Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q2PIT4

Protein Details
Accession Q2PIT4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
105-124SVSFRRREPLRRDSLKRREABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
109-136RRREPLRRDSLKRREALLKGKDGSRRRQ
195-216GTKGEKHRVPKDLRLKLKHARA
Subcellular Location(s) nucl 11.5, mito 9, cyto_nucl 8.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025952  R3H-assoc_dom  
IPR036867  R3H_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
KEGG aor:AO090206000072  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13902  R3H-assoc  
CDD cd02325  R3H  
Amino Acid Sequences MAIHPTLSPQSNAQGTLSPQQARAISAWSEQAAAHLGNLTISDSVPAADQHRAGPESPSTRGALRGTTVTLSIPLDDPVPSTGNTSAPRVKLLGQPSAQTQQVPSVSFRRREPLRRDSLKRREALLKGKDGSRRRQRWENDRLLNNPWAEPPSSRDWAVEPTYTRHDPMPYYLAPLWDVHYKHIDHTSSRQTAKGTKGEKHRVPKDLRLKLKHARAARGMLQDIEEDIRQFIQRWGEKQLLLERDGLADAPGSSDEDSEDEVVFVGRNGQMHDSPERKKKLQQMREAMHANRERDGEKLVFESLVDDRASGFGRWLVHSIASYYGLHTWSVTVGEPARREAYVGFYPPAPGSRAGLVTTQPTCRQEAMIQPGDALPQPLWTQV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.26
3 0.31
4 0.35
5 0.31
6 0.3
7 0.33
8 0.32
9 0.31
10 0.29
11 0.26
12 0.22
13 0.21
14 0.22
15 0.19
16 0.19
17 0.16
18 0.16
19 0.15
20 0.13
21 0.12
22 0.11
23 0.1
24 0.09
25 0.1
26 0.09
27 0.08
28 0.08
29 0.08
30 0.07
31 0.07
32 0.08
33 0.1
34 0.11
35 0.13
36 0.14
37 0.15
38 0.19
39 0.21
40 0.21
41 0.22
42 0.26
43 0.27
44 0.29
45 0.29
46 0.27
47 0.26
48 0.29
49 0.27
50 0.23
51 0.21
52 0.2
53 0.18
54 0.17
55 0.17
56 0.14
57 0.14
58 0.13
59 0.12
60 0.11
61 0.1
62 0.1
63 0.1
64 0.11
65 0.11
66 0.12
67 0.11
68 0.13
69 0.14
70 0.17
71 0.19
72 0.23
73 0.25
74 0.24
75 0.25
76 0.24
77 0.26
78 0.27
79 0.29
80 0.31
81 0.27
82 0.28
83 0.3
84 0.32
85 0.3
86 0.26
87 0.22
88 0.21
89 0.21
90 0.22
91 0.21
92 0.26
93 0.31
94 0.34
95 0.36
96 0.39
97 0.44
98 0.52
99 0.57
100 0.58
101 0.63
102 0.68
103 0.75
104 0.78
105 0.81
106 0.79
107 0.73
108 0.68
109 0.64
110 0.61
111 0.62
112 0.56
113 0.52
114 0.47
115 0.49
116 0.53
117 0.51
118 0.56
119 0.57
120 0.6
121 0.6
122 0.67
123 0.71
124 0.73
125 0.78
126 0.77
127 0.74
128 0.7
129 0.67
130 0.61
131 0.58
132 0.48
133 0.39
134 0.3
135 0.24
136 0.21
137 0.18
138 0.19
139 0.2
140 0.21
141 0.21
142 0.2
143 0.2
144 0.23
145 0.24
146 0.22
147 0.18
148 0.18
149 0.23
150 0.23
151 0.23
152 0.2
153 0.2
154 0.19
155 0.2
156 0.21
157 0.16
158 0.19
159 0.19
160 0.18
161 0.17
162 0.17
163 0.16
164 0.16
165 0.17
166 0.15
167 0.18
168 0.18
169 0.18
170 0.22
171 0.21
172 0.18
173 0.22
174 0.27
175 0.28
176 0.29
177 0.29
178 0.26
179 0.29
180 0.32
181 0.34
182 0.31
183 0.31
184 0.4
185 0.47
186 0.51
187 0.56
188 0.56
189 0.58
190 0.58
191 0.62
192 0.63
193 0.63
194 0.66
195 0.61
196 0.63
197 0.62
198 0.64
199 0.61
200 0.54
201 0.5
202 0.45
203 0.44
204 0.42
205 0.38
206 0.32
207 0.26
208 0.24
209 0.19
210 0.17
211 0.15
212 0.1
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.1
219 0.16
220 0.18
221 0.2
222 0.24
223 0.26
224 0.26
225 0.27
226 0.3
227 0.26
228 0.25
229 0.24
230 0.2
231 0.18
232 0.18
233 0.15
234 0.1
235 0.07
236 0.06
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.07
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.06
251 0.05
252 0.07
253 0.07
254 0.08
255 0.09
256 0.11
257 0.12
258 0.15
259 0.22
260 0.26
261 0.32
262 0.4
263 0.45
264 0.46
265 0.51
266 0.58
267 0.62
268 0.66
269 0.69
270 0.7
271 0.67
272 0.71
273 0.71
274 0.62
275 0.6
276 0.56
277 0.48
278 0.41
279 0.4
280 0.33
281 0.29
282 0.32
283 0.24
284 0.19
285 0.2
286 0.17
287 0.15
288 0.14
289 0.15
290 0.12
291 0.13
292 0.12
293 0.1
294 0.1
295 0.12
296 0.14
297 0.11
298 0.12
299 0.12
300 0.13
301 0.15
302 0.16
303 0.16
304 0.15
305 0.15
306 0.15
307 0.14
308 0.15
309 0.14
310 0.13
311 0.14
312 0.14
313 0.14
314 0.13
315 0.12
316 0.1
317 0.11
318 0.1
319 0.11
320 0.14
321 0.18
322 0.2
323 0.23
324 0.24
325 0.23
326 0.23
327 0.21
328 0.24
329 0.23
330 0.25
331 0.23
332 0.22
333 0.24
334 0.24
335 0.25
336 0.21
337 0.18
338 0.18
339 0.19
340 0.2
341 0.2
342 0.21
343 0.2
344 0.23
345 0.25
346 0.28
347 0.3
348 0.31
349 0.33
350 0.32
351 0.34
352 0.32
353 0.37
354 0.41
355 0.42
356 0.39
357 0.37
358 0.36
359 0.35
360 0.32
361 0.26
362 0.17
363 0.15