Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A167DMF2

Protein Details
Accession A0A167DMF2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
308-337SEAEIKKSLARKRQRRRQKQKDNKVEDVDAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
312-328IKKSLARKRQRRRQKQK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12.5, cyto 11.5, nucl 10.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR047575  Sm  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
IPR007148  SSU_processome_Utp12  
IPR016654  U6_snRNA_Lsm2  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
PF04003  Utp12  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52002  SM  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd01725  LSm2  
cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MVKSYLKYEHAKSFGVITTNTSNIIWTAKDRSGNHTGQAVVAANEDILCWDIKKGELISRWRDERCTVPVTAIAQSKADKDIFAVGYEDGSIRLWDSKTSTVIVHFNGHKSAITKLVFDSTGVRLASGSKDTDVIIWDLVAEVGLFKLRGHKDQVTGLQFIEPKLQVENDDRSHAMVLDDENPSDGFLLTTGKDSLLKLWDLSSRHCIETHISQTNGECWALGVSPDLSGCITAGNDGEMKVWSLDNERLAASAQQVDVSAVAHYLHDRGVLHRQSKDRAIELLFHPHRDYFTVHGSEKSVDVWRIKSEAEIKKSLARKRQRRRQKQKDNKVEDVDAENGDEANEDVSKADVGDVFVQYVIVRTGGKARSVDWAASSNQKDLQLLVSTANNQLEYYSIPQKEKAERKKKDDIPDYTRGLTVELPGHRADIRALSLSSDDKMLASAANGSMKVWNIKTQACIRTFECGYALCCAFLPGDKVVVVGTKSGELQLFDVASASLLDNVQAHEGAIWSLSVHPDGRSVVSGSADKTAKFWEFKIVQEEILGTRRTTPRLKLIQSRTLKVSDDILSLKFSPDAKLLAVALLDNTVKVFFVDSLKLYLNLYGHKLPVLSMDISYDSKLIVTSSADKNIRLWGLDFGDCHKALFGHQDSILQVAFVPHNSDGNGHHFFSSSKDRTIRYWDGDKFEQIQRLDGHHGEIWTMAISHTGNFLVSASHDKSIRVWEETDEQIFLEEEREKEMEELYESTLTTSLENNPDAEDENDEVAAATKQTTETLMAGERIQEALEMGMADLNLMKEYEEAKLVNAQAPAPQRNPIFLALGNITAEAHVMSVLQRIKASALHDALLVLPFATVPVLFTFLNIFAMRSMNMPLTCRILFFMVKTHHKQIVASRTMKVMMDGIRTNLRAALKRQKDEMGVNIAALKVVGMQIRDRSVKDYVDETWEDENPEKKTDFDPVARPIDHVMYMDPQAPKRDGNLGSKHQDINISKKNHQKLSSLKRVSAEDLIRTLAQSEPGSQSPPRAADLRETATREDAVFQCQGSNEEFSFFKTLIEHEVTVELKNDIQLKGTLKSVDQYLNIKLDDISVVEELKYPHLSSVKNVFIRGSVVRYVHLPAGSVDTQLLEDATRREAAAQQAKAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.35
3 0.3
4 0.26
5 0.26
6 0.26
7 0.27
8 0.23
9 0.2
10 0.18
11 0.2
12 0.16
13 0.16
14 0.21
15 0.24
16 0.32
17 0.33
18 0.39
19 0.46
20 0.46
21 0.45
22 0.43
23 0.39
24 0.32
25 0.32
26 0.26
27 0.18
28 0.17
29 0.14
30 0.11
31 0.1
32 0.1
33 0.08
34 0.08
35 0.08
36 0.07
37 0.09
38 0.1
39 0.11
40 0.15
41 0.17
42 0.23
43 0.29
44 0.37
45 0.44
46 0.5
47 0.56
48 0.55
49 0.56
50 0.53
51 0.51
52 0.5
53 0.46
54 0.38
55 0.33
56 0.34
57 0.33
58 0.34
59 0.32
60 0.27
61 0.25
62 0.27
63 0.27
64 0.28
65 0.26
66 0.21
67 0.18
68 0.23
69 0.21
70 0.2
71 0.2
72 0.16
73 0.15
74 0.16
75 0.15
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.12
81 0.13
82 0.15
83 0.18
84 0.2
85 0.22
86 0.23
87 0.23
88 0.23
89 0.25
90 0.25
91 0.28
92 0.28
93 0.29
94 0.29
95 0.29
96 0.27
97 0.25
98 0.25
99 0.26
100 0.24
101 0.23
102 0.22
103 0.25
104 0.23
105 0.22
106 0.23
107 0.18
108 0.22
109 0.21
110 0.19
111 0.16
112 0.18
113 0.2
114 0.19
115 0.18
116 0.14
117 0.15
118 0.15
119 0.16
120 0.16
121 0.14
122 0.12
123 0.1
124 0.09
125 0.08
126 0.08
127 0.07
128 0.05
129 0.04
130 0.04
131 0.05
132 0.06
133 0.06
134 0.15
135 0.18
136 0.22
137 0.28
138 0.32
139 0.34
140 0.4
141 0.47
142 0.42
143 0.4
144 0.37
145 0.34
146 0.32
147 0.3
148 0.29
149 0.22
150 0.2
151 0.2
152 0.2
153 0.2
154 0.23
155 0.3
156 0.26
157 0.29
158 0.29
159 0.28
160 0.28
161 0.25
162 0.2
163 0.14
164 0.14
165 0.14
166 0.15
167 0.14
168 0.14
169 0.14
170 0.14
171 0.13
172 0.11
173 0.07
174 0.06
175 0.08
176 0.08
177 0.1
178 0.1
179 0.1
180 0.12
181 0.12
182 0.15
183 0.16
184 0.16
185 0.15
186 0.16
187 0.2
188 0.21
189 0.24
190 0.29
191 0.29
192 0.29
193 0.29
194 0.29
195 0.28
196 0.33
197 0.37
198 0.34
199 0.32
200 0.32
201 0.32
202 0.33
203 0.3
204 0.23
205 0.16
206 0.11
207 0.11
208 0.1
209 0.09
210 0.09
211 0.07
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.08
227 0.09
228 0.09
229 0.09
230 0.09
231 0.12
232 0.14
233 0.15
234 0.16
235 0.15
236 0.15
237 0.15
238 0.15
239 0.13
240 0.12
241 0.11
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.1
246 0.09
247 0.07
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.07
254 0.08
255 0.09
256 0.11
257 0.2
258 0.26
259 0.3
260 0.35
261 0.39
262 0.41
263 0.46
264 0.47
265 0.39
266 0.37
267 0.33
268 0.32
269 0.3
270 0.36
271 0.32
272 0.3
273 0.3
274 0.28
275 0.27
276 0.25
277 0.25
278 0.18
279 0.22
280 0.25
281 0.25
282 0.25
283 0.26
284 0.25
285 0.23
286 0.22
287 0.19
288 0.18
289 0.2
290 0.2
291 0.2
292 0.21
293 0.2
294 0.21
295 0.28
296 0.31
297 0.34
298 0.35
299 0.35
300 0.4
301 0.47
302 0.5
303 0.5
304 0.54
305 0.6
306 0.68
307 0.78
308 0.82
309 0.87
310 0.92
311 0.94
312 0.95
313 0.96
314 0.96
315 0.96
316 0.93
317 0.89
318 0.81
319 0.71
320 0.61
321 0.53
322 0.44
323 0.33
324 0.24
325 0.17
326 0.13
327 0.12
328 0.09
329 0.06
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.06
338 0.05
339 0.06
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.07
344 0.08
345 0.07
346 0.07
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.12
352 0.13
353 0.16
354 0.15
355 0.16
356 0.21
357 0.22
358 0.22
359 0.18
360 0.19
361 0.18
362 0.25
363 0.25
364 0.21
365 0.22
366 0.22
367 0.21
368 0.19
369 0.19
370 0.14
371 0.13
372 0.13
373 0.11
374 0.12
375 0.14
376 0.14
377 0.12
378 0.11
379 0.1
380 0.1
381 0.1
382 0.12
383 0.17
384 0.19
385 0.19
386 0.22
387 0.26
388 0.34
389 0.43
390 0.5
391 0.54
392 0.59
393 0.66
394 0.73
395 0.76
396 0.77
397 0.77
398 0.74
399 0.7
400 0.7
401 0.65
402 0.56
403 0.49
404 0.4
405 0.32
406 0.24
407 0.19
408 0.16
409 0.14
410 0.15
411 0.15
412 0.16
413 0.15
414 0.15
415 0.14
416 0.1
417 0.11
418 0.1
419 0.1
420 0.09
421 0.1
422 0.11
423 0.1
424 0.09
425 0.08
426 0.07
427 0.07
428 0.07
429 0.06
430 0.05
431 0.05
432 0.06
433 0.06
434 0.06
435 0.07
436 0.08
437 0.08
438 0.11
439 0.1
440 0.14
441 0.15
442 0.16
443 0.2
444 0.25
445 0.3
446 0.3
447 0.32
448 0.29
449 0.31
450 0.31
451 0.27
452 0.22
453 0.16
454 0.16
455 0.15
456 0.15
457 0.1
458 0.09
459 0.09
460 0.09
461 0.08
462 0.1
463 0.07
464 0.08
465 0.08
466 0.08
467 0.07
468 0.08
469 0.08
470 0.07
471 0.07
472 0.06
473 0.07
474 0.07
475 0.08
476 0.07
477 0.07
478 0.07
479 0.07
480 0.06
481 0.06
482 0.05
483 0.05
484 0.05
485 0.04
486 0.04
487 0.04
488 0.05
489 0.05
490 0.05
491 0.06
492 0.05
493 0.05
494 0.04
495 0.05
496 0.04
497 0.04
498 0.04
499 0.03
500 0.04
501 0.04
502 0.05
503 0.06
504 0.06
505 0.07
506 0.08
507 0.08
508 0.08
509 0.08
510 0.08
511 0.09
512 0.09
513 0.09
514 0.13
515 0.13
516 0.12
517 0.12
518 0.14
519 0.15
520 0.15
521 0.15
522 0.18
523 0.19
524 0.2
525 0.24
526 0.22
527 0.2
528 0.19
529 0.19
530 0.13
531 0.15
532 0.14
533 0.1
534 0.14
535 0.16
536 0.2
537 0.22
538 0.23
539 0.28
540 0.33
541 0.37
542 0.41
543 0.45
544 0.5
545 0.5
546 0.5
547 0.44
548 0.39
549 0.36
550 0.28
551 0.26
552 0.17
553 0.16
554 0.15
555 0.13
556 0.13
557 0.12
558 0.12
559 0.11
560 0.1
561 0.1
562 0.1
563 0.1
564 0.09
565 0.09
566 0.09
567 0.07
568 0.07
569 0.05
570 0.05
571 0.05
572 0.05
573 0.04
574 0.04
575 0.04
576 0.04
577 0.04
578 0.04
579 0.04
580 0.06
581 0.07
582 0.07
583 0.09
584 0.09
585 0.1
586 0.1
587 0.1
588 0.1
589 0.1
590 0.12
591 0.11
592 0.11
593 0.11
594 0.11
595 0.09
596 0.1
597 0.11
598 0.08
599 0.07
600 0.08
601 0.09
602 0.1
603 0.1
604 0.09
605 0.07
606 0.06
607 0.06
608 0.06
609 0.05
610 0.05
611 0.1
612 0.11
613 0.16
614 0.17
615 0.17
616 0.18
617 0.19
618 0.19
619 0.15
620 0.14
621 0.11
622 0.13
623 0.13
624 0.13
625 0.13
626 0.16
627 0.16
628 0.15
629 0.12
630 0.11
631 0.1
632 0.16
633 0.15
634 0.13
635 0.14
636 0.15
637 0.15
638 0.16
639 0.15
640 0.09
641 0.07
642 0.07
643 0.07
644 0.06
645 0.08
646 0.07
647 0.08
648 0.08
649 0.09
650 0.1
651 0.15
652 0.17
653 0.16
654 0.16
655 0.16
656 0.16
657 0.19
658 0.26
659 0.22
660 0.24
661 0.26
662 0.28
663 0.29
664 0.37
665 0.36
666 0.32
667 0.37
668 0.36
669 0.38
670 0.38
671 0.38
672 0.34
673 0.33
674 0.34
675 0.27
676 0.27
677 0.23
678 0.24
679 0.26
680 0.22
681 0.21
682 0.17
683 0.17
684 0.14
685 0.13
686 0.11
687 0.08
688 0.07
689 0.05
690 0.05
691 0.05
692 0.06
693 0.06
694 0.06
695 0.06
696 0.06
697 0.06
698 0.05
699 0.06
700 0.1
701 0.11
702 0.13
703 0.13
704 0.13
705 0.15
706 0.19
707 0.2
708 0.18
709 0.17
710 0.17
711 0.2
712 0.21
713 0.21
714 0.16
715 0.14
716 0.13
717 0.12
718 0.1
719 0.09
720 0.09
721 0.09
722 0.11
723 0.11
724 0.11
725 0.12
726 0.12
727 0.1
728 0.1
729 0.1
730 0.09
731 0.1
732 0.09
733 0.09
734 0.1
735 0.09
736 0.09
737 0.09
738 0.11
739 0.13
740 0.13
741 0.13
742 0.13
743 0.13
744 0.14
745 0.13
746 0.12
747 0.1
748 0.1
749 0.1
750 0.09
751 0.09
752 0.08
753 0.08
754 0.06
755 0.05
756 0.05
757 0.06
758 0.06
759 0.07
760 0.07
761 0.07
762 0.08
763 0.09
764 0.1
765 0.09
766 0.1
767 0.09
768 0.09
769 0.08
770 0.07
771 0.06
772 0.05
773 0.05
774 0.04
775 0.04
776 0.04
777 0.04
778 0.04
779 0.05
780 0.05
781 0.05
782 0.05
783 0.05
784 0.06
785 0.07
786 0.08
787 0.09
788 0.09
789 0.09
790 0.12
791 0.13
792 0.15
793 0.15
794 0.14
795 0.17
796 0.22
797 0.25
798 0.23
799 0.28
800 0.25
801 0.26
802 0.27
803 0.25
804 0.21
805 0.18
806 0.19
807 0.14
808 0.15
809 0.13
810 0.11
811 0.1
812 0.08
813 0.08
814 0.05
815 0.04
816 0.04
817 0.04
818 0.04
819 0.09
820 0.1
821 0.11
822 0.11
823 0.12
824 0.13
825 0.15
826 0.16
827 0.17
828 0.16
829 0.16
830 0.16
831 0.16
832 0.15
833 0.13
834 0.11
835 0.06
836 0.05
837 0.04
838 0.04
839 0.04
840 0.04
841 0.04
842 0.05
843 0.07
844 0.07
845 0.08
846 0.09
847 0.09
848 0.12
849 0.11
850 0.11
851 0.09
852 0.1
853 0.11
854 0.1
855 0.12
856 0.12
857 0.13
858 0.15
859 0.16
860 0.19
861 0.19
862 0.18
863 0.18
864 0.17
865 0.17
866 0.16
867 0.21
868 0.23
869 0.3
870 0.35
871 0.39
872 0.4
873 0.4
874 0.42
875 0.42
876 0.46
877 0.46
878 0.44
879 0.4
880 0.38
881 0.38
882 0.36
883 0.29
884 0.23
885 0.18
886 0.19
887 0.19
888 0.2
889 0.22
890 0.23
891 0.23
892 0.23
893 0.24
894 0.24
895 0.3
896 0.38
897 0.42
898 0.44
899 0.47
900 0.47
901 0.47
902 0.45
903 0.43
904 0.39
905 0.31
906 0.28
907 0.26
908 0.22
909 0.18
910 0.15
911 0.11
912 0.05
913 0.07
914 0.08
915 0.08
916 0.11
917 0.14
918 0.18
919 0.21
920 0.22
921 0.24
922 0.25
923 0.26
924 0.26
925 0.25
926 0.23
927 0.25
928 0.25
929 0.24
930 0.24
931 0.23
932 0.24
933 0.25
934 0.28
935 0.25
936 0.28
937 0.26
938 0.25
939 0.25
940 0.29
941 0.31
942 0.31
943 0.34
944 0.37
945 0.42
946 0.4
947 0.39
948 0.35
949 0.32
950 0.28
951 0.23
952 0.19
953 0.16
954 0.17
955 0.21
956 0.22
957 0.23
958 0.26
959 0.28
960 0.27
961 0.27
962 0.33
963 0.33
964 0.38
965 0.43
966 0.46
967 0.48
968 0.51
969 0.5
970 0.44
971 0.47
972 0.42
973 0.44
974 0.45
975 0.47
976 0.49
977 0.57
978 0.64
979 0.64
980 0.63
981 0.61
982 0.63
983 0.68
984 0.72
985 0.68
986 0.62
987 0.59
988 0.58
989 0.54
990 0.51
991 0.43
992 0.35
993 0.32
994 0.31
995 0.27
996 0.25
997 0.23
998 0.16
999 0.18
1000 0.15
1001 0.17
1002 0.19
1003 0.2
1004 0.24
1005 0.23
1006 0.25
1007 0.26
1008 0.27
1009 0.27
1010 0.26
1011 0.26
1012 0.29
1013 0.34
1014 0.36
1015 0.37
1016 0.37
1017 0.36
1018 0.35
1019 0.35
1020 0.29
1021 0.29
1022 0.25
1023 0.24
1024 0.23
1025 0.21
1026 0.2
1027 0.2
1028 0.22
1029 0.19
1030 0.21
1031 0.17
1032 0.18
1033 0.18
1034 0.2
1035 0.22
1036 0.2
1037 0.18
1038 0.15
1039 0.16
1040 0.19
1041 0.22
1042 0.2
1043 0.18
1044 0.22
1045 0.22
1046 0.22
1047 0.22
1048 0.17
1049 0.14
1050 0.18
1051 0.2
1052 0.17
1053 0.18
1054 0.22
1055 0.23
1056 0.25
1057 0.27
1058 0.25
1059 0.22
1060 0.25
1061 0.26
1062 0.26
1063 0.26
1064 0.28
1065 0.29
1066 0.31
1067 0.3
1068 0.29
1069 0.25
1070 0.22
1071 0.19
1072 0.16
1073 0.14
1074 0.11
1075 0.12
1076 0.12
1077 0.14
1078 0.14
1079 0.18
1080 0.19
1081 0.17
1082 0.21
1083 0.25
1084 0.26
1085 0.29
1086 0.36
1087 0.41
1088 0.41
1089 0.41
1090 0.37
1091 0.34
1092 0.37
1093 0.34
1094 0.29
1095 0.26
1096 0.24
1097 0.24
1098 0.26
1099 0.27
1100 0.27
1101 0.24
1102 0.21
1103 0.17
1104 0.23
1105 0.22
1106 0.21
1107 0.19
1108 0.15
1109 0.16
1110 0.15
1111 0.14
1112 0.09
1113 0.11
1114 0.12
1115 0.14
1116 0.15
1117 0.15
1118 0.16
1119 0.2
1120 0.28
1121 0.35