Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A162JM09

Protein Details
Accession A0A162JM09    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
73-104AAVSHSGAKKGKKKKKKSKGKRTQHAVANGRABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
79-97GAKKGKKKKKKSKGKRTQH
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 9.5, mito 6, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006994  TCF25/Rqc1  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF04910  Tcf25  
Amino Acid Sequences MSSRQLRKLQQQKDLERVQISAPDDPEESQDTQGPIEAALKPRPNLFAALGGEEEGEEEDEDNGAPLAEPTAAAVSHSGAKKGKKKKKKSKGKRTQHAVANGRARAEAKESEDEIDRAIKELKLDSARTDIGPGSDEEDATTTGPRKRMIELLAINTYHLRVANEMRRLFGREVIESANAEEEQQSRTRRQQTPQQVDLETFLREPPGAKKLPEVSLRRNVFVQGRDHWPRQSAGGLSMEEMGKSSDGLSTEYAYVHDKNYDAEQAVFWAFVQIGDPMRMVHLLKESPYHVSTLLQVSSVAKQDQNMALAAELCERALFTFGRVTTSAFRHDIEHGRARLDFRRPENRQFWLAGFHYLRSLIRKGTFRTALEWAKLLYSLDPQDPYAMRHYIHVLALRAYQSKWWIDFMEQMALAADHPDMIYLRQSLVLARLQMNDVSGAREVLEHGIRTVPWLYCALFQELSLDTPPSIWGIGADSGSRSFWVKLYIHKAKDLWNNSQATTLLQQVARSLDKVDVASLLSQDPAVDRGATRLAYLEGQTSLLAAAPRHLLDAQPNYEFDPLPPPLEDNVFTAQSSQLPWEREGGSQEEVGQDRLPDELVVRMQNLLARRGVAPGGGMMGLMDNAGDEDEEDDEVRALRAADDEELQRDIEAHMDWGNEQGFLGTLMQMLGVGRRANDDGDDQGETGGDEEAPPPGAWPEEDAV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.71
3 0.63
4 0.56
5 0.48
6 0.43
7 0.39
8 0.34
9 0.3
10 0.27
11 0.27
12 0.26
13 0.27
14 0.26
15 0.25
16 0.23
17 0.25
18 0.23
19 0.22
20 0.23
21 0.2
22 0.16
23 0.17
24 0.19
25 0.2
26 0.27
27 0.32
28 0.32
29 0.34
30 0.37
31 0.35
32 0.34
33 0.31
34 0.29
35 0.26
36 0.26
37 0.23
38 0.2
39 0.19
40 0.15
41 0.14
42 0.09
43 0.08
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.08
48 0.08
49 0.07
50 0.07
51 0.06
52 0.06
53 0.05
54 0.06
55 0.06
56 0.06
57 0.06
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.08
62 0.08
63 0.14
64 0.15
65 0.19
66 0.23
67 0.31
68 0.4
69 0.51
70 0.6
71 0.65
72 0.76
73 0.83
74 0.89
75 0.93
76 0.95
77 0.96
78 0.96
79 0.97
80 0.96
81 0.94
82 0.92
83 0.88
84 0.87
85 0.81
86 0.78
87 0.74
88 0.65
89 0.56
90 0.49
91 0.42
92 0.34
93 0.32
94 0.27
95 0.24
96 0.27
97 0.27
98 0.28
99 0.29
100 0.27
101 0.24
102 0.24
103 0.2
104 0.18
105 0.19
106 0.17
107 0.17
108 0.18
109 0.22
110 0.23
111 0.24
112 0.23
113 0.25
114 0.26
115 0.25
116 0.25
117 0.2
118 0.16
119 0.16
120 0.15
121 0.13
122 0.12
123 0.12
124 0.11
125 0.11
126 0.11
127 0.11
128 0.13
129 0.15
130 0.18
131 0.21
132 0.23
133 0.24
134 0.26
135 0.3
136 0.3
137 0.33
138 0.32
139 0.33
140 0.34
141 0.32
142 0.31
143 0.26
144 0.24
145 0.18
146 0.16
147 0.12
148 0.11
149 0.19
150 0.25
151 0.32
152 0.32
153 0.32
154 0.33
155 0.36
156 0.35
157 0.33
158 0.28
159 0.22
160 0.24
161 0.23
162 0.23
163 0.19
164 0.18
165 0.15
166 0.12
167 0.12
168 0.11
169 0.11
170 0.12
171 0.17
172 0.2
173 0.22
174 0.31
175 0.4
176 0.44
177 0.49
178 0.56
179 0.62
180 0.68
181 0.69
182 0.65
183 0.56
184 0.51
185 0.47
186 0.39
187 0.29
188 0.2
189 0.15
190 0.12
191 0.11
192 0.12
193 0.14
194 0.19
195 0.2
196 0.21
197 0.25
198 0.28
199 0.34
200 0.4
201 0.42
202 0.42
203 0.49
204 0.5
205 0.47
206 0.44
207 0.41
208 0.37
209 0.36
210 0.33
211 0.27
212 0.34
213 0.38
214 0.4
215 0.39
216 0.37
217 0.34
218 0.31
219 0.3
220 0.22
221 0.18
222 0.18
223 0.16
224 0.15
225 0.16
226 0.14
227 0.11
228 0.11
229 0.09
230 0.07
231 0.07
232 0.06
233 0.06
234 0.07
235 0.08
236 0.08
237 0.09
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.12
242 0.12
243 0.11
244 0.12
245 0.11
246 0.11
247 0.13
248 0.13
249 0.11
250 0.11
251 0.1
252 0.11
253 0.1
254 0.09
255 0.08
256 0.06
257 0.06
258 0.05
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.09
267 0.08
268 0.08
269 0.1
270 0.1
271 0.11
272 0.13
273 0.13
274 0.15
275 0.15
276 0.15
277 0.12
278 0.12
279 0.13
280 0.14
281 0.13
282 0.1
283 0.1
284 0.1
285 0.11
286 0.12
287 0.12
288 0.1
289 0.1
290 0.13
291 0.13
292 0.13
293 0.11
294 0.1
295 0.09
296 0.09
297 0.09
298 0.07
299 0.06
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.09
308 0.09
309 0.11
310 0.11
311 0.13
312 0.14
313 0.16
314 0.18
315 0.16
316 0.17
317 0.16
318 0.19
319 0.22
320 0.23
321 0.27
322 0.25
323 0.25
324 0.25
325 0.26
326 0.27
327 0.29
328 0.3
329 0.3
330 0.4
331 0.43
332 0.5
333 0.52
334 0.5
335 0.46
336 0.42
337 0.37
338 0.3
339 0.27
340 0.24
341 0.2
342 0.17
343 0.16
344 0.15
345 0.16
346 0.14
347 0.15
348 0.12
349 0.16
350 0.19
351 0.21
352 0.25
353 0.28
354 0.26
355 0.27
356 0.3
357 0.28
358 0.26
359 0.24
360 0.19
361 0.15
362 0.15
363 0.13
364 0.08
365 0.08
366 0.09
367 0.1
368 0.1
369 0.1
370 0.12
371 0.12
372 0.13
373 0.14
374 0.14
375 0.13
376 0.14
377 0.15
378 0.14
379 0.15
380 0.15
381 0.13
382 0.12
383 0.13
384 0.14
385 0.13
386 0.12
387 0.12
388 0.13
389 0.14
390 0.14
391 0.14
392 0.14
393 0.13
394 0.16
395 0.16
396 0.15
397 0.13
398 0.12
399 0.11
400 0.1
401 0.09
402 0.07
403 0.05
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.05
409 0.06
410 0.06
411 0.06
412 0.07
413 0.07
414 0.07
415 0.09
416 0.1
417 0.11
418 0.12
419 0.12
420 0.12
421 0.12
422 0.12
423 0.11
424 0.1
425 0.1
426 0.09
427 0.08
428 0.07
429 0.07
430 0.07
431 0.09
432 0.09
433 0.08
434 0.08
435 0.09
436 0.09
437 0.11
438 0.12
439 0.1
440 0.1
441 0.11
442 0.12
443 0.14
444 0.16
445 0.17
446 0.14
447 0.14
448 0.15
449 0.14
450 0.14
451 0.12
452 0.11
453 0.08
454 0.08
455 0.09
456 0.07
457 0.07
458 0.05
459 0.05
460 0.06
461 0.07
462 0.07
463 0.07
464 0.07
465 0.08
466 0.08
467 0.09
468 0.09
469 0.08
470 0.09
471 0.14
472 0.14
473 0.2
474 0.29
475 0.36
476 0.36
477 0.39
478 0.39
479 0.41
480 0.49
481 0.48
482 0.44
483 0.43
484 0.44
485 0.41
486 0.42
487 0.34
488 0.28
489 0.24
490 0.2
491 0.17
492 0.15
493 0.15
494 0.15
495 0.17
496 0.17
497 0.16
498 0.15
499 0.13
500 0.13
501 0.14
502 0.12
503 0.1
504 0.1
505 0.1
506 0.1
507 0.09
508 0.08
509 0.07
510 0.07
511 0.07
512 0.08
513 0.08
514 0.07
515 0.07
516 0.09
517 0.11
518 0.11
519 0.11
520 0.1
521 0.11
522 0.12
523 0.12
524 0.12
525 0.1
526 0.1
527 0.1
528 0.09
529 0.08
530 0.08
531 0.09
532 0.07
533 0.08
534 0.1
535 0.1
536 0.11
537 0.12
538 0.11
539 0.16
540 0.21
541 0.23
542 0.23
543 0.23
544 0.24
545 0.25
546 0.24
547 0.19
548 0.2
549 0.19
550 0.19
551 0.19
552 0.19
553 0.19
554 0.21
555 0.21
556 0.17
557 0.19
558 0.19
559 0.18
560 0.17
561 0.17
562 0.15
563 0.15
564 0.16
565 0.18
566 0.19
567 0.2
568 0.23
569 0.24
570 0.24
571 0.26
572 0.26
573 0.23
574 0.21
575 0.21
576 0.21
577 0.2
578 0.2
579 0.18
580 0.15
581 0.13
582 0.13
583 0.13
584 0.09
585 0.09
586 0.1
587 0.12
588 0.13
589 0.14
590 0.14
591 0.14
592 0.16
593 0.18
594 0.18
595 0.16
596 0.17
597 0.17
598 0.18
599 0.18
600 0.15
601 0.13
602 0.11
603 0.1
604 0.08
605 0.08
606 0.06
607 0.06
608 0.05
609 0.05
610 0.04
611 0.03
612 0.03
613 0.04
614 0.04
615 0.04
616 0.05
617 0.06
618 0.07
619 0.07
620 0.08
621 0.08
622 0.09
623 0.09
624 0.09
625 0.08
626 0.08
627 0.09
628 0.1
629 0.11
630 0.14
631 0.15
632 0.17
633 0.18
634 0.17
635 0.16
636 0.15
637 0.14
638 0.13
639 0.11
640 0.11
641 0.11
642 0.12
643 0.12
644 0.15
645 0.15
646 0.13
647 0.12
648 0.11
649 0.1
650 0.1
651 0.1
652 0.07
653 0.07
654 0.07
655 0.07
656 0.07
657 0.07
658 0.08
659 0.1
660 0.11
661 0.11
662 0.14
663 0.16
664 0.16
665 0.18
666 0.19
667 0.18
668 0.2
669 0.21
670 0.18
671 0.17
672 0.16
673 0.14
674 0.12
675 0.1
676 0.07
677 0.07
678 0.07
679 0.09
680 0.11
681 0.1
682 0.11
683 0.11
684 0.13
685 0.13