FuNGI

A0A178EXW3

Protein Details

Accession

A0A178EXW3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
544-567	GWSTVSAKQKNPRRGNYNRGAQAS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
418-425	ERLEKQKA
501-508	GRGRGGPP

Subcellular Location(s)

mito 13.5, cyto_mito 10, nucl 8, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM

Amino Acid Sequences

MNQAQGVHIRREVKSLTTTCLASAKSKAQKMSIGTFLADETYGSWADEMEDNPIPFSSYAPRSGYGGDRERSTFGTSGGYAQEHHDRVYSMREELPMPTQPPYTAHIGNLSFDATQADIQELFAECEVTSVRIVEDKLTGSPKGFGYVEFASVDGLKKALTFQGTSLQGRNIRVSIAEPPKDRHDGRDLSDWTRKGPLPDLPGQRRVSDRPGFGGARNFDPASDAANERPGRRAYEAANDGRSRDFSNWERKGPLSPSLQSAPSREGRPHSKDGPQFRRASPAWGEGRSQDGSRPPRREFTERPVPERAPTAPELDNQWRARMRPDAPAQPETPVEPVTPTAAATAPVPGARPRLNLQKRTIPESEAAAPSPAVAEAQSSIFGGAKPIDTASREQEVAEKRELALQQKKEADEKAKAERLEKQKAEKAAKEEAEKAEANGTKEDTTEGKPVEILKREEGEEKAADDSEKAAAPTQKTEAGQDKGRPPLQSRTSSGWRNGGGRGRGGPPHSRGGSRSTSQRGPPVQGTPSETATPASPATPDEDGWSTVSAKQKNPRRGNYNRGAQAS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.41
2	0.39
3	0.39
4	0.37
5	0.36
6	0.33
7	0.35
8	0.32
9	0.27
10	0.3
11	0.34
12	0.39
13	0.43
14	0.45
15	0.44
16	0.47
17	0.49
18	0.49
19	0.45
20	0.38
21	0.33
22	0.3
23	0.27
24	0.23
25	0.18
26	0.13
27	0.09
28	0.1
29	0.1
30	0.1
31	0.09
32	0.08
33	0.1
34	0.13
35	0.12
36	0.15
37	0.18
38	0.18
39	0.19
40	0.19
41	0.18
42	0.16
43	0.18
44	0.2
45	0.2
46	0.24
47	0.26
48	0.27
49	0.27
50	0.29
51	0.32
52	0.33
53	0.37
54	0.34
55	0.35
56	0.36
57	0.37
58	0.36
59	0.35
60	0.28
61	0.22
62	0.22
63	0.2
64	0.2
65	0.19
66	0.18
67	0.15
68	0.18
69	0.24
70	0.22
71	0.23
72	0.22
73	0.21
74	0.22
75	0.27
76	0.26
77	0.21
78	0.22
79	0.23
80	0.23
81	0.24
82	0.27
83	0.25
84	0.24
85	0.24
86	0.23
87	0.22
88	0.23
89	0.25
90	0.26
91	0.23
92	0.22
93	0.24
94	0.24
95	0.24
96	0.22
97	0.2
98	0.14
99	0.13
100	0.13
101	0.09
102	0.09
103	0.08
104	0.09
105	0.08
106	0.08
107	0.09
108	0.09
109	0.09
110	0.09
111	0.09
112	0.08
113	0.08
114	0.09
115	0.08
116	0.08
117	0.08
118	0.08
119	0.1
120	0.1
121	0.1
122	0.12
123	0.12
124	0.14
125	0.17
126	0.17
127	0.15
128	0.18
129	0.17
130	0.18
131	0.18
132	0.15
133	0.17
134	0.17
135	0.18
136	0.15
137	0.15
138	0.12
139	0.13
140	0.13
141	0.09
142	0.08
143	0.07
144	0.07
145	0.07
146	0.09
147	0.1
148	0.1
149	0.11
150	0.17
151	0.21
152	0.22
153	0.23
154	0.25
155	0.27
156	0.28
157	0.28
158	0.22
159	0.19
160	0.18
161	0.18
162	0.22
163	0.26
164	0.29
165	0.3
166	0.32
167	0.37
168	0.43
169	0.42
170	0.37
171	0.38
172	0.36
173	0.38
174	0.43
175	0.42
176	0.4
177	0.46
178	0.42
179	0.36
180	0.37
181	0.35
182	0.28
183	0.28
184	0.27
185	0.27
186	0.34
187	0.42
188	0.41
189	0.48
190	0.47
191	0.46
192	0.45
193	0.43
194	0.43
195	0.39
196	0.35
197	0.3
198	0.33
199	0.32
200	0.3
201	0.33
202	0.26
203	0.23
204	0.25
205	0.22
206	0.17
207	0.18
208	0.17
209	0.13
210	0.13
211	0.13
212	0.11
213	0.18
214	0.2
215	0.19
216	0.23
217	0.22
218	0.22
219	0.23
220	0.25
221	0.2
222	0.26
223	0.3
224	0.28
225	0.31
226	0.29
227	0.28
228	0.26
229	0.26
230	0.2
231	0.16
232	0.2
233	0.21
234	0.31
235	0.33
236	0.34
237	0.35
238	0.34
239	0.36
240	0.33
241	0.33
242	0.26
243	0.24
244	0.25
245	0.25
246	0.27
247	0.25
248	0.24
249	0.22
250	0.22
251	0.23
252	0.21
253	0.24
254	0.29
255	0.33
256	0.37
257	0.36
258	0.4
259	0.44
260	0.52
261	0.55
262	0.54
263	0.52
264	0.48
265	0.51
266	0.45
267	0.43
268	0.35
269	0.34
270	0.3
271	0.27
272	0.28
273	0.21
274	0.24
275	0.21
276	0.19
277	0.15
278	0.19
279	0.27
280	0.33
281	0.38
282	0.36
283	0.41
284	0.46
285	0.51
286	0.49
287	0.48
288	0.52
289	0.49
290	0.52
291	0.51
292	0.47
293	0.41
294	0.39
295	0.31
296	0.24
297	0.23
298	0.22
299	0.18
300	0.19
301	0.22
302	0.23
303	0.3
304	0.26
305	0.29
306	0.27
307	0.27
308	0.29
309	0.3
310	0.28
311	0.29
312	0.33
313	0.36
314	0.39
315	0.41
316	0.39
317	0.35
318	0.33
319	0.26
320	0.23
321	0.17
322	0.13
323	0.1
324	0.1
325	0.1
326	0.09
327	0.08
328	0.08
329	0.07
330	0.07
331	0.07
332	0.07
333	0.07
334	0.07
335	0.08
336	0.08
337	0.12
338	0.13
339	0.15
340	0.18
341	0.28
342	0.35
343	0.4
344	0.44
345	0.48
346	0.49
347	0.52
348	0.5
349	0.41
350	0.35
351	0.32
352	0.31
353	0.24
354	0.22
355	0.17
356	0.15
357	0.13
358	0.12
359	0.09
360	0.05
361	0.04
362	0.04
363	0.05
364	0.05
365	0.06
366	0.05
367	0.06
368	0.06
369	0.06
370	0.07
371	0.07
372	0.07
373	0.07
374	0.08
375	0.09
376	0.1
377	0.13
378	0.15
379	0.17
380	0.17
381	0.17
382	0.22
383	0.25
384	0.27
385	0.27
386	0.24
387	0.22
388	0.26
389	0.28
390	0.3
391	0.33
392	0.32
393	0.37
394	0.4
395	0.41
396	0.4
397	0.42
398	0.4
399	0.38
400	0.39
401	0.41
402	0.42
403	0.42
404	0.41
405	0.45
406	0.48
407	0.52
408	0.51
409	0.51
410	0.51
411	0.58
412	0.61
413	0.57
414	0.53
415	0.51
416	0.51
417	0.47
418	0.47
419	0.4
420	0.39
421	0.35
422	0.3
423	0.29
424	0.28
425	0.27
426	0.24
427	0.24
428	0.2
429	0.2
430	0.21
431	0.18
432	0.18
433	0.21
434	0.2
435	0.19
436	0.2
437	0.23
438	0.28
439	0.3
440	0.31
441	0.29
442	0.31
443	0.33
444	0.35
445	0.33
446	0.3
447	0.25
448	0.23
449	0.21
450	0.19
451	0.18
452	0.14
453	0.14
454	0.12
455	0.12
456	0.11
457	0.14
458	0.17
459	0.19
460	0.21
461	0.23
462	0.25
463	0.25
464	0.3
465	0.33
466	0.34
467	0.37
468	0.41
469	0.43
470	0.47
471	0.5
472	0.48
473	0.46
474	0.51
475	0.53
476	0.53
477	0.53
478	0.52
479	0.57
480	0.6
481	0.59
482	0.55
483	0.51
484	0.47
485	0.48
486	0.48
487	0.43
488	0.4
489	0.39
490	0.37
491	0.39
492	0.41
493	0.42
494	0.39
495	0.45
496	0.45
497	0.43
498	0.42
499	0.43
500	0.45
501	0.43
502	0.47
503	0.45
504	0.48
505	0.5
506	0.56
507	0.54
508	0.53
509	0.53
510	0.5
511	0.47
512	0.44
513	0.46
514	0.4
515	0.39
516	0.35
517	0.31
518	0.27
519	0.25
520	0.24
521	0.19
522	0.16
523	0.14
524	0.13
525	0.17
526	0.17
527	0.17
528	0.18
529	0.2
530	0.21
531	0.21
532	0.22
533	0.19
534	0.22
535	0.29
536	0.3
537	0.35
538	0.44
539	0.52
540	0.62
541	0.7
542	0.76
543	0.78
544	0.82
545	0.85
546	0.86
547	0.86

A0A178EXW3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer