Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A162M4C1

Protein Details
Accession A0A162M4C1    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
226-247ISGSHGKKQRERERKVKHMVDFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
97-108ARVRGGRGSRRP
232-242KKQRERERKVK
255-289ERTRGGARGGRGGRGGRGGERGGERGRGGNFRGGR
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 11.5, cyto 9, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSQVASQNRFAFLGNDDSGEDKPIAPVKTVDKAPVRTTKRNTEPQPPAAPTRGTGNRRGAPRGNEAAFRDRGAGSDRNHTRSTDEAPRDGSRGGYGARVRGGRGSRRPRENDDRHTSRTGVHPGSEKQAAQSWGANEGDAELKDEQAGEAIAQSEKKEALNEDAAGEEPTEPEDKSVSYAEYLAQQAEKKLNIEGFKVREANEGSKLDKKWAGAKALEKPEDEDFISGSHGKKQRERERKVKHMVDFDPRFVEPERTRGGARGGRGGRGGRGGERGGERGRGGNFRGGRGGATAPINTKDESAFPSLGGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.19
4 0.2
5 0.2
6 0.21
7 0.19
8 0.13
9 0.16
10 0.2
11 0.21
12 0.2
13 0.23
14 0.25
15 0.32
16 0.33
17 0.36
18 0.38
19 0.41
20 0.46
21 0.52
22 0.55
23 0.58
24 0.63
25 0.67
26 0.69
27 0.75
28 0.74
29 0.75
30 0.75
31 0.73
32 0.73
33 0.67
34 0.62
35 0.56
36 0.51
37 0.42
38 0.42
39 0.44
40 0.4
41 0.44
42 0.47
43 0.49
44 0.52
45 0.57
46 0.54
47 0.5
48 0.53
49 0.53
50 0.47
51 0.45
52 0.45
53 0.45
54 0.41
55 0.37
56 0.32
57 0.25
58 0.24
59 0.25
60 0.27
61 0.23
62 0.31
63 0.35
64 0.38
65 0.39
66 0.39
67 0.36
68 0.33
69 0.37
70 0.37
71 0.35
72 0.32
73 0.35
74 0.36
75 0.35
76 0.32
77 0.26
78 0.17
79 0.16
80 0.15
81 0.15
82 0.15
83 0.15
84 0.18
85 0.18
86 0.18
87 0.22
88 0.26
89 0.29
90 0.37
91 0.46
92 0.51
93 0.59
94 0.63
95 0.67
96 0.73
97 0.73
98 0.73
99 0.72
100 0.7
101 0.66
102 0.63
103 0.56
104 0.47
105 0.43
106 0.4
107 0.31
108 0.27
109 0.26
110 0.25
111 0.28
112 0.28
113 0.23
114 0.18
115 0.22
116 0.21
117 0.19
118 0.19
119 0.15
120 0.16
121 0.16
122 0.15
123 0.11
124 0.1
125 0.1
126 0.08
127 0.1
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.03
136 0.03
137 0.04
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.06
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.1
147 0.1
148 0.11
149 0.1
150 0.1
151 0.1
152 0.09
153 0.09
154 0.06
155 0.05
156 0.06
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.08
163 0.09
164 0.08
165 0.07
166 0.08
167 0.08
168 0.1
169 0.1
170 0.09
171 0.09
172 0.1
173 0.11
174 0.13
175 0.13
176 0.12
177 0.13
178 0.16
179 0.16
180 0.18
181 0.2
182 0.2
183 0.23
184 0.23
185 0.23
186 0.24
187 0.25
188 0.25
189 0.26
190 0.26
191 0.25
192 0.3
193 0.29
194 0.29
195 0.28
196 0.27
197 0.28
198 0.3
199 0.31
200 0.29
201 0.33
202 0.38
203 0.43
204 0.44
205 0.38
206 0.37
207 0.34
208 0.33
209 0.29
210 0.21
211 0.14
212 0.12
213 0.14
214 0.14
215 0.13
216 0.19
217 0.24
218 0.28
219 0.33
220 0.44
221 0.53
222 0.61
223 0.69
224 0.72
225 0.77
226 0.83
227 0.86
228 0.83
229 0.78
230 0.75
231 0.71
232 0.71
233 0.64
234 0.56
235 0.49
236 0.42
237 0.39
238 0.33
239 0.37
240 0.28
241 0.32
242 0.33
243 0.32
244 0.32
245 0.32
246 0.37
247 0.32
248 0.32
249 0.35
250 0.33
251 0.33
252 0.36
253 0.35
254 0.3
255 0.31
256 0.31
257 0.24
258 0.26
259 0.25
260 0.26
261 0.26
262 0.29
263 0.27
264 0.28
265 0.27
266 0.27
267 0.3
268 0.3
269 0.31
270 0.34
271 0.34
272 0.33
273 0.35
274 0.31
275 0.28
276 0.26
277 0.25
278 0.2
279 0.21
280 0.21
281 0.2
282 0.23
283 0.25
284 0.23
285 0.23
286 0.21
287 0.21
288 0.23
289 0.25
290 0.22