Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178F4W4

Protein Details
Accession A0A178F4W4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
183-208AALIKEINRKRSRRKTQRRGWSDLDDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
191-200RKRSRRKTQR
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 8.5, mito 8, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MARCTRDAPQLVNCKWWKRGYCQRGDLCYFRHDPCLLGVDQKADVSTNPSDANATTQITSLTSPVAAYVIPSAIFPAPPVGTGDSKGTVENEAPSSNQSEPNGKSYATPNPLKTSIVKEYNRSMKRIPCRYFQTAVKNWKQELDEATEKKREAPPFRPGCYFGNKCHYAHIDPQAGQPYIFDAALIKEINRKRSRRKTQRRGWSDLDDYPVFFGDLEPDLEYAFLTAYLETGNDWEIGNNWDVLDDSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.58
3 0.61
4 0.57
5 0.57
6 0.67
7 0.67
8 0.71
9 0.75
10 0.75
11 0.74
12 0.75
13 0.69
14 0.61
15 0.57
16 0.52
17 0.44
18 0.43
19 0.36
20 0.31
21 0.29
22 0.3
23 0.24
24 0.24
25 0.23
26 0.2
27 0.2
28 0.19
29 0.17
30 0.13
31 0.13
32 0.14
33 0.14
34 0.14
35 0.14
36 0.14
37 0.15
38 0.14
39 0.17
40 0.15
41 0.15
42 0.13
43 0.13
44 0.13
45 0.13
46 0.13
47 0.1
48 0.08
49 0.07
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.05
54 0.05
55 0.05
56 0.05
57 0.05
58 0.05
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.07
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.1
67 0.11
68 0.11
69 0.12
70 0.14
71 0.13
72 0.13
73 0.13
74 0.12
75 0.11
76 0.11
77 0.11
78 0.11
79 0.1
80 0.1
81 0.11
82 0.13
83 0.13
84 0.15
85 0.14
86 0.18
87 0.19
88 0.22
89 0.22
90 0.2
91 0.2
92 0.2
93 0.25
94 0.26
95 0.28
96 0.26
97 0.28
98 0.29
99 0.29
100 0.28
101 0.26
102 0.26
103 0.31
104 0.31
105 0.3
106 0.35
107 0.43
108 0.43
109 0.41
110 0.38
111 0.37
112 0.45
113 0.52
114 0.49
115 0.46
116 0.51
117 0.53
118 0.53
119 0.51
120 0.51
121 0.49
122 0.54
123 0.53
124 0.5
125 0.46
126 0.45
127 0.41
128 0.34
129 0.29
130 0.27
131 0.28
132 0.27
133 0.3
134 0.3
135 0.29
136 0.31
137 0.34
138 0.35
139 0.34
140 0.38
141 0.45
142 0.49
143 0.51
144 0.5
145 0.48
146 0.45
147 0.48
148 0.45
149 0.39
150 0.41
151 0.41
152 0.39
153 0.4
154 0.4
155 0.33
156 0.36
157 0.39
158 0.34
159 0.32
160 0.34
161 0.35
162 0.32
163 0.29
164 0.23
165 0.18
166 0.15
167 0.14
168 0.11
169 0.07
170 0.08
171 0.1
172 0.11
173 0.09
174 0.16
175 0.19
176 0.3
177 0.37
178 0.44
179 0.53
180 0.64
181 0.75
182 0.79
183 0.87
184 0.88
185 0.9
186 0.94
187 0.91
188 0.87
189 0.82
190 0.78
191 0.71
192 0.63
193 0.59
194 0.48
195 0.41
196 0.34
197 0.28
198 0.2
199 0.15
200 0.13
201 0.09
202 0.1
203 0.11
204 0.11
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.1
209 0.08
210 0.07
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.07
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.1
224 0.12
225 0.13
226 0.12
227 0.11
228 0.11