FuNGI

A0A178EXL2

Protein Details

Accession

A0A178EXL2

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
74-94	KPTLKFQPKVVTRKSKEQRDA	Hydrophilic
338-366	SEKAVPKPRVKPRKVKDPKKKLQTEEERQ	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
112-163	AARRTTRGGGDRGRGRGRGRGGASGASGPLGEGTGPGRHGGAWKGKGGRSGK
340-358	KAVPKPRVKPRKVKDPKKK

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 14.5, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPNPPPNRPPAGRGQPSSSESSSATPGPSGTGGTGRGGSASVRGRPVQRLQSLKKRTPGGSLVPLNADGSTPKPTLKFQPKVVTRKSKEQRDALENLEAQRLRERISAANAARRTTRGGGDRGRGRGRGRGGASGASGPLGEGTGPGRHGGAWKGKGGRSGKISGFYGVKNEAGADGEQIGGDISSDEGSDHGLRFSIDHINFESDSEGEALEAGAMTKGKASMGKSTPTGGSRGLRPVRVERHEHVERSLGIPTESSSSLSKSAELRKKAKEKAGAADDSLFVEDDQSESDVDGGDDDVVMGDIKETDPTSDGPQIKAEPTDDDATIDDSVPPAPSEKAVPKPRVKPRKVKDPKKKLQTEEERQEYDRYEEDIDYLKSTLGSLSTTAGNAPDTSATAEVGKKDEDDAETSAKPATDERQGQLFLLQFPPMTPNLVPPTPEKNGAAGQADEAVVETATPLPVAGTAPAAQGSVTIKQEEGAVNPASTASTAPPLVTATNSTLPRGRVGKLNIHRSGKATIDWGGVSFELTKGSTVGFIQDAVILSDNMAGAADGSASIRDKKLWAMSQVTGKFVVTPDWDKILDE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.64
2	0.62
3	0.6
4	0.61
5	0.62
6	0.52
7	0.44
8	0.37
9	0.35
10	0.32
11	0.27
12	0.24
13	0.19
14	0.18
15	0.17
16	0.16
17	0.15
18	0.13
19	0.13
20	0.14
21	0.15
22	0.15
23	0.13
24	0.13
25	0.13
26	0.12
27	0.16
28	0.19
29	0.21
30	0.24
31	0.29
32	0.32
33	0.38
34	0.45
35	0.48
36	0.51
37	0.57
38	0.62
39	0.69
40	0.75
41	0.75
42	0.75
43	0.73
44	0.67
45	0.63
46	0.6
47	0.56
48	0.55
49	0.52
50	0.46
51	0.41
52	0.4
53	0.34
54	0.28
55	0.22
56	0.14
57	0.14
58	0.17
59	0.16
60	0.18
61	0.2
62	0.23
63	0.33
64	0.42
65	0.46
66	0.49
67	0.58
68	0.65
69	0.72
70	0.78
71	0.79
72	0.73
73	0.78
74	0.81
75	0.81
76	0.8
77	0.78
78	0.75
79	0.71
80	0.69
81	0.61
82	0.57
83	0.49
84	0.42
85	0.42
86	0.35
87	0.3
88	0.31
89	0.29
90	0.26
91	0.27
92	0.27
93	0.24
94	0.28
95	0.35
96	0.32
97	0.39
98	0.38
99	0.37
100	0.37
101	0.35
102	0.34
103	0.29
104	0.32
105	0.29
106	0.34
107	0.38
108	0.44
109	0.49
110	0.51
111	0.52
112	0.52
113	0.48
114	0.48
115	0.47
116	0.46
117	0.42
118	0.38
119	0.36
120	0.32
121	0.31
122	0.25
123	0.21
124	0.14
125	0.12
126	0.08
127	0.07
128	0.06
129	0.05
130	0.04
131	0.06
132	0.07
133	0.08
134	0.08
135	0.08
136	0.09
137	0.11
138	0.15
139	0.21
140	0.22
141	0.26
142	0.3
143	0.31
144	0.38
145	0.39
146	0.38
147	0.35
148	0.38
149	0.35
150	0.34
151	0.34
152	0.3
153	0.29
154	0.25
155	0.23
156	0.2
157	0.18
158	0.15
159	0.14
160	0.11
161	0.1
162	0.1
163	0.08
164	0.07
165	0.06
166	0.06
167	0.06
168	0.06
169	0.04
170	0.04
171	0.03
172	0.03
173	0.03
174	0.04
175	0.04
176	0.04
177	0.06
178	0.07
179	0.07
180	0.07
181	0.07
182	0.07
183	0.08
184	0.1
185	0.16
186	0.15
187	0.16
188	0.17
189	0.19
190	0.19
191	0.19
192	0.18
193	0.1
194	0.11
195	0.09
196	0.08
197	0.05
198	0.05
199	0.05
200	0.04
201	0.04
202	0.03
203	0.03
204	0.04
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.05
209	0.08
210	0.09
211	0.15
212	0.18
213	0.2
214	0.2
215	0.22
216	0.23
217	0.22
218	0.22
219	0.18
220	0.17
221	0.17
222	0.25
223	0.25
224	0.25
225	0.27
226	0.32
227	0.36
228	0.39
229	0.42
230	0.36
231	0.42
232	0.44
233	0.43
234	0.37
235	0.32
236	0.28
237	0.25
238	0.24
239	0.16
240	0.12
241	0.11
242	0.11
243	0.11
244	0.1
245	0.11
246	0.1
247	0.1
248	0.12
249	0.12
250	0.13
251	0.14
252	0.23
253	0.27
254	0.33
255	0.37
256	0.43
257	0.51
258	0.54
259	0.56
260	0.53
261	0.5
262	0.49
263	0.49
264	0.42
265	0.35
266	0.31
267	0.25
268	0.19
269	0.17
270	0.11
271	0.06
272	0.06
273	0.05
274	0.04
275	0.04
276	0.05
277	0.04
278	0.04
279	0.04
280	0.04
281	0.04
282	0.04
283	0.04
284	0.03
285	0.03
286	0.03
287	0.03
288	0.03
289	0.03
290	0.02
291	0.02
292	0.03
293	0.03
294	0.04
295	0.04
296	0.04
297	0.06
298	0.07
299	0.09
300	0.15
301	0.16
302	0.16
303	0.17
304	0.17
305	0.17
306	0.17
307	0.15
308	0.1
309	0.12
310	0.13
311	0.12
312	0.12
313	0.11
314	0.12
315	0.12
316	0.11
317	0.08
318	0.07
319	0.07
320	0.07
321	0.07
322	0.06
323	0.06
324	0.07
325	0.1
326	0.13
327	0.22
328	0.29
329	0.36
330	0.42
331	0.51
332	0.6
333	0.69
334	0.72
335	0.73
336	0.73
337	0.77
338	0.82
339	0.84
340	0.85
341	0.85
342	0.88
343	0.88
344	0.88
345	0.81
346	0.81
347	0.8
348	0.79
349	0.76
350	0.72
351	0.64
352	0.58
353	0.55
354	0.45
355	0.37
356	0.29
357	0.22
358	0.18
359	0.15
360	0.15
361	0.16
362	0.15
363	0.14
364	0.13
365	0.11
366	0.1
367	0.1
368	0.09
369	0.06
370	0.06
371	0.06
372	0.07
373	0.07
374	0.07
375	0.07
376	0.08
377	0.08
378	0.07
379	0.07
380	0.06
381	0.06
382	0.07
383	0.07
384	0.07
385	0.08
386	0.1
387	0.1
388	0.11
389	0.11
390	0.1
391	0.11
392	0.12
393	0.12
394	0.13
395	0.14
396	0.16
397	0.16
398	0.16
399	0.16
400	0.15
401	0.14
402	0.13
403	0.14
404	0.18
405	0.21
406	0.22
407	0.25
408	0.25
409	0.25
410	0.26
411	0.24
412	0.18
413	0.17
414	0.16
415	0.12
416	0.12
417	0.14
418	0.12
419	0.13
420	0.12
421	0.15
422	0.2
423	0.21
424	0.22
425	0.23
426	0.3
427	0.3
428	0.32
429	0.28
430	0.25
431	0.26
432	0.27
433	0.25
434	0.19
435	0.17
436	0.15
437	0.14
438	0.11
439	0.1
440	0.08
441	0.06
442	0.05
443	0.05
444	0.05
445	0.05
446	0.05
447	0.04
448	0.04
449	0.05
450	0.06
451	0.05
452	0.06
453	0.07
454	0.08
455	0.08
456	0.08
457	0.07
458	0.08
459	0.1
460	0.13
461	0.13
462	0.14
463	0.13
464	0.14
465	0.16
466	0.16
467	0.15
468	0.15
469	0.15
470	0.14
471	0.14
472	0.14
473	0.12
474	0.12
475	0.11
476	0.08
477	0.1
478	0.1
479	0.1
480	0.11
481	0.12
482	0.12
483	0.12
484	0.13
485	0.14
486	0.2
487	0.21
488	0.23
489	0.26
490	0.26
491	0.31
492	0.32
493	0.3
494	0.3
495	0.34
496	0.42
497	0.47
498	0.56
499	0.58
500	0.6
501	0.6
502	0.55
503	0.55
504	0.47
505	0.39
506	0.32
507	0.27
508	0.24
509	0.22
510	0.2
511	0.17
512	0.15
513	0.14
514	0.12
515	0.1
516	0.1
517	0.1
518	0.1
519	0.09
520	0.1
521	0.1
522	0.09
523	0.11
524	0.1
525	0.1
526	0.1
527	0.11
528	0.11
529	0.11
530	0.12
531	0.1
532	0.1
533	0.1
534	0.1
535	0.08
536	0.08
537	0.06
538	0.05
539	0.05
540	0.05
541	0.04
542	0.05
543	0.07
544	0.09
545	0.12
546	0.13
547	0.15
548	0.17
549	0.22
550	0.29
551	0.32
552	0.35
553	0.38
554	0.41
555	0.48
556	0.48
557	0.46
558	0.39
559	0.34
560	0.3
561	0.26
562	0.26
563	0.22
564	0.24
565	0.25
566	0.28

A0A178EXL2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer