FuNGI

A0A162LSC4

Protein Details

Accession

A0A162LSC4

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
897-918	AFLPRKRAARHRGKVKSFPKDD	Basic
993-1023	SDEVKRRFYKNWYKSKKKAFTKYAKKHSESS	Hydrophilic
1112-1136	VTARWGTKKLPRKTHKGLRKVACIG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
890-921	APRHGSLAFLPRKRAARHRGKVKSFPKDDPKK
1008-1010	KKK
1119-1128	KKLPRKTHKG

Subcellular Location(s)

nucl 16, cyto_nucl 12, cyto 6, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045077 L3_arc_euk IPR000597 Ribosomal_L3 IPR019926 Ribosomal_L3_CS IPR044892 Ribosomal_L3_dom_3_arc_sf IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf IPR001440 TPR_1 IPR019734 TPR_repeat IPR009000 Transl_B-barrel_sf
Gene Ontology	GO:1990904 C:ribonucleoprotein complex GO:0005840 C:ribosome GO:0003735 F:structural constituent of ribosome GO:0006412 P:translation
Pfam	View protein in Pfam PF00297 Ribosomal_L3 PF00515 TPR_1 PF14559 TPR_19 PF13181 TPR_8
PROSITE	View protein in PROSITE PS00474 RIBOSOMAL_L3 PS50005 TPR PS50293 TPR_REGION

Amino Acid Sequences

MMQLQQQQQQQHQPPVPPPQSVPPGHFAPSHQIAAMNEAVWLQIGSFSELLRVPDEAMHAYERALQANPNSTAAMNAIGMLLKGREAFDKALEFFRAIVQLEQSNGEAWGNLGHCYLMTENLQKAYDAYQQALVNLRDPKDPMLWYGIGILYDRYGSYDYAEEAFSQVMQIQPDFDKANEIYFRLGIIYKQQSKFNQSLECFKYIVNSPPGPLTQEDIWFQIGHVHEQQKDFDSAKAAYQRVLDQSPSHAKVLQQLGWLHHQQSSAYDTQDRAIQYLEKSVAADNADAQSWYLLGRCYMAQQKYPKAYEAYQQAVYRDGKNPTFWCSIGVLYYQINQYRDALDAYSRAIRLNPYISEVWYDLGTLYESCNNQIADALDAYQRAAELDPGNPHIKARLQLLRSGGSNGSGPAPAPQPADVHPQAYQAAGPSGPVGPQWGGSAQQPPAGGPPPAPAGAGDNWVGRLAGVNVPPQPPNPYDNRGEPFRGPPPPPQRQPSPPQDQQMRQGGYPEPRGAAPPGPSRRGPSPAPSSHQYGQPPPSQPADRRVANPNWGGPPPSSSGPPSNNANGANPPSNGAVPFRPTSSPRGEVRPHDNRMPSPKSAYPQHPAASSYPPHHPEGPLPGVSENGPPLSGPGPDTVVQRPDDRPSSVGPKRMREWEEDSAVKKQANEETRARLDDMRHRRPSTPPRDAYRRNSNEARRTDEQRRPDDPKKEEARPQSDSYHPSEAAHHPQNHSIASNQLPPMQPGNIPSSGPQDKSQPGQTAKEERPATEQVPSVASSAEPERAARKMDVDEDYDDSPEEEKKTGIVANGSGPGDAKTTSPASAGINGSSGTVTKTETSLKISPTNYPEKPSYFAYSRNFSPGRLRQLSTNPEPPQPSKMSHRKFEAPRHGSLAFLPRKRAARHRGKVKSFPKDDPKKPVHLTAAMGYKAGMTTIVRDLDRPGAKANKKEVVEAVTVVDTPPMIVVGLVGYIETPRGLRSLTTVWAEHLSDEVKRRFYKNWYKSKKKAFTKYAKKHSESSGASITRELERIKKYCTVVRVLAHTQIRKTPLKQKKAHLMEIQVNGGSVADKVTFGRDLFEKPVSIDSIFEQDEMIDVIAVTKGHGFNGVTARWGTKKLPRKTHKGLRKVACIGAWHPSHVQWTVARAGQMGYHHRTSVNHKIYRIAKGDAEDSASTEVDVTKKSITPLGGFVRYGEVNNDFVMVKGSIPGVKKRVMTLRKSMFTHTSRRALEKINLKWIDTSSEFGHGAFQTPAEKKQYQGTLKKDLTSA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.67
3	0.65
4	0.58
5	0.53
6	0.52
7	0.56
8	0.53
9	0.51
10	0.45
11	0.44
12	0.44
13	0.42
14	0.36
15	0.36
16	0.38
17	0.35
18	0.3
19	0.29
20	0.27
21	0.3
22	0.29
23	0.2
24	0.15
25	0.14
26	0.13
27	0.11
28	0.1
29	0.06
30	0.07
31	0.08
32	0.11
33	0.11
34	0.11
35	0.14
36	0.16
37	0.17
38	0.16
39	0.16
40	0.14
41	0.15
42	0.17
43	0.16
44	0.17
45	0.17
46	0.16
47	0.16
48	0.2
49	0.2
50	0.2
51	0.19
52	0.2
53	0.22
54	0.28
55	0.3
56	0.26
57	0.26
58	0.23
59	0.23
60	0.21
61	0.19
62	0.11
63	0.1
64	0.09
65	0.08
66	0.08
67	0.08
68	0.07
69	0.07
70	0.08
71	0.09
72	0.11
73	0.14
74	0.16
75	0.18
76	0.22
77	0.23
78	0.26
79	0.26
80	0.24
81	0.21
82	0.22
83	0.21
84	0.18
85	0.18
86	0.17
87	0.17
88	0.18
89	0.19
90	0.18
91	0.15
92	0.15
93	0.14
94	0.11
95	0.09
96	0.12
97	0.11
98	0.11
99	0.11
100	0.1
101	0.1
102	0.12
103	0.12
104	0.12
105	0.14
106	0.18
107	0.2
108	0.23
109	0.23
110	0.22
111	0.22
112	0.22
113	0.26
114	0.23
115	0.23
116	0.25
117	0.25
118	0.26
119	0.31
120	0.28
121	0.27
122	0.31
123	0.31
124	0.29
125	0.3
126	0.32
127	0.3
128	0.3
129	0.27
130	0.27
131	0.25
132	0.23
133	0.23
134	0.2
135	0.17
136	0.16
137	0.14
138	0.1
139	0.1
140	0.09
141	0.09
142	0.1
143	0.1
144	0.11
145	0.12
146	0.13
147	0.14
148	0.14
149	0.12
150	0.12
151	0.12
152	0.1
153	0.09
154	0.09
155	0.1
156	0.1
157	0.1
158	0.12
159	0.12
160	0.16
161	0.17
162	0.16
163	0.18
164	0.18
165	0.23
166	0.22
167	0.22
168	0.21
169	0.2
170	0.2
171	0.16
172	0.17
173	0.12
174	0.19
175	0.27
176	0.33
177	0.36
178	0.42
179	0.45
180	0.51
181	0.54
182	0.51
183	0.5
184	0.44
185	0.51
186	0.49
187	0.47
188	0.41
189	0.36
190	0.35
191	0.31
192	0.35
193	0.33
194	0.29
195	0.28
196	0.3
197	0.31
198	0.3
199	0.27
200	0.24
201	0.2
202	0.22
203	0.22
204	0.2
205	0.21
206	0.19
207	0.18
208	0.18
209	0.17
210	0.18
211	0.23
212	0.26
213	0.28
214	0.29
215	0.31
216	0.3
217	0.32
218	0.3
219	0.25
220	0.24
221	0.22
222	0.25
223	0.29
224	0.26
225	0.25
226	0.25
227	0.26
228	0.27
229	0.28
230	0.25
231	0.2
232	0.26
233	0.32
234	0.33
235	0.32
236	0.29
237	0.28
238	0.33
239	0.37
240	0.33
241	0.29
242	0.29
243	0.31
244	0.35
245	0.36
246	0.31
247	0.28
248	0.27
249	0.22
250	0.22
251	0.24
252	0.21
253	0.21
254	0.21
255	0.19
256	0.19
257	0.23
258	0.21
259	0.17
260	0.16
261	0.17
262	0.15
263	0.19
264	0.19
265	0.16
266	0.16
267	0.16
268	0.17
269	0.15
270	0.15
271	0.12
272	0.12
273	0.11
274	0.11
275	0.1
276	0.08
277	0.07
278	0.07
279	0.07
280	0.06
281	0.06
282	0.07
283	0.08
284	0.12
285	0.19
286	0.21
287	0.27
288	0.33
289	0.4
290	0.45
291	0.47
292	0.45
293	0.41
294	0.41
295	0.41
296	0.4
297	0.37
298	0.35
299	0.35
300	0.32
301	0.34
302	0.35
303	0.31
304	0.3
305	0.31
306	0.28
307	0.32
308	0.33
309	0.33
310	0.34
311	0.31
312	0.28
313	0.24
314	0.23
315	0.19
316	0.18
317	0.14
318	0.12
319	0.14
320	0.15
321	0.18
322	0.18
323	0.18
324	0.19
325	0.18
326	0.18
327	0.17
328	0.14
329	0.11
330	0.11
331	0.12
332	0.14
333	0.13
334	0.13
335	0.13
336	0.14
337	0.16
338	0.18
339	0.16
340	0.18
341	0.18
342	0.18
343	0.19
344	0.18
345	0.16
346	0.13
347	0.13
348	0.09
349	0.08
350	0.09
351	0.07
352	0.07
353	0.1
354	0.11
355	0.12
356	0.15
357	0.14
358	0.13
359	0.14
360	0.14
361	0.11
362	0.11
363	0.11
364	0.09
365	0.09
366	0.09
367	0.08
368	0.07
369	0.07
370	0.07
371	0.08
372	0.08
373	0.1
374	0.12
375	0.16
376	0.18
377	0.17
378	0.17
379	0.17
380	0.18
381	0.18
382	0.23
383	0.26
384	0.25
385	0.28
386	0.31
387	0.3
388	0.28
389	0.28
390	0.22
391	0.17
392	0.16
393	0.13
394	0.12
395	0.1
396	0.1
397	0.1
398	0.11
399	0.12
400	0.12
401	0.12
402	0.13
403	0.15
404	0.22
405	0.21
406	0.21
407	0.2
408	0.2
409	0.2
410	0.18
411	0.16
412	0.09
413	0.1
414	0.08
415	0.07
416	0.07
417	0.07
418	0.06
419	0.06
420	0.07
421	0.07
422	0.07
423	0.08
424	0.07
425	0.08
426	0.1
427	0.13
428	0.12
429	0.14
430	0.14
431	0.13
432	0.15
433	0.16
434	0.14
435	0.11
436	0.13
437	0.12
438	0.13
439	0.12
440	0.1
441	0.11
442	0.12
443	0.13
444	0.12
445	0.1
446	0.11
447	0.11
448	0.1
449	0.07
450	0.07
451	0.07
452	0.09
453	0.1
454	0.12
455	0.14
456	0.16
457	0.17
458	0.17
459	0.19
460	0.18
461	0.21
462	0.23
463	0.25
464	0.27
465	0.31
466	0.34
467	0.34
468	0.34
469	0.33
470	0.32
471	0.33
472	0.35
473	0.32
474	0.38
475	0.44
476	0.51
477	0.55
478	0.55
479	0.57
480	0.58
481	0.64
482	0.63
483	0.63
484	0.59
485	0.6
486	0.62
487	0.58
488	0.57
489	0.56
490	0.49
491	0.4
492	0.38
493	0.34
494	0.32
495	0.32
496	0.26
497	0.19
498	0.18
499	0.19
500	0.19
501	0.17
502	0.18
503	0.23
504	0.27
505	0.29
506	0.3
507	0.32
508	0.34
509	0.36
510	0.33
511	0.32
512	0.35
513	0.35
514	0.39
515	0.38
516	0.41
517	0.38
518	0.41
519	0.36
520	0.33
521	0.34
522	0.34
523	0.34
524	0.3
525	0.32
526	0.32
527	0.32
528	0.34
529	0.36
530	0.33
531	0.34
532	0.38
533	0.36
534	0.38
535	0.37
536	0.32
537	0.29
538	0.28
539	0.26
540	0.2
541	0.2
542	0.17
543	0.17
544	0.16
545	0.15
546	0.19
547	0.2
548	0.22
549	0.23
550	0.21
551	0.23
552	0.22
553	0.21
554	0.19
555	0.2
556	0.19
557	0.16
558	0.16
559	0.14
560	0.14
561	0.13
562	0.13
563	0.11
564	0.12
565	0.13
566	0.13
567	0.14
568	0.16
569	0.2
570	0.23
571	0.27
572	0.26
573	0.31
574	0.32
575	0.35
576	0.41
577	0.45
578	0.44
579	0.43
580	0.44
581	0.41
582	0.45
583	0.45
584	0.38
585	0.34
586	0.33
587	0.33
588	0.36
589	0.37
590	0.33
591	0.33
592	0.33
593	0.29
594	0.29
595	0.26
596	0.25
597	0.23
598	0.21
599	0.23
600	0.24
601	0.25
602	0.24
603	0.23
604	0.2
605	0.24
606	0.24
607	0.19
608	0.17
609	0.15
610	0.15
611	0.15
612	0.14
613	0.1
614	0.07
615	0.07
616	0.06
617	0.07
618	0.07
619	0.06
620	0.07
621	0.07
622	0.09
623	0.1
624	0.12
625	0.12
626	0.14
627	0.15
628	0.16
629	0.17
630	0.18
631	0.19
632	0.18
633	0.18
634	0.18
635	0.26
636	0.26
637	0.32
638	0.32
639	0.34
640	0.36
641	0.41
642	0.41
643	0.37
644	0.41
645	0.37
646	0.37
647	0.36
648	0.35
649	0.31
650	0.31
651	0.27
652	0.21
653	0.19
654	0.21
655	0.22
656	0.25
657	0.25
658	0.28
659	0.29
660	0.3
661	0.29
662	0.25
663	0.25
664	0.29
665	0.36
666	0.41
667	0.45
668	0.47
669	0.48
670	0.54
671	0.62
672	0.62
673	0.61
674	0.58
675	0.58
676	0.65
677	0.69
678	0.68
679	0.69
680	0.64
681	0.6
682	0.62
683	0.63
684	0.62
685	0.59
686	0.58
687	0.51
688	0.53
689	0.56
690	0.54
691	0.55
692	0.53
693	0.56
694	0.56
695	0.6
696	0.62
697	0.57
698	0.6
699	0.59
700	0.57
701	0.58
702	0.58
703	0.56
704	0.52
705	0.51
706	0.45
707	0.43
708	0.42
709	0.39
710	0.35
711	0.29
712	0.25
713	0.26
714	0.26
715	0.29
716	0.31
717	0.3
718	0.28
719	0.3
720	0.31
721	0.28
722	0.25
723	0.19
724	0.16
725	0.16
726	0.18
727	0.16
728	0.18
729	0.17
730	0.18
731	0.19
732	0.17
733	0.16
734	0.15
735	0.18
736	0.16
737	0.15
738	0.15
739	0.2
740	0.22
741	0.23
742	0.22
743	0.22
744	0.23
745	0.26
746	0.28
747	0.27
748	0.28
749	0.29
750	0.32
751	0.35
752	0.35
753	0.4
754	0.37
755	0.32
756	0.35
757	0.34
758	0.31
759	0.26
760	0.25
761	0.18
762	0.19
763	0.19
764	0.14
765	0.11
766	0.1
767	0.09
768	0.1
769	0.11
770	0.09
771	0.1
772	0.11
773	0.13
774	0.15
775	0.14
776	0.14
777	0.14
778	0.17
779	0.18
780	0.18
781	0.19
782	0.19
783	0.19
784	0.17
785	0.16
786	0.13
787	0.12
788	0.12
789	0.12
790	0.1
791	0.09
792	0.09
793	0.11
794	0.11
795	0.11
796	0.1
797	0.09
798	0.1
799	0.13
800	0.13
801	0.12
802	0.11
803	0.1
804	0.1
805	0.1
806	0.09
807	0.09
808	0.1
809	0.1
810	0.1
811	0.11
812	0.11
813	0.13
814	0.14
815	0.11
816	0.11
817	0.1
818	0.1
819	0.09
820	0.09
821	0.06
822	0.06
823	0.07
824	0.07
825	0.08
826	0.11
827	0.12
828	0.17
829	0.19
830	0.21
831	0.25
832	0.26
833	0.29
834	0.32
835	0.38
836	0.34
837	0.35
838	0.36
839	0.33
840	0.35
841	0.33
842	0.33
843	0.27
844	0.32
845	0.33
846	0.34
847	0.33
848	0.37
849	0.35
850	0.31
851	0.38
852	0.37
853	0.42
854	0.42
855	0.42
856	0.39
857	0.46
858	0.52
859	0.48
860	0.51
861	0.44
862	0.44
863	0.48
864	0.45
865	0.44
866	0.39
867	0.38
868	0.39
869	0.47
870	0.49
871	0.51
872	0.54
873	0.57
874	0.62
875	0.68
876	0.69
877	0.63
878	0.59
879	0.58
880	0.53
881	0.45
882	0.39
883	0.39
884	0.35
885	0.33
886	0.34
887	0.34
888	0.4
889	0.44
890	0.51
891	0.52
892	0.56
893	0.63
894	0.71
895	0.76
896	0.77
897	0.83
898	0.82
899	0.82
900	0.76
901	0.75
902	0.75
903	0.76
904	0.75
905	0.74
906	0.7
907	0.68
908	0.65
909	0.63
910	0.56
911	0.48
912	0.44
913	0.39
914	0.38
915	0.3
916	0.28
917	0.22
918	0.18
919	0.15
920	0.14
921	0.1
922	0.05
923	0.07
924	0.1
925	0.13
926	0.13
927	0.13
928	0.15
929	0.22
930	0.23
931	0.22
932	0.24
933	0.31
934	0.35
935	0.41
936	0.45
937	0.44
938	0.43
939	0.44
940	0.41
941	0.35
942	0.32
943	0.27
944	0.22
945	0.15
946	0.15
947	0.13
948	0.11
949	0.07
950	0.06
951	0.05
952	0.04
953	0.04
954	0.03
955	0.03
956	0.03
957	0.04
958	0.03
959	0.03
960	0.03
961	0.03
962	0.04
963	0.04
964	0.05
965	0.05
966	0.06
967	0.07
968	0.07
969	0.1
970	0.12
971	0.15
972	0.18
973	0.17
974	0.18
975	0.2
976	0.2
977	0.17
978	0.16
979	0.14
980	0.15
981	0.21
982	0.23
983	0.28
984	0.31
985	0.34
986	0.37
987	0.46
988	0.54
989	0.57
990	0.65
991	0.7
992	0.76
993	0.82
994	0.89
995	0.89
996	0.88
997	0.88
998	0.87
999	0.88
1000	0.89
1001	0.9
1002	0.9
1003	0.89
1004	0.83
1005	0.77
1006	0.72
1007	0.7
1008	0.6
1009	0.54
1010	0.51
1011	0.43
1012	0.4
1013	0.36
1014	0.33
1015	0.26
1016	0.27
1017	0.23
1018	0.23
1019	0.28
1020	0.31
1021	0.34
1022	0.38
1023	0.39
1024	0.41
1025	0.44
1026	0.42
1027	0.4
1028	0.4
1029	0.42
1030	0.38
1031	0.42
1032	0.44
1033	0.42
1034	0.39
1035	0.39
1036	0.43
1037	0.42
1038	0.46
1039	0.49
1040	0.54
1041	0.61
1042	0.65
1043	0.69
1044	0.73
1045	0.75
1046	0.77
1047	0.71
1048	0.68
1049	0.64
1050	0.6
1051	0.53
1052	0.42
1053	0.35
1054	0.27
1055	0.23
1056	0.16
1057	0.09
1058	0.07
1059	0.06
1060	0.06
1061	0.07
1062	0.09
1063	0.11
1064	0.11
1065	0.14
1066	0.15
1067	0.18
1068	0.21
1069	0.23
1070	0.21
1071	0.21
1072	0.23
1073	0.22
1074	0.21
1075	0.19
1076	0.16
1077	0.19
1078	0.19
1079	0.17
1080	0.15
1081	0.12
1082	0.12
1083	0.12
1084	0.11
1085	0.05
1086	0.05
1087	0.05
1088	0.07
1089	0.07
1090	0.07
1091	0.09
1092	0.09
1093	0.1
1094	0.13
1095	0.12
1096	0.15
1097	0.2
1098	0.2
1099	0.19
1100	0.2
1101	0.23
1102	0.22
1103	0.25
1104	0.26
1105	0.3
1106	0.4
1107	0.48
1108	0.58
1109	0.64
1110	0.71
1111	0.79
1112	0.85
1113	0.86
1114	0.86
1115	0.86
1116	0.83
1117	0.83
1118	0.78
1119	0.7
1120	0.62
1121	0.55
1122	0.46
1123	0.45
1124	0.37
1125	0.31
1126	0.28
1127	0.27
1128	0.28
1129	0.26
1130	0.27
1131	0.2
1132	0.23
1133	0.24
1134	0.25
1135	0.24
1136	0.2
1137	0.2
1138	0.2
1139	0.23
1140	0.27
1141	0.28
1142	0.28
1143	0.29
1144	0.3
1145	0.33
1146	0.39
1147	0.45
1148	0.48
1149	0.47
1150	0.46
1151	0.53
1152	0.56
1153	0.61
1154	0.57
1155	0.49
1156	0.42
1157	0.4
1158	0.41
1159	0.34
1160	0.32
1161	0.25
1162	0.22
1163	0.21
1164	0.18
1165	0.15
1166	0.14
1167	0.15
1168	0.13
1169	0.14
1170	0.14
1171	0.15
1172	0.16
1173	0.18
1174	0.22
1175	0.22
1176	0.22
1177	0.27
1178	0.31
1179	0.31
1180	0.3
1181	0.29
1182	0.29
1183	0.28
1184	0.27
1185	0.24
1186	0.2
1187	0.19
1188	0.19
1189	0.2
1190	0.15
1191	0.15
1192	0.17
1193	0.13
1194	0.11
1195	0.11
1196	0.13
1197	0.15
1198	0.19
1199	0.26
1200	0.27
1201	0.32
1202	0.33
1203	0.38
1204	0.47
1205	0.51
1206	0.54
1207	0.58
1208	0.63
1209	0.65
1210	0.65
1211	0.65
1212	0.63
1213	0.6
1214	0.63
1215	0.61
1216	0.6
1217	0.57
1218	0.6
1219	0.59
1220	0.56
1221	0.59
1222	0.59
1223	0.57
1224	0.59
1225	0.57
1226	0.53
1227	0.51
1228	0.46
1229	0.45
1230	0.37
1231	0.35
1232	0.26
1233	0.29
1234	0.27
1235	0.25
1236	0.28
1237	0.21
1238	0.22
1239	0.19
1240	0.19
1241	0.21
1242	0.24
1243	0.3
1244	0.33
1245	0.34
1246	0.33
1247	0.41
1248	0.49
1249	0.51
1250	0.57
1251	0.59
1252	0.62
1253	0.63

A0A162LSC4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer