Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A162JIS8

Protein Details
Accession A0A162JIS8    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
175-196EHDPEERRRRHQENRPRYRDRDBasic
391-411GKELLDPARSKRRQRAQDLFSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
182-193RRRHQENRPRYR
200-201RR
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 11.5, cyto 7.5, mito 3, plas 1, pero 1, cysk 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MDLDIEMGDAAQGSLELPVEELPLADDILGTAELQEPGELLDDEAADIGADGQEENERKTLIPNKLHIQGVDTLHTDDIKAYIRSHFRPVEKVEWIDDTSANLVFDSESTARDAITALSAIPVVDVTVLAPGEILPAKPFDGKPEISLHVRFAFDDDKKQAGAALRSRYYLLHPEHDPEERRRRHQENRPRYRDRDDHFRRHGGRQRRNSDDDVETFEASMYDDIPRPSRSRRDSAPEVNPRSYVEENRGKELFMNKSSRRDRSASPRRDGDGDAQMDDLDRSSHRNRTQARSLKTRLVADNSSKELFPTKAKGRGGQLDQLENSIGSARLEDQDLPKVVDTTKVQAGGSLNIRGLANERAGAGPGFSIRGAASASAQELFPGKLGMSNAGKELLDPARSKRRQRAQDLFS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.05
3 0.05
4 0.06
5 0.06
6 0.08
7 0.07
8 0.07
9 0.08
10 0.08
11 0.08
12 0.07
13 0.06
14 0.06
15 0.07
16 0.07
17 0.06
18 0.06
19 0.08
20 0.09
21 0.09
22 0.09
23 0.07
24 0.08
25 0.1
26 0.09
27 0.07
28 0.08
29 0.08
30 0.08
31 0.08
32 0.07
33 0.05
34 0.05
35 0.05
36 0.04
37 0.04
38 0.04
39 0.05
40 0.1
41 0.12
42 0.14
43 0.15
44 0.16
45 0.16
46 0.23
47 0.31
48 0.35
49 0.39
50 0.43
51 0.47
52 0.52
53 0.53
54 0.46
55 0.4
56 0.37
57 0.33
58 0.31
59 0.27
60 0.22
61 0.21
62 0.21
63 0.18
64 0.13
65 0.13
66 0.14
67 0.14
68 0.14
69 0.2
70 0.26
71 0.28
72 0.35
73 0.39
74 0.39
75 0.43
76 0.47
77 0.47
78 0.45
79 0.44
80 0.39
81 0.36
82 0.34
83 0.29
84 0.24
85 0.19
86 0.16
87 0.15
88 0.13
89 0.1
90 0.09
91 0.07
92 0.07
93 0.1
94 0.1
95 0.1
96 0.11
97 0.11
98 0.11
99 0.11
100 0.11
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.05
105 0.06
106 0.06
107 0.05
108 0.05
109 0.04
110 0.04
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.07
124 0.08
125 0.11
126 0.11
127 0.14
128 0.18
129 0.19
130 0.2
131 0.23
132 0.25
133 0.25
134 0.26
135 0.24
136 0.22
137 0.21
138 0.19
139 0.18
140 0.2
141 0.18
142 0.22
143 0.22
144 0.21
145 0.21
146 0.21
147 0.21
148 0.18
149 0.21
150 0.21
151 0.24
152 0.24
153 0.25
154 0.25
155 0.24
156 0.23
157 0.26
158 0.23
159 0.22
160 0.22
161 0.24
162 0.26
163 0.29
164 0.31
165 0.31
166 0.4
167 0.4
168 0.46
169 0.51
170 0.57
171 0.62
172 0.69
173 0.72
174 0.73
175 0.8
176 0.83
177 0.81
178 0.78
179 0.76
180 0.73
181 0.66
182 0.66
183 0.63
184 0.63
185 0.61
186 0.64
187 0.6
188 0.6
189 0.63
190 0.63
191 0.64
192 0.64
193 0.67
194 0.66
195 0.67
196 0.61
197 0.57
198 0.49
199 0.41
200 0.36
201 0.3
202 0.24
203 0.2
204 0.18
205 0.14
206 0.11
207 0.1
208 0.06
209 0.06
210 0.07
211 0.08
212 0.1
213 0.12
214 0.15
215 0.19
216 0.27
217 0.31
218 0.34
219 0.37
220 0.43
221 0.48
222 0.53
223 0.57
224 0.58
225 0.58
226 0.54
227 0.51
228 0.43
229 0.42
230 0.37
231 0.29
232 0.27
233 0.31
234 0.31
235 0.34
236 0.34
237 0.29
238 0.29
239 0.33
240 0.3
241 0.27
242 0.34
243 0.32
244 0.42
245 0.47
246 0.49
247 0.49
248 0.47
249 0.48
250 0.51
251 0.59
252 0.58
253 0.58
254 0.58
255 0.55
256 0.54
257 0.5
258 0.43
259 0.39
260 0.32
261 0.27
262 0.23
263 0.21
264 0.19
265 0.17
266 0.13
267 0.07
268 0.06
269 0.11
270 0.15
271 0.23
272 0.26
273 0.34
274 0.39
275 0.46
276 0.56
277 0.59
278 0.61
279 0.63
280 0.64
281 0.63
282 0.61
283 0.58
284 0.51
285 0.47
286 0.45
287 0.42
288 0.42
289 0.39
290 0.36
291 0.31
292 0.29
293 0.27
294 0.25
295 0.23
296 0.27
297 0.28
298 0.34
299 0.36
300 0.4
301 0.42
302 0.47
303 0.47
304 0.46
305 0.43
306 0.4
307 0.38
308 0.35
309 0.3
310 0.22
311 0.19
312 0.14
313 0.11
314 0.07
315 0.08
316 0.09
317 0.09
318 0.11
319 0.13
320 0.15
321 0.2
322 0.21
323 0.22
324 0.21
325 0.21
326 0.2
327 0.23
328 0.23
329 0.22
330 0.23
331 0.24
332 0.23
333 0.24
334 0.25
335 0.25
336 0.26
337 0.23
338 0.2
339 0.2
340 0.2
341 0.18
342 0.19
343 0.18
344 0.16
345 0.14
346 0.15
347 0.14
348 0.15
349 0.15
350 0.12
351 0.1
352 0.09
353 0.1
354 0.09
355 0.09
356 0.08
357 0.09
358 0.09
359 0.09
360 0.09
361 0.09
362 0.11
363 0.11
364 0.11
365 0.11
366 0.12
367 0.12
368 0.11
369 0.11
370 0.1
371 0.12
372 0.13
373 0.18
374 0.2
375 0.2
376 0.21
377 0.23
378 0.22
379 0.2
380 0.24
381 0.22
382 0.24
383 0.25
384 0.32
385 0.41
386 0.49
387 0.58
388 0.63
389 0.69
390 0.74
391 0.82