Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178F6A0

Protein Details
Accession A0A178F6A0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-52TVSENHRRKKKTTVTTKKKKHIDKTRRREGEVLRCBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
24-45RRKKKTTVTTKKKKHIDKTRRR
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 6, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004023  Mago_nashi  
IPR036605  Mago_nashi_sf  
IPR018618  Vacuolar_import/degrad_Vid24  
Gene Ontology GO:0035145  C:exon-exon junction complex  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF02792  Mago_nashi  
PF09783  Vac_ImportDeg  
CDD cd11295  Mago_nashi  
Amino Acid Sequences MPRLVVRGERGVLEYIGTVSENHRRKKKTTVTTKKKKHIDKTRRREGEVLRCRATTRPSICDTKFDFKSLGDGRSASARYANNSNYRNDSLIRKEMCVSSLLIQEIKRIIKESEILKEDDSKWPQKNKDGRQELEIRLGNEHISFETAKIGSLVDVTESADPEGLRVFYYLVQDLKALVFSLISLHFKWRCAARLDGLLGPATCAPYLRLPAQSILCPAVKAVSMPTHSDISAHTQVSATSNAPTRPTCPPESDRITSWIESAEGRINPVADNGSLTAQSPPTTAGERPDSDSAMTTDEALSPQRREQEQQSQGPEPVPATGDDSTSNDAAATMHSPGTGNNGAAGSGIVESLATAEEVRSPVSDSTAITDDYDETDEPMTPTTSVSAATEIKDEQREPAAAAAAATPAIPDIQATHRTSMSFEYSHARLVPDHSSSYFRGGSRFTGTQQSEQQIYTVDVEIKNVDMSESYLCGYLKIKGLTPDHPTLTTFFEGEIIGTKHTFQTRHEDWGATEKTDMHHWSRFPAWRPLSRLAKQSNFTFKDYAQRENIFMRWKEAFLVPDHRVKTISGASFEGFYYICFNQVQGTISGIYFHAKSEKHQQLELKPVENYGCCAAIEFR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.14
3 0.13
4 0.12
5 0.11
6 0.13
7 0.22
8 0.29
9 0.38
10 0.47
11 0.51
12 0.55
13 0.65
14 0.71
15 0.73
16 0.77
17 0.79
18 0.82
19 0.88
20 0.94
21 0.93
22 0.93
23 0.92
24 0.91
25 0.91
26 0.91
27 0.92
28 0.92
29 0.93
30 0.9
31 0.85
32 0.82
33 0.8
34 0.8
35 0.79
36 0.76
37 0.68
38 0.61
39 0.58
40 0.55
41 0.51
42 0.49
43 0.44
44 0.43
45 0.45
46 0.53
47 0.52
48 0.55
49 0.56
50 0.56
51 0.52
52 0.48
53 0.44
54 0.36
55 0.43
56 0.4
57 0.35
58 0.28
59 0.27
60 0.25
61 0.3
62 0.31
63 0.23
64 0.24
65 0.24
66 0.26
67 0.32
68 0.36
69 0.38
70 0.41
71 0.44
72 0.44
73 0.45
74 0.43
75 0.4
76 0.41
77 0.39
78 0.44
79 0.42
80 0.38
81 0.38
82 0.37
83 0.35
84 0.3
85 0.25
86 0.2
87 0.21
88 0.21
89 0.21
90 0.2
91 0.22
92 0.25
93 0.25
94 0.22
95 0.22
96 0.21
97 0.21
98 0.25
99 0.26
100 0.29
101 0.3
102 0.3
103 0.29
104 0.34
105 0.33
106 0.37
107 0.4
108 0.4
109 0.45
110 0.51
111 0.55
112 0.59
113 0.67
114 0.68
115 0.73
116 0.74
117 0.69
118 0.67
119 0.7
120 0.62
121 0.6
122 0.54
123 0.43
124 0.36
125 0.35
126 0.29
127 0.22
128 0.2
129 0.12
130 0.12
131 0.11
132 0.1
133 0.13
134 0.12
135 0.12
136 0.11
137 0.11
138 0.09
139 0.09
140 0.08
141 0.06
142 0.06
143 0.07
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.09
148 0.08
149 0.08
150 0.09
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.08
155 0.09
156 0.11
157 0.13
158 0.12
159 0.12
160 0.12
161 0.12
162 0.12
163 0.1
164 0.08
165 0.06
166 0.05
167 0.05
168 0.07
169 0.08
170 0.09
171 0.1
172 0.16
173 0.17
174 0.18
175 0.21
176 0.22
177 0.25
178 0.26
179 0.28
180 0.25
181 0.27
182 0.28
183 0.26
184 0.24
185 0.21
186 0.18
187 0.16
188 0.14
189 0.11
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.09
194 0.12
195 0.14
196 0.15
197 0.16
198 0.19
199 0.2
200 0.19
201 0.19
202 0.19
203 0.17
204 0.15
205 0.14
206 0.11
207 0.1
208 0.09
209 0.1
210 0.11
211 0.12
212 0.13
213 0.16
214 0.16
215 0.16
216 0.16
217 0.15
218 0.18
219 0.2
220 0.19
221 0.17
222 0.16
223 0.16
224 0.18
225 0.18
226 0.12
227 0.11
228 0.13
229 0.14
230 0.16
231 0.16
232 0.18
233 0.21
234 0.26
235 0.26
236 0.29
237 0.31
238 0.36
239 0.41
240 0.4
241 0.36
242 0.35
243 0.35
244 0.3
245 0.27
246 0.2
247 0.15
248 0.13
249 0.13
250 0.13
251 0.11
252 0.11
253 0.11
254 0.11
255 0.1
256 0.11
257 0.1
258 0.06
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.07
266 0.08
267 0.07
268 0.08
269 0.09
270 0.1
271 0.1
272 0.12
273 0.15
274 0.16
275 0.18
276 0.18
277 0.17
278 0.16
279 0.16
280 0.14
281 0.12
282 0.11
283 0.08
284 0.08
285 0.07
286 0.08
287 0.09
288 0.1
289 0.1
290 0.12
291 0.16
292 0.16
293 0.19
294 0.23
295 0.31
296 0.36
297 0.39
298 0.4
299 0.37
300 0.37
301 0.35
302 0.31
303 0.21
304 0.15
305 0.11
306 0.08
307 0.09
308 0.09
309 0.09
310 0.09
311 0.1
312 0.12
313 0.11
314 0.1
315 0.08
316 0.07
317 0.07
318 0.07
319 0.06
320 0.05
321 0.05
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.1
326 0.1
327 0.09
328 0.09
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.09
333 0.05
334 0.04
335 0.04
336 0.03
337 0.03
338 0.03
339 0.03
340 0.03
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.04
345 0.05
346 0.06
347 0.06
348 0.07
349 0.07
350 0.08
351 0.09
352 0.08
353 0.1
354 0.11
355 0.11
356 0.1
357 0.1
358 0.09
359 0.09
360 0.11
361 0.08
362 0.08
363 0.08
364 0.08
365 0.08
366 0.09
367 0.08
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.09
375 0.09
376 0.09
377 0.1
378 0.1
379 0.12
380 0.14
381 0.14
382 0.13
383 0.14
384 0.14
385 0.13
386 0.13
387 0.12
388 0.09
389 0.09
390 0.08
391 0.06
392 0.06
393 0.05
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.03
398 0.03
399 0.05
400 0.09
401 0.15
402 0.17
403 0.19
404 0.19
405 0.2
406 0.21
407 0.21
408 0.21
409 0.16
410 0.16
411 0.18
412 0.18
413 0.19
414 0.19
415 0.17
416 0.15
417 0.17
418 0.19
419 0.17
420 0.18
421 0.18
422 0.21
423 0.21
424 0.24
425 0.24
426 0.21
427 0.21
428 0.21
429 0.22
430 0.23
431 0.24
432 0.22
433 0.27
434 0.29
435 0.31
436 0.34
437 0.35
438 0.31
439 0.3
440 0.28
441 0.21
442 0.2
443 0.17
444 0.14
445 0.14
446 0.13
447 0.13
448 0.13
449 0.13
450 0.12
451 0.1
452 0.09
453 0.06
454 0.08
455 0.08
456 0.08
457 0.08
458 0.1
459 0.1
460 0.11
461 0.12
462 0.13
463 0.17
464 0.17
465 0.19
466 0.23
467 0.26
468 0.3
469 0.35
470 0.37
471 0.34
472 0.34
473 0.33
474 0.29
475 0.29
476 0.26
477 0.2
478 0.15
479 0.14
480 0.13
481 0.13
482 0.14
483 0.11
484 0.11
485 0.12
486 0.12
487 0.15
488 0.19
489 0.2
490 0.19
491 0.28
492 0.29
493 0.36
494 0.37
495 0.35
496 0.32
497 0.4
498 0.39
499 0.3
500 0.29
501 0.23
502 0.22
503 0.26
504 0.29
505 0.25
506 0.28
507 0.27
508 0.31
509 0.36
510 0.42
511 0.41
512 0.47
513 0.5
514 0.51
515 0.57
516 0.62
517 0.64
518 0.62
519 0.66
520 0.64
521 0.64
522 0.62
523 0.63
524 0.64
525 0.59
526 0.58
527 0.52
528 0.45
529 0.48
530 0.47
531 0.46
532 0.42
533 0.4
534 0.4
535 0.41
536 0.44
537 0.42
538 0.4
539 0.39
540 0.34
541 0.32
542 0.32
543 0.32
544 0.3
545 0.26
546 0.33
547 0.32
548 0.37
549 0.38
550 0.36
551 0.34
552 0.32
553 0.33
554 0.32
555 0.31
556 0.26
557 0.27
558 0.26
559 0.26
560 0.26
561 0.22
562 0.15
563 0.13
564 0.15
565 0.13
566 0.15
567 0.14
568 0.14
569 0.15
570 0.17
571 0.19
572 0.15
573 0.17
574 0.16
575 0.15
576 0.16
577 0.14
578 0.15
579 0.13
580 0.14
581 0.18
582 0.18
583 0.22
584 0.32
585 0.41
586 0.41
587 0.46
588 0.52
589 0.52
590 0.62
591 0.62
592 0.55
593 0.47
594 0.46
595 0.45
596 0.39
597 0.36
598 0.28
599 0.24
600 0.2