Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A162LSA1

Protein Details
Accession A0A162LSA1    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
309-333REEDPNAPPRKRRKSKNVRSTAVDDHydrophilic
339-362DDATSSKSGRKRKTKSERSASGSEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
316-324PPRKRRKSK
346-357SGRKRKTKSERS
371-385SRRRKSGANGPKPPR
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011598  bHLH_dom  
IPR036638  HLH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0046983  F:protein dimerization activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00010  HLH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50888  BHLH  
CDD cd11404  bHLHzip_Mlx_like  
Amino Acid Sequences MLAVQHTPRMGSTQPESDPLLLFGYSVDSTQPDVFDAAPDPAPGAPLLTETDSKFLSSFFEDMTSNQYNMPSFGEGLNFSDAWLDLPPQFMGSSTSLGPQETSADFGFSHDHQSEMSRMLSAGSSMMPPPPLPPTAHTQPFSQQHSDDVLNAAATLLQNGNRAGTPKSGSGPSNSHNSSNNANRPVAYPPVGHLRHQPMEEFREDNRRSSQGAEVDHTFTRWMWGSKPKSPVSKSVLGDFQWGSDASFSDVQGYVPEPGNESVESMHQNHMKCLDCLEVNKSAANTRPSSPANGQPTSSNSDRPFYIKREEDPNAPPRKRRKSKNVRSTAVDDDDDDDDDATSSKSGRKRKTKSERSASGSEPPSDTTASSRRRKSGANGPKPPRENLSEEQKRENHIRSEQKRRTLIKEGFDDLGELVPGLKGGGFSKSATLSMAAEYLDELLRGNKALAMQVSALERR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.33
3 0.35
4 0.33
5 0.32
6 0.27
7 0.24
8 0.17
9 0.15
10 0.12
11 0.13
12 0.12
13 0.11
14 0.11
15 0.1
16 0.13
17 0.14
18 0.15
19 0.12
20 0.13
21 0.13
22 0.14
23 0.14
24 0.14
25 0.14
26 0.13
27 0.13
28 0.12
29 0.13
30 0.11
31 0.1
32 0.08
33 0.08
34 0.11
35 0.12
36 0.15
37 0.15
38 0.18
39 0.17
40 0.18
41 0.17
42 0.15
43 0.15
44 0.15
45 0.15
46 0.13
47 0.15
48 0.14
49 0.15
50 0.22
51 0.22
52 0.2
53 0.2
54 0.21
55 0.2
56 0.2
57 0.22
58 0.16
59 0.14
60 0.14
61 0.15
62 0.14
63 0.15
64 0.17
65 0.14
66 0.13
67 0.13
68 0.12
69 0.11
70 0.11
71 0.11
72 0.09
73 0.11
74 0.11
75 0.11
76 0.11
77 0.1
78 0.12
79 0.12
80 0.14
81 0.13
82 0.15
83 0.15
84 0.15
85 0.15
86 0.12
87 0.14
88 0.12
89 0.14
90 0.12
91 0.12
92 0.12
93 0.12
94 0.15
95 0.13
96 0.17
97 0.15
98 0.15
99 0.14
100 0.16
101 0.17
102 0.17
103 0.16
104 0.12
105 0.11
106 0.12
107 0.11
108 0.09
109 0.08
110 0.07
111 0.07
112 0.08
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.1
117 0.13
118 0.14
119 0.15
120 0.16
121 0.23
122 0.29
123 0.35
124 0.35
125 0.34
126 0.39
127 0.43
128 0.45
129 0.4
130 0.34
131 0.3
132 0.32
133 0.31
134 0.24
135 0.19
136 0.15
137 0.12
138 0.11
139 0.09
140 0.07
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.07
145 0.09
146 0.09
147 0.1
148 0.1
149 0.11
150 0.12
151 0.14
152 0.15
153 0.14
154 0.17
155 0.19
156 0.19
157 0.21
158 0.23
159 0.22
160 0.27
161 0.27
162 0.27
163 0.27
164 0.29
165 0.31
166 0.35
167 0.38
168 0.34
169 0.34
170 0.32
171 0.31
172 0.31
173 0.28
174 0.22
175 0.17
176 0.15
177 0.24
178 0.25
179 0.24
180 0.27
181 0.3
182 0.31
183 0.32
184 0.31
185 0.25
186 0.28
187 0.29
188 0.25
189 0.21
190 0.29
191 0.29
192 0.3
193 0.3
194 0.28
195 0.27
196 0.27
197 0.28
198 0.22
199 0.22
200 0.21
201 0.2
202 0.21
203 0.2
204 0.18
205 0.15
206 0.11
207 0.12
208 0.11
209 0.1
210 0.11
211 0.2
212 0.24
213 0.29
214 0.36
215 0.38
216 0.43
217 0.44
218 0.48
219 0.45
220 0.48
221 0.43
222 0.39
223 0.38
224 0.31
225 0.32
226 0.25
227 0.19
228 0.13
229 0.12
230 0.1
231 0.08
232 0.08
233 0.07
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.1
246 0.11
247 0.1
248 0.1
249 0.09
250 0.1
251 0.12
252 0.12
253 0.15
254 0.18
255 0.18
256 0.19
257 0.22
258 0.22
259 0.2
260 0.19
261 0.18
262 0.15
263 0.16
264 0.19
265 0.18
266 0.17
267 0.18
268 0.17
269 0.17
270 0.2
271 0.22
272 0.21
273 0.2
274 0.25
275 0.25
276 0.28
277 0.29
278 0.32
279 0.35
280 0.34
281 0.32
282 0.29
283 0.31
284 0.32
285 0.31
286 0.29
287 0.24
288 0.25
289 0.25
290 0.28
291 0.29
292 0.28
293 0.33
294 0.31
295 0.33
296 0.38
297 0.4
298 0.41
299 0.43
300 0.49
301 0.52
302 0.52
303 0.57
304 0.6
305 0.68
306 0.73
307 0.77
308 0.79
309 0.8
310 0.88
311 0.92
312 0.91
313 0.85
314 0.81
315 0.75
316 0.69
317 0.61
318 0.5
319 0.4
320 0.32
321 0.28
322 0.23
323 0.18
324 0.13
325 0.09
326 0.09
327 0.09
328 0.07
329 0.06
330 0.07
331 0.12
332 0.19
333 0.27
334 0.37
335 0.47
336 0.55
337 0.66
338 0.76
339 0.82
340 0.86
341 0.88
342 0.86
343 0.83
344 0.8
345 0.71
346 0.68
347 0.6
348 0.51
349 0.42
350 0.35
351 0.3
352 0.26
353 0.24
354 0.21
355 0.26
356 0.33
357 0.4
358 0.44
359 0.47
360 0.5
361 0.53
362 0.55
363 0.57
364 0.59
365 0.62
366 0.67
367 0.7
368 0.76
369 0.76
370 0.72
371 0.66
372 0.6
373 0.56
374 0.52
375 0.56
376 0.56
377 0.55
378 0.61
379 0.59
380 0.59
381 0.59
382 0.58
383 0.54
384 0.54
385 0.61
386 0.62
387 0.71
388 0.73
389 0.75
390 0.78
391 0.77
392 0.75
393 0.74
394 0.71
395 0.67
396 0.65
397 0.59
398 0.52
399 0.46
400 0.4
401 0.3
402 0.25
403 0.17
404 0.11
405 0.08
406 0.07
407 0.06
408 0.06
409 0.05
410 0.06
411 0.07
412 0.1
413 0.11
414 0.12
415 0.15
416 0.16
417 0.16
418 0.16
419 0.16
420 0.14
421 0.14
422 0.14
423 0.11
424 0.1
425 0.1
426 0.1
427 0.09
428 0.08
429 0.08
430 0.09
431 0.1
432 0.11
433 0.11
434 0.11
435 0.12
436 0.15
437 0.16
438 0.16
439 0.15
440 0.17