Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A178F5C9

Protein Details
Accession A0A178F5C9    Localization Confidence High Confidence Score 17.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
279-305AEFERREADKKKRKEAQFRTKLKELKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
284-314READKKKRKEAQFRTKLKELKKRTQFEAHRR
467-477KKEREKSSKLA
489-503KEVAKKSLKALEKKQ
739-757KSPTRGRGSRRKSSGGRRR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009061  DNA-bd_dom_put_sf  
IPR013258  Striatin_N  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR000465  XPA  
IPR022656  XPA_C  
IPR022658  XPA_CS  
IPR037129  XPA_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF08232  Striatin  
PF00400  WD40  
PF05181  XPA_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
PS00753  XPA_2  
CDD cd21077  DBD_Rad14  
cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MEPSQPTTPSKTAGTPDPKPLTPEQIQRIELNRLKAKALREQREAEARNRGTGGSIVAGRKRPISSVLSPSKTPANLRDGRNNPSTTGERPLDTIRPVRAFAKYVEYDFSKMTDTKGGFLTAEDDPHNKALYSKDHDGKPAHMTQRDWERYQQLQAARKDPHGPFAPGATVQDSGKQKKCRECGTVDIDWKWDEVFKCSICSVCKEKFPEKYSLLTKTEAKEDYLLTDPELKDEELLPHLERPNPHKSTWNNMMLFLRFQVEEYAFSAKKWGSPEGLDAEFERREADKKKRKEAQFRTKLKELKKRTQFEAHRRNREGGGGSFGDTLGGRQRHVHQWGRPVDNAETGMSVKTCVDCGMEVEEISVRPGILMAWQPQSAMAGNGGMGGGSMDVSNGGGQPQGTEYTLQGVMRFLQTEWHRHERDRNAWEIERAEMKSRIGRLEGDARTSKRMHESLGKHVRILEVALKKEREKSSKLAAGEKIEPSVDPKEVAKKSLKALEKKQPKPSSGLDNYADDEESNSPDAQHENERDKSRLYLGKCTQEVAYHVIPGSHPPPEINEQDLLNHDYQQHHMQRQPLDSGYIQEHQRQQQQSVPQQKQQLVPAQPQLNHVSMVREPEGSQMMMPTYNENGAQGSAQREFLDRRPQEPQRANETTQEERNSNYEFPPKTEEPSQTESKSPEAFSGKEDFGKPPTTNDIIVDEADGWNFDEAPSTEPTPAPVTRRPDTDAFPSANFIPPKSPTRGRGSRRKSSGGRRRSDGNPDVRELSGSAGPKADTTNFKVRFALRGHLDVVRSVIFTGGGSPSEPEICTCGDDGTVKRWIIPATYGVFGSNVAAPGSDLDVTSYFTHRGHNGSVATLAACPPSQNFSSGGRATGDGWVFSGGQDGCVKVWERGRVDPKATLDGHKDAVWTVCVLPGTSKSVFGDQCNANGGPDRVLLASGAADGRILIWAISAPPQLSSPQTSSRRSAGGSRRANSISSGSNFPTSPQPSTASSTAFNYTLVHQIVRNDIAPTCISPLSLAGVNFVVSYADASILVYDTRTGEEIVGMASLETYDGTRATGVNAVVASTIGFDGTASLDPNRAISEEESVVHGATGTSGGVEGVVISGYEDRYIRFFDANSGQCTYTMLAHPAAISSLSRSPDGRELVSAGHDASLRFWSLEKRSCTQEITSHRLMRGEGVCSVVWSQDGRWVASGGGDGVVKVFSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.45
3 0.52
4 0.55
5 0.53
6 0.54
7 0.54
8 0.53
9 0.51
10 0.56
11 0.54
12 0.55
13 0.56
14 0.55
15 0.56
16 0.58
17 0.55
18 0.55
19 0.53
20 0.48
21 0.49
22 0.49
23 0.5
24 0.5
25 0.56
26 0.56
27 0.56
28 0.59
29 0.61
30 0.67
31 0.66
32 0.62
33 0.62
34 0.55
35 0.51
36 0.48
37 0.41
38 0.33
39 0.3
40 0.25
41 0.18
42 0.21
43 0.22
44 0.27
45 0.31
46 0.31
47 0.35
48 0.34
49 0.33
50 0.34
51 0.36
52 0.37
53 0.43
54 0.5
55 0.5
56 0.49
57 0.5
58 0.5
59 0.47
60 0.45
61 0.41
62 0.41
63 0.44
64 0.49
65 0.57
66 0.57
67 0.6
68 0.63
69 0.58
70 0.5
71 0.49
72 0.48
73 0.41
74 0.44
75 0.39
76 0.33
77 0.35
78 0.37
79 0.35
80 0.36
81 0.38
82 0.36
83 0.36
84 0.38
85 0.38
86 0.37
87 0.35
88 0.33
89 0.36
90 0.32
91 0.31
92 0.33
93 0.32
94 0.31
95 0.29
96 0.28
97 0.24
98 0.22
99 0.22
100 0.25
101 0.23
102 0.23
103 0.24
104 0.24
105 0.2
106 0.2
107 0.22
108 0.16
109 0.18
110 0.17
111 0.18
112 0.19
113 0.21
114 0.22
115 0.18
116 0.19
117 0.21
118 0.27
119 0.33
120 0.39
121 0.44
122 0.46
123 0.52
124 0.52
125 0.5
126 0.49
127 0.49
128 0.48
129 0.45
130 0.44
131 0.45
132 0.54
133 0.57
134 0.53
135 0.51
136 0.5
137 0.49
138 0.52
139 0.51
140 0.47
141 0.48
142 0.51
143 0.52
144 0.49
145 0.49
146 0.53
147 0.48
148 0.49
149 0.46
150 0.43
151 0.37
152 0.36
153 0.34
154 0.27
155 0.27
156 0.22
157 0.19
158 0.16
159 0.22
160 0.27
161 0.33
162 0.4
163 0.47
164 0.52
165 0.59
166 0.66
167 0.67
168 0.66
169 0.63
170 0.63
171 0.62
172 0.61
173 0.57
174 0.51
175 0.46
176 0.4
177 0.36
178 0.28
179 0.25
180 0.2
181 0.19
182 0.22
183 0.21
184 0.23
185 0.23
186 0.26
187 0.24
188 0.29
189 0.31
190 0.31
191 0.36
192 0.41
193 0.47
194 0.53
195 0.55
196 0.57
197 0.53
198 0.56
199 0.55
200 0.55
201 0.5
202 0.45
203 0.46
204 0.4
205 0.43
206 0.38
207 0.34
208 0.29
209 0.27
210 0.26
211 0.25
212 0.23
213 0.18
214 0.23
215 0.22
216 0.21
217 0.23
218 0.2
219 0.17
220 0.18
221 0.19
222 0.14
223 0.17
224 0.16
225 0.19
226 0.22
227 0.24
228 0.27
229 0.31
230 0.38
231 0.4
232 0.4
233 0.43
234 0.44
235 0.5
236 0.55
237 0.57
238 0.48
239 0.47
240 0.49
241 0.42
242 0.39
243 0.31
244 0.24
245 0.16
246 0.16
247 0.16
248 0.14
249 0.14
250 0.15
251 0.2
252 0.18
253 0.18
254 0.21
255 0.18
256 0.21
257 0.22
258 0.23
259 0.19
260 0.2
261 0.23
262 0.24
263 0.25
264 0.22
265 0.2
266 0.22
267 0.19
268 0.18
269 0.17
270 0.14
271 0.19
272 0.26
273 0.36
274 0.42
275 0.5
276 0.6
277 0.68
278 0.76
279 0.82
280 0.85
281 0.86
282 0.86
283 0.87
284 0.84
285 0.83
286 0.81
287 0.78
288 0.78
289 0.75
290 0.75
291 0.76
292 0.74
293 0.72
294 0.75
295 0.76
296 0.77
297 0.79
298 0.79
299 0.79
300 0.77
301 0.74
302 0.64
303 0.58
304 0.51
305 0.41
306 0.35
307 0.26
308 0.24
309 0.21
310 0.19
311 0.16
312 0.12
313 0.12
314 0.14
315 0.15
316 0.14
317 0.17
318 0.21
319 0.27
320 0.35
321 0.41
322 0.37
323 0.46
324 0.52
325 0.53
326 0.51
327 0.47
328 0.41
329 0.37
330 0.34
331 0.25
332 0.19
333 0.16
334 0.15
335 0.11
336 0.1
337 0.09
338 0.08
339 0.08
340 0.07
341 0.08
342 0.07
343 0.08
344 0.1
345 0.1
346 0.09
347 0.1
348 0.1
349 0.09
350 0.1
351 0.09
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.05
356 0.07
357 0.09
358 0.11
359 0.14
360 0.14
361 0.14
362 0.14
363 0.15
364 0.13
365 0.11
366 0.08
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.05
371 0.04
372 0.04
373 0.03
374 0.03
375 0.03
376 0.03
377 0.03
378 0.03
379 0.03
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.05
386 0.06
387 0.07
388 0.07
389 0.08
390 0.08
391 0.1
392 0.12
393 0.11
394 0.11
395 0.1
396 0.1
397 0.1
398 0.11
399 0.08
400 0.14
401 0.16
402 0.22
403 0.28
404 0.35
405 0.37
406 0.38
407 0.46
408 0.47
409 0.54
410 0.52
411 0.5
412 0.46
413 0.45
414 0.45
415 0.38
416 0.32
417 0.28
418 0.25
419 0.24
420 0.2
421 0.21
422 0.21
423 0.22
424 0.22
425 0.19
426 0.18
427 0.18
428 0.25
429 0.24
430 0.25
431 0.28
432 0.28
433 0.31
434 0.31
435 0.3
436 0.27
437 0.27
438 0.25
439 0.29
440 0.31
441 0.38
442 0.47
443 0.45
444 0.4
445 0.4
446 0.38
447 0.3
448 0.28
449 0.23
450 0.18
451 0.2
452 0.24
453 0.25
454 0.26
455 0.33
456 0.37
457 0.35
458 0.35
459 0.36
460 0.4
461 0.42
462 0.43
463 0.4
464 0.37
465 0.36
466 0.35
467 0.31
468 0.25
469 0.2
470 0.19
471 0.17
472 0.17
473 0.13
474 0.12
475 0.12
476 0.2
477 0.21
478 0.25
479 0.25
480 0.26
481 0.28
482 0.35
483 0.4
484 0.38
485 0.44
486 0.5
487 0.57
488 0.61
489 0.68
490 0.66
491 0.61
492 0.6
493 0.56
494 0.56
495 0.48
496 0.46
497 0.38
498 0.34
499 0.33
500 0.29
501 0.25
502 0.16
503 0.14
504 0.1
505 0.1
506 0.1
507 0.09
508 0.08
509 0.09
510 0.1
511 0.1
512 0.14
513 0.16
514 0.2
515 0.26
516 0.28
517 0.29
518 0.29
519 0.28
520 0.28
521 0.29
522 0.26
523 0.3
524 0.31
525 0.36
526 0.35
527 0.35
528 0.31
529 0.27
530 0.27
531 0.22
532 0.19
533 0.13
534 0.13
535 0.12
536 0.12
537 0.13
538 0.13
539 0.1
540 0.09
541 0.09
542 0.12
543 0.16
544 0.17
545 0.16
546 0.16
547 0.15
548 0.16
549 0.17
550 0.17
551 0.13
552 0.13
553 0.13
554 0.12
555 0.14
556 0.21
557 0.23
558 0.23
559 0.25
560 0.28
561 0.29
562 0.3
563 0.3
564 0.23
565 0.21
566 0.19
567 0.18
568 0.16
569 0.17
570 0.17
571 0.19
572 0.22
573 0.24
574 0.3
575 0.29
576 0.28
577 0.28
578 0.33
579 0.37
580 0.43
581 0.43
582 0.41
583 0.44
584 0.46
585 0.44
586 0.41
587 0.4
588 0.32
589 0.32
590 0.33
591 0.31
592 0.29
593 0.3
594 0.29
595 0.24
596 0.22
597 0.19
598 0.16
599 0.14
600 0.16
601 0.13
602 0.11
603 0.11
604 0.12
605 0.12
606 0.1
607 0.1
608 0.08
609 0.07
610 0.07
611 0.07
612 0.07
613 0.06
614 0.07
615 0.07
616 0.07
617 0.07
618 0.06
619 0.06
620 0.07
621 0.08
622 0.08
623 0.09
624 0.09
625 0.1
626 0.12
627 0.16
628 0.24
629 0.23
630 0.25
631 0.32
632 0.35
633 0.43
634 0.47
635 0.48
636 0.46
637 0.49
638 0.48
639 0.46
640 0.47
641 0.41
642 0.38
643 0.36
644 0.28
645 0.26
646 0.26
647 0.23
648 0.2
649 0.19
650 0.22
651 0.2
652 0.22
653 0.27
654 0.26
655 0.27
656 0.3
657 0.31
658 0.29
659 0.34
660 0.36
661 0.3
662 0.32
663 0.3
664 0.29
665 0.27
666 0.22
667 0.2
668 0.19
669 0.18
670 0.18
671 0.21
672 0.18
673 0.19
674 0.2
675 0.18
676 0.18
677 0.22
678 0.2
679 0.17
680 0.21
681 0.21
682 0.2
683 0.19
684 0.18
685 0.15
686 0.15
687 0.13
688 0.09
689 0.08
690 0.07
691 0.07
692 0.05
693 0.05
694 0.05
695 0.04
696 0.05
697 0.06
698 0.08
699 0.1
700 0.11
701 0.12
702 0.12
703 0.13
704 0.15
705 0.16
706 0.18
707 0.22
708 0.27
709 0.28
710 0.31
711 0.33
712 0.32
713 0.33
714 0.33
715 0.32
716 0.27
717 0.25
718 0.25
719 0.22
720 0.24
721 0.22
722 0.17
723 0.16
724 0.19
725 0.23
726 0.27
727 0.3
728 0.3
729 0.39
730 0.48
731 0.53
732 0.6
733 0.64
734 0.67
735 0.68
736 0.7
737 0.68
738 0.7
739 0.73
740 0.72
741 0.68
742 0.62
743 0.63
744 0.59
745 0.6
746 0.56
747 0.55
748 0.48
749 0.45
750 0.44
751 0.39
752 0.35
753 0.27
754 0.22
755 0.16
756 0.14
757 0.13
758 0.12
759 0.12
760 0.12
761 0.13
762 0.14
763 0.14
764 0.19
765 0.28
766 0.29
767 0.3
768 0.32
769 0.32
770 0.35
771 0.33
772 0.34
773 0.26
774 0.26
775 0.27
776 0.27
777 0.26
778 0.21
779 0.2
780 0.14
781 0.12
782 0.1
783 0.09
784 0.07
785 0.06
786 0.07
787 0.06
788 0.06
789 0.06
790 0.07
791 0.07
792 0.08
793 0.08
794 0.07
795 0.08
796 0.09
797 0.09
798 0.09
799 0.09
800 0.08
801 0.11
802 0.12
803 0.13
804 0.18
805 0.17
806 0.17
807 0.19
808 0.19
809 0.17
810 0.17
811 0.17
812 0.14
813 0.15
814 0.15
815 0.13
816 0.13
817 0.12
818 0.12
819 0.09
820 0.07
821 0.06
822 0.06
823 0.06
824 0.06
825 0.07
826 0.06
827 0.06
828 0.06
829 0.07
830 0.09
831 0.1
832 0.11
833 0.12
834 0.12
835 0.14
836 0.15
837 0.17
838 0.16
839 0.19
840 0.18
841 0.17
842 0.17
843 0.14
844 0.13
845 0.11
846 0.1
847 0.08
848 0.07
849 0.07
850 0.07
851 0.11
852 0.11
853 0.12
854 0.14
855 0.16
856 0.22
857 0.22
858 0.23
859 0.2
860 0.2
861 0.19
862 0.21
863 0.18
864 0.12
865 0.12
866 0.12
867 0.11
868 0.1
869 0.13
870 0.09
871 0.11
872 0.12
873 0.12
874 0.11
875 0.13
876 0.15
877 0.14
878 0.18
879 0.23
880 0.25
881 0.32
882 0.39
883 0.41
884 0.42
885 0.43
886 0.41
887 0.41
888 0.39
889 0.35
890 0.33
891 0.31
892 0.3
893 0.26
894 0.24
895 0.19
896 0.19
897 0.16
898 0.13
899 0.1
900 0.1
901 0.1
902 0.1
903 0.1
904 0.11
905 0.16
906 0.15
907 0.16
908 0.15
909 0.2
910 0.22
911 0.22
912 0.27
913 0.23
914 0.23
915 0.26
916 0.25
917 0.2
918 0.22
919 0.21
920 0.16
921 0.15
922 0.15
923 0.11
924 0.11
925 0.11
926 0.08
927 0.07
928 0.07
929 0.06
930 0.05
931 0.05
932 0.04
933 0.05
934 0.05
935 0.05
936 0.04
937 0.04
938 0.04
939 0.05
940 0.08
941 0.09
942 0.09
943 0.09
944 0.1
945 0.12
946 0.14
947 0.17
948 0.18
949 0.26
950 0.33
951 0.36
952 0.38
953 0.4
954 0.39
955 0.37
956 0.42
957 0.42
958 0.46
959 0.5
960 0.49
961 0.51
962 0.51
963 0.5
964 0.43
965 0.37
966 0.32
967 0.27
968 0.28
969 0.25
970 0.26
971 0.25
972 0.25
973 0.3
974 0.28
975 0.27
976 0.27
977 0.28
978 0.28
979 0.34
980 0.34
981 0.28
982 0.26
983 0.26
984 0.26
985 0.23
986 0.21
987 0.17
988 0.17
989 0.2
990 0.19
991 0.18
992 0.17
993 0.18
994 0.21
995 0.22
996 0.22
997 0.18
998 0.17
999 0.19
1000 0.18
1001 0.17
1002 0.17
1003 0.15
1004 0.14
1005 0.12
1006 0.13
1007 0.13
1008 0.14
1009 0.13
1010 0.11
1011 0.11
1012 0.12
1013 0.11
1014 0.11
1015 0.08
1016 0.06
1017 0.07
1018 0.05
1019 0.05
1020 0.05
1021 0.05
1022 0.06
1023 0.06
1024 0.06
1025 0.06
1026 0.06
1027 0.07
1028 0.08
1029 0.09
1030 0.09
1031 0.09
1032 0.09
1033 0.09
1034 0.08
1035 0.08
1036 0.06
1037 0.05
1038 0.05
1039 0.04
1040 0.04
1041 0.04
1042 0.05
1043 0.05
1044 0.06
1045 0.06
1046 0.07
1047 0.07
1048 0.08
1049 0.11
1050 0.11
1051 0.11
1052 0.11
1053 0.11
1054 0.1
1055 0.1
1056 0.09
1057 0.06
1058 0.06
1059 0.05
1060 0.05
1061 0.04
1062 0.05
1063 0.07
1064 0.08
1065 0.08
1066 0.09
1067 0.11
1068 0.11
1069 0.12
1070 0.13
1071 0.12
1072 0.13
1073 0.13
1074 0.16
1075 0.16
1076 0.17
1077 0.18
1078 0.17
1079 0.17
1080 0.14
1081 0.13
1082 0.09
1083 0.08
1084 0.07
1085 0.05
1086 0.05
1087 0.05
1088 0.05
1089 0.04
1090 0.04
1091 0.04
1092 0.03
1093 0.04
1094 0.03
1095 0.04
1096 0.06
1097 0.06
1098 0.09
1099 0.09
1100 0.1
1101 0.12
1102 0.15
1103 0.16
1104 0.17
1105 0.17
1106 0.21
1107 0.29
1108 0.32
1109 0.34
1110 0.34
1111 0.32
1112 0.3
1113 0.32
1114 0.27
1115 0.22
1116 0.2
1117 0.19
1118 0.17
1119 0.17
1120 0.17
1121 0.16
1122 0.15
1123 0.12
1124 0.11
1125 0.12
1126 0.15
1127 0.17
1128 0.19
1129 0.2
1130 0.23
1131 0.29
1132 0.31
1133 0.29
1134 0.26
1135 0.25
1136 0.25
1137 0.26
1138 0.23
1139 0.17
1140 0.15
1141 0.15
1142 0.14
1143 0.15
1144 0.16
1145 0.15
1146 0.14
1147 0.16
1148 0.21
1149 0.28
1150 0.36
1151 0.4
1152 0.41
1153 0.47
1154 0.5
1155 0.51
1156 0.48
1157 0.48
1158 0.48
1159 0.51
1160 0.55
1161 0.53
1162 0.51
1163 0.5
1164 0.46
1165 0.45
1166 0.4
1167 0.35
1168 0.28
1169 0.26
1170 0.25
1171 0.24
1172 0.24
1173 0.18
1174 0.16
1175 0.15
1176 0.14
1177 0.17
1178 0.19
1179 0.19
1180 0.2
1181 0.2
1182 0.18
1183 0.18
1184 0.18
1185 0.13
1186 0.12
1187 0.11
1188 0.09
1189 0.09