Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178F5C9

Protein Details
Accession A0A178F5C9    Localization Confidence High Confidence Score 17.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
279-305AEFERREADKKKRKEAQFRTKLKELKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
284-314READKKKRKEAQFRTKLKELKKRTQFEAHRR
467-477KKEREKSSKLA
489-503KEVAKKSLKALEKKQ
739-757KSPTRGRGSRRKSSGGRRR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009061  DNA-bd_dom_put_sf  
IPR013258  Striatin_N  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR000465  XPA  
IPR022656  XPA_C  
IPR022658  XPA_CS  
IPR037129  XPA_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF08232  Striatin  
PF00400  WD40  
PF05181  XPA_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
PS00753  XPA_2  
CDD cd21077  DBD_Rad14  
cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MEPSQPTTPSKTAGTPDPKPLTPEQIQRIELNRLKAKALREQREAEARNRGTGGSIVAGRKRPISSVLSPSKTPANLRDGRNNPSTTGERPLDTIRPVRAFAKYVEYDFSKMTDTKGGFLTAEDDPHNKALYSKDHDGKPAHMTQRDWERYQQLQAARKDPHGPFAPGATVQDSGKQKKCRECGTVDIDWKWDEVFKCSICSVCKEKFPEKYSLLTKTEAKEDYLLTDPELKDEELLPHLERPNPHKSTWNNMMLFLRFQVEEYAFSAKKWGSPEGLDAEFERREADKKKRKEAQFRTKLKELKKRTQFEAHRRNREGGGGSFGDTLGGRQRHVHQWGRPVDNAETGMSVKTCVDCGMEVEEISVRPGILMAWQPQSAMAGNGGMGGGSMDVSNGGGQPQGTEYTLQGVMRFLQTEWHRHERDRNAWEIERAEMKSRIGRLEGDARTSKRMHESLGKHVRILEVALKKEREKSSKLAAGEKIEPSVDPKEVAKKSLKALEKKQPKPSSGLDNYADDEESNSPDAQHENERDKSRLYLGKCTQEVAYHVIPGSHPPPEINEQDLLNHDYQQHHMQRQPLDSGYIQEHQRQQQQSVPQQKQQLVPAQPQLNHVSMVREPEGSQMMMPTYNENGAQGSAQREFLDRRPQEPQRANETTQEERNSNYEFPPKTEEPSQTESKSPEAFSGKEDFGKPPTTNDIIVDEADGWNFDEAPSTEPTPAPVTRRPDTDAFPSANFIPPKSPTRGRGSRRKSSGGRRRSDGNPDVRELSGSAGPKADTTNFKVRFALRGHLDVVRSVIFTGGGSPSEPEICTCGDDGTVKRWIIPATYGVFGSNVAAPGSDLDVTSYFTHRGHNGSVATLAACPPSQNFSSGGRATGDGWVFSGGQDGCVKVWERGRVDPKATLDGHKDAVWTVCVLPGTSKSVFGDQCNANGGPDRVLLASGAADGRILIWAISAPPQLSSPQTSSRRSAGGSRRANSISSGSNFPTSPQPSTASSTAFNYTLVHQIVRNDIAPTCISPLSLAGVNFVVSYADASILVYDTRTGEEIVGMASLETYDGTRATGVNAVVASTIGFDGTASLDPNRAISEEESVVHGATGTSGGVEGVVISGYEDRYIRFFDANSGQCTYTMLAHPAAISSLSRSPDGRELVSAGHDASLRFWSLEKRSCTQEITSHRLMRGEGVCSVVWSQDGRWVASGGGDGVVKVFSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.45
3 0.52
4 0.55
5 0.53
6 0.54
7 0.54
8 0.53
9 0.51
10 0.56
11 0.54
12 0.55
13 0.56
14 0.55
15 0.56
16 0.58
17 0.55
18 0.55
19 0.53
20 0.48
21 0.49
22 0.49
23 0.5
24 0.5
25 0.56
26 0.56
27 0.56
28 0.59
29 0.61
30 0.67
31 0.66
32 0.62
33 0.62
34 0.55
35 0.51
36 0.48
37 0.41
38 0.33
39 0.3
40 0.25
41 0.18
42 0.21
43 0.22
44 0.27
45 0.31
46 0.31
47 0.35
48 0.34
49 0.33
50 0.34
51 0.36
52 0.37
53 0.43
54 0.5
55 0.5
56 0.49
57 0.5
58 0.5
59 0.47
60 0.45
61 0.41
62 0.41
63 0.44
64 0.49
65 0.57
66 0.57
67 0.6
68 0.63
69 0.58
70 0.5
71 0.49
72 0.48
73 0.41
74 0.44
75 0.39
76 0.33
77 0.35
78 0.37
79 0.35
80 0.36
81 0.38
82 0.36
83 0.36
84 0.38
85 0.38
86 0.37
87 0.35
88 0.33
89 0.36
90 0.32
91 0.31
92 0.33
93 0.32
94 0.31
95 0.29
96 0.28
97 0.24
98 0.22
99 0.22
100 0.25
101 0.23
102 0.23
103 0.24
104 0.24
105 0.2
106 0.2
107 0.22
108 0.16
109 0.18
110 0.17
111 0.18
112 0.19
113 0.21
114 0.22
115 0.18
116 0.19
117 0.21
118 0.27
119 0.33
120 0.39
121 0.44
122 0.46
123 0.52
124 0.52
125 0.5
126 0.49
127 0.49
128 0.48
129 0.45
130 0.44
131 0.45
132 0.54
133 0.57
134 0.53
135 0.51
136 0.5
137 0.49
138 0.52
139 0.51
140 0.47
141 0.48
142 0.51
143 0.52
144 0.49
145 0.49
146 0.53
147 0.48
148 0.49
149 0.46
150 0.43
151 0.37
152 0.36
153 0.34
154 0.27
155 0.27
156 0.22
157 0.19
158 0.16
159 0.22
160 0.27
161 0.33
162 0.4
163 0.47
164 0.52
165 0.59
166 0.66
167 0.67
168 0.66
169 0.63
170 0.63
171 0.62
172 0.61
173 0.57
174 0.51
175 0.46
176 0.4
177 0.36
178 0.28
179 0.25
180 0.2
181 0.19
182 0.22
183 0.21
184 0.23
185 0.23
186 0.26
187 0.24
188 0.29
189 0.31
190 0.31
191 0.36
192 0.41
193 0.47
194 0.53
195 0.55
196 0.57
197 0.53
198 0.56
199 0.55
200 0.55
201 0.5
202 0.45
203 0.46
204 0.4
205 0.43
206 0.38
207 0.34
208 0.29
209 0.27
210 0.26
211 0.25
212 0.23
213 0.18
214 0.23
215 0.22
216 0.21
217 0.23
218 0.2
219 0.17
220 0.18
221 0.19
222 0.14
223 0.17
224 0.16
225 0.19
226 0.22
227 0.24
228 0.27
229 0.31
230 0.38
231 0.4
232 0.4
233 0.43
234 0.44
235 0.5
236 0.55
237 0.57
238 0.48
239 0.47
240 0.49
241 0.42
242 0.39
243 0.31
244 0.24
245 0.16
246 0.16
247 0.16
248 0.14
249 0.14
250 0.15
251 0.2
252 0.18
253 0.18
254 0.21
255 0.18
256 0.21
257 0.22
258 0.23
259 0.19
260 0.2
261 0.23
262 0.24
263 0.25
264 0.22
265 0.2
266 0.22
267 0.19
268 0.18
269 0.17
270 0.14
271 0.19
272 0.26
273 0.36
274 0.42
275 0.5
276 0.6
277 0.68
278 0.76
279 0.82
280 0.85
281 0.86
282 0.86
283 0.87
284 0.84
285 0.83
286 0.81
287 0.78
288 0.78
289 0.75
290 0.75
291 0.76
292 0.74
293 0.72
294 0.75
295 0.76
296 0.77
297 0.79
298 0.79
299 0.79
300 0.77
301 0.74
302 0.64
303 0.58
304 0.51
305 0.41
306 0.35
307 0.26
308 0.24
309 0.21
310 0.19
311 0.16
312 0.12
313 0.12
314 0.14
315 0.15
316 0.14
317 0.17
318 0.21
319 0.27
320 0.35
321 0.41
322 0.37
323 0.46
324 0.52
325 0.53
326 0.51
327 0.47
328 0.41
329 0.37
330 0.34
331 0.25
332 0.19
333 0.16
334 0.15
335 0.11
336 0.1
337 0.09
338 0.08
339 0.08
340 0.07
341 0.08
342 0.07
343 0.08
344 0.1
345 0.1
346 0.09
347 0.1
348 0.1
349 0.09
350 0.1
351 0.09
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.05
356 0.07
357 0.09
358 0.11
359 0.14
360 0.14
361 0.14
362 0.14
363 0.15
364 0.13
365 0.11
366 0.08
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.05
371 0.04
372 0.04
373 0.03
374 0.03
375 0.03
376 0.03
377 0.03
378 0.03
379 0.03
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.05
386 0.06
387 0.07
388 0.07
389 0.08
390 0.08
391 0.1
392 0.12
393 0.11
394 0.11
395 0.1
396 0.1
397 0.1
398 0.11
399 0.08
400 0.14
401 0.16
402 0.22
403 0.28
404 0.35
405 0.37
406 0.38
407 0.46
408 0.47
409 0.54
410 0.52
411 0.5
412 0.46
413 0.45
414 0.45
415 0.38
416 0.32
417 0.28
418 0.25
419 0.24
420 0.2
421 0.21
422 0.21
423 0.22
424 0.22
425 0.19
426 0.18
427 0.18
428 0.25
429 0.24
430 0.25
431 0.28
432 0.28
433 0.31
434 0.31
435 0.3
436 0.27
437 0.27
438 0.25
439 0.29
440 0.31
441 0.38
442 0.47
443 0.45
444 0.4
445 0.4
446 0.38
447 0.3
448 0.28
449 0.23
450 0.18
451 0.2
452 0.24
453 0.25
454 0.26
455 0.33
456 0.37
457 0.35
458 0.35
459 0.36
460 0.4
461 0.42
462 0.43
463 0.4
464 0.37
465 0.36
466 0.35
467 0.31
468 0.25
469 0.2
470 0.19
471 0.17
472 0.17
473 0.13
474 0.12
475 0.12
476 0.2
477 0.21
478 0.25
479 0.25
480 0.26
481 0.28
482 0.35
483 0.4
484 0.38
485 0.44
486 0.5
487 0.57
488 0.61
489 0.68
490 0.66
491 0.61
492 0.6
493 0.56
494 0.56
495 0.48
496 0.46
497 0.38
498 0.34
499 0.33
500 0.29
501 0.25
502 0.16
503 0.14
504 0.1
505 0.1
506 0.1
507 0.09
508 0.08
509 0.09
510 0.1
511 0.1
512 0.14
513 0.16
514 0.2
515 0.26
516 0.28
517 0.29
518 0.29
519 0.28
520 0.28
521 0.29
522 0.26
523 0.3
524 0.31
525 0.36
526 0.35
527 0.35
528 0.31
529 0.27
530 0.27
531 0.22
532 0.19
533 0.13
534 0.13
535 0.12
536 0.12
537 0.13
538 0.13
539 0.1
540 0.09
541 0.09
542 0.12
543 0.16
544 0.17
545 0.16
546 0.16
547 0.15
548 0.16
549 0.17
550 0.17
551 0.13
552 0.13
553 0.13
554 0.12
555 0.14
556 0.21
557 0.23
558 0.23
559 0.25
560 0.28
561 0.29
562 0.3
563 0.3
564 0.23
565 0.21
566 0.19
567 0.18
568 0.16
569 0.17
570 0.17
571 0.19
572 0.22
573 0.24
574 0.3
575 0.29
576 0.28
577 0.28
578 0.33
579 0.37
580 0.43
581 0.43
582 0.41
583 0.44
584 0.46
585 0.44
586 0.41
587 0.4
588 0.32
589 0.32
590 0.33
591 0.31
592 0.29
593 0.3
594 0.29
595 0.24
596 0.22
597 0.19
598 0.16
599 0.14
600 0.16
601 0.13
602 0.11
603 0.11
604 0.12
605 0.12
606 0.1
607 0.1
608 0.08
609 0.07
610 0.07
611 0.07
612 0.07
613 0.06
614 0.07
615 0.07
616 0.07
617 0.07
618 0.06
619 0.06
620 0.07
621 0.08
622 0.08
623 0.09
624 0.09
625 0.1
626 0.12
627 0.16
628 0.24
629 0.23
630 0.25
631 0.32
632 0.35
633 0.43
634 0.47
635 0.48
636 0.46
637 0.49
638 0.48
639 0.46
640 0.47
641 0.41
642 0.38
643 0.36
644 0.28
645 0.26
646 0.26
647 0.23
648 0.2
649 0.19
650 0.22
651 0.2
652 0.22
653 0.27
654 0.26
655 0.27
656 0.3
657 0.31
658 0.29
659 0.34
660 0.36
661 0.3
662 0.32
663 0.3
664 0.29
665 0.27
666 0.22
667 0.2
668 0.19
669 0.18
670 0.18
671 0.21
672 0.18
673 0.19
674 0.2
675 0.18
676 0.18
677 0.22
678 0.2
679 0.17
680 0.21
681 0.21
682 0.2
683 0.19
684 0.18
685 0.15
686 0.15
687 0.13
688 0.09
689 0.08
690 0.07
691 0.07
692 0.05
693 0.05
694 0.05
695 0.04
696 0.05
697 0.06
698 0.08
699 0.1
700 0.11
701 0.12
702 0.12
703 0.13
704 0.15
705 0.16
706 0.18
707 0.22
708 0.27
709 0.28
710 0.31
711 0.33
712 0.32
713 0.33
714 0.33
715 0.32
716 0.27
717 0.25
718 0.25
719 0.22
720 0.24
721 0.22
722 0.17
723 0.16
724 0.19
725 0.23
726 0.27
727 0.3
728 0.3
729 0.39
730 0.48
731 0.53
732 0.6
733 0.64
734 0.67
735 0.68
736 0.7
737 0.68
738 0.7
739 0.73
740 0.72
741 0.68
742 0.62
743 0.63
744 0.59
745 0.6
746 0.56
747 0.55
748 0.48
749 0.45
750 0.44
751 0.39
752 0.35
753 0.27
754 0.22
755 0.16
756 0.14
757 0.13
758 0.12
759 0.12
760 0.12
761 0.13
762 0.14
763 0.14
764 0.19
765 0.28
766 0.29
767 0.3
768 0.32
769 0.32
770 0.35
771 0.33
772 0.34
773 0.26
774 0.26
775 0.27
776 0.27
777 0.26
778 0.21
779 0.2
780 0.14
781 0.12
782 0.1
783 0.09
784 0.07
785 0.06
786 0.07
787 0.06
788 0.06
789 0.06
790 0.07
791 0.07
792 0.08
793 0.08
794 0.07
795 0.08
796 0.09
797 0.09
798 0.09
799 0.09
800 0.08
801 0.11
802 0.12
803 0.13
804 0.18
805 0.17
806 0.17
807 0.19
808 0.19
809 0.17
810 0.17
811 0.17
812 0.14
813 0.15
814 0.15
815 0.13
816 0.13
817 0.12
818 0.12
819 0.09
820 0.07
821 0.06
822 0.06
823 0.06
824 0.06
825 0.07
826 0.06
827 0.06
828 0.06
829 0.07
830 0.09
831 0.1
832 0.11
833 0.12
834 0.12
835 0.14
836 0.15
837 0.17
838 0.16
839 0.19
840 0.18
841 0.17
842 0.17
843 0.14
844 0.13
845 0.11
846 0.1
847 0.08
848 0.07
849 0.07
850 0.07
851 0.11
852 0.11
853 0.12
854 0.14
855 0.16
856 0.22
857 0.22
858 0.23
859 0.2
860 0.2
861 0.19
862 0.21
863 0.18
864 0.12
865 0.12
866 0.12
867 0.11
868 0.1
869 0.13
870 0.09
871 0.11
872 0.12
873 0.12
874 0.11
875 0.13
876 0.15
877 0.14
878 0.18
879 0.23
880 0.25
881 0.32
882 0.39
883 0.41
884 0.42
885 0.43
886 0.41
887 0.41
888 0.39
889 0.35
890 0.33
891 0.31
892 0.3
893 0.26
894 0.24
895 0.19
896 0.19
897 0.16
898 0.13
899 0.1
900 0.1
901 0.1
902 0.1
903 0.1
904 0.11
905 0.16
906 0.15
907 0.16
908 0.15
909 0.2
910 0.22
911 0.22
912 0.27
913 0.23
914 0.23
915 0.26
916 0.25
917 0.2
918 0.22
919 0.21
920 0.16
921 0.15
922 0.15
923 0.11
924 0.11
925 0.11
926 0.08
927 0.07
928 0.07
929 0.06
930 0.05
931 0.05
932 0.04
933 0.05
934 0.05
935 0.05
936 0.04
937 0.04
938 0.04
939 0.05
940 0.08
941 0.09
942 0.09
943 0.09
944 0.1
945 0.12
946 0.14
947 0.17
948 0.18
949 0.26
950 0.33
951 0.36
952 0.38
953 0.4
954 0.39
955 0.37
956 0.42
957 0.42
958 0.46
959 0.5
960 0.49
961 0.51
962 0.51
963 0.5
964 0.43
965 0.37
966 0.32
967 0.27
968 0.28
969 0.25
970 0.26
971 0.25
972 0.25
973 0.3
974 0.28
975 0.27
976 0.27
977 0.28
978 0.28
979 0.34
980 0.34
981 0.28
982 0.26
983 0.26
984 0.26
985 0.23
986 0.21
987 0.17
988 0.17
989 0.2
990 0.19
991 0.18
992 0.17
993 0.18
994 0.21
995 0.22
996 0.22
997 0.18
998 0.17
999 0.19
1000 0.18
1001 0.17
1002 0.17
1003 0.15
1004 0.14
1005 0.12
1006 0.13
1007 0.13
1008 0.14
1009 0.13
1010 0.11
1011 0.11
1012 0.12
1013 0.11
1014 0.11
1015 0.08
1016 0.06
1017 0.07
1018 0.05
1019 0.05
1020 0.05
1021 0.05
1022 0.06
1023 0.06
1024 0.06
1025 0.06
1026 0.06
1027 0.07
1028 0.08
1029 0.09
1030 0.09
1031 0.09
1032 0.09
1033 0.09
1034 0.08
1035 0.08
1036 0.06
1037 0.05
1038 0.05
1039 0.04
1040 0.04
1041 0.04
1042 0.05
1043 0.05
1044 0.06
1045 0.06
1046 0.07
1047 0.07
1048 0.08
1049 0.11
1050 0.11
1051 0.11
1052 0.11
1053 0.11
1054 0.1
1055 0.1
1056 0.09
1057 0.06
1058 0.06
1059 0.05
1060 0.05
1061 0.04
1062 0.05
1063 0.07
1064 0.08
1065 0.08
1066 0.09
1067 0.11
1068 0.11
1069 0.12
1070 0.13
1071 0.12
1072 0.13
1073 0.13
1074 0.16
1075 0.16
1076 0.17
1077 0.18
1078 0.17
1079 0.17
1080 0.14
1081 0.13
1082 0.09
1083 0.08
1084 0.07
1085 0.05
1086 0.05
1087 0.05
1088 0.05
1089 0.04
1090 0.04
1091 0.04
1092 0.03
1093 0.04
1094 0.03
1095 0.04
1096 0.06
1097 0.06
1098 0.09
1099 0.09
1100 0.1
1101 0.12
1102 0.15
1103 0.16
1104 0.17
1105 0.17
1106 0.21
1107 0.29
1108 0.32
1109 0.34
1110 0.34
1111 0.32
1112 0.3
1113 0.32
1114 0.27
1115 0.22
1116 0.2
1117 0.19
1118 0.17
1119 0.17
1120 0.17
1121 0.16
1122 0.15
1123 0.12
1124 0.11
1125 0.12
1126 0.15
1127 0.17
1128 0.19
1129 0.2
1130 0.23
1131 0.29
1132 0.31
1133 0.29
1134 0.26
1135 0.25
1136 0.25
1137 0.26
1138 0.23
1139 0.17
1140 0.15
1141 0.15
1142 0.14
1143 0.15
1144 0.16
1145 0.15
1146 0.14
1147 0.16
1148 0.21
1149 0.28
1150 0.36
1151 0.4
1152 0.41
1153 0.47
1154 0.5
1155 0.51
1156 0.48
1157 0.48
1158 0.48
1159 0.51
1160 0.55
1161 0.53
1162 0.51
1163 0.5
1164 0.46
1165 0.45
1166 0.4
1167 0.35
1168 0.28
1169 0.26
1170 0.25
1171 0.24
1172 0.24
1173 0.18
1174 0.16
1175 0.15
1176 0.14
1177 0.17
1178 0.19
1179 0.19
1180 0.2
1181 0.2
1182 0.18
1183 0.18
1184 0.18
1185 0.13
1186 0.12
1187 0.11
1188 0.09
1189 0.09