Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R2F3

Protein Details
Accession C4R2F3    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
44-66ETICANCHRKGHKRQQCKVVVCHHydrophilic
217-241SEDPRGDSRPQKRNHRGHNRDDGPPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
221-251RGDSRPQKRNHRGHNRDDGPPIKKGRLPPPS
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0031499  C:TRAMP complex  
GO:0034458  F:3'-5' RNA helicase activity  
GO:0008168  F:methyltransferase activity  
GO:1990817  F:poly(A) RNA polymerase activity  
GO:0030674  F:protein-macromolecule adaptor activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0032259  P:methylation  
GO:0043629  P:ncRNA polyadenylation  
GO:0071031  P:nuclear mRNA surveillance of mRNA 3'-end processing  
GO:0071039  P:nuclear polyadenylation-dependent CUT catabolic process  
GO:0071035  P:nuclear polyadenylation-dependent rRNA catabolic process  
GO:0071036  P:nuclear polyadenylation-dependent snoRNA catabolic process  
GO:0071037  P:nuclear polyadenylation-dependent snRNA catabolic process  
GO:0071038  P:nuclear polyadenylation-dependent tRNA catabolic process  
GO:0006400  P:tRNA modification  
KEGG ppa:PAS_chr2-2_0239  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MTEPDVAPKGKVFSLRMEDVNENPEELVAMRGEGRYFGVTDTHETICANCHRKGHKRQQCKVVVCHSCGAVDDHYYTQCPQSVVCSICGTKGHFRNNCPDKGKMRNSYCRVCDSRAHSSDRCPTIWRCYITIKTKDKIGMPQIWCYNCGSKGHFGDECLQQRSSRTPNLNGSSFSGGNLPKSLRSQYYSTLDGRRSTSSYNYSAVPPPRYGSGKRDSEDPRGDSRPQKRNHRGHNRDDGPPIKKGRLPPPSQITREPRRYPYNSGNRNSNIKRGFLPPRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.38
3 0.38
4 0.39
5 0.39
6 0.37
7 0.39
8 0.32
9 0.25
10 0.22
11 0.19
12 0.15
13 0.13
14 0.12
15 0.08
16 0.08
17 0.09
18 0.09
19 0.1
20 0.1
21 0.11
22 0.11
23 0.11
24 0.11
25 0.12
26 0.13
27 0.16
28 0.2
29 0.19
30 0.18
31 0.18
32 0.17
33 0.21
34 0.27
35 0.28
36 0.27
37 0.34
38 0.42
39 0.52
40 0.62
41 0.68
42 0.7
43 0.77
44 0.82
45 0.86
46 0.87
47 0.82
48 0.78
49 0.77
50 0.71
51 0.63
52 0.56
53 0.46
54 0.37
55 0.32
56 0.28
57 0.19
58 0.15
59 0.14
60 0.14
61 0.14
62 0.15
63 0.15
64 0.15
65 0.16
66 0.14
67 0.13
68 0.14
69 0.18
70 0.18
71 0.19
72 0.2
73 0.17
74 0.19
75 0.21
76 0.21
77 0.24
78 0.3
79 0.37
80 0.39
81 0.41
82 0.5
83 0.54
84 0.58
85 0.54
86 0.53
87 0.5
88 0.56
89 0.61
90 0.6
91 0.61
92 0.64
93 0.66
94 0.66
95 0.63
96 0.6
97 0.55
98 0.49
99 0.47
100 0.43
101 0.46
102 0.44
103 0.47
104 0.41
105 0.42
106 0.46
107 0.43
108 0.38
109 0.33
110 0.31
111 0.32
112 0.36
113 0.33
114 0.28
115 0.3
116 0.35
117 0.39
118 0.46
119 0.44
120 0.4
121 0.41
122 0.41
123 0.38
124 0.36
125 0.34
126 0.32
127 0.28
128 0.31
129 0.32
130 0.3
131 0.3
132 0.27
133 0.25
134 0.2
135 0.2
136 0.18
137 0.19
138 0.19
139 0.21
140 0.2
141 0.19
142 0.21
143 0.26
144 0.27
145 0.26
146 0.25
147 0.23
148 0.24
149 0.28
150 0.28
151 0.28
152 0.28
153 0.3
154 0.36
155 0.4
156 0.39
157 0.35
158 0.34
159 0.3
160 0.27
161 0.23
162 0.2
163 0.16
164 0.16
165 0.16
166 0.15
167 0.13
168 0.16
169 0.18
170 0.17
171 0.2
172 0.21
173 0.25
174 0.28
175 0.29
176 0.3
177 0.32
178 0.32
179 0.31
180 0.31
181 0.28
182 0.26
183 0.25
184 0.26
185 0.26
186 0.26
187 0.26
188 0.25
189 0.25
190 0.29
191 0.32
192 0.3
193 0.27
194 0.26
195 0.29
196 0.32
197 0.33
198 0.33
199 0.37
200 0.4
201 0.4
202 0.47
203 0.47
204 0.51
205 0.54
206 0.51
207 0.49
208 0.47
209 0.51
210 0.52
211 0.58
212 0.59
213 0.61
214 0.68
215 0.73
216 0.78
217 0.84
218 0.87
219 0.86
220 0.86
221 0.88
222 0.82
223 0.76
224 0.74
225 0.71
226 0.63
227 0.61
228 0.57
229 0.5
230 0.49
231 0.51
232 0.54
233 0.56
234 0.57
235 0.59
236 0.64
237 0.69
238 0.7
239 0.71
240 0.71
241 0.71
242 0.76
243 0.74
244 0.72
245 0.73
246 0.73
247 0.72
248 0.74
249 0.75
250 0.74
251 0.73
252 0.74
253 0.7
254 0.75
255 0.7
256 0.69
257 0.61
258 0.55
259 0.53
260 0.52