FuNGI

A0A162J354

Protein Details

Accession

A0A162J354

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1092-1112	TAVAQKIKQLRKNSKLCPKEE	Hydrophilic
1223-1243	EIVGAKQKNKSAKRNLKTSAS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 11, cyto_nucl 9, mito 6, nucl 5, E.R. 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024075 DNA-dir_RNA_pol_helix_hairp_sf IPR046950 DNA-dir_Rpol_C_phage-type IPR002092 DNA-dir_Rpol_phage-type IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR037159 RNA_POL_N_sf IPR029262 RPOL_N
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005739 C:mitochondrion GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF00940 RNA_pol PF14700 RPOL_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS00900 RNA_POL_PHAGE_1 PS00489 RNA_POL_PHAGE_2

Amino Acid Sequences

MLPVFDACIRVGKLDRAALVLKRFNVMGILSGEERILLNNQYLKASLQQMRNSPDRRQAEELHKWYEVQIRSTGLPHTAETVACMLKASLLSERGSRLDRLVNRYMGMAPGEAGLRVLSMDDILSDQDLAVITGICPKYNFTPEAEQNIEMLEPTDEITDLRPTQGSIDRSEGAVTHNEAAELVPTPQRGIGLVSLRKGLHLLRELEEVEISMMPESDRRTIQLQLERDSIGCAINRWREANKNLAKKGISTAVSPSSAEGSLSCRMAVWLESLEKSLKDEMVLIKASESKTSKSDQDLERCLYGPLISQADPARLAALTILSVLSLGAVLGADRGIVVSTLVTKIARLAQEDIETQRREKDRTDAALIAKKLAKHGFKAQRQVQFTDTTTDATARQSSKPTTTMIENSLETAQELKDATRKPWSVSIRAQVGSFLLKTLIDNAFVKVLVEHPTTKELISQNQPAFTHIQQPRRGKKVGVLHLNGNLVQQLKKEPIGDYIAKHLPMIVEPKPWRQRDEGGFLDSKTALVRAKSNGMEQKLYTEAAINAGDMTQVFKGLDVLGKTAWQINQNVLNVMMEAWNSGEEIANMPPLEPKFDLPPEPDSSADPLLRRSWMQAVKAVENQRSGLHSQRCFMNLQLEIARAFRNQTMYFPHNVDYRGRAYPMPTYLNHMGADHTRAILKFARGRELGERGLRWLKIHLANLYGLDKSNFDEREAFTNDNIANIIESATNPLNGSRWWLHAEDAWQCLAACFELKAALELQDPTKFVSQLPVHQDGTCNGLQHYAALGGDTWGAKQVNLEPGDRPADVYSAVADLVKQGIDKDAEANNEFALVLRGKITRKVVKQTVMTNVYGVTFSGAKKQVCKQIDALYPELGKQCGIPNMILSTYIAKHIFNALATMFRGAHDIQYWLGEIGGRVCRALTPAQLEEIRDNYEKGGHKKKDELEDVIKQFRSSVVWTTPLRMPVVQPYRKSTAREIRTCLQAVVYPMSDQTDPVNKRKQLQGFPPNFIHSLDASHMLLSALQCHEQGLDFAAVHDSFWTHAADVDTMNGILREAFIQIHEEDVVGRLAIEFEARHKGSLYLAHLDPSTAVAQKIKQLRKNSKLCPKEELVLEHKRNSLRLSGNPWDLEAAKKIVTPASVYEQMAGAEIDVSISEDAKDTGLGEIPPTEADTDEQMAAIGMDEAADVYDDAMVGSDELSDAAGLSERLMEDLKMGHFEAEIVGAKQKNKSAKRNLKTSASVPVWLPLTVPPIPKKGDFDVRRLRESNYFFS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.29
3	0.27
4	0.31
5	0.32
6	0.36
7	0.37
8	0.34
9	0.33
10	0.32
11	0.29
12	0.27
13	0.22
14	0.19
15	0.15
16	0.17
17	0.16
18	0.16
19	0.16
20	0.14
21	0.14
22	0.13
23	0.14
24	0.12
25	0.16
26	0.2
27	0.22
28	0.22
29	0.23
30	0.23
31	0.25
32	0.32
33	0.34
34	0.37
35	0.41
36	0.46
37	0.52
38	0.59
39	0.59
40	0.57
41	0.6
42	0.59
43	0.6
44	0.59
45	0.61
46	0.62
47	0.67
48	0.67
49	0.62
50	0.57
51	0.51
52	0.48
53	0.49
54	0.42
55	0.34
56	0.32
57	0.3
58	0.3
59	0.32
60	0.3
61	0.26
62	0.24
63	0.22
64	0.22
65	0.21
66	0.19
67	0.19
68	0.2
69	0.17
70	0.16
71	0.15
72	0.12
73	0.12
74	0.13
75	0.13
76	0.13
77	0.16
78	0.17
79	0.19
80	0.22
81	0.24
82	0.26
83	0.26
84	0.25
85	0.31
86	0.35
87	0.4
88	0.44
89	0.42
90	0.4
91	0.4
92	0.38
93	0.32
94	0.26
95	0.19
96	0.13
97	0.13
98	0.12
99	0.11
100	0.1
101	0.08
102	0.07
103	0.06
104	0.06
105	0.05
106	0.05
107	0.05
108	0.05
109	0.06
110	0.06
111	0.07
112	0.06
113	0.06
114	0.07
115	0.07
116	0.07
117	0.06
118	0.06
119	0.06
120	0.13
121	0.14
122	0.14
123	0.14
124	0.17
125	0.21
126	0.27
127	0.28
128	0.25
129	0.34
130	0.37
131	0.44
132	0.44
133	0.39
134	0.34
135	0.33
136	0.28
137	0.2
138	0.16
139	0.1
140	0.07
141	0.07
142	0.08
143	0.07
144	0.08
145	0.1
146	0.14
147	0.14
148	0.15
149	0.15
150	0.14
151	0.18
152	0.25
153	0.25
154	0.23
155	0.27
156	0.26
157	0.26
158	0.27
159	0.23
160	0.19
161	0.19
162	0.18
163	0.16
164	0.15
165	0.14
166	0.14
167	0.14
168	0.12
169	0.11
170	0.1
171	0.11
172	0.12
173	0.12
174	0.13
175	0.13
176	0.12
177	0.13
178	0.15
179	0.2
180	0.23
181	0.24
182	0.27
183	0.27
184	0.27
185	0.27
186	0.23
187	0.22
188	0.25
189	0.27
190	0.25
191	0.28
192	0.28
193	0.27
194	0.26
195	0.2
196	0.15
197	0.12
198	0.1
199	0.08
200	0.07
201	0.07
202	0.1
203	0.12
204	0.14
205	0.15
206	0.17
207	0.19
208	0.23
209	0.3
210	0.34
211	0.36
212	0.36
213	0.37
214	0.36
215	0.33
216	0.3
217	0.24
218	0.19
219	0.15
220	0.14
221	0.18
222	0.23
223	0.26
224	0.28
225	0.31
226	0.36
227	0.39
228	0.48
229	0.5
230	0.53
231	0.53
232	0.55
233	0.52
234	0.46
235	0.46
236	0.42
237	0.35
238	0.27
239	0.28
240	0.26
241	0.26
242	0.25
243	0.22
244	0.17
245	0.16
246	0.15
247	0.12
248	0.12
249	0.14
250	0.14
251	0.14
252	0.12
253	0.12
254	0.13
255	0.13
256	0.1
257	0.1
258	0.12
259	0.12
260	0.14
261	0.15
262	0.14
263	0.16
264	0.16
265	0.14
266	0.12
267	0.15
268	0.15
269	0.17
270	0.18
271	0.16
272	0.15
273	0.19
274	0.19
275	0.22
276	0.22
277	0.21
278	0.23
279	0.26
280	0.28
281	0.29
282	0.36
283	0.37
284	0.42
285	0.44
286	0.44
287	0.42
288	0.4
289	0.35
290	0.28
291	0.22
292	0.16
293	0.14
294	0.15
295	0.13
296	0.15
297	0.16
298	0.17
299	0.17
300	0.16
301	0.13
302	0.1
303	0.1
304	0.08
305	0.07
306	0.05
307	0.05
308	0.05
309	0.04
310	0.04
311	0.04
312	0.03
313	0.03
314	0.03
315	0.02
316	0.02
317	0.02
318	0.03
319	0.03
320	0.03
321	0.02
322	0.03
323	0.03
324	0.03
325	0.03
326	0.03
327	0.05
328	0.05
329	0.06
330	0.06
331	0.06
332	0.08
333	0.12
334	0.13
335	0.14
336	0.16
337	0.16
338	0.18
339	0.2
340	0.23
341	0.26
342	0.26
343	0.24
344	0.29
345	0.31
346	0.31
347	0.32
348	0.35
349	0.34
350	0.37
351	0.4
352	0.37
353	0.37
354	0.4
355	0.38
356	0.35
357	0.31
358	0.27
359	0.28
360	0.31
361	0.29
362	0.27
363	0.37
364	0.43
365	0.47
366	0.56
367	0.58
368	0.59
369	0.6
370	0.59
371	0.51
372	0.45
373	0.4
374	0.34
375	0.28
376	0.22
377	0.19
378	0.18
379	0.16
380	0.15
381	0.17
382	0.16
383	0.17
384	0.2
385	0.22
386	0.24
387	0.25
388	0.24
389	0.23
390	0.24
391	0.24
392	0.23
393	0.23
394	0.2
395	0.2
396	0.19
397	0.16
398	0.14
399	0.12
400	0.1
401	0.09
402	0.09
403	0.08
404	0.14
405	0.15
406	0.17
407	0.24
408	0.25
409	0.25
410	0.33
411	0.36
412	0.36
413	0.39
414	0.42
415	0.39
416	0.39
417	0.36
418	0.29
419	0.26
420	0.21
421	0.17
422	0.12
423	0.08
424	0.07
425	0.07
426	0.1
427	0.1
428	0.11
429	0.11
430	0.12
431	0.12
432	0.12
433	0.12
434	0.08
435	0.1
436	0.11
437	0.12
438	0.13
439	0.14
440	0.16
441	0.17
442	0.16
443	0.19
444	0.17
445	0.21
446	0.24
447	0.29
448	0.28
449	0.3
450	0.3
451	0.28
452	0.29
453	0.25
454	0.3
455	0.29
456	0.36
457	0.4
458	0.49
459	0.55
460	0.57
461	0.58
462	0.49
463	0.5
464	0.52
465	0.52
466	0.51
467	0.46
468	0.42
469	0.43
470	0.43
471	0.36
472	0.27
473	0.21
474	0.14
475	0.13
476	0.12
477	0.12
478	0.13
479	0.14
480	0.15
481	0.14
482	0.15
483	0.19
484	0.2
485	0.19
486	0.22
487	0.23
488	0.22
489	0.21
490	0.18
491	0.14
492	0.14
493	0.17
494	0.13
495	0.18
496	0.2
497	0.29
498	0.37
499	0.39
500	0.4
501	0.39
502	0.44
503	0.42
504	0.46
505	0.39
506	0.34
507	0.34
508	0.31
509	0.29
510	0.22
511	0.18
512	0.12
513	0.12
514	0.09
515	0.09
516	0.12
517	0.12
518	0.16
519	0.16
520	0.2
521	0.23
522	0.24
523	0.25
524	0.22
525	0.22
526	0.2
527	0.19
528	0.15
529	0.11
530	0.1
531	0.1
532	0.1
533	0.08
534	0.06
535	0.06
536	0.06
537	0.05
538	0.06
539	0.04
540	0.05
541	0.05
542	0.05
543	0.05
544	0.05
545	0.07
546	0.06
547	0.07
548	0.07
549	0.07
550	0.07
551	0.09
552	0.1
553	0.11
554	0.12
555	0.13
556	0.17
557	0.17
558	0.17
559	0.15
560	0.14
561	0.11
562	0.11
563	0.09
564	0.04
565	0.04
566	0.04
567	0.04
568	0.04
569	0.04
570	0.04
571	0.04
572	0.05
573	0.05
574	0.06
575	0.06
576	0.06
577	0.09
578	0.09
579	0.11
580	0.1
581	0.11
582	0.13
583	0.14
584	0.16
585	0.16
586	0.19
587	0.19
588	0.2
589	0.2
590	0.17
591	0.18
592	0.18
593	0.18
594	0.14
595	0.13
596	0.13
597	0.14
598	0.13
599	0.12
600	0.17
601	0.18
602	0.19
603	0.21
604	0.22
605	0.23
606	0.28
607	0.29
608	0.25
609	0.23
610	0.23
611	0.19
612	0.19
613	0.19
614	0.21
615	0.23
616	0.22
617	0.23
618	0.24
619	0.25
620	0.23
621	0.23
622	0.2
623	0.14
624	0.15
625	0.14
626	0.14
627	0.12
628	0.13
629	0.13
630	0.09
631	0.1
632	0.09
633	0.12
634	0.12
635	0.13
636	0.17
637	0.19
638	0.21
639	0.2
640	0.21
641	0.2
642	0.21
643	0.21
644	0.18
645	0.19
646	0.18
647	0.18
648	0.17
649	0.16
650	0.17
651	0.19
652	0.19
653	0.16
654	0.21
655	0.21
656	0.22
657	0.21
658	0.19
659	0.17
660	0.15
661	0.17
662	0.11
663	0.1
664	0.1
665	0.09
666	0.11
667	0.12
668	0.14
669	0.16
670	0.17
671	0.21
672	0.2
673	0.22
674	0.23
675	0.24
676	0.24
677	0.22
678	0.22
679	0.2
680	0.23
681	0.22
682	0.19
683	0.17
684	0.19
685	0.2
686	0.22
687	0.2
688	0.18
689	0.18
690	0.18
691	0.18
692	0.14
693	0.11
694	0.09
695	0.09
696	0.09
697	0.13
698	0.13
699	0.13
700	0.15
701	0.15
702	0.2
703	0.22
704	0.22
705	0.17
706	0.2
707	0.19
708	0.17
709	0.16
710	0.11
711	0.08
712	0.07
713	0.08
714	0.05
715	0.05
716	0.07
717	0.07
718	0.08
719	0.08
720	0.08
721	0.08
722	0.08
723	0.12
724	0.11
725	0.12
726	0.14
727	0.15
728	0.15
729	0.16
730	0.18
731	0.17
732	0.17
733	0.15
734	0.12
735	0.12
736	0.11
737	0.1
738	0.08
739	0.06
740	0.04
741	0.04
742	0.05
743	0.05
744	0.06
745	0.06
746	0.07
747	0.08
748	0.09
749	0.1
750	0.1
751	0.11
752	0.12
753	0.13
754	0.12
755	0.11
756	0.18
757	0.18
758	0.21
759	0.26
760	0.29
761	0.28
762	0.28
763	0.29
764	0.22
765	0.26
766	0.22
767	0.17
768	0.13
769	0.13
770	0.12
771	0.12
772	0.11
773	0.07
774	0.06
775	0.06
776	0.05
777	0.05
778	0.06
779	0.05
780	0.05
781	0.08
782	0.08
783	0.08
784	0.08
785	0.11
786	0.16
787	0.18
788	0.19
789	0.17
790	0.19
791	0.22
792	0.21
793	0.19
794	0.13
795	0.12
796	0.11
797	0.11
798	0.08
799	0.06
800	0.07
801	0.06
802	0.05
803	0.05
804	0.05
805	0.05
806	0.05
807	0.05
808	0.06
809	0.07
810	0.07
811	0.1
812	0.12
813	0.14
814	0.15
815	0.15
816	0.13
817	0.13
818	0.12
819	0.09
820	0.09
821	0.07
822	0.07
823	0.08
824	0.11
825	0.12
826	0.17
827	0.23
828	0.28
829	0.32
830	0.4
831	0.43
832	0.45
833	0.48
834	0.47
835	0.49
836	0.45
837	0.41
838	0.33
839	0.28
840	0.23
841	0.2
842	0.16
843	0.09
844	0.08
845	0.08
846	0.14
847	0.18
848	0.19
849	0.22
850	0.28
851	0.35
852	0.35
853	0.37
854	0.34
855	0.37
856	0.41
857	0.41
858	0.38
859	0.31
860	0.3
861	0.29
862	0.27
863	0.2
864	0.15
865	0.13
866	0.13
867	0.14
868	0.15
869	0.14
870	0.13
871	0.14
872	0.14
873	0.13
874	0.11
875	0.11
876	0.1
877	0.13
878	0.13
879	0.11
880	0.12
881	0.14
882	0.14
883	0.11
884	0.12
885	0.09
886	0.1
887	0.1
888	0.11
889	0.09
890	0.09
891	0.11
892	0.1
893	0.11
894	0.1
895	0.11
896	0.1
897	0.11
898	0.11
899	0.08
900	0.08
901	0.07
902	0.07
903	0.09
904	0.11
905	0.11
906	0.1
907	0.1
908	0.11
909	0.13
910	0.14
911	0.14
912	0.15
913	0.16
914	0.19
915	0.2
916	0.21
917	0.21
918	0.21
919	0.22
920	0.19
921	0.19
922	0.16
923	0.21
924	0.25
925	0.31
926	0.4
927	0.4
928	0.42
929	0.49
930	0.54
931	0.56
932	0.55
933	0.53
934	0.49
935	0.52
936	0.53
937	0.52
938	0.47
939	0.38
940	0.34
941	0.29
942	0.25
943	0.19
944	0.2
945	0.17
946	0.22
947	0.23
948	0.27
949	0.28
950	0.29
951	0.28
952	0.24
953	0.23
954	0.27
955	0.36
956	0.38
957	0.38
958	0.42
959	0.47
960	0.5
961	0.52
962	0.52
963	0.52
964	0.55
965	0.58
966	0.58
967	0.56
968	0.58
969	0.55
970	0.46
971	0.37
972	0.3
973	0.27
974	0.24
975	0.2
976	0.14
977	0.14
978	0.16
979	0.15
980	0.13
981	0.14
982	0.21
983	0.24
984	0.31
985	0.39
986	0.4
987	0.44
988	0.51
989	0.56
990	0.54
991	0.6
992	0.64
993	0.6
994	0.63
995	0.61
996	0.57
997	0.5
998	0.43
999	0.35
1000	0.24
1001	0.22
1002	0.18
1003	0.18
1004	0.15
1005	0.14
1006	0.13
1007	0.11
1008	0.12
1009	0.1
1010	0.12
1011	0.11
1012	0.11
1013	0.11
1014	0.11
1015	0.12
1016	0.11
1017	0.11
1018	0.1
1019	0.1
1020	0.09
1021	0.09
1022	0.12
1023	0.11
1024	0.11
1025	0.11
1026	0.09
1027	0.08
1028	0.1
1029	0.1
1030	0.07
1031	0.1
1032	0.11
1033	0.11
1034	0.11
1035	0.11
1036	0.11
1037	0.1
1038	0.1
1039	0.08
1040	0.07
1041	0.06
1042	0.06
1043	0.06
1044	0.06
1045	0.07
1046	0.07
1047	0.1
1048	0.1
1049	0.11
1050	0.11
1051	0.1
1052	0.09
1053	0.1
1054	0.1
1055	0.07
1056	0.07
1057	0.06
1058	0.06
1059	0.06
1060	0.07
1061	0.06
1062	0.09
1063	0.17
1064	0.18
1065	0.18
1066	0.19
1067	0.19
1068	0.2
1069	0.25
1070	0.26
1071	0.23
1072	0.23
1073	0.24
1074	0.23
1075	0.23
1076	0.21
1077	0.18
1078	0.17
1079	0.13
1080	0.13
1081	0.14
1082	0.16
1083	0.22
1084	0.31
1085	0.37
1086	0.42
1087	0.51
1088	0.61
1089	0.68
1090	0.76
1091	0.8
1092	0.81
1093	0.81
1094	0.78
1095	0.74
1096	0.67
1097	0.63
1098	0.57
1099	0.53
1100	0.5
1101	0.52
1102	0.53
1103	0.5
1104	0.51
1105	0.48
1106	0.47
1107	0.43
1108	0.43
1109	0.38
1110	0.39
1111	0.43
1112	0.45
1113	0.47
1114	0.45
1115	0.43
1116	0.38
1117	0.34
1118	0.31
1119	0.26
1120	0.22
1121	0.18
1122	0.18
1123	0.19
1124	0.18
1125	0.18
1126	0.17
1127	0.17
1128	0.22
1129	0.25
1130	0.24
1131	0.24
1132	0.23
1133	0.22
1134	0.21
1135	0.18
1136	0.11
1137	0.07
1138	0.06
1139	0.06
1140	0.05
1141	0.06
1142	0.06
1143	0.06
1144	0.07
1145	0.07
1146	0.08
1147	0.08
1148	0.08
1149	0.07
1150	0.08
1151	0.1
1152	0.1
1153	0.1
1154	0.11
1155	0.11
1156	0.11
1157	0.12
1158	0.11
1159	0.1
1160	0.11
1161	0.13
1162	0.14
1163	0.13
1164	0.13
1165	0.12
1166	0.11
1167	0.1
1168	0.09
1169	0.07
1170	0.04
1171	0.04
1172	0.04
1173	0.04
1174	0.04
1175	0.04
1176	0.04
1177	0.04
1178	0.04
1179	0.04
1180	0.04
1181	0.05
1182	0.05
1183	0.04
1184	0.05
1185	0.04
1186	0.04
1187	0.05
1188	0.05
1189	0.04
1190	0.04
1191	0.05
1192	0.06
1193	0.06
1194	0.06
1195	0.07
1196	0.07
1197	0.09
1198	0.1
1199	0.09
1200	0.1
1201	0.12
1202	0.13
1203	0.14
1204	0.15
1205	0.14
1206	0.13
1207	0.13
1208	0.12
1209	0.13
1210	0.13
1211	0.12
1212	0.17
1213	0.2
1214	0.23
1215	0.27
1216	0.33
1217	0.4
1218	0.48
1219	0.57
1220	0.63
1221	0.7
1222	0.75
1223	0.81
1224	0.82
1225	0.8
1226	0.76
1227	0.69
1228	0.67
1229	0.58
1230	0.53
1231	0.43
1232	0.41
1233	0.35
1234	0.29
1235	0.27
1236	0.2
1237	0.23
1238	0.24
1239	0.3
1240	0.3
1241	0.34
1242	0.38
1243	0.4
1244	0.43
1245	0.45
1246	0.52
1247	0.5
1248	0.56
1249	0.61
1250	0.63
1251	0.67
1252	0.64
1253	0.6
1254	0.59

A0A162J354

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer