Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A162JSK1

Protein Details
Accession A0A162JSK1    Localization Confidence High Confidence Score 20.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
113-137AAPVEEKKERKKRTHDPNAPKRPLTBasic
251-272DEAKTPKKAAPRKRKTATPAADHydrophilic
276-305TETAKATPASPDKKRRRTSTKPAEEEPKKSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
119-127KKERKKRTH
255-265TPKKAAPRKRK
286-313PDKKRRRTSTKPAEEEPKKSGRKKTKSS
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 11.5, cyto_mito 7.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MPRQTKKADDKKVAVAPAPTMIPAPTAGIIPQPPIPIGVPQRVVDNESFLRVRDSAVGRLTTILELLRSFTQDYIRQTNLLLGMPTAEGQGDLLSSFETAAAQLMMPVTGEIAAPVEEKKERKKRTHDPNAPKRPLTPYFLYMQHARSIIANDLGSEAPKGAVQEEGQRRWANMSPNEKKGWNTAYQYNLRLYNARVHSYKNGNPLAKNMSDEEALKYADEFQIPMPSIKDEPAQEAPANDQDAIAEQLQDEAKTPKKAAPRKRKTATPAADTTITETAKATPASPDKKRRRTSTKPAEEEPKKSGRKKTKSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.5
3 0.42
4 0.35
5 0.31
6 0.23
7 0.18
8 0.15
9 0.13
10 0.12
11 0.12
12 0.1
13 0.1
14 0.1
15 0.12
16 0.13
17 0.14
18 0.16
19 0.16
20 0.15
21 0.16
22 0.17
23 0.2
24 0.24
25 0.27
26 0.28
27 0.27
28 0.31
29 0.3
30 0.32
31 0.27
32 0.27
33 0.23
34 0.24
35 0.24
36 0.2
37 0.22
38 0.19
39 0.2
40 0.2
41 0.22
42 0.22
43 0.25
44 0.25
45 0.22
46 0.23
47 0.23
48 0.17
49 0.15
50 0.11
51 0.09
52 0.08
53 0.11
54 0.1
55 0.11
56 0.12
57 0.12
58 0.16
59 0.2
60 0.25
61 0.28
62 0.28
63 0.27
64 0.27
65 0.27
66 0.24
67 0.21
68 0.16
69 0.1
70 0.1
71 0.09
72 0.09
73 0.07
74 0.06
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.04
79 0.04
80 0.04
81 0.04
82 0.04
83 0.04
84 0.04
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.04
94 0.04
95 0.03
96 0.04
97 0.04
98 0.03
99 0.04
100 0.04
101 0.05
102 0.05
103 0.07
104 0.1
105 0.13
106 0.23
107 0.33
108 0.4
109 0.48
110 0.57
111 0.65
112 0.74
113 0.82
114 0.83
115 0.84
116 0.88
117 0.9
118 0.85
119 0.75
120 0.66
121 0.61
122 0.54
123 0.48
124 0.39
125 0.31
126 0.3
127 0.31
128 0.31
129 0.26
130 0.24
131 0.21
132 0.19
133 0.17
134 0.15
135 0.14
136 0.12
137 0.12
138 0.1
139 0.08
140 0.09
141 0.09
142 0.08
143 0.07
144 0.06
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.06
150 0.06
151 0.14
152 0.18
153 0.19
154 0.23
155 0.23
156 0.23
157 0.25
158 0.27
159 0.25
160 0.27
161 0.36
162 0.37
163 0.41
164 0.43
165 0.41
166 0.39
167 0.37
168 0.34
169 0.29
170 0.27
171 0.27
172 0.31
173 0.33
174 0.34
175 0.33
176 0.31
177 0.27
178 0.25
179 0.23
180 0.25
181 0.24
182 0.26
183 0.24
184 0.26
185 0.3
186 0.35
187 0.37
188 0.37
189 0.4
190 0.39
191 0.38
192 0.39
193 0.38
194 0.33
195 0.31
196 0.25
197 0.21
198 0.19
199 0.19
200 0.18
201 0.15
202 0.14
203 0.13
204 0.12
205 0.11
206 0.12
207 0.11
208 0.1
209 0.09
210 0.13
211 0.14
212 0.14
213 0.14
214 0.14
215 0.15
216 0.16
217 0.18
218 0.15
219 0.19
220 0.21
221 0.23
222 0.21
223 0.21
224 0.22
225 0.22
226 0.23
227 0.18
228 0.15
229 0.12
230 0.13
231 0.15
232 0.12
233 0.09
234 0.08
235 0.1
236 0.11
237 0.11
238 0.12
239 0.14
240 0.19
241 0.22
242 0.24
243 0.26
244 0.35
245 0.44
246 0.54
247 0.6
248 0.66
249 0.73
250 0.79
251 0.82
252 0.8
253 0.82
254 0.78
255 0.74
256 0.67
257 0.6
258 0.56
259 0.48
260 0.44
261 0.38
262 0.31
263 0.24
264 0.21
265 0.19
266 0.2
267 0.21
268 0.18
269 0.19
270 0.28
271 0.36
272 0.45
273 0.54
274 0.61
275 0.72
276 0.8
277 0.84
278 0.85
279 0.87
280 0.89
281 0.9
282 0.9
283 0.86
284 0.85
285 0.85
286 0.82
287 0.77
288 0.73
289 0.71
290 0.69
291 0.7
292 0.73
293 0.73