FuNGI

A0A178F4E4

Protein Details

Accession

A0A178F4E4

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
21-45	AVSEHPPSKKSKKTQEKHAKPEAAT	Hydrophilic
66-91	EKLSVKVDKKPTKESKPRKRAADFLS	Hydrophilic
102-148	IAPKPKAEKKEMQPKKKAKSEKLGVSAESKEKIKKAKSKAKEVEKEP	Basic
318-337	GANRRFKKTPWNQIEKRRLD	Hydrophilic
344-367	GWSKAISKEKSKRAKKAEKMKALG	Hydrophilic
402-423	VEDKKEETPKKKESKSKGEEVE	Acidic
443-499	VEAEKKSTEKESKKPKKAVNDAPAISEKPTKDEKQSKNALKVKKVEEKPKKVKKAKA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
7-11	ATKRK
25-86	HPPSKKSKKTQEKHAKPEAATVKTSSIKPKKEKDTVDGAKSEKLSVKVDKKPTKESKPRKRA
103-143	APKPKAEKKEMQPKKKAKSEKLGVSAESKEKIKKAKSKAKE
209-222	SKKAMKAIRKKKKE
320-364	NRRFKKTPWNQIEKRRLDAGKSREGWSKAISKEKSKRAKKAEKMK
409-499	TPKKKESKSKGEEVEAKPVTNGKAAKEKRPEAGNVEAEKKSTEKESKKPKKAVNDAPAISEKPTKDEKQSKNALKVKKVEEKPKKVKKAKA

Subcellular Location(s)

nucl 15, cyto_nucl 12.333, mito_nucl 10.999, cyto 6.5, mito 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12307 RRM_NIFK_like

Amino Acid Sequences

MAPEKKATKRKAPATTTAAPAVSEHPPSKKSKKTQEKHAKPEAATVKTSSIKPKKEKDTVDGAKSEKLSVKVDKKPTKESKPRKRAADFLSDDEEEGPKQEIAPKPKAEKKEMQPKKKAKSEKLGVSAESKEKIKKAKSKAKEVEKEPEEAPELVEKPFSPDSDADSDKEAEDDQTLALIRGFESSGDEDPSEDEGFEPGQEVPKIPDSKKAMKAIRKKKKESSAPEEPGTVYVGRIPHGFYEDEMRAYFSQFGDISRLRLSRNRTTGKSKHYAFIEFTSSSVAKVVAATMQNYLMFGHILKCMYIPTDKVHADMWKGANRRFKKTPWNQIEKRRLDAGKSREGWSKAISKEKSKRAKKAEKMKALGYEYEIPKLKSVREVPVALAVQDQIEEGTSAPVAEVEDKKEETPKKKESKSKGEEVEAKPVTNGKAAKEKRPEAGNVEAEKKSTEKESKKPKKAVNDAPAISEKPTKDEKQSKNALKVKKVEEKPKKVKKAKA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.77
2	0.74
3	0.68
4	0.61
5	0.52
6	0.42
7	0.37
8	0.32
9	0.27
10	0.27
11	0.27
12	0.29
13	0.33
14	0.42
15	0.5
16	0.56
17	0.62
18	0.68
19	0.76
20	0.79
21	0.85
22	0.88
23	0.9
24	0.9
25	0.9
26	0.86
27	0.75
28	0.76
29	0.73
30	0.65
31	0.57
32	0.49
33	0.44
34	0.41
35	0.44
36	0.45
37	0.46
38	0.52
39	0.59
40	0.66
41	0.71
42	0.75
43	0.77
44	0.72
45	0.74
46	0.72
47	0.68
48	0.63
49	0.55
50	0.51
51	0.46
52	0.43
53	0.37
54	0.33
55	0.32
56	0.37
57	0.43
58	0.47
59	0.57
60	0.62
61	0.63
62	0.7
63	0.75
64	0.77
65	0.8
66	0.83
67	0.84
68	0.87
69	0.9
70	0.88
71	0.84
72	0.81
73	0.75
74	0.75
75	0.67
76	0.6
77	0.57
78	0.48
79	0.43
80	0.36
81	0.31
82	0.21
83	0.18
84	0.16
85	0.11
86	0.11
87	0.17
88	0.22
89	0.29
90	0.36
91	0.4
92	0.47
93	0.53
94	0.59
95	0.6
96	0.63
97	0.65
98	0.69
99	0.74
100	0.76
101	0.79
102	0.83
103	0.85
104	0.84
105	0.84
106	0.81
107	0.82
108	0.8
109	0.77
110	0.75
111	0.68
112	0.61
113	0.55
114	0.5
115	0.42
116	0.37
117	0.32
118	0.28
119	0.3
120	0.36
121	0.4
122	0.46
123	0.53
124	0.6
125	0.65
126	0.73
127	0.78
128	0.81
129	0.81
130	0.77
131	0.77
132	0.68
133	0.64
134	0.53
135	0.46
136	0.38
137	0.3
138	0.26
139	0.2
140	0.19
141	0.16
142	0.16
143	0.14
144	0.16
145	0.18
146	0.17
147	0.16
148	0.15
149	0.19
150	0.23
151	0.24
152	0.2
153	0.21
154	0.21
155	0.18
156	0.19
157	0.15
158	0.1
159	0.09
160	0.09
161	0.06
162	0.07
163	0.07
164	0.07
165	0.07
166	0.06
167	0.06
168	0.06
169	0.06
170	0.05
171	0.07
172	0.09
173	0.09
174	0.1
175	0.1
176	0.09
177	0.1
178	0.13
179	0.11
180	0.09
181	0.08
182	0.08
183	0.08
184	0.08
185	0.08
186	0.06
187	0.08
188	0.08
189	0.09
190	0.1
191	0.16
192	0.2
193	0.19
194	0.27
195	0.3
196	0.37
197	0.42
198	0.48
199	0.48
200	0.53
201	0.63
202	0.66
203	0.71
204	0.73
205	0.74
206	0.75
207	0.78
208	0.79
209	0.77
210	0.75
211	0.74
212	0.69
213	0.63
214	0.56
215	0.47
216	0.38
217	0.3
218	0.22
219	0.12
220	0.09
221	0.09
222	0.09
223	0.09
224	0.09
225	0.08
226	0.1
227	0.1
228	0.08
229	0.12
230	0.12
231	0.12
232	0.12
233	0.14
234	0.12
235	0.12
236	0.13
237	0.09
238	0.1
239	0.09
240	0.09
241	0.12
242	0.12
243	0.13
244	0.14
245	0.15
246	0.15
247	0.19
248	0.25
249	0.27
250	0.35
251	0.39
252	0.41
253	0.48
254	0.53
255	0.55
256	0.57
257	0.51
258	0.48
259	0.44
260	0.43
261	0.36
262	0.32
263	0.28
264	0.21
265	0.2
266	0.18
267	0.16
268	0.14
269	0.13
270	0.11
271	0.07
272	0.07
273	0.07
274	0.07
275	0.07
276	0.08
277	0.08
278	0.09
279	0.09
280	0.09
281	0.09
282	0.06
283	0.06
284	0.06
285	0.06
286	0.07
287	0.08
288	0.07
289	0.08
290	0.08
291	0.09
292	0.1
293	0.1
294	0.11
295	0.16
296	0.16
297	0.17
298	0.19
299	0.19
300	0.19
301	0.22
302	0.23
303	0.23
304	0.26
305	0.3
306	0.37
307	0.4
308	0.46
309	0.46
310	0.48
311	0.54
312	0.6
313	0.67
314	0.67
315	0.74
316	0.74
317	0.79
318	0.85
319	0.77
320	0.71
321	0.67
322	0.58
323	0.52
324	0.53
325	0.48
326	0.47
327	0.46
328	0.46
329	0.45
330	0.46
331	0.43
332	0.38
333	0.39
334	0.34
335	0.41
336	0.41
337	0.45
338	0.52
339	0.6
340	0.67
341	0.68
342	0.74
343	0.75
344	0.83
345	0.82
346	0.85
347	0.85
348	0.84
349	0.79
350	0.73
351	0.69
352	0.6
353	0.52
354	0.45
355	0.42
356	0.33
357	0.35
358	0.34
359	0.28
360	0.29
361	0.3
362	0.27
363	0.28
364	0.3
365	0.31
366	0.33
367	0.34
368	0.31
369	0.35
370	0.34
371	0.27
372	0.24
373	0.18
374	0.13
375	0.12
376	0.11
377	0.05
378	0.05
379	0.06
380	0.05
381	0.06
382	0.06
383	0.05
384	0.05
385	0.06
386	0.06
387	0.1
388	0.11
389	0.14
390	0.17
391	0.19
392	0.2
393	0.28
394	0.35
395	0.39
396	0.46
397	0.53
398	0.6
399	0.68
400	0.76
401	0.78
402	0.82
403	0.81
404	0.81
405	0.77
406	0.74
407	0.75
408	0.68
409	0.68
410	0.58
411	0.51
412	0.43
413	0.41
414	0.34
415	0.3
416	0.3
417	0.23
418	0.32
419	0.36
420	0.44
421	0.5
422	0.53
423	0.53
424	0.56
425	0.56
426	0.51
427	0.55
428	0.53
429	0.48
430	0.5
431	0.44
432	0.4
433	0.38
434	0.34
435	0.29
436	0.3
437	0.35
438	0.37
439	0.46
440	0.57
441	0.67
442	0.76
443	0.82
444	0.81
445	0.82
446	0.85
447	0.86
448	0.84
449	0.82
450	0.73
451	0.69
452	0.65
453	0.56
454	0.48
455	0.44
456	0.35
457	0.32
458	0.39
459	0.38
460	0.45
461	0.54
462	0.59
463	0.63
464	0.73
465	0.75
466	0.78
467	0.81
468	0.79
469	0.77
470	0.78
471	0.77
472	0.77
473	0.77
474	0.78
475	0.82
476	0.84
477	0.87
478	0.9
479	0.92

A0A178F4E4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer