Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A166YT04

Protein Details
Accession A0A166YT04    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
484-503LVAIPKRRRNDTRPARPPSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
476-504ARPPRKLALVAIPKRRRNDTRPARPPSTA
Subcellular Location(s) nucl 15.5, mito_nucl 9.333, cyto 8.5, cyto_mito 5.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024662  Trs65  
Gene Ontology GO:1990071  C:TRAPPII protein complex  
GO:0006891  P:intra-Golgi vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF12735  Trs65  
Amino Acid Sequences MAGAGGKPEGVALAKDVPSATGDFLEQSYLTYLVPTRTDIDLDDVFRDGGSGNSILQSIEQRESLLFDETVEVLLILRMPWLEETELQAQIDRLVISLEGQVVSGNPTDRTSQPASEPIFKGHVQNVADPFTIVDEEQAESENGASRSIYAMWKLRVFLSRPRTRLQQPTVLFTASASIKPDVRSDTSSTRGMEYLQSGKPSSFNLLESFSSDPALDGIKPHLSSLRVSRVAPVSRQQDLVAHLRAQPQLRLPIYPVVHTRIRFSRPSTAQSTSALIAMLEIDLTPHVECEVFIDEIKLDTDDGTVESLNDEEQMKLPMSCVSHDHITFLYHIRPHQTDKTPRNFVGSLDISITATAQVIPGICTPKLCMGWNAALDFTIPVNPSFNKMPESAGIQRAHKPSQLSIGSNTAMTPLKSPSLTRPDALPGLEASSRTEVAALELGITMSFTGPSEAVHPGDVFSWTVYVVNRSSEKTARPPRKLALVAIPKRRRNDTRPARPPSTAARRQGEKEIADAVVDLNLLHALHKASAVDETDVICLSADTRVGPLAPGACHVAELQFLALREGVMGIEAVRVIDLGSQEHVDIRDLPTTIVEPAAAQAQE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.16
3 0.17
4 0.16
5 0.17
6 0.17
7 0.16
8 0.12
9 0.12
10 0.12
11 0.12
12 0.13
13 0.11
14 0.11
15 0.12
16 0.11
17 0.11
18 0.11
19 0.13
20 0.14
21 0.16
22 0.17
23 0.18
24 0.18
25 0.19
26 0.19
27 0.22
28 0.22
29 0.22
30 0.21
31 0.19
32 0.18
33 0.17
34 0.16
35 0.11
36 0.09
37 0.1
38 0.1
39 0.09
40 0.1
41 0.11
42 0.1
43 0.11
44 0.15
45 0.16
46 0.17
47 0.17
48 0.17
49 0.17
50 0.19
51 0.19
52 0.18
53 0.15
54 0.13
55 0.14
56 0.14
57 0.14
58 0.11
59 0.1
60 0.07
61 0.07
62 0.07
63 0.05
64 0.06
65 0.05
66 0.06
67 0.07
68 0.09
69 0.11
70 0.11
71 0.16
72 0.19
73 0.2
74 0.19
75 0.2
76 0.18
77 0.16
78 0.17
79 0.12
80 0.09
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.09
85 0.09
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.07
90 0.09
91 0.1
92 0.1
93 0.1
94 0.12
95 0.15
96 0.16
97 0.22
98 0.23
99 0.24
100 0.25
101 0.31
102 0.33
103 0.36
104 0.37
105 0.33
106 0.34
107 0.33
108 0.33
109 0.29
110 0.31
111 0.26
112 0.29
113 0.29
114 0.28
115 0.27
116 0.24
117 0.21
118 0.16
119 0.16
120 0.11
121 0.09
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.09
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.12
130 0.11
131 0.11
132 0.11
133 0.1
134 0.11
135 0.13
136 0.14
137 0.13
138 0.17
139 0.2
140 0.22
141 0.22
142 0.24
143 0.26
144 0.28
145 0.33
146 0.39
147 0.44
148 0.46
149 0.48
150 0.53
151 0.55
152 0.61
153 0.58
154 0.56
155 0.5
156 0.52
157 0.5
158 0.43
159 0.36
160 0.27
161 0.25
162 0.17
163 0.17
164 0.14
165 0.14
166 0.16
167 0.17
168 0.19
169 0.19
170 0.2
171 0.22
172 0.24
173 0.27
174 0.29
175 0.31
176 0.3
177 0.27
178 0.25
179 0.23
180 0.2
181 0.19
182 0.2
183 0.18
184 0.19
185 0.19
186 0.19
187 0.19
188 0.18
189 0.19
190 0.15
191 0.15
192 0.14
193 0.16
194 0.16
195 0.17
196 0.17
197 0.14
198 0.13
199 0.12
200 0.11
201 0.09
202 0.1
203 0.08
204 0.07
205 0.09
206 0.11
207 0.11
208 0.11
209 0.13
210 0.13
211 0.15
212 0.19
213 0.24
214 0.24
215 0.24
216 0.27
217 0.29
218 0.3
219 0.3
220 0.32
221 0.29
222 0.28
223 0.29
224 0.26
225 0.23
226 0.24
227 0.27
228 0.22
229 0.19
230 0.19
231 0.22
232 0.25
233 0.24
234 0.22
235 0.2
236 0.25
237 0.24
238 0.22
239 0.21
240 0.23
241 0.23
242 0.24
243 0.23
244 0.21
245 0.24
246 0.24
247 0.26
248 0.26
249 0.29
250 0.3
251 0.31
252 0.35
253 0.35
254 0.39
255 0.4
256 0.37
257 0.35
258 0.33
259 0.31
260 0.23
261 0.2
262 0.15
263 0.1
264 0.08
265 0.06
266 0.05
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.04
272 0.03
273 0.03
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.05
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.08
284 0.08
285 0.06
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.05
291 0.05
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.06
301 0.07
302 0.07
303 0.07
304 0.08
305 0.09
306 0.09
307 0.1
308 0.11
309 0.12
310 0.15
311 0.15
312 0.15
313 0.13
314 0.13
315 0.14
316 0.13
317 0.13
318 0.12
319 0.13
320 0.16
321 0.17
322 0.21
323 0.26
324 0.33
325 0.4
326 0.46
327 0.53
328 0.54
329 0.53
330 0.53
331 0.47
332 0.4
333 0.37
334 0.3
335 0.23
336 0.18
337 0.18
338 0.14
339 0.13
340 0.13
341 0.06
342 0.05
343 0.05
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.05
348 0.07
349 0.09
350 0.09
351 0.09
352 0.1
353 0.13
354 0.15
355 0.14
356 0.14
357 0.14
358 0.17
359 0.18
360 0.18
361 0.14
362 0.13
363 0.12
364 0.11
365 0.09
366 0.08
367 0.07
368 0.07
369 0.1
370 0.1
371 0.13
372 0.14
373 0.15
374 0.16
375 0.16
376 0.17
377 0.16
378 0.21
379 0.21
380 0.25
381 0.26
382 0.26
383 0.32
384 0.35
385 0.35
386 0.33
387 0.31
388 0.26
389 0.31
390 0.31
391 0.27
392 0.25
393 0.26
394 0.24
395 0.22
396 0.21
397 0.16
398 0.14
399 0.13
400 0.13
401 0.11
402 0.13
403 0.14
404 0.15
405 0.2
406 0.26
407 0.28
408 0.27
409 0.27
410 0.28
411 0.29
412 0.28
413 0.22
414 0.14
415 0.15
416 0.15
417 0.14
418 0.13
419 0.13
420 0.13
421 0.12
422 0.12
423 0.1
424 0.1
425 0.11
426 0.08
427 0.07
428 0.06
429 0.06
430 0.06
431 0.06
432 0.05
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.05
437 0.05
438 0.05
439 0.08
440 0.1
441 0.1
442 0.11
443 0.11
444 0.1
445 0.11
446 0.12
447 0.1
448 0.08
449 0.08
450 0.07
451 0.09
452 0.09
453 0.11
454 0.11
455 0.14
456 0.16
457 0.18
458 0.22
459 0.24
460 0.28
461 0.35
462 0.45
463 0.51
464 0.55
465 0.59
466 0.58
467 0.62
468 0.6
469 0.53
470 0.52
471 0.53
472 0.55
473 0.61
474 0.66
475 0.64
476 0.67
477 0.73
478 0.71
479 0.67
480 0.7
481 0.71
482 0.73
483 0.78
484 0.81
485 0.77
486 0.71
487 0.68
488 0.67
489 0.66
490 0.63
491 0.61
492 0.6
493 0.6
494 0.62
495 0.65
496 0.61
497 0.51
498 0.45
499 0.39
500 0.31
501 0.26
502 0.23
503 0.16
504 0.1
505 0.1
506 0.07
507 0.05
508 0.06
509 0.06
510 0.06
511 0.07
512 0.08
513 0.08
514 0.1
515 0.09
516 0.09
517 0.12
518 0.13
519 0.13
520 0.13
521 0.13
522 0.13
523 0.13
524 0.12
525 0.1
526 0.08
527 0.08
528 0.08
529 0.08
530 0.07
531 0.08
532 0.09
533 0.09
534 0.09
535 0.11
536 0.12
537 0.12
538 0.13
539 0.15
540 0.14
541 0.15
542 0.15
543 0.13
544 0.11
545 0.12
546 0.11
547 0.11
548 0.11
549 0.11
550 0.11
551 0.1
552 0.1
553 0.09
554 0.08
555 0.06
556 0.06
557 0.05
558 0.06
559 0.06
560 0.06
561 0.05
562 0.05
563 0.05
564 0.07
565 0.08
566 0.09
567 0.1
568 0.11
569 0.12
570 0.14
571 0.15
572 0.15
573 0.16
574 0.17
575 0.19
576 0.19
577 0.19
578 0.18
579 0.19
580 0.18
581 0.16
582 0.14
583 0.1
584 0.11