Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178F351

Protein Details
Accession A0A178F351    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
168-191KTQFSRAKYMLRKRKKYLHRFTVEHydrophilic
379-408LASWKPSKRSMHFKKKRRWTRVRNTVDEARHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
384-397PSKRSMHFKKKRRW
Subcellular Location(s) cyto 13, mito 11, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0008168  F:methyltransferase activity  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MHSSIPPNVYVALKLPSDVTKIIQTVPNSYGKHHLASHGVIANGSGRNISLGKYGSFPCNQIIGRPFYATFEIADNPDADGHVLHIVPAAELHTEALLADGEGEGDGEAGTSTPSAPFPQEDNRHIIDNKSTQQLTMEQIEELKQSSTDAGREIISKLLESHSALDQKTQFSRAKYMLRKRKKYLHRFTVEPMDVGVLTEWMLEQKDPGRILELRDETIGLIGAWANVHYGGSGESDGVAKVNGAVNPAKGRWLIVDDTGGLVVAAMAERAGILYPPEVLSGEGLGSITKQGARPAQSVEDETPAVEATPAPHTTITVIHHNLQPNLSMLKYFSYDINEPSETHPLSSHLKTLSWLQLLHPSEDAIYEMEPPEIGEEELASWKPSKRSMHFKKKRRWTRVRNTVDEARAGGFDGLIVATLMEPASILKHTVPLLAGSAQVVVYSPYIEPLVQLADLYSTARRTAYITYKREAAEGAAEDKEEDFPVDPTLLLAPTLHTSRVRTWQVLPGRTHPLMTGRGGAEGYVFHAVRVLPAIGKVEARGVQAKKRRTEIS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.19
3 0.19
4 0.21
5 0.22
6 0.21
7 0.22
8 0.23
9 0.26
10 0.28
11 0.27
12 0.29
13 0.32
14 0.37
15 0.33
16 0.34
17 0.39
18 0.37
19 0.39
20 0.36
21 0.35
22 0.32
23 0.32
24 0.35
25 0.3
26 0.27
27 0.23
28 0.22
29 0.23
30 0.19
31 0.18
32 0.13
33 0.1
34 0.12
35 0.13
36 0.14
37 0.14
38 0.15
39 0.16
40 0.19
41 0.22
42 0.25
43 0.26
44 0.27
45 0.25
46 0.29
47 0.28
48 0.3
49 0.32
50 0.33
51 0.33
52 0.34
53 0.32
54 0.28
55 0.31
56 0.26
57 0.21
58 0.18
59 0.18
60 0.17
61 0.18
62 0.16
63 0.14
64 0.13
65 0.13
66 0.11
67 0.09
68 0.08
69 0.09
70 0.08
71 0.08
72 0.09
73 0.09
74 0.09
75 0.09
76 0.09
77 0.07
78 0.07
79 0.08
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.06
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.04
94 0.03
95 0.03
96 0.03
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.05
101 0.06
102 0.08
103 0.09
104 0.11
105 0.14
106 0.23
107 0.29
108 0.32
109 0.36
110 0.37
111 0.4
112 0.39
113 0.37
114 0.34
115 0.33
116 0.34
117 0.34
118 0.32
119 0.28
120 0.29
121 0.3
122 0.27
123 0.25
124 0.22
125 0.16
126 0.17
127 0.18
128 0.17
129 0.15
130 0.12
131 0.09
132 0.09
133 0.1
134 0.11
135 0.11
136 0.11
137 0.11
138 0.12
139 0.13
140 0.13
141 0.13
142 0.12
143 0.12
144 0.12
145 0.12
146 0.12
147 0.12
148 0.13
149 0.15
150 0.18
151 0.18
152 0.21
153 0.22
154 0.24
155 0.25
156 0.28
157 0.28
158 0.26
159 0.31
160 0.32
161 0.39
162 0.45
163 0.54
164 0.59
165 0.66
166 0.73
167 0.75
168 0.8
169 0.82
170 0.84
171 0.85
172 0.84
173 0.79
174 0.73
175 0.7
176 0.69
177 0.59
178 0.47
179 0.37
180 0.27
181 0.22
182 0.19
183 0.15
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.04
188 0.04
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.08
193 0.12
194 0.12
195 0.13
196 0.15
197 0.16
198 0.18
199 0.23
200 0.22
201 0.2
202 0.19
203 0.19
204 0.16
205 0.15
206 0.13
207 0.06
208 0.05
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.03
217 0.04
218 0.04
219 0.05
220 0.05
221 0.04
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.04
228 0.04
229 0.06
230 0.06
231 0.08
232 0.09
233 0.1
234 0.11
235 0.12
236 0.12
237 0.1
238 0.1
239 0.09
240 0.11
241 0.1
242 0.1
243 0.1
244 0.08
245 0.09
246 0.08
247 0.07
248 0.05
249 0.04
250 0.03
251 0.02
252 0.02
253 0.02
254 0.02
255 0.02
256 0.02
257 0.02
258 0.02
259 0.02
260 0.03
261 0.03
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.03
273 0.03
274 0.03
275 0.04
276 0.05
277 0.05
278 0.08
279 0.11
280 0.13
281 0.15
282 0.16
283 0.17
284 0.17
285 0.19
286 0.17
287 0.16
288 0.13
289 0.12
290 0.11
291 0.09
292 0.08
293 0.06
294 0.05
295 0.05
296 0.08
297 0.08
298 0.09
299 0.09
300 0.09
301 0.1
302 0.12
303 0.13
304 0.15
305 0.16
306 0.18
307 0.21
308 0.23
309 0.23
310 0.21
311 0.19
312 0.16
313 0.15
314 0.13
315 0.1
316 0.09
317 0.09
318 0.1
319 0.1
320 0.1
321 0.12
322 0.14
323 0.15
324 0.18
325 0.18
326 0.17
327 0.19
328 0.23
329 0.19
330 0.18
331 0.17
332 0.17
333 0.21
334 0.21
335 0.21
336 0.17
337 0.17
338 0.18
339 0.21
340 0.22
341 0.19
342 0.18
343 0.16
344 0.23
345 0.24
346 0.24
347 0.21
348 0.17
349 0.15
350 0.15
351 0.15
352 0.08
353 0.07
354 0.07
355 0.07
356 0.07
357 0.07
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.06
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.08
366 0.08
367 0.08
368 0.1
369 0.13
370 0.15
371 0.22
372 0.28
373 0.32
374 0.43
375 0.53
376 0.63
377 0.7
378 0.78
379 0.82
380 0.86
381 0.91
382 0.91
383 0.91
384 0.91
385 0.92
386 0.93
387 0.92
388 0.86
389 0.82
390 0.78
391 0.69
392 0.59
393 0.48
394 0.38
395 0.29
396 0.24
397 0.17
398 0.09
399 0.07
400 0.06
401 0.05
402 0.04
403 0.04
404 0.03
405 0.03
406 0.04
407 0.04
408 0.03
409 0.03
410 0.03
411 0.05
412 0.05
413 0.07
414 0.07
415 0.1
416 0.1
417 0.11
418 0.11
419 0.11
420 0.12
421 0.11
422 0.11
423 0.09
424 0.09
425 0.08
426 0.07
427 0.07
428 0.06
429 0.06
430 0.07
431 0.06
432 0.07
433 0.08
434 0.08
435 0.08
436 0.08
437 0.09
438 0.08
439 0.08
440 0.07
441 0.07
442 0.07
443 0.09
444 0.1
445 0.09
446 0.1
447 0.11
448 0.11
449 0.13
450 0.18
451 0.27
452 0.35
453 0.38
454 0.4
455 0.44
456 0.44
457 0.43
458 0.38
459 0.29
460 0.23
461 0.21
462 0.21
463 0.17
464 0.16
465 0.16
466 0.16
467 0.16
468 0.13
469 0.12
470 0.1
471 0.1
472 0.12
473 0.12
474 0.11
475 0.11
476 0.11
477 0.1
478 0.1
479 0.09
480 0.09
481 0.12
482 0.14
483 0.16
484 0.17
485 0.2
486 0.25
487 0.34
488 0.37
489 0.37
490 0.38
491 0.44
492 0.5
493 0.54
494 0.53
495 0.5
496 0.53
497 0.5
498 0.48
499 0.41
500 0.38
501 0.35
502 0.32
503 0.32
504 0.24
505 0.25
506 0.24
507 0.22
508 0.18
509 0.14
510 0.15
511 0.16
512 0.15
513 0.13
514 0.15
515 0.15
516 0.16
517 0.18
518 0.16
519 0.11
520 0.13
521 0.16
522 0.16
523 0.17
524 0.16
525 0.18
526 0.2
527 0.22
528 0.29
529 0.3
530 0.38
531 0.46
532 0.54
533 0.56