Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178F185

Protein Details
Accession A0A178F185    Localization Confidence High Confidence Score 20.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
237-259AENLPVPKTKRRKLGDRRDKIVEBasic
278-302GFTAQKTRSRDPRKQPLKNQNSEETHydrophilic
452-475SEGKGWCKPARKPKRPAKSKISTIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
244-251KTKRRKLG
459-471KPARKPKRPAKSK
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 10, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013926  CGI121/TPRKB  
IPR036504  CGI121/TPRKB_sf  
IPR027784  Slx4_ascomycetes  
IPR018574  Structure-sp_endonuc_su_Slx4  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006996  P:organelle organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF08617  CGI-121  
PF09494  Slx4  
CDD cd22999  SAP_SLX4  
Amino Acid Sequences MSLLKSLQIAHLPPSLVVHVALYRDVKNSSFLREQLISANSAYEYAFIDASMIADAFRRFGIADSTTDLLVVKVSTSPEITHETVSKHLGEAVEGTQVTFDDTTLSQITDMSKIQKVYKLSNLAIHKPSKKPMDPAQGHGVEGVEEASRRRMETSMIVRSFDTINVALAPQVRPASVTAILPTSPDETQIEFPSKQTSSRTCGLKSDPESHGGVNTQLQSNRSARHTRTILGGKANAENLPVPKTKRRKLGDRRDKIVENMEDSADCSRPHSQLVQNGFTAQKTRSRDPRKQPLKNQNSEETTHSRLKGKVIKPSTNSKISTSKKCSMHPADLQQRVAGSSGSEFCGLRLEEATMRRDFWTPIKDTTLAHIDLTGSPVFTRTGETQDKGKDFRSLMSGFNFSREASREVGSDGQYPAEGPTTKQLLELIPQSLPSGKHSGDEAHDAATSSASEGKGWCKPARKPKRPAKSKISTITSLTIGRYESPFTSEGGDYILSADKDVASIQPAGKPSSKRKGTNARSGTKISRDEYQAQARPPIMEALQTIENLALVFGTSSQLERDSSPSVYGLESGLEHGQGQCESARIRSREPSPGLMVSRFSKSKNLWAASSRDLDGCLLNVERVDLVGPAALAHKPRGEQQTTSANRFPEGEIHAGIPPPIEHESFEKIESSLNAIVNIDTPNTIQHPHEISTTHSNGNGVESMPDFNRLSTEDLAVKLASFGFRPIKRREKMIELLEKCWESKRKTSGRPEIEPACPDEPQGTAQGEPLNITATPIEASSIPSINPLIRTIKPKDATPDGIADSSRTNEATSHNLKLSPKAEGNTPRFKGSERDTQPATIEIDDATNEDLPESSKQLSNPENSHIPSRVPSCDRLNGLVPRPGKFSIRTKGVSTKANEPADLPNIFIQITNAVKAQPRIRSIKGVKQPTWHEKIVMYDPIWLDDFTLWLNVEGFKRIHEDREVHASLILFQSFVSWDIPENGISIYMVFSWYGESSLALWTLMPGEKGKEQQVLEAKVVPHPLGTSL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.22
3 0.19
4 0.17
5 0.15
6 0.13
7 0.14
8 0.17
9 0.18
10 0.19
11 0.21
12 0.23
13 0.22
14 0.27
15 0.28
16 0.31
17 0.33
18 0.33
19 0.36
20 0.35
21 0.36
22 0.35
23 0.35
24 0.29
25 0.24
26 0.25
27 0.18
28 0.18
29 0.16
30 0.12
31 0.11
32 0.11
33 0.1
34 0.09
35 0.09
36 0.09
37 0.09
38 0.09
39 0.07
40 0.06
41 0.09
42 0.09
43 0.1
44 0.09
45 0.1
46 0.09
47 0.11
48 0.15
49 0.14
50 0.16
51 0.18
52 0.19
53 0.19
54 0.18
55 0.17
56 0.13
57 0.12
58 0.1
59 0.07
60 0.08
61 0.1
62 0.11
63 0.13
64 0.13
65 0.16
66 0.22
67 0.22
68 0.23
69 0.25
70 0.25
71 0.27
72 0.29
73 0.26
74 0.21
75 0.22
76 0.19
77 0.17
78 0.17
79 0.15
80 0.16
81 0.15
82 0.14
83 0.12
84 0.12
85 0.13
86 0.11
87 0.1
88 0.09
89 0.09
90 0.13
91 0.13
92 0.13
93 0.11
94 0.13
95 0.14
96 0.15
97 0.17
98 0.18
99 0.21
100 0.23
101 0.26
102 0.3
103 0.32
104 0.35
105 0.4
106 0.42
107 0.4
108 0.45
109 0.47
110 0.49
111 0.52
112 0.54
113 0.54
114 0.52
115 0.59
116 0.61
117 0.59
118 0.6
119 0.63
120 0.66
121 0.63
122 0.63
123 0.64
124 0.56
125 0.52
126 0.45
127 0.36
128 0.25
129 0.21
130 0.17
131 0.08
132 0.08
133 0.09
134 0.14
135 0.14
136 0.15
137 0.17
138 0.17
139 0.19
140 0.26
141 0.32
142 0.37
143 0.37
144 0.37
145 0.36
146 0.37
147 0.35
148 0.27
149 0.23
150 0.13
151 0.13
152 0.12
153 0.12
154 0.12
155 0.13
156 0.13
157 0.13
158 0.14
159 0.13
160 0.14
161 0.15
162 0.17
163 0.16
164 0.16
165 0.14
166 0.14
167 0.14
168 0.14
169 0.15
170 0.14
171 0.12
172 0.14
173 0.14
174 0.15
175 0.19
176 0.21
177 0.25
178 0.22
179 0.23
180 0.27
181 0.26
182 0.26
183 0.29
184 0.3
185 0.31
186 0.37
187 0.41
188 0.37
189 0.4
190 0.42
191 0.44
192 0.45
193 0.46
194 0.41
195 0.4
196 0.4
197 0.35
198 0.33
199 0.25
200 0.22
201 0.18
202 0.18
203 0.19
204 0.19
205 0.2
206 0.24
207 0.26
208 0.29
209 0.31
210 0.37
211 0.35
212 0.42
213 0.43
214 0.39
215 0.44
216 0.46
217 0.43
218 0.4
219 0.4
220 0.33
221 0.33
222 0.33
223 0.25
224 0.21
225 0.2
226 0.18
227 0.2
228 0.22
229 0.24
230 0.32
231 0.42
232 0.47
233 0.55
234 0.6
235 0.67
236 0.74
237 0.81
238 0.83
239 0.83
240 0.82
241 0.78
242 0.73
243 0.65
244 0.62
245 0.52
246 0.44
247 0.36
248 0.31
249 0.24
250 0.23
251 0.23
252 0.16
253 0.14
254 0.14
255 0.16
256 0.17
257 0.19
258 0.23
259 0.25
260 0.3
261 0.35
262 0.35
263 0.32
264 0.33
265 0.31
266 0.27
267 0.26
268 0.2
269 0.21
270 0.25
271 0.31
272 0.4
273 0.49
274 0.58
275 0.65
276 0.75
277 0.79
278 0.83
279 0.87
280 0.87
281 0.89
282 0.87
283 0.82
284 0.78
285 0.71
286 0.64
287 0.58
288 0.52
289 0.47
290 0.43
291 0.4
292 0.36
293 0.34
294 0.39
295 0.43
296 0.42
297 0.46
298 0.48
299 0.52
300 0.52
301 0.6
302 0.6
303 0.57
304 0.54
305 0.49
306 0.52
307 0.52
308 0.58
309 0.56
310 0.58
311 0.55
312 0.56
313 0.61
314 0.57
315 0.57
316 0.53
317 0.54
318 0.55
319 0.56
320 0.54
321 0.45
322 0.4
323 0.33
324 0.29
325 0.19
326 0.11
327 0.08
328 0.09
329 0.09
330 0.1
331 0.1
332 0.09
333 0.13
334 0.12
335 0.11
336 0.11
337 0.11
338 0.13
339 0.16
340 0.2
341 0.17
342 0.18
343 0.19
344 0.2
345 0.2
346 0.22
347 0.25
348 0.24
349 0.26
350 0.28
351 0.27
352 0.26
353 0.27
354 0.27
355 0.21
356 0.18
357 0.16
358 0.14
359 0.13
360 0.15
361 0.12
362 0.08
363 0.07
364 0.08
365 0.09
366 0.08
367 0.11
368 0.09
369 0.16
370 0.19
371 0.2
372 0.24
373 0.27
374 0.3
375 0.29
376 0.29
377 0.27
378 0.24
379 0.24
380 0.25
381 0.22
382 0.22
383 0.22
384 0.24
385 0.2
386 0.21
387 0.21
388 0.16
389 0.17
390 0.17
391 0.17
392 0.15
393 0.16
394 0.14
395 0.15
396 0.17
397 0.16
398 0.16
399 0.14
400 0.12
401 0.11
402 0.11
403 0.1
404 0.11
405 0.1
406 0.08
407 0.12
408 0.13
409 0.14
410 0.14
411 0.14
412 0.12
413 0.14
414 0.15
415 0.12
416 0.11
417 0.11
418 0.11
419 0.12
420 0.12
421 0.13
422 0.15
423 0.13
424 0.14
425 0.14
426 0.16
427 0.15
428 0.17
429 0.15
430 0.12
431 0.12
432 0.12
433 0.11
434 0.1
435 0.08
436 0.06
437 0.07
438 0.07
439 0.07
440 0.07
441 0.1
442 0.13
443 0.17
444 0.2
445 0.24
446 0.3
447 0.41
448 0.52
449 0.59
450 0.67
451 0.73
452 0.8
453 0.84
454 0.86
455 0.85
456 0.82
457 0.79
458 0.76
459 0.7
460 0.61
461 0.53
462 0.46
463 0.38
464 0.3
465 0.23
466 0.17
467 0.13
468 0.12
469 0.11
470 0.1
471 0.09
472 0.11
473 0.11
474 0.11
475 0.12
476 0.11
477 0.1
478 0.1
479 0.1
480 0.07
481 0.07
482 0.08
483 0.06
484 0.06
485 0.06
486 0.05
487 0.05
488 0.06
489 0.05
490 0.05
491 0.06
492 0.07
493 0.09
494 0.1
495 0.12
496 0.15
497 0.19
498 0.25
499 0.33
500 0.39
501 0.39
502 0.46
503 0.55
504 0.57
505 0.63
506 0.64
507 0.58
508 0.55
509 0.55
510 0.5
511 0.44
512 0.41
513 0.32
514 0.29
515 0.29
516 0.28
517 0.29
518 0.34
519 0.32
520 0.3
521 0.3
522 0.27
523 0.24
524 0.22
525 0.18
526 0.12
527 0.1
528 0.09
529 0.09
530 0.1
531 0.09
532 0.09
533 0.08
534 0.07
535 0.07
536 0.06
537 0.03
538 0.02
539 0.03
540 0.03
541 0.03
542 0.03
543 0.04
544 0.04
545 0.05
546 0.06
547 0.07
548 0.1
549 0.11
550 0.11
551 0.11
552 0.11
553 0.11
554 0.1
555 0.1
556 0.08
557 0.06
558 0.06
559 0.06
560 0.06
561 0.06
562 0.06
563 0.06
564 0.06
565 0.06
566 0.07
567 0.06
568 0.07
569 0.07
570 0.11
571 0.16
572 0.17
573 0.2
574 0.24
575 0.27
576 0.32
577 0.34
578 0.33
579 0.29
580 0.3
581 0.29
582 0.25
583 0.24
584 0.19
585 0.21
586 0.2
587 0.19
588 0.22
589 0.22
590 0.28
591 0.33
592 0.32
593 0.31
594 0.32
595 0.35
596 0.33
597 0.33
598 0.27
599 0.2
600 0.19
601 0.18
602 0.15
603 0.11
604 0.09
605 0.07
606 0.07
607 0.06
608 0.06
609 0.05
610 0.05
611 0.05
612 0.04
613 0.04
614 0.04
615 0.04
616 0.04
617 0.05
618 0.06
619 0.07
620 0.08
621 0.09
622 0.1
623 0.16
624 0.22
625 0.23
626 0.23
627 0.26
628 0.35
629 0.37
630 0.41
631 0.38
632 0.32
633 0.31
634 0.31
635 0.27
636 0.21
637 0.2
638 0.17
639 0.15
640 0.16
641 0.16
642 0.15
643 0.14
644 0.11
645 0.08
646 0.09
647 0.11
648 0.1
649 0.1
650 0.13
651 0.17
652 0.18
653 0.18
654 0.16
655 0.15
656 0.15
657 0.14
658 0.15
659 0.14
660 0.13
661 0.13
662 0.12
663 0.12
664 0.13
665 0.13
666 0.1
667 0.07
668 0.07
669 0.08
670 0.09
671 0.11
672 0.1
673 0.13
674 0.15
675 0.16
676 0.17
677 0.17
678 0.19
679 0.24
680 0.26
681 0.24
682 0.22
683 0.21
684 0.2
685 0.2
686 0.17
687 0.11
688 0.09
689 0.09
690 0.1
691 0.1
692 0.14
693 0.12
694 0.12
695 0.13
696 0.13
697 0.16
698 0.15
699 0.17
700 0.14
701 0.15
702 0.16
703 0.14
704 0.13
705 0.1
706 0.09
707 0.08
708 0.07
709 0.1
710 0.17
711 0.21
712 0.27
713 0.35
714 0.45
715 0.46
716 0.52
717 0.53
718 0.53
719 0.56
720 0.58
721 0.6
722 0.52
723 0.52
724 0.49
725 0.46
726 0.39
727 0.39
728 0.38
729 0.32
730 0.38
731 0.45
732 0.5
733 0.59
734 0.68
735 0.72
736 0.72
737 0.72
738 0.71
739 0.66
740 0.6
741 0.52
742 0.47
743 0.39
744 0.31
745 0.27
746 0.22
747 0.18
748 0.16
749 0.18
750 0.14
751 0.12
752 0.14
753 0.15
754 0.14
755 0.14
756 0.13
757 0.11
758 0.1
759 0.1
760 0.08
761 0.07
762 0.08
763 0.07
764 0.08
765 0.06
766 0.09
767 0.1
768 0.11
769 0.1
770 0.11
771 0.12
772 0.12
773 0.13
774 0.14
775 0.17
776 0.2
777 0.26
778 0.3
779 0.38
780 0.38
781 0.4
782 0.43
783 0.44
784 0.44
785 0.4
786 0.38
787 0.31
788 0.3
789 0.28
790 0.23
791 0.19
792 0.16
793 0.16
794 0.13
795 0.12
796 0.12
797 0.15
798 0.21
799 0.24
800 0.26
801 0.26
802 0.29
803 0.3
804 0.34
805 0.34
806 0.31
807 0.31
808 0.29
809 0.34
810 0.4
811 0.46
812 0.49
813 0.5
814 0.47
815 0.45
816 0.45
817 0.45
818 0.41
819 0.45
820 0.4
821 0.44
822 0.43
823 0.43
824 0.43
825 0.39
826 0.35
827 0.24
828 0.2
829 0.14
830 0.13
831 0.12
832 0.11
833 0.1
834 0.09
835 0.09
836 0.09
837 0.09
838 0.1
839 0.12
840 0.14
841 0.14
842 0.16
843 0.17
844 0.23
845 0.28
846 0.32
847 0.32
848 0.35
849 0.38
850 0.38
851 0.41
852 0.36
853 0.33
854 0.32
855 0.33
856 0.35
857 0.33
858 0.37
859 0.38
860 0.42
861 0.43
862 0.41
863 0.44
864 0.43
865 0.44
866 0.45
867 0.42
868 0.38
869 0.4
870 0.39
871 0.36
872 0.36
873 0.4
874 0.42
875 0.47
876 0.48
877 0.48
878 0.54
879 0.55
880 0.57
881 0.52
882 0.52
883 0.54
884 0.52
885 0.48
886 0.42
887 0.41
888 0.4
889 0.36
890 0.29
891 0.22
892 0.21
893 0.21
894 0.19
895 0.15
896 0.15
897 0.16
898 0.15
899 0.15
900 0.16
901 0.19
902 0.25
903 0.3
904 0.31
905 0.37
906 0.42
907 0.44
908 0.53
909 0.55
910 0.6
911 0.64
912 0.66
913 0.63
914 0.65
915 0.71
916 0.7
917 0.71
918 0.63
919 0.55
920 0.48
921 0.49
922 0.47
923 0.43
924 0.33
925 0.31
926 0.3
927 0.3
928 0.3
929 0.24
930 0.21
931 0.15
932 0.16
933 0.11
934 0.13
935 0.11
936 0.1
937 0.11
938 0.13
939 0.14
940 0.18
941 0.17
942 0.17
943 0.23
944 0.24
945 0.28
946 0.31
947 0.33
948 0.33
949 0.42
950 0.42
951 0.37
952 0.36
953 0.32
954 0.28
955 0.28
956 0.23
957 0.14
958 0.12
959 0.13
960 0.12
961 0.13
962 0.12
963 0.09
964 0.11
965 0.14
966 0.15
967 0.15
968 0.15
969 0.13
970 0.13
971 0.12
972 0.11
973 0.09
974 0.08
975 0.08
976 0.07
977 0.07
978 0.09
979 0.09
980 0.1
981 0.09
982 0.09
983 0.1
984 0.11
985 0.12
986 0.09
987 0.09
988 0.08
989 0.11
990 0.12
991 0.13
992 0.13
993 0.17
994 0.21
995 0.25
996 0.29
997 0.33
998 0.32
999 0.38
1000 0.44
1001 0.44
1002 0.42
1003 0.42
1004 0.39
1005 0.37
1006 0.39
1007 0.32
1008 0.24