FuNGI

A0A162JV98

Protein Details

Accession

A0A162JV98

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
496-537	PSSIPHGKSEKKDRKKKQKEKERNEPETPRKGKRKHGSSEDD	Basic
641-668	VTSTPITSKDEKKARKKKAKTPGAAASS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
502-531	GKSEKKDRKKKQKEKERNEPETPRKGKRKH
651-662	EKKARKKKAKTP

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013240 DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0006360 P:transcription by RNA polymerase I
Pfam	View protein in Pfam PF08208 RNA_polI_A34

Amino Acid Sequences

MAPKKPYKVHSMTKHVESMNKGLSAEALYNKRPASKSIAPIKREPGAVDEVIFGGGETDDGDSDSSSSGSSDDDGSDFLRKLQATKTSTTASSKKPAKRDEIADSDDERRPTAKAVASVNPERLAQPGSSSDEEDSSSESESDSEPAAPKSTKGEPKVRANGAPSKVVARSRSESTSASGSEDEDDESSSDDEPVKQTTATEVNSPTSSGGNSGDRASESESEDKVQPTASTKRQPATKHANGTSTATTSETSSSDEGTDDDNVALCRAKPSAKDEAISHASSDDSSGESSREEDADVSMHIADRQKDHQTTVPDFIAPDFILRKSDGGSNGQDVARMCNQANLQGKQVWYFTVPANVPISVVQNMEIPMNQSQRGNSIFSHDGEDYGISLDSMTPKSSIQILIPSVDGARYQPAPRSIDQVMQIKKITQLGENTGNASAVGPAPKPAPRQQPRGLKARYQPYGVKSPMGQIGIDLSFQVENDDAEMVDAPPVTIPSSIPHGKSEKKDRKKKQKEKERNEPETPRKGKRKHGSSEDDAVAAAEQLMKESMSVETKNKKQKTQRDGSPDLGSDAPSSSAVSAKRKLVVPSSIPASTPSSKPNSRSKIETPATKPRETAVPIPHVPGSSQPKVSPVPVPRPVVTSTPITSKDEKKARKKKAKTPGAAASSQQSPPPSAQSAGKSSKNKLTPVPMPKIKNPA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.72
2	0.64
3	0.61
4	0.55
5	0.52
6	0.46
7	0.41
8	0.36
9	0.3
10	0.29
11	0.25
12	0.24
13	0.25
14	0.25
15	0.26
16	0.3
17	0.32
18	0.37
19	0.37
20	0.37
21	0.39
22	0.42
23	0.49
24	0.55
25	0.62
26	0.6
27	0.64
28	0.66
29	0.62
30	0.56
31	0.48
32	0.41
33	0.39
34	0.34
35	0.29
36	0.24
37	0.2
38	0.19
39	0.17
40	0.12
41	0.07
42	0.06
43	0.06
44	0.05
45	0.05
46	0.05
47	0.06
48	0.07
49	0.06
50	0.07
51	0.08
52	0.07
53	0.07
54	0.07
55	0.07
56	0.07
57	0.08
58	0.09
59	0.09
60	0.09
61	0.1
62	0.11
63	0.14
64	0.14
65	0.14
66	0.17
67	0.17
68	0.19
69	0.23
70	0.31
71	0.31
72	0.34
73	0.37
74	0.35
75	0.38
76	0.42
77	0.43
78	0.4
79	0.46
80	0.52
81	0.54
82	0.6
83	0.64
84	0.65
85	0.66
86	0.67
87	0.65
88	0.63
89	0.6
90	0.55
91	0.51
92	0.48
93	0.45
94	0.4
95	0.33
96	0.28
97	0.25
98	0.24
99	0.26
100	0.24
101	0.24
102	0.28
103	0.32
104	0.38
105	0.41
106	0.41
107	0.36
108	0.34
109	0.3
110	0.28
111	0.24
112	0.17
113	0.16
114	0.16
115	0.2
116	0.21
117	0.22
118	0.21
119	0.2
120	0.2
121	0.19
122	0.18
123	0.13
124	0.13
125	0.11
126	0.11
127	0.11
128	0.11
129	0.11
130	0.1
131	0.11
132	0.12
133	0.13
134	0.16
135	0.16
136	0.16
137	0.2
138	0.27
139	0.33
140	0.37
141	0.45
142	0.49
143	0.58
144	0.66
145	0.64
146	0.59
147	0.56
148	0.58
149	0.52
150	0.47
151	0.38
152	0.33
153	0.33
154	0.34
155	0.32
156	0.29
157	0.31
158	0.32
159	0.34
160	0.34
161	0.31
162	0.3
163	0.3
164	0.25
165	0.22
166	0.19
167	0.17
168	0.15
169	0.14
170	0.13
171	0.1
172	0.1
173	0.08
174	0.09
175	0.1
176	0.09
177	0.09
178	0.09
179	0.1
180	0.11
181	0.13
182	0.12
183	0.11
184	0.11
185	0.13
186	0.16
187	0.17
188	0.18
189	0.18
190	0.19
191	0.2
192	0.2
193	0.17
194	0.14
195	0.13
196	0.11
197	0.12
198	0.11
199	0.12
200	0.12
201	0.12
202	0.12
203	0.13
204	0.14
205	0.14
206	0.15
207	0.18
208	0.18
209	0.19
210	0.21
211	0.2
212	0.18
213	0.16
214	0.14
215	0.16
216	0.22
217	0.26
218	0.31
219	0.34
220	0.38
221	0.43
222	0.45
223	0.48
224	0.52
225	0.52
226	0.52
227	0.51
228	0.49
229	0.45
230	0.45
231	0.38
232	0.29
233	0.23
234	0.16
235	0.15
236	0.13
237	0.13
238	0.1
239	0.11
240	0.11
241	0.11
242	0.1
243	0.1
244	0.1
245	0.1
246	0.1
247	0.08
248	0.08
249	0.08
250	0.08
251	0.08
252	0.08
253	0.07
254	0.07
255	0.09
256	0.1
257	0.12
258	0.17
259	0.24
260	0.25
261	0.26
262	0.26
263	0.3
264	0.32
265	0.3
266	0.25
267	0.17
268	0.16
269	0.15
270	0.14
271	0.09
272	0.06
273	0.06
274	0.07
275	0.07
276	0.07
277	0.08
278	0.08
279	0.08
280	0.07
281	0.07
282	0.07
283	0.07
284	0.07
285	0.06
286	0.06
287	0.06
288	0.07
289	0.09
290	0.1
291	0.12
292	0.15
293	0.2
294	0.2
295	0.22
296	0.24
297	0.27
298	0.28
299	0.29
300	0.26
301	0.21
302	0.2
303	0.18
304	0.16
305	0.11
306	0.1
307	0.08
308	0.08
309	0.09
310	0.09
311	0.09
312	0.09
313	0.11
314	0.12
315	0.14
316	0.14
317	0.14
318	0.16
319	0.16
320	0.16
321	0.14
322	0.15
323	0.14
324	0.15
325	0.13
326	0.14
327	0.15
328	0.19
329	0.24
330	0.22
331	0.22
332	0.23
333	0.23
334	0.21
335	0.21
336	0.16
337	0.11
338	0.12
339	0.1
340	0.12
341	0.12
342	0.13
343	0.13
344	0.13
345	0.12
346	0.11
347	0.12
348	0.09
349	0.09
350	0.08
351	0.08
352	0.09
353	0.09
354	0.08
355	0.08
356	0.1
357	0.12
358	0.13
359	0.12
360	0.12
361	0.15
362	0.16
363	0.16
364	0.13
365	0.16
366	0.16
367	0.17
368	0.19
369	0.16
370	0.15
371	0.14
372	0.14
373	0.09
374	0.08
375	0.07
376	0.04
377	0.04
378	0.04
379	0.06
380	0.07
381	0.07
382	0.07
383	0.07
384	0.08
385	0.09
386	0.1
387	0.09
388	0.11
389	0.11
390	0.11
391	0.11
392	0.1
393	0.09
394	0.08
395	0.08
396	0.06
397	0.08
398	0.09
399	0.1
400	0.13
401	0.17
402	0.2
403	0.21
404	0.25
405	0.24
406	0.25
407	0.28
408	0.32
409	0.3
410	0.29
411	0.29
412	0.25
413	0.25
414	0.26
415	0.22
416	0.18
417	0.18
418	0.19
419	0.23
420	0.23
421	0.22
422	0.19
423	0.18
424	0.15
425	0.14
426	0.1
427	0.07
428	0.08
429	0.07
430	0.08
431	0.1
432	0.13
433	0.17
434	0.23
435	0.33
436	0.38
437	0.46
438	0.54
439	0.62
440	0.64
441	0.7
442	0.66
443	0.61
444	0.62
445	0.62
446	0.57
447	0.5
448	0.5
449	0.44
450	0.49
451	0.43
452	0.38
453	0.29
454	0.3
455	0.29
456	0.25
457	0.21
458	0.13
459	0.15
460	0.13
461	0.13
462	0.1
463	0.08
464	0.07
465	0.07
466	0.08
467	0.06
468	0.05
469	0.06
470	0.06
471	0.05
472	0.05
473	0.06
474	0.05
475	0.06
476	0.06
477	0.05
478	0.05
479	0.06
480	0.06
481	0.06
482	0.06
483	0.07
484	0.14
485	0.17
486	0.18
487	0.21
488	0.26
489	0.31
490	0.38
491	0.48
492	0.53
493	0.61
494	0.7
495	0.78
496	0.84
497	0.9
498	0.94
499	0.93
500	0.94
501	0.95
502	0.94
503	0.95
504	0.94
505	0.91
506	0.88
507	0.87
508	0.85
509	0.84
510	0.81
511	0.79
512	0.78
513	0.76
514	0.78
515	0.79
516	0.79
517	0.78
518	0.8
519	0.78
520	0.74
521	0.74
522	0.64
523	0.54
524	0.44
525	0.36
526	0.26
527	0.17
528	0.12
529	0.06
530	0.05
531	0.06
532	0.06
533	0.06
534	0.06
535	0.07
536	0.09
537	0.11
538	0.13
539	0.19
540	0.27
541	0.35
542	0.45
543	0.49
544	0.56
545	0.63
546	0.71
547	0.75
548	0.76
549	0.77
550	0.76
551	0.76
552	0.72
553	0.66
554	0.56
555	0.49
556	0.39
557	0.32
558	0.23
559	0.19
560	0.15
561	0.12
562	0.11
563	0.09
564	0.12
565	0.15
566	0.2
567	0.24
568	0.26
569	0.3
570	0.33
571	0.35
572	0.36
573	0.38
574	0.36
575	0.36
576	0.38
577	0.34
578	0.31
579	0.31
580	0.32
581	0.29
582	0.28
583	0.3
584	0.34
585	0.38
586	0.43
587	0.51
588	0.53
589	0.54
590	0.59
591	0.58
592	0.6
593	0.62
594	0.65
595	0.62
596	0.65
597	0.67
598	0.61
599	0.57
600	0.49
601	0.5
602	0.45
603	0.45
604	0.41
605	0.43
606	0.43
607	0.45
608	0.44
609	0.38
610	0.34
611	0.35
612	0.37
613	0.34
614	0.36
615	0.33
616	0.36
617	0.38
618	0.4
619	0.4
620	0.39
621	0.43
622	0.47
623	0.52
624	0.48
625	0.49
626	0.49
627	0.45
628	0.4
629	0.36
630	0.31
631	0.32
632	0.34
633	0.36
634	0.4
635	0.43
636	0.5
637	0.55
638	0.62
639	0.68
640	0.75
641	0.81
642	0.86
643	0.89
644	0.9
645	0.91
646	0.92
647	0.88
648	0.86
649	0.84
650	0.79
651	0.72
652	0.63
653	0.57
654	0.5
655	0.44
656	0.38
657	0.31
658	0.27
659	0.27
660	0.31
661	0.29
662	0.27
663	0.31
664	0.33
665	0.39
666	0.44
667	0.5
668	0.51
669	0.54
670	0.6
671	0.61
672	0.6
673	0.58
674	0.59
675	0.6
676	0.64
677	0.68
678	0.68
679	0.69

A0A162JV98

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer