Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178F853

Protein Details
Accession A0A178F853    Localization Confidence High Confidence Score 24.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
80-100GHSCYRPRRTGERKRKSVRGABasic
179-205QRLVTPQRLQRKRHRMALKRRRSEASKHydrophilic
220-239HEEKAKRDELRKRRASSMRKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
88-95RTGERKRK
133-142LGPKRATKIR
153-208VRKFVIRRTVTPKGEGKKEYTKAPKIQRLVTPQRLQRKRHRMALKRRRSEASKEAA
213-239KMLASRVHEEKAKRDELRKRRASSMRK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014401  Ribosomal_S6_euk  
IPR001377  Ribosomal_S6e  
IPR018282  Ribosomal_S6e_CS  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF01092  Ribosomal_S6e  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00578  RIBOSOMAL_S6E  
Amino Acid Sequences MKLNVSYPANGSQKLIEIDDERKLRPFMEKRMGTEVAGDSLGDEFKGYVFRITGGNDKQGFPMKQGVLLPNRTRLLLSDGHSCYRPRRTGERKRKSVRGAITGLDLSVLALSIVKQGEGELPGLTDVVNPKRLGPKRATKIRSFFGLDKKDDVRKFVIRRTVTPKGEGKKEYTKAPKIQRLVTPQRLQRKRHRMALKRRRSEASKEAANEYAKMLASRVHEEKAKRDELRKRRASSMRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.27
3 0.21
4 0.21
5 0.23
6 0.3
7 0.32
8 0.29
9 0.31
10 0.31
11 0.29
12 0.36
13 0.39
14 0.41
15 0.49
16 0.51
17 0.51
18 0.57
19 0.57
20 0.47
21 0.43
22 0.35
23 0.26
24 0.22
25 0.18
26 0.11
27 0.11
28 0.11
29 0.07
30 0.07
31 0.05
32 0.06
33 0.08
34 0.08
35 0.08
36 0.08
37 0.1
38 0.11
39 0.13
40 0.2
41 0.2
42 0.27
43 0.27
44 0.28
45 0.29
46 0.35
47 0.33
48 0.28
49 0.33
50 0.26
51 0.27
52 0.28
53 0.31
54 0.29
55 0.35
56 0.35
57 0.34
58 0.35
59 0.32
60 0.3
61 0.26
62 0.25
63 0.23
64 0.23
65 0.25
66 0.26
67 0.27
68 0.29
69 0.29
70 0.3
71 0.33
72 0.35
73 0.32
74 0.41
75 0.5
76 0.6
77 0.7
78 0.76
79 0.79
80 0.81
81 0.84
82 0.79
83 0.75
84 0.68
85 0.62
86 0.53
87 0.43
88 0.38
89 0.3
90 0.25
91 0.18
92 0.13
93 0.07
94 0.05
95 0.04
96 0.02
97 0.02
98 0.03
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.05
104 0.06
105 0.06
106 0.07
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.07
114 0.09
115 0.12
116 0.12
117 0.14
118 0.22
119 0.25
120 0.28
121 0.32
122 0.4
123 0.46
124 0.55
125 0.58
126 0.55
127 0.57
128 0.55
129 0.53
130 0.47
131 0.42
132 0.41
133 0.42
134 0.38
135 0.37
136 0.38
137 0.42
138 0.38
139 0.37
140 0.34
141 0.35
142 0.37
143 0.39
144 0.44
145 0.39
146 0.44
147 0.49
148 0.53
149 0.48
150 0.5
151 0.52
152 0.49
153 0.53
154 0.5
155 0.48
156 0.48
157 0.49
158 0.52
159 0.54
160 0.56
161 0.58
162 0.65
163 0.66
164 0.61
165 0.64
166 0.62
167 0.62
168 0.65
169 0.66
170 0.64
171 0.63
172 0.7
173 0.72
174 0.74
175 0.75
176 0.76
177 0.74
178 0.77
179 0.81
180 0.8
181 0.84
182 0.88
183 0.88
184 0.86
185 0.84
186 0.82
187 0.76
188 0.74
189 0.71
190 0.68
191 0.63
192 0.56
193 0.53
194 0.51
195 0.47
196 0.4
197 0.32
198 0.27
199 0.22
200 0.19
201 0.17
202 0.16
203 0.18
204 0.24
205 0.26
206 0.27
207 0.32
208 0.34
209 0.42
210 0.46
211 0.51
212 0.5
213 0.57
214 0.63
215 0.69
216 0.77
217 0.78
218 0.76
219 0.77