
26 0.49
27 0.41
28 0.37
29 0.38
30 0.43
31 0.46
32 0.52
33 0.57
34 0.58
35 0.68
36 0.71
37 0.75
38 0.74
39 0.74
40 0.73
41 0.75
42 0.76
43 0.76
44 0.73
45 0.71
46 0.72
47 0.72
48 0.71
49 0.7
50 0.68
51 0.68
52 0.75
53 0.72
54 0.69
55 0.61
56 0.52
57 0.44
58 0.39
59 0.35
60 0.3
61 0.3
62 0.29
63 0.3
64 0.35
65 0.35
66 0.34
67 0.3
68 0.27
69 0.28
70 0.27
71 0.29
72 0.3
73 0.3
74 0.31
75 0.31
76 0.28
77 0.3
78 0.3
79 0.27
80 0.24
81 0.22
82 0.2
83 0.18
84 0.18
85 0.15
86 0.14
87 0.2
88 0.24
89 0.31
90 0.32
91 0.35
92 0.42
93 0.48
94 0.52
95 0.47
96 0.51
97 0.48
98 0.48
99 0.46
100 0.44
101 0.39
102 0.34
103 0.33
104 0.25
105 0.25
106 0.24
107 0.23
108 0.21
109 0.2
110 0.22
111 0.21
112 0.2
113 0.16
114 0.17
115 0.16
116 0.13
117 0.12
118 0.1
119 0.13
120 0.13
121 0.17
122 0.24
123 0.33
124 0.4
125 0.48
126 0.56
127 0.63
128 0.71
129 0.78
130 0.8
131 0.79
132 0.8
133 0.82
134 0.79
135 0.74
136 0.66
137 0.6
138 0.51
139 0.45
140 0.41
141 0.31
142 0.29
143 0.25
144 0.23
145 0.27
146 0.28
147 0.32
148 0.36
149 0.38
150 0.42
151 0.47
152 0.53
153 0.5
154 0.56
155 0.6
156 0.56
157 0.61
158 0.62
159 0.63
160 0.6
161 0.57
162 0.56
163 0.52
164 0.52
165 0.53
166 0.49
167 0.5
168 0.5
169 0.46
170 0.41
171 0.35
172 0.32
173 0.24
174 0.18
175 0.11
176 0.08
177 0.07
178 0.06
179 0.07
180 0.09
181 0.1
182 0.12
183 0.18
184 0.26
185 0.32
186 0.37
187 0.41
188 0.45
189 0.46
190 0.5
191 0.48
192 0.41
193 0.36
194 0.33
195 0.28
196 0.23
197 0.2
198 0.15
199 0.1
200 0.1
201 0.1
202 0.08
203 0.07
204 0.09
205 0.09
206 0.11
207 0.1
208 0.1
209 0.1
210 0.09
211 0.09
212 0.07
213 0.06
214 0.05
215 0.05
216 0.06
217 0.06
218 0.07
219 0.08
220 0.09
221 0.13
222 0.16
223 0.17
224 0.22
225 0.26
226 0.27
227 0.34
228 0.41
229 0.41
230 0.43
231 0.43
232 0.39
233 0.38
234 0.36
235 0.3
236 0.24
237 0.18