Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A166WDK6

Protein Details
Accession A0A166WDK6    Localization Confidence High Confidence Score 24.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-39AASPEPSVPKHDKKIKKEKSSRSAKKRAREEDHAAAHydrophilic
60-89DEINGQDVKKQKKKKDKKSKHRQDGADETEBasic
91-116ADEASAEKRLKKKKHHKEETASFSQIHydrophilic
123-147HGAEPRTGKKDRKKKAKHAEIANIABasic
417-440TAQMRLEKKGGRRTERRRAPEFSMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-49PKHDKKIKKEKSSRSAKKRAREEDHAAADGERKHKRSK
68-81KKQKKKKDKKSKHR
98-107KRLKKKKHHK
128-140RTGKKDRKKKAKH
421-434RLEKKGGRRTERRR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041901  RNAP_I_Rpa43_N  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
CDD cd04328  RNAP_I_Rpa43_N  
Amino Acid Sequences MSAAASPEPSVPKHDKKIKKEKSSRSAKKRAREEDHAAADGERKHKRSKSITANGIAQSDEINGQDVKKQKKKKDKKSKHRQDGADETEAADEASAEKRLKKKKHHKEETASFSQIDQQEELHGAEPRTGKKDRKKKAKHAEIANIALSEKPQSSDAQHTTFEDPDSMDIDEPSISALKSSNIYQPPDIPVDPQFPFFEQTVSLYEPLYPNGWAQPVTSCQYQHLQHLQNRYVPSLRGVLLDYKNVALGPKPGRDGAATDDETPTTVVSQNEYAVGFGWITADIELFVPSRGAWMEGSVNLQTEGHIGVVCFGKFNASIEARRLPPAWKWVSNESPDAHGFEETASVITADDHGVVRQIHSTGFWVDGEGDRVKGKIRFRIRNFDAGTSGETSYLSLEGTMLDKDSEKKLVKEEARTAQMRLEKKGGRRTERRRAPEFSMTRFADVETETEGLKEQPSGEIVQES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.65
3 0.73
4 0.83
5 0.86
6 0.89
7 0.91
8 0.91
9 0.91
10 0.93
11 0.93
12 0.93
13 0.93
14 0.9
15 0.9
16 0.89
17 0.89
18 0.86
19 0.84
20 0.81
21 0.79
22 0.76
23 0.67
24 0.57
25 0.47
26 0.44
27 0.4
28 0.4
29 0.37
30 0.37
31 0.44
32 0.48
33 0.57
34 0.6
35 0.66
36 0.69
37 0.72
38 0.75
39 0.71
40 0.72
41 0.64
42 0.56
43 0.46
44 0.35
45 0.26
46 0.19
47 0.16
48 0.11
49 0.11
50 0.11
51 0.11
52 0.16
53 0.23
54 0.32
55 0.4
56 0.49
57 0.57
58 0.68
59 0.78
60 0.85
61 0.9
62 0.91
63 0.93
64 0.96
65 0.97
66 0.97
67 0.95
68 0.9
69 0.87
70 0.85
71 0.8
72 0.72
73 0.6
74 0.5
75 0.4
76 0.34
77 0.25
78 0.15
79 0.09
80 0.06
81 0.08
82 0.11
83 0.12
84 0.17
85 0.25
86 0.35
87 0.44
88 0.54
89 0.63
90 0.71
91 0.81
92 0.87
93 0.89
94 0.9
95 0.91
96 0.89
97 0.83
98 0.73
99 0.62
100 0.52
101 0.47
102 0.39
103 0.32
104 0.23
105 0.18
106 0.17
107 0.18
108 0.18
109 0.14
110 0.14
111 0.13
112 0.16
113 0.19
114 0.21
115 0.26
116 0.31
117 0.38
118 0.45
119 0.55
120 0.62
121 0.7
122 0.77
123 0.82
124 0.88
125 0.9
126 0.88
127 0.86
128 0.84
129 0.77
130 0.69
131 0.59
132 0.48
133 0.37
134 0.29
135 0.21
136 0.15
137 0.1
138 0.09
139 0.1
140 0.11
141 0.13
142 0.2
143 0.23
144 0.23
145 0.24
146 0.25
147 0.26
148 0.25
149 0.23
150 0.17
151 0.14
152 0.12
153 0.12
154 0.11
155 0.09
156 0.08
157 0.08
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.06
162 0.05
163 0.05
164 0.06
165 0.07
166 0.08
167 0.1
168 0.16
169 0.18
170 0.2
171 0.21
172 0.22
173 0.23
174 0.25
175 0.23
176 0.18
177 0.17
178 0.2
179 0.2
180 0.2
181 0.18
182 0.16
183 0.18
184 0.16
185 0.15
186 0.11
187 0.11
188 0.12
189 0.12
190 0.12
191 0.1
192 0.11
193 0.11
194 0.11
195 0.11
196 0.09
197 0.08
198 0.09
199 0.1
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.11
204 0.14
205 0.14
206 0.14
207 0.14
208 0.19
209 0.2
210 0.22
211 0.27
212 0.3
213 0.31
214 0.36
215 0.37
216 0.36
217 0.35
218 0.33
219 0.27
220 0.22
221 0.2
222 0.17
223 0.16
224 0.12
225 0.12
226 0.16
227 0.15
228 0.16
229 0.14
230 0.12
231 0.12
232 0.11
233 0.11
234 0.06
235 0.11
236 0.14
237 0.15
238 0.16
239 0.16
240 0.17
241 0.17
242 0.17
243 0.15
244 0.18
245 0.17
246 0.16
247 0.17
248 0.16
249 0.16
250 0.15
251 0.11
252 0.07
253 0.08
254 0.07
255 0.08
256 0.09
257 0.09
258 0.1
259 0.1
260 0.09
261 0.07
262 0.07
263 0.06
264 0.05
265 0.05
266 0.04
267 0.05
268 0.05
269 0.04
270 0.04
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.07
282 0.07
283 0.08
284 0.1
285 0.09
286 0.1
287 0.09
288 0.09
289 0.08
290 0.07
291 0.07
292 0.06
293 0.06
294 0.05
295 0.07
296 0.09
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.09
301 0.09
302 0.1
303 0.13
304 0.14
305 0.16
306 0.19
307 0.24
308 0.24
309 0.26
310 0.26
311 0.23
312 0.23
313 0.31
314 0.33
315 0.33
316 0.35
317 0.39
318 0.44
319 0.45
320 0.45
321 0.37
322 0.36
323 0.32
324 0.3
325 0.25
326 0.19
327 0.16
328 0.13
329 0.12
330 0.09
331 0.08
332 0.07
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.09
342 0.09
343 0.1
344 0.11
345 0.11
346 0.1
347 0.11
348 0.13
349 0.11
350 0.12
351 0.11
352 0.1
353 0.11
354 0.11
355 0.15
356 0.13
357 0.14
358 0.13
359 0.14
360 0.17
361 0.21
362 0.25
363 0.31
364 0.4
365 0.49
366 0.54
367 0.65
368 0.65
369 0.69
370 0.67
371 0.6
372 0.52
373 0.43
374 0.4
375 0.32
376 0.28
377 0.19
378 0.16
379 0.14
380 0.13
381 0.11
382 0.09
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.08
387 0.08
388 0.08
389 0.08
390 0.1
391 0.13
392 0.16
393 0.23
394 0.25
395 0.27
396 0.31
397 0.39
398 0.43
399 0.47
400 0.52
401 0.52
402 0.56
403 0.56
404 0.52
405 0.49
406 0.5
407 0.47
408 0.44
409 0.45
410 0.43
411 0.49
412 0.58
413 0.62
414 0.65
415 0.72
416 0.78
417 0.8
418 0.85
419 0.86
420 0.83
421 0.8
422 0.77
423 0.77
424 0.73
425 0.68
426 0.67
427 0.6
428 0.55
429 0.49
430 0.42
431 0.34
432 0.28
433 0.23
434 0.17
435 0.16
436 0.14
437 0.14
438 0.15
439 0.13
440 0.13
441 0.13
442 0.11
443 0.12
444 0.15
445 0.16