Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178EZF9

Protein Details
Accession A0A178EZF9    Localization Confidence High Confidence Score 23.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-32VGAPQQFKQPSRKGKKAWRKNVDVTEVQHydrophilic
267-295YEAESMKKKRPERKTKAQRNKILRRKEAEBasic
672-700VDGGSGEQKKKPKKKKRITERGKEDIKKLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-22RKGKKAW
273-308KKKRPERKTKAQRNKILRRKEAERKAKAEAKMKKRE
406-411KKAKRK
663-695KRWPARPALVDGGSGEQKKKPKKKKRITERGKE
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013520  Exonuclease_RNaseT/DNA_pol3  
IPR011687  Nop53/GLTSCR2  
IPR037431  REX4_DEDDh_dom  
IPR013924  RNase_H2_suC  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0032299  C:ribonuclease H2 complex  
GO:0008408  F:3'-5' exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF07767  Nop53  
PF08615  RNase_H2_suC  
PF00929  RNase_T  
CDD cd06144  REX4_like  
cd09271  RNase_H2-C  
Amino Acid Sequences MSATVGAPQQFKQPSRKGKKAWRKNVDVTEVQEGLDQVREEEIKGGVLAEKPSEELFILDPTGDEEVQRKVQKKFKSLRADEIIAQRSAISAVDSRKRPSNSRVTDGVIEPKTKKSRSDWVTREEWLRLKKVAREAKLDETSIQPSVVHDPWAMEAKEEQEFSFLEKKKPVVAPKTLSHAPISLAANGKAIPSVIKPKAGTSYNPSFQDWDELITKEGEKEVEAEKLRLDEQKREADRIARIEAAEGDDGQIKSDDESVWEGFESEYEAESMKKKRPERKTKAQRNKILRRKEAERKAKAEAKMKKREQQAAQAKAISKQIEENEKAKLAVAKAEESSEDDEPTLRKRPFGGRTPVPAKPLELVLPEELKDSLLLLKPEGNLLADRYRTLMVQGKLEARNPITQAKKAKRKATENWDGAKKSFKQLEKASADSEIQQYYGCIKEDTYRGHASKRRKTMSTSTAATDEDNAAQTLSGQKSSDKDLVNIGLSSDVEVGKYVAIDCEMVGVGSDPDRDSALARVSIVNYNGDQVYDSYVRPKEMVTDWRSAISGILPKHMAEARSLETVQQDVAKLLDGRILIGHAVRNDLEALLLSHPKRDIRDTSRYPPYRKLAGGGSPKLKILASQLLGLEIQGSAHSSVEDARATMMLFRRDKDGFEKEHAKRWPARPALVDGGSGEQKKKPKKKKRITERGKEDIKKLIDTQLEDTSWPAAIDRTRQRPSSIIGIMLALRPATAKERDQRLEDQPEPDQENASQSQSWVSSAHTPISVSMNILPCRIHHDGPVEVSKRYWNPVRDGGSDNSVVVTKLPKDESVTKRVAGYESEDEEDNEEPLSQLESVGRFSAFTVWEHEKLPTDDDLYVRSMEEWVSFAHSGTSSIFSGTVSISSIKD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.68
3 0.77
4 0.78
5 0.83
6 0.89
7 0.9
8 0.92
9 0.91
10 0.89
11 0.89
12 0.88
13 0.84
14 0.77
15 0.7
16 0.66
17 0.56
18 0.47
19 0.39
20 0.3
21 0.24
22 0.22
23 0.18
24 0.12
25 0.15
26 0.16
27 0.15
28 0.17
29 0.16
30 0.13
31 0.13
32 0.13
33 0.12
34 0.14
35 0.15
36 0.14
37 0.14
38 0.15
39 0.16
40 0.16
41 0.14
42 0.12
43 0.12
44 0.13
45 0.12
46 0.11
47 0.11
48 0.11
49 0.13
50 0.12
51 0.12
52 0.12
53 0.17
54 0.24
55 0.31
56 0.35
57 0.4
58 0.48
59 0.55
60 0.63
61 0.68
62 0.7
63 0.75
64 0.74
65 0.76
66 0.75
67 0.71
68 0.66
69 0.64
70 0.58
71 0.47
72 0.43
73 0.33
74 0.26
75 0.23
76 0.18
77 0.12
78 0.12
79 0.18
80 0.26
81 0.3
82 0.34
83 0.41
84 0.46
85 0.5
86 0.54
87 0.59
88 0.57
89 0.6
90 0.6
91 0.55
92 0.54
93 0.51
94 0.5
95 0.43
96 0.41
97 0.37
98 0.42
99 0.47
100 0.46
101 0.48
102 0.46
103 0.53
104 0.55
105 0.64
106 0.61
107 0.59
108 0.61
109 0.6
110 0.57
111 0.52
112 0.52
113 0.47
114 0.44
115 0.43
116 0.43
117 0.45
118 0.52
119 0.55
120 0.53
121 0.54
122 0.55
123 0.59
124 0.57
125 0.53
126 0.44
127 0.39
128 0.37
129 0.31
130 0.27
131 0.18
132 0.16
133 0.21
134 0.2
135 0.19
136 0.16
137 0.16
138 0.18
139 0.24
140 0.22
141 0.17
142 0.17
143 0.18
144 0.21
145 0.21
146 0.19
147 0.15
148 0.15
149 0.18
150 0.26
151 0.26
152 0.28
153 0.3
154 0.32
155 0.36
156 0.42
157 0.46
158 0.45
159 0.49
160 0.51
161 0.5
162 0.56
163 0.52
164 0.48
165 0.41
166 0.34
167 0.28
168 0.27
169 0.26
170 0.22
171 0.22
172 0.2
173 0.2
174 0.19
175 0.18
176 0.13
177 0.12
178 0.1
179 0.1
180 0.19
181 0.2
182 0.24
183 0.24
184 0.26
185 0.32
186 0.33
187 0.33
188 0.32
189 0.38
190 0.4
191 0.42
192 0.41
193 0.36
194 0.34
195 0.36
196 0.29
197 0.24
198 0.21
199 0.19
200 0.19
201 0.19
202 0.19
203 0.14
204 0.15
205 0.12
206 0.1
207 0.12
208 0.12
209 0.17
210 0.18
211 0.18
212 0.17
213 0.19
214 0.2
215 0.24
216 0.25
217 0.26
218 0.3
219 0.39
220 0.4
221 0.42
222 0.42
223 0.41
224 0.42
225 0.39
226 0.36
227 0.28
228 0.26
229 0.24
230 0.22
231 0.19
232 0.15
233 0.11
234 0.1
235 0.13
236 0.13
237 0.13
238 0.13
239 0.11
240 0.11
241 0.12
242 0.11
243 0.09
244 0.12
245 0.11
246 0.11
247 0.11
248 0.1
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.08
257 0.13
258 0.18
259 0.22
260 0.29
261 0.37
262 0.46
263 0.57
264 0.67
265 0.72
266 0.8
267 0.85
268 0.89
269 0.92
270 0.93
271 0.91
272 0.9
273 0.92
274 0.89
275 0.88
276 0.84
277 0.79
278 0.78
279 0.79
280 0.78
281 0.78
282 0.76
283 0.7
284 0.69
285 0.69
286 0.66
287 0.65
288 0.63
289 0.63
290 0.66
291 0.68
292 0.68
293 0.68
294 0.71
295 0.65
296 0.67
297 0.67
298 0.62
299 0.58
300 0.55
301 0.48
302 0.43
303 0.43
304 0.33
305 0.24
306 0.21
307 0.23
308 0.26
309 0.28
310 0.27
311 0.26
312 0.26
313 0.25
314 0.23
315 0.21
316 0.15
317 0.15
318 0.14
319 0.14
320 0.13
321 0.14
322 0.13
323 0.13
324 0.15
325 0.13
326 0.12
327 0.11
328 0.11
329 0.12
330 0.15
331 0.21
332 0.18
333 0.18
334 0.21
335 0.29
336 0.34
337 0.41
338 0.46
339 0.42
340 0.5
341 0.54
342 0.53
343 0.48
344 0.42
345 0.35
346 0.28
347 0.25
348 0.18
349 0.14
350 0.14
351 0.12
352 0.12
353 0.12
354 0.11
355 0.11
356 0.09
357 0.08
358 0.07
359 0.08
360 0.09
361 0.09
362 0.09
363 0.1
364 0.1
365 0.11
366 0.11
367 0.09
368 0.08
369 0.09
370 0.11
371 0.1
372 0.1
373 0.11
374 0.11
375 0.11
376 0.13
377 0.17
378 0.16
379 0.17
380 0.18
381 0.22
382 0.23
383 0.24
384 0.24
385 0.19
386 0.2
387 0.21
388 0.25
389 0.23
390 0.26
391 0.34
392 0.41
393 0.49
394 0.53
395 0.58
396 0.59
397 0.64
398 0.67
399 0.68
400 0.69
401 0.64
402 0.62
403 0.6
404 0.54
405 0.48
406 0.46
407 0.37
408 0.33
409 0.34
410 0.3
411 0.31
412 0.33
413 0.41
414 0.38
415 0.38
416 0.34
417 0.29
418 0.28
419 0.23
420 0.22
421 0.13
422 0.11
423 0.09
424 0.09
425 0.09
426 0.1
427 0.09
428 0.07
429 0.07
430 0.1
431 0.14
432 0.16
433 0.19
434 0.22
435 0.22
436 0.28
437 0.33
438 0.39
439 0.44
440 0.5
441 0.5
442 0.47
443 0.51
444 0.52
445 0.53
446 0.49
447 0.43
448 0.35
449 0.32
450 0.31
451 0.27
452 0.2
453 0.15
454 0.1
455 0.09
456 0.07
457 0.06
458 0.05
459 0.06
460 0.09
461 0.09
462 0.09
463 0.09
464 0.1
465 0.11
466 0.15
467 0.2
468 0.17
469 0.17
470 0.17
471 0.18
472 0.18
473 0.16
474 0.13
475 0.08
476 0.07
477 0.07
478 0.07
479 0.06
480 0.05
481 0.05
482 0.05
483 0.05
484 0.05
485 0.04
486 0.04
487 0.04
488 0.04
489 0.04
490 0.04
491 0.04
492 0.04
493 0.04
494 0.04
495 0.04
496 0.04
497 0.05
498 0.04
499 0.05
500 0.06
501 0.06
502 0.06
503 0.08
504 0.09
505 0.08
506 0.09
507 0.09
508 0.1
509 0.11
510 0.11
511 0.11
512 0.1
513 0.11
514 0.1
515 0.1
516 0.09
517 0.07
518 0.1
519 0.1
520 0.1
521 0.14
522 0.15
523 0.16
524 0.16
525 0.15
526 0.15
527 0.17
528 0.25
529 0.24
530 0.27
531 0.27
532 0.27
533 0.27
534 0.24
535 0.21
536 0.15
537 0.15
538 0.12
539 0.13
540 0.13
541 0.13
542 0.15
543 0.17
544 0.15
545 0.12
546 0.15
547 0.15
548 0.17
549 0.17
550 0.15
551 0.14
552 0.14
553 0.13
554 0.12
555 0.1
556 0.08
557 0.08
558 0.08
559 0.08
560 0.08
561 0.09
562 0.08
563 0.08
564 0.08
565 0.08
566 0.07
567 0.08
568 0.09
569 0.07
570 0.09
571 0.08
572 0.09
573 0.09
574 0.08
575 0.08
576 0.06
577 0.07
578 0.07
579 0.12
580 0.11
581 0.13
582 0.15
583 0.17
584 0.19
585 0.22
586 0.28
587 0.31
588 0.41
589 0.45
590 0.51
591 0.59
592 0.64
593 0.63
594 0.63
595 0.61
596 0.56
597 0.5
598 0.45
599 0.38
600 0.4
601 0.43
602 0.41
603 0.39
604 0.35
605 0.34
606 0.33
607 0.29
608 0.22
609 0.19
610 0.19
611 0.17
612 0.18
613 0.17
614 0.17
615 0.17
616 0.16
617 0.12
618 0.07
619 0.06
620 0.04
621 0.05
622 0.05
623 0.05
624 0.05
625 0.05
626 0.06
627 0.08
628 0.08
629 0.07
630 0.07
631 0.08
632 0.08
633 0.11
634 0.14
635 0.19
636 0.21
637 0.21
638 0.26
639 0.26
640 0.28
641 0.32
642 0.34
643 0.31
644 0.36
645 0.45
646 0.42
647 0.5
648 0.51
649 0.5
650 0.52
651 0.54
652 0.57
653 0.51
654 0.53
655 0.47
656 0.48
657 0.48
658 0.41
659 0.35
660 0.26
661 0.25
662 0.25
663 0.24
664 0.21
665 0.21
666 0.28
667 0.38
668 0.48
669 0.56
670 0.63
671 0.73
672 0.82
673 0.89
674 0.93
675 0.94
676 0.95
677 0.95
678 0.93
679 0.91
680 0.9
681 0.83
682 0.74
683 0.71
684 0.62
685 0.54
686 0.46
687 0.42
688 0.36
689 0.34
690 0.34
691 0.3
692 0.28
693 0.25
694 0.24
695 0.19
696 0.16
697 0.14
698 0.11
699 0.1
700 0.11
701 0.19
702 0.27
703 0.35
704 0.4
705 0.42
706 0.43
707 0.43
708 0.45
709 0.44
710 0.37
711 0.29
712 0.24
713 0.23
714 0.22
715 0.2
716 0.17
717 0.09
718 0.08
719 0.07
720 0.09
721 0.13
722 0.16
723 0.21
724 0.29
725 0.38
726 0.41
727 0.45
728 0.5
729 0.53
730 0.57
731 0.55
732 0.51
733 0.45
734 0.47
735 0.46
736 0.41
737 0.35
738 0.27
739 0.28
740 0.26
741 0.25
742 0.2
743 0.17
744 0.19
745 0.18
746 0.18
747 0.14
748 0.15
749 0.18
750 0.19
751 0.21
752 0.19
753 0.19
754 0.2
755 0.23
756 0.21
757 0.16
758 0.19
759 0.24
760 0.24
761 0.25
762 0.23
763 0.2
764 0.27
765 0.3
766 0.27
767 0.24
768 0.28
769 0.29
770 0.33
771 0.41
772 0.36
773 0.32
774 0.32
775 0.35
776 0.34
777 0.38
778 0.41
779 0.37
780 0.41
781 0.49
782 0.53
783 0.5
784 0.52
785 0.48
786 0.45
787 0.41
788 0.35
789 0.27
790 0.23
791 0.19
792 0.15
793 0.17
794 0.15
795 0.19
796 0.21
797 0.21
798 0.27
799 0.36
800 0.41
801 0.45
802 0.46
803 0.43
804 0.43
805 0.43
806 0.39
807 0.31
808 0.31
809 0.28
810 0.28
811 0.29
812 0.27
813 0.26
814 0.27
815 0.25
816 0.2
817 0.15
818 0.12
819 0.1
820 0.1
821 0.11
822 0.09
823 0.09
824 0.11
825 0.12
826 0.14
827 0.15
828 0.14
829 0.13
830 0.13
831 0.17
832 0.15
833 0.15
834 0.2
835 0.24
836 0.26
837 0.28
838 0.29
839 0.3
840 0.3
841 0.32
842 0.28
843 0.25
844 0.25
845 0.25
846 0.25
847 0.23
848 0.21
849 0.19
850 0.17
851 0.15
852 0.14
853 0.13
854 0.12
855 0.11
856 0.15
857 0.15
858 0.15
859 0.16
860 0.15
861 0.16
862 0.16
863 0.19
864 0.14
865 0.15
866 0.15
867 0.12
868 0.13
869 0.12
870 0.11
871 0.1