Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178F4R1

Protein Details
Accession A0A178F4R1    Localization Confidence High Confidence Score 19.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
55-77AASLRFQPTKRPQLPSQRLKAKSHydrophilic
128-154GYYGGEKRQRGGRKKRKKNYESEVILQHydrophilic
582-601EYPTKPPKCKFVPPLFHPNVHydrophilic
649-668YNLFKKDRPAYEKKVRQVVKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
134-145KRQRGGRKKRKK
401-425KKKSDSEGRGVAPPGGPRGKIVGGG
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR040052  RBM17  
IPR000608  UBQ-conjugat_E2  
IPR023313  UBQ-conjugating_AS  
IPR016135  UBQ-conjugating_enzyme/RWD  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0016740  F:transferase activity  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF01585  G-patch  
PF00179  UQ_con  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
PS00183  UBC_1  
PS50127  UBC_2  
CDD cd00195  UBCc  
Amino Acid Sequences MSSEKMTTPKPGMSLYANLLDTHESASISRAPVVFKQATDASQDDPAMKKQQISAASLRFQPTKRPQLPSQRLKAKSGISKPPVIISSASPATPDQGTTSGAVTAGRPTGKSTLADWTATADDDDVNGYYGGEKRQRGGRKKRKKNYESEVILQNWDDIYDPTRPNSYEAYKHSDEKIQEVREWKDRLYAHRLAQQYNSDSDSDEERSRLQMNRQFAPPPSFAPPPNLNAPPEESPEPERTFSEAVPQPAVEIPDDSTGEEAYARRLRLSANINQPEPSPQPSQPSQLSQPSPTDEAPASTAPTSQNSNTATISRPPVRYALPAAPGDLPATEAELEATLANEQEDVNKEGDEDAPRSLRPGQKGFAERLLTKYGWTKGSGLGANESGIVNPLQVKVQKQKKKSDSEGRGVAPPGGPRGKIVGGGRKQEEQGKFGPMSDVVILHGMVDGLDLDAELESGELMQEIGDECGEKYGRVERVYIDRNSKDRIPVFIKFTNQLSALRLSSKQLAPFSPSKMSLCINRLTEERKQWRRDHPFGFFAKPYRTPQGALDLKRWECGVPGKSKTLWDGGLFKLDLIFPDEYPTKPPKCKFVPPLFHPNVYPSGTVCLSILAEDDGWKPAITIKQILLGIQDLLDDPNPESPAQAEAYNLFKKDRPAYEKKVRQVVKEHPAV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.3
3 0.32
4 0.3
5 0.27
6 0.27
7 0.25
8 0.22
9 0.2
10 0.18
11 0.13
12 0.12
13 0.15
14 0.17
15 0.16
16 0.19
17 0.18
18 0.2
19 0.22
20 0.3
21 0.29
22 0.26
23 0.3
24 0.29
25 0.29
26 0.31
27 0.3
28 0.24
29 0.25
30 0.26
31 0.24
32 0.24
33 0.28
34 0.3
35 0.3
36 0.3
37 0.29
38 0.35
39 0.35
40 0.37
41 0.4
42 0.38
43 0.4
44 0.42
45 0.43
46 0.43
47 0.41
48 0.46
49 0.49
50 0.55
51 0.58
52 0.62
53 0.66
54 0.72
55 0.82
56 0.81
57 0.82
58 0.8
59 0.77
60 0.74
61 0.71
62 0.67
63 0.65
64 0.63
65 0.63
66 0.58
67 0.6
68 0.56
69 0.55
70 0.48
71 0.41
72 0.34
73 0.25
74 0.27
75 0.23
76 0.22
77 0.19
78 0.19
79 0.19
80 0.18
81 0.17
82 0.13
83 0.13
84 0.14
85 0.14
86 0.15
87 0.12
88 0.12
89 0.12
90 0.1
91 0.11
92 0.13
93 0.13
94 0.13
95 0.15
96 0.18
97 0.19
98 0.2
99 0.2
100 0.24
101 0.25
102 0.25
103 0.22
104 0.22
105 0.21
106 0.2
107 0.18
108 0.11
109 0.09
110 0.09
111 0.1
112 0.07
113 0.08
114 0.07
115 0.07
116 0.08
117 0.11
118 0.16
119 0.2
120 0.21
121 0.24
122 0.32
123 0.42
124 0.5
125 0.6
126 0.66
127 0.72
128 0.82
129 0.89
130 0.92
131 0.91
132 0.91
133 0.88
134 0.88
135 0.82
136 0.76
137 0.72
138 0.62
139 0.54
140 0.44
141 0.35
142 0.25
143 0.19
144 0.15
145 0.09
146 0.1
147 0.15
148 0.16
149 0.17
150 0.2
151 0.21
152 0.22
153 0.27
154 0.28
155 0.29
156 0.32
157 0.39
158 0.38
159 0.41
160 0.4
161 0.4
162 0.37
163 0.37
164 0.4
165 0.34
166 0.34
167 0.37
168 0.39
169 0.42
170 0.43
171 0.37
172 0.37
173 0.37
174 0.39
175 0.42
176 0.43
177 0.39
178 0.43
179 0.45
180 0.41
181 0.41
182 0.4
183 0.34
184 0.31
185 0.29
186 0.23
187 0.21
188 0.2
189 0.2
190 0.19
191 0.17
192 0.16
193 0.16
194 0.17
195 0.2
196 0.22
197 0.26
198 0.28
199 0.32
200 0.34
201 0.36
202 0.36
203 0.36
204 0.38
205 0.32
206 0.3
207 0.3
208 0.29
209 0.28
210 0.31
211 0.31
212 0.29
213 0.33
214 0.33
215 0.29
216 0.27
217 0.3
218 0.26
219 0.27
220 0.25
221 0.22
222 0.23
223 0.28
224 0.29
225 0.26
226 0.25
227 0.24
228 0.24
229 0.21
230 0.26
231 0.23
232 0.22
233 0.22
234 0.21
235 0.19
236 0.18
237 0.19
238 0.12
239 0.09
240 0.09
241 0.1
242 0.11
243 0.1
244 0.09
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.07
249 0.11
250 0.14
251 0.14
252 0.14
253 0.14
254 0.15
255 0.2
256 0.24
257 0.26
258 0.33
259 0.36
260 0.36
261 0.36
262 0.36
263 0.34
264 0.32
265 0.29
266 0.23
267 0.21
268 0.25
269 0.26
270 0.31
271 0.28
272 0.29
273 0.29
274 0.31
275 0.31
276 0.28
277 0.28
278 0.26
279 0.26
280 0.23
281 0.22
282 0.16
283 0.15
284 0.15
285 0.14
286 0.12
287 0.1
288 0.11
289 0.1
290 0.11
291 0.13
292 0.11
293 0.15
294 0.15
295 0.17
296 0.16
297 0.17
298 0.16
299 0.17
300 0.21
301 0.21
302 0.21
303 0.2
304 0.22
305 0.22
306 0.22
307 0.22
308 0.2
309 0.19
310 0.18
311 0.18
312 0.17
313 0.16
314 0.15
315 0.11
316 0.1
317 0.06
318 0.07
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.04
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.05
332 0.07
333 0.09
334 0.09
335 0.09
336 0.09
337 0.09
338 0.11
339 0.11
340 0.11
341 0.1
342 0.11
343 0.11
344 0.12
345 0.16
346 0.18
347 0.21
348 0.22
349 0.23
350 0.27
351 0.3
352 0.29
353 0.3
354 0.29
355 0.25
356 0.25
357 0.27
358 0.22
359 0.2
360 0.22
361 0.21
362 0.2
363 0.2
364 0.19
365 0.17
366 0.2
367 0.2
368 0.16
369 0.15
370 0.13
371 0.12
372 0.12
373 0.11
374 0.07
375 0.07
376 0.06
377 0.05
378 0.06
379 0.06
380 0.08
381 0.09
382 0.13
383 0.21
384 0.31
385 0.38
386 0.44
387 0.53
388 0.59
389 0.65
390 0.71
391 0.72
392 0.7
393 0.69
394 0.67
395 0.59
396 0.53
397 0.46
398 0.38
399 0.29
400 0.22
401 0.21
402 0.18
403 0.16
404 0.15
405 0.17
406 0.16
407 0.18
408 0.2
409 0.24
410 0.27
411 0.31
412 0.33
413 0.32
414 0.34
415 0.37
416 0.36
417 0.3
418 0.28
419 0.28
420 0.26
421 0.24
422 0.23
423 0.16
424 0.16
425 0.13
426 0.11
427 0.07
428 0.08
429 0.07
430 0.06
431 0.06
432 0.05
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.03
437 0.03
438 0.03
439 0.03
440 0.03
441 0.03
442 0.03
443 0.03
444 0.02
445 0.03
446 0.03
447 0.02
448 0.03
449 0.02
450 0.03
451 0.03
452 0.04
453 0.04
454 0.05
455 0.05
456 0.08
457 0.08
458 0.08
459 0.09
460 0.14
461 0.18
462 0.19
463 0.2
464 0.2
465 0.27
466 0.33
467 0.36
468 0.37
469 0.37
470 0.39
471 0.43
472 0.42
473 0.41
474 0.37
475 0.4
476 0.37
477 0.37
478 0.4
479 0.4
480 0.41
481 0.37
482 0.37
483 0.33
484 0.29
485 0.27
486 0.23
487 0.22
488 0.2
489 0.2
490 0.19
491 0.19
492 0.23
493 0.24
494 0.25
495 0.25
496 0.25
497 0.28
498 0.31
499 0.32
500 0.3
501 0.3
502 0.28
503 0.28
504 0.29
505 0.3
506 0.29
507 0.31
508 0.29
509 0.29
510 0.31
511 0.34
512 0.38
513 0.42
514 0.5
515 0.53
516 0.59
517 0.64
518 0.72
519 0.77
520 0.79
521 0.75
522 0.7
523 0.69
524 0.65
525 0.63
526 0.55
527 0.5
528 0.47
529 0.45
530 0.45
531 0.44
532 0.42
533 0.39
534 0.37
535 0.43
536 0.45
537 0.42
538 0.43
539 0.43
540 0.42
541 0.42
542 0.41
543 0.3
544 0.26
545 0.31
546 0.32
547 0.32
548 0.35
549 0.38
550 0.39
551 0.41
552 0.41
553 0.37
554 0.32
555 0.27
556 0.27
557 0.24
558 0.27
559 0.25
560 0.23
561 0.2
562 0.18
563 0.16
564 0.17
565 0.17
566 0.12
567 0.17
568 0.19
569 0.19
570 0.25
571 0.32
572 0.35
573 0.42
574 0.45
575 0.49
576 0.54
577 0.63
578 0.68
579 0.71
580 0.74
581 0.73
582 0.81
583 0.76
584 0.71
585 0.62
586 0.56
587 0.51
588 0.43
589 0.36
590 0.26
591 0.26
592 0.24
593 0.23
594 0.19
595 0.15
596 0.13
597 0.13
598 0.12
599 0.09
600 0.09
601 0.1
602 0.11
603 0.12
604 0.13
605 0.12
606 0.12
607 0.15
608 0.19
609 0.21
610 0.23
611 0.22
612 0.27
613 0.27
614 0.27
615 0.24
616 0.21
617 0.18
618 0.15
619 0.14
620 0.09
621 0.11
622 0.11
623 0.11
624 0.11
625 0.15
626 0.17
627 0.16
628 0.16
629 0.15
630 0.17
631 0.17
632 0.17
633 0.14
634 0.15
635 0.22
636 0.25
637 0.26
638 0.26
639 0.27
640 0.34
641 0.4
642 0.47
643 0.5
644 0.55
645 0.64
646 0.72
647 0.79
648 0.8
649 0.82
650 0.77
651 0.74
652 0.73
653 0.73