FuNGI

A0A178F373

Protein Details

Accession

A0A178F373

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
161-194	ETNGNMSVKRKNKNNPETPPKKRKQLKLGDYGIG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
169-184	KRKNKNNPETPPKKRK

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto 4.5, cyto_mito 3.5, mito 1.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007855 RNA-dep_RNA_pol_euk-typ
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0003968 F:RNA-dependent RNA polymerase activity GO:0031047 P:RNA-mediated gene silencing
Pfam	View protein in Pfam PF05183 RdRP

Amino Acid Sequences

MSKQRKKSGKDLERIIEDINIGFDLDLPRVQSQGPSESCPAEQKCVSYIIYLYWNDHLHEPLVELFKWDRRQFPNRQISGRSFQSYFADPLSSTALRRGLDQPLRLRSEKEKAGVYEYWSKVLYDAYWIARHNLAESTSPGRDTSSTANSTTDTPDKCTAETNGNMSVKRKNKNNPETPPKKRKQLKLGDYGIGTSASPKVSAPVMTSPRIDTLQSKINDGMIVKKSPSRTMHPGLSNSKSLSLNDSSSPGRSFSSTTVSTVPNSRVTTPLTSFASTTFRSPIYPVMRISPTLTPLDEGKLIPMLSDLVTNGPFSKRLAWFKDVPLRLRYEVERLARACDITPETILSEDVLTEDQSYDDLCHNLYRGPYKNKFERSKLTVWRVATETYMDAEKQTMVVFSGQLEWKGERLVLVLNPLKLEKSHRFARRYGADRFLEILLPSKHPTKCGRDAEIFGKALGKWLSNEYHYLLGRRWRAFYLEDLKSKSKTTSFSGSGRKAFLFAVDGEDFLGTLPRISPMDETSENHTPMTVEQLVDWHIHYDRNTHQEYSKLFTRIRLGLSRTTATITLRPEEFIYDDDPRQEKMSDGCAMMSRSLGRAIADSLCLSKVPTCFQGRIAGAKGIWVVAKDNRDIHVKGLRHFETERGYWLVINASQLKVQPPPCDTSLMIDKHQLTFDVSSYSQPPQPVHLNTQFLMVLQDRGTNKEYILSLILEEADKFYSEFLLVQNGDSAACRAWVRQNGGDASSQIPALNESTFSHSLTGRLNMLLDAGFSPSTLAFVRRLFKEYSLGGFVQKLEALKIKTPQSTYVYCIPDPYGVLEEGQVHLDLGDSWEDGTTDLDGIDVLVARAPAHLPSDIQKCRAVFHPALRYLKNVAIFPTKGEVPLASLLSGGDYDGDEVWVCWDQEIVKPFVNYPMPDIPEPEEYGLVKVSRRVGDMPFDRFMEYSFIFNMSQNPLGLCTNEHERYCYHRGGIGSPLAIHFSGLLSHLADIRKSGYEYPAENRQKYRESLGPLTLRNPAYKTDKTPEQDGDLITWKSDNILDCLRFEVVEMVKERIYSRLNDDCPSINIPRVDEDLIATWKRIWDRAIQERNSGCSKLLEAIKKLREQVEAASESYRRVTDKLSHAAKVTFAAESLMAIKPPDIDHPVAIVWKESDYEWKNLLASCAYQCSPDSWFTWHAAFKVLCHMKARANGNWYSVKAPIYHRLTMNKSMMKKIEIERRKAETEEELLLLRSLEEQEILDNDSDDDWYSVV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.68
2	0.59
3	0.49
4	0.39
5	0.31
6	0.23
7	0.16
8	0.12
9	0.1
10	0.11
11	0.11
12	0.12
13	0.13
14	0.14
15	0.15
16	0.16
17	0.17
18	0.18
19	0.2
20	0.27
21	0.28
22	0.3
23	0.32
24	0.33
25	0.34
26	0.39
27	0.38
28	0.36
29	0.35
30	0.33
31	0.32
32	0.33
33	0.32
34	0.25
35	0.24
36	0.2
37	0.25
38	0.24
39	0.24
40	0.25
41	0.26
42	0.26
43	0.28
44	0.26
45	0.22
46	0.21
47	0.2
48	0.2
49	0.22
50	0.2
51	0.21
52	0.23
53	0.29
54	0.38
55	0.4
56	0.44
57	0.49
58	0.58
59	0.65
60	0.72
61	0.75
62	0.73
63	0.75
64	0.73
65	0.71
66	0.7
67	0.66
68	0.6
69	0.5
70	0.46
71	0.44
72	0.41
73	0.36
74	0.29
75	0.25
76	0.2
77	0.21
78	0.24
79	0.22
80	0.19
81	0.22
82	0.25
83	0.23
84	0.27
85	0.29
86	0.33
87	0.38
88	0.44
89	0.47
90	0.51
91	0.57
92	0.55
93	0.55
94	0.53
95	0.55
96	0.54
97	0.5
98	0.47
99	0.43
100	0.47
101	0.45
102	0.43
103	0.44
104	0.4
105	0.38
106	0.34
107	0.32
108	0.27
109	0.26
110	0.21
111	0.16
112	0.19
113	0.19
114	0.22
115	0.23
116	0.25
117	0.26
118	0.26
119	0.23
120	0.22
121	0.2
122	0.19
123	0.21
124	0.24
125	0.23
126	0.23
127	0.22
128	0.22
129	0.21
130	0.22
131	0.24
132	0.26
133	0.27
134	0.27
135	0.28
136	0.27
137	0.28
138	0.3
139	0.3
140	0.25
141	0.28
142	0.33
143	0.33
144	0.33
145	0.35
146	0.33
147	0.33
148	0.34
149	0.32
150	0.34
151	0.35
152	0.36
153	0.36
154	0.42
155	0.43
156	0.48
157	0.53
158	0.56
159	0.64
160	0.73
161	0.8
162	0.82
163	0.85
164	0.88
165	0.9
166	0.91
167	0.88
168	0.88
169	0.87
170	0.87
171	0.86
172	0.86
173	0.85
174	0.83
175	0.8
176	0.73
177	0.65
178	0.56
179	0.46
180	0.35
181	0.26
182	0.17
183	0.14
184	0.11
185	0.11
186	0.1
187	0.11
188	0.12
189	0.13
190	0.14
191	0.2
192	0.24
193	0.26
194	0.28
195	0.27
196	0.28
197	0.29
198	0.28
199	0.22
200	0.22
201	0.28
202	0.27
203	0.28
204	0.26
205	0.26
206	0.26
207	0.24
208	0.27
209	0.23
210	0.24
211	0.23
212	0.27
213	0.28
214	0.34
215	0.38
216	0.38
217	0.42
218	0.46
219	0.51
220	0.52
221	0.57
222	0.56
223	0.55
224	0.51
225	0.44
226	0.42
227	0.36
228	0.32
229	0.3
230	0.26
231	0.25
232	0.23
233	0.25
234	0.22
235	0.23
236	0.23
237	0.19
238	0.18
239	0.17
240	0.18
241	0.17
242	0.22
243	0.2
244	0.21
245	0.23
246	0.23
247	0.24
248	0.25
249	0.26
250	0.26
251	0.27
252	0.26
253	0.25
254	0.27
255	0.3
256	0.28
257	0.3
258	0.26
259	0.25
260	0.24
261	0.24
262	0.25
263	0.22
264	0.22
265	0.19
266	0.17
267	0.18
268	0.19
269	0.24
270	0.25
271	0.27
272	0.26
273	0.29
274	0.3
275	0.3
276	0.32
277	0.26
278	0.24
279	0.23
280	0.22
281	0.18
282	0.18
283	0.19
284	0.18
285	0.15
286	0.13
287	0.14
288	0.13
289	0.12
290	0.11
291	0.1
292	0.08
293	0.09
294	0.08
295	0.08
296	0.09
297	0.09
298	0.1
299	0.1
300	0.11
301	0.12
302	0.17
303	0.21
304	0.28
305	0.33
306	0.36
307	0.39
308	0.44
309	0.52
310	0.5
311	0.48
312	0.45
313	0.44
314	0.41
315	0.41
316	0.36
317	0.32
318	0.34
319	0.33
320	0.35
321	0.31
322	0.32
323	0.3
324	0.29
325	0.24
326	0.21
327	0.2
328	0.16
329	0.16
330	0.14
331	0.13
332	0.13
333	0.13
334	0.1
335	0.08
336	0.06
337	0.07
338	0.06
339	0.06
340	0.06
341	0.06
342	0.06
343	0.06
344	0.06
345	0.07
346	0.08
347	0.08
348	0.08
349	0.09
350	0.09
351	0.11
352	0.14
353	0.19
354	0.25
355	0.33
356	0.4
357	0.47
358	0.55
359	0.63
360	0.67
361	0.66
362	0.67
363	0.65
364	0.66
365	0.67
366	0.65
367	0.6
368	0.54
369	0.51
370	0.45
371	0.39
372	0.31
373	0.24
374	0.18
375	0.14
376	0.14
377	0.11
378	0.1
379	0.09
380	0.09
381	0.08
382	0.07
383	0.06
384	0.06
385	0.07
386	0.07
387	0.06
388	0.1
389	0.1
390	0.11
391	0.12
392	0.12
393	0.12
394	0.12
395	0.12
396	0.08
397	0.08
398	0.09
399	0.08
400	0.13
401	0.15
402	0.15
403	0.16
404	0.16
405	0.16
406	0.15
407	0.21
408	0.21
409	0.25
410	0.33
411	0.4
412	0.44
413	0.45
414	0.52
415	0.54
416	0.54
417	0.52
418	0.5
419	0.44
420	0.41
421	0.41
422	0.33
423	0.26
424	0.21
425	0.22
426	0.16
427	0.17
428	0.18
429	0.23
430	0.23
431	0.26
432	0.33
433	0.35
434	0.42
435	0.45
436	0.48
437	0.45
438	0.47
439	0.46
440	0.44
441	0.37
442	0.28
443	0.25
444	0.2
445	0.2
446	0.17
447	0.15
448	0.12
449	0.14
450	0.16
451	0.15
452	0.17
453	0.15
454	0.18
455	0.18
456	0.19
457	0.18
458	0.23
459	0.28
460	0.28
461	0.28
462	0.25
463	0.26
464	0.26
465	0.29
466	0.31
467	0.3
468	0.32
469	0.34
470	0.36
471	0.35
472	0.35
473	0.31
474	0.26
475	0.24
476	0.24
477	0.27
478	0.28
479	0.32
480	0.38
481	0.4
482	0.39
483	0.38
484	0.34
485	0.29
486	0.25
487	0.2
488	0.14
489	0.11
490	0.13
491	0.11
492	0.11
493	0.1
494	0.1
495	0.1
496	0.08
497	0.09
498	0.04
499	0.04
500	0.04
501	0.05
502	0.06
503	0.07
504	0.08
505	0.08
506	0.13
507	0.14
508	0.15
509	0.2
510	0.24
511	0.24
512	0.22
513	0.21
514	0.17
515	0.16
516	0.19
517	0.14
518	0.1
519	0.09
520	0.1
521	0.11
522	0.12
523	0.12
524	0.08
525	0.08
526	0.1
527	0.1
528	0.13
529	0.16
530	0.21
531	0.23
532	0.23
533	0.23
534	0.25
535	0.26
536	0.27
537	0.28
538	0.26
539	0.24
540	0.25
541	0.28
542	0.26
543	0.28
544	0.26
545	0.24
546	0.24
547	0.26
548	0.25
549	0.21
550	0.2
551	0.18
552	0.16
553	0.16
554	0.15
555	0.15
556	0.14
557	0.14
558	0.13
559	0.13
560	0.13
561	0.11
562	0.12
563	0.12
564	0.12
565	0.15
566	0.16
567	0.16
568	0.17
569	0.16
570	0.14
571	0.13
572	0.16
573	0.14
574	0.13
575	0.13
576	0.13
577	0.14
578	0.13
579	0.12
580	0.09
581	0.08
582	0.08
583	0.08
584	0.06
585	0.06
586	0.07
587	0.07
588	0.07
589	0.07
590	0.07
591	0.07
592	0.07
593	0.07
594	0.08
595	0.08
596	0.1
597	0.14
598	0.16
599	0.16
600	0.17
601	0.22
602	0.2
603	0.21
604	0.21
605	0.17
606	0.14
607	0.14
608	0.13
609	0.09
610	0.08
611	0.06
612	0.07
613	0.09
614	0.11
615	0.12
616	0.13
617	0.14
618	0.17
619	0.18
620	0.19
621	0.22
622	0.22
623	0.24
624	0.29
625	0.28
626	0.27
627	0.27
628	0.27
629	0.24
630	0.23
631	0.22
632	0.17
633	0.16
634	0.14
635	0.14
636	0.12
637	0.09
638	0.11
639	0.1
640	0.09
641	0.1
642	0.1
643	0.11
644	0.15
645	0.17
646	0.17
647	0.18
648	0.21
649	0.21
650	0.22
651	0.21
652	0.19
653	0.24
654	0.23
655	0.22
656	0.22
657	0.22
658	0.21
659	0.21
660	0.18
661	0.13
662	0.12
663	0.11
664	0.11
665	0.1
666	0.1
667	0.12
668	0.13
669	0.14
670	0.15
671	0.15
672	0.16
673	0.2
674	0.21
675	0.25
676	0.27
677	0.28
678	0.26
679	0.27
680	0.23
681	0.19
682	0.19
683	0.13
684	0.1
685	0.09
686	0.12
687	0.11
688	0.15
689	0.16
690	0.15
691	0.15
692	0.16
693	0.16
694	0.13
695	0.13
696	0.1
697	0.08
698	0.08
699	0.08
700	0.06
701	0.06
702	0.06
703	0.05
704	0.05
705	0.05
706	0.05
707	0.05
708	0.05
709	0.06
710	0.05
711	0.08
712	0.08
713	0.08
714	0.09
715	0.08
716	0.08
717	0.08
718	0.08
719	0.05
720	0.06
721	0.06
722	0.07
723	0.12
724	0.16
725	0.19
726	0.2
727	0.23
728	0.22
729	0.24
730	0.23
731	0.19
732	0.16
733	0.13
734	0.12
735	0.09
736	0.09
737	0.08
738	0.09
739	0.08
740	0.07
741	0.08
742	0.13
743	0.14
744	0.14
745	0.15
746	0.14
747	0.16
748	0.16
749	0.16
750	0.12
751	0.11
752	0.11
753	0.09
754	0.1
755	0.08
756	0.07
757	0.05
758	0.06
759	0.05
760	0.05
761	0.06
762	0.05
763	0.07
764	0.07
765	0.08
766	0.09
767	0.12
768	0.16
769	0.17
770	0.2
771	0.2
772	0.21
773	0.22
774	0.21
775	0.2
776	0.19
777	0.18
778	0.16
779	0.15
780	0.14
781	0.12
782	0.12
783	0.1
784	0.09
785	0.12
786	0.13
787	0.15
788	0.2
789	0.23
790	0.24
791	0.25
792	0.28
793	0.29
794	0.29
795	0.3
796	0.33
797	0.32
798	0.29
799	0.29
800	0.26
801	0.22
802	0.21
803	0.18
804	0.13
805	0.1
806	0.1
807	0.1
808	0.1
809	0.09
810	0.1
811	0.08
812	0.06
813	0.06
814	0.06
815	0.05
816	0.05
817	0.05
818	0.05
819	0.05
820	0.05
821	0.05
822	0.06
823	0.06
824	0.05
825	0.05
826	0.05
827	0.04
828	0.04
829	0.04
830	0.04
831	0.03
832	0.03
833	0.04
834	0.04
835	0.04
836	0.05
837	0.05
838	0.06
839	0.07
840	0.08
841	0.08
842	0.13
843	0.22
844	0.24
845	0.26
846	0.28
847	0.27
848	0.28
849	0.31
850	0.32
851	0.27
852	0.32
853	0.37
854	0.4
855	0.44
856	0.43
857	0.42
858	0.38
859	0.38
860	0.33
861	0.26
862	0.23
863	0.23
864	0.23
865	0.22
866	0.22
867	0.19
868	0.17
869	0.17
870	0.14
871	0.11
872	0.13
873	0.12
874	0.09
875	0.09
876	0.09
877	0.08
878	0.08
879	0.06
880	0.04
881	0.04
882	0.05
883	0.05
884	0.05
885	0.05
886	0.05
887	0.07
888	0.08
889	0.08
890	0.07
891	0.08
892	0.08
893	0.12
894	0.15
895	0.17
896	0.17
897	0.18
898	0.18
899	0.23
900	0.25
901	0.22
902	0.23
903	0.25
904	0.26
905	0.26
906	0.28
907	0.26
908	0.25
909	0.26
910	0.22
911	0.18
912	0.15
913	0.16
914	0.16
915	0.14
916	0.12
917	0.14
918	0.18
919	0.18
920	0.2
921	0.21
922	0.21
923	0.28
924	0.32
925	0.33
926	0.31
927	0.3
928	0.29
929	0.27
930	0.26
931	0.23
932	0.19
933	0.16
934	0.14
935	0.15
936	0.15
937	0.16
938	0.18
939	0.16
940	0.17
941	0.16
942	0.15
943	0.15
944	0.16
945	0.15
946	0.13
947	0.13
948	0.2
949	0.23
950	0.24
951	0.23
952	0.24
953	0.31
954	0.35
955	0.34
956	0.27
957	0.26
958	0.27
959	0.28
960	0.3
961	0.24
962	0.2
963	0.18
964	0.17
965	0.16
966	0.15
967	0.13
968	0.09
969	0.07
970	0.07
971	0.08
972	0.08
973	0.07
974	0.08
975	0.11
976	0.12
977	0.12
978	0.12
979	0.13
980	0.14
981	0.15
982	0.17
983	0.17
984	0.19
985	0.22
986	0.25
987	0.34
988	0.4
989	0.42
990	0.44
991	0.46
992	0.47
993	0.47
994	0.48
995	0.43
996	0.42
997	0.43
998	0.46
999	0.45
1000	0.41
1001	0.41
1002	0.42
1003	0.38
1004	0.34
1005	0.31
1006	0.3
1007	0.33
1008	0.36
1009	0.39
1010	0.4
1011	0.46
1012	0.47
1013	0.51
1014	0.47
1015	0.44
1016	0.43
1017	0.37
1018	0.33
1019	0.31
1020	0.28
1021	0.23
1022	0.21
1023	0.16
1024	0.15
1025	0.17
1026	0.15
1027	0.14
1028	0.19
1029	0.2
1030	0.21
1031	0.23
1032	0.22
1033	0.19
1034	0.18
1035	0.19
1036	0.15
1037	0.18
1038	0.2
1039	0.2
1040	0.2
1041	0.22
1042	0.22
1043	0.22
1044	0.23
1045	0.21
1046	0.26
1047	0.33
1048	0.35
1049	0.35
1050	0.37
1051	0.34
1052	0.34
1053	0.36
1054	0.31
1055	0.27
1056	0.26
1057	0.26
1058	0.26
1059	0.27
1060	0.25
1061	0.21
1062	0.2
1063	0.19
1064	0.22
1065	0.22
1066	0.2
1067	0.18
1068	0.21
1069	0.22
1070	0.24
1071	0.22
1072	0.25
1073	0.33
1074	0.44
1075	0.52
1076	0.5
1077	0.56
1078	0.55
1079	0.58
1080	0.54
1081	0.47
1082	0.37
1083	0.29
1084	0.28
1085	0.27
1086	0.32
1087	0.32
1088	0.33
1089	0.41
1090	0.45
1091	0.47
1092	0.5
1093	0.47
1094	0.43
1095	0.39
1096	0.38
1097	0.37
1098	0.34
1099	0.31
1100	0.3
1101	0.27
1102	0.26
1103	0.26
1104	0.24
1105	0.19
1106	0.18
1107	0.21
1108	0.26
1109	0.33
1110	0.41
1111	0.43
1112	0.43
1113	0.44
1114	0.43
1115	0.4
1116	0.34
1117	0.28
1118	0.19
1119	0.15
1120	0.14
1121	0.11
1122	0.11
1123	0.12
1124	0.11
1125	0.1
1126	0.1
1127	0.1
1128	0.11
1129	0.13
1130	0.17
1131	0.19
1132	0.2
1133	0.2
1134	0.21
1135	0.22
1136	0.22
1137	0.22
1138	0.18
1139	0.15
1140	0.14
1141	0.15
1142	0.14
1143	0.22
1144	0.23
1145	0.27
1146	0.27
1147	0.28
1148	0.29
1149	0.28
1150	0.3
1151	0.22
1152	0.21
1153	0.19
1154	0.22
1155	0.21
1156	0.21
1157	0.21
1158	0.21
1159	0.23
1160	0.23
1161	0.23
1162	0.22
1163	0.25
1164	0.25
1165	0.29
1166	0.29
1167	0.27
1168	0.31
1169	0.29
1170	0.26
1171	0.34
1172	0.36
1173	0.34
1174	0.36
1175	0.39
1176	0.38
1177	0.45
1178	0.5
1179	0.44
1180	0.45
1181	0.45
1182	0.46
1183	0.48
1184	0.44
1185	0.39
1186	0.36
1187	0.32
1188	0.31
1189	0.33
1190	0.38
1191	0.38
1192	0.41
1193	0.44
1194	0.49
1195	0.53
1196	0.57
1197	0.61
1198	0.58
1199	0.56
1200	0.58
1201	0.57
1202	0.51
1203	0.52
1204	0.52
1205	0.55
1206	0.56
1207	0.6
1208	0.61
1209	0.63
1210	0.65
1211	0.6
1212	0.55
1213	0.5
1214	0.45
1215	0.4
1216	0.34
1217	0.28
1218	0.25
1219	0.24
1220	0.2
1221	0.15
1222	0.13
1223	0.12
1224	0.11
1225	0.11
1226	0.1
1227	0.12
1228	0.13
1229	0.15
1230	0.14
1231	0.13
1232	0.13
1233	0.13
1234	0.13
1235	0.12

A0A178F373

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer