Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178FAP1

Protein Details
Accession A0A178FAP1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
620-652EESEDIKKDTPNRKKRKREKRTTNSPAITRRQQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
629-640TPNRKKRKREKR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR026832  Asteroid  
IPR039436  Asteroid_dom  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF12813  XPG_I_2  
Amino Acid Sequences MGIPRLKGHLLRYEEAVWLGTTAQQGQENTRNITSVVIDGPALVYHVYYGLMAAMEQHLNPFSAQPSSDEVSVGVMKMLLHLRAIGVTMYVPMYRSTVAFANYLNDREKIYFDGALPTSKRKVRLERMAKLASKLQQACQAKKHGFKSGTVAGGRPSPDTKLFFSRRLVNPKFYSLPDNPFMVATVAEDLKYRWSWQAIECFHDLNSTEEGHGSSFPWADITEVVMGEADIFCAEAARERGSAVLTGDSDLVIHDLGSDGSVVFLESIEMYETPDTNERELRLPPFGVRAKEIRPSRIANQLGIKNLLRVGYELKQDPYVKWSSISKLCQAAEKRSRVSSSYGEFLAEYNARPFSMKGNDKSNEFPLLDSKVSELVAQYHHPSFDADGDQLYSYLPVMTENHARRCAWVDCSDIRAIGYSIFNLSFPRNKRRDTILEYARRGQRIVPNPLTLLNEDALALAAKELLEQIESIRLSSGNESIYFWIPYALLRIYSDAEHSNLPKPDAIIKFLKFGYMGGSLTWDDLHLRAQVLCTLYSLRMLKQFLQVSLITGDAEVQRIGKPLLDVLAELPPLRILSEAGIWLNSCTEKDMKSISDTISTLFECLGGTQIPVSDADLEQEESEDIKKDTPNRKKRKREKRTTNSPAITRRQQAASSNMYDILQSTYDP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.34
3 0.3
4 0.22
5 0.16
6 0.15
7 0.13
8 0.13
9 0.13
10 0.15
11 0.18
12 0.19
13 0.25
14 0.32
15 0.34
16 0.37
17 0.36
18 0.34
19 0.31
20 0.31
21 0.25
22 0.19
23 0.16
24 0.13
25 0.12
26 0.11
27 0.11
28 0.1
29 0.09
30 0.07
31 0.06
32 0.05
33 0.06
34 0.06
35 0.06
36 0.06
37 0.05
38 0.05
39 0.05
40 0.06
41 0.08
42 0.09
43 0.09
44 0.11
45 0.11
46 0.12
47 0.12
48 0.13
49 0.13
50 0.14
51 0.14
52 0.15
53 0.19
54 0.21
55 0.21
56 0.19
57 0.18
58 0.18
59 0.18
60 0.16
61 0.11
62 0.09
63 0.09
64 0.12
65 0.14
66 0.11
67 0.11
68 0.11
69 0.11
70 0.11
71 0.12
72 0.09
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.08
77 0.08
78 0.09
79 0.09
80 0.1
81 0.11
82 0.11
83 0.12
84 0.14
85 0.15
86 0.15
87 0.15
88 0.18
89 0.19
90 0.22
91 0.22
92 0.21
93 0.21
94 0.21
95 0.22
96 0.21
97 0.21
98 0.2
99 0.18
100 0.23
101 0.22
102 0.26
103 0.26
104 0.28
105 0.32
106 0.35
107 0.41
108 0.42
109 0.51
110 0.56
111 0.65
112 0.7
113 0.7
114 0.75
115 0.75
116 0.69
117 0.62
118 0.58
119 0.52
120 0.51
121 0.46
122 0.4
123 0.42
124 0.46
125 0.48
126 0.48
127 0.52
128 0.49
129 0.55
130 0.56
131 0.56
132 0.51
133 0.48
134 0.49
135 0.45
136 0.45
137 0.38
138 0.35
139 0.27
140 0.29
141 0.28
142 0.24
143 0.21
144 0.19
145 0.22
146 0.25
147 0.26
148 0.33
149 0.36
150 0.38
151 0.4
152 0.46
153 0.49
154 0.57
155 0.57
156 0.55
157 0.54
158 0.55
159 0.54
160 0.47
161 0.46
162 0.4
163 0.41
164 0.36
165 0.34
166 0.29
167 0.26
168 0.25
169 0.19
170 0.15
171 0.09
172 0.09
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.11
178 0.12
179 0.13
180 0.13
181 0.15
182 0.17
183 0.2
184 0.28
185 0.26
186 0.29
187 0.29
188 0.27
189 0.25
190 0.24
191 0.22
192 0.16
193 0.16
194 0.13
195 0.12
196 0.12
197 0.12
198 0.12
199 0.11
200 0.09
201 0.09
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.08
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.06
213 0.06
214 0.05
215 0.05
216 0.04
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.06
223 0.07
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.1
228 0.1
229 0.11
230 0.09
231 0.08
232 0.07
233 0.08
234 0.08
235 0.07
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.04
240 0.04
241 0.03
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.03
254 0.03
255 0.04
256 0.04
257 0.05
258 0.05
259 0.06
260 0.07
261 0.12
262 0.12
263 0.13
264 0.15
265 0.15
266 0.17
267 0.19
268 0.19
269 0.17
270 0.16
271 0.15
272 0.2
273 0.22
274 0.21
275 0.22
276 0.23
277 0.23
278 0.3
279 0.32
280 0.29
281 0.3
282 0.32
283 0.32
284 0.38
285 0.36
286 0.31
287 0.34
288 0.33
289 0.3
290 0.3
291 0.27
292 0.19
293 0.19
294 0.17
295 0.12
296 0.1
297 0.12
298 0.13
299 0.15
300 0.16
301 0.16
302 0.19
303 0.2
304 0.19
305 0.21
306 0.2
307 0.17
308 0.17
309 0.18
310 0.19
311 0.23
312 0.24
313 0.22
314 0.24
315 0.24
316 0.28
317 0.28
318 0.33
319 0.35
320 0.37
321 0.36
322 0.34
323 0.35
324 0.31
325 0.32
326 0.27
327 0.21
328 0.2
329 0.18
330 0.17
331 0.16
332 0.14
333 0.13
334 0.1
335 0.09
336 0.08
337 0.08
338 0.08
339 0.09
340 0.09
341 0.11
342 0.18
343 0.23
344 0.24
345 0.31
346 0.33
347 0.34
348 0.36
349 0.34
350 0.3
351 0.25
352 0.23
353 0.18
354 0.19
355 0.17
356 0.15
357 0.13
358 0.11
359 0.11
360 0.11
361 0.09
362 0.08
363 0.09
364 0.1
365 0.12
366 0.11
367 0.11
368 0.11
369 0.11
370 0.1
371 0.11
372 0.11
373 0.08
374 0.08
375 0.09
376 0.08
377 0.08
378 0.07
379 0.06
380 0.05
381 0.04
382 0.04
383 0.05
384 0.06
385 0.08
386 0.16
387 0.19
388 0.23
389 0.26
390 0.26
391 0.26
392 0.29
393 0.29
394 0.25
395 0.24
396 0.24
397 0.23
398 0.26
399 0.25
400 0.2
401 0.18
402 0.15
403 0.13
404 0.1
405 0.09
406 0.07
407 0.08
408 0.08
409 0.08
410 0.09
411 0.11
412 0.16
413 0.2
414 0.3
415 0.34
416 0.36
417 0.39
418 0.45
419 0.5
420 0.51
421 0.55
422 0.54
423 0.57
424 0.58
425 0.61
426 0.58
427 0.52
428 0.45
429 0.4
430 0.39
431 0.39
432 0.45
433 0.41
434 0.39
435 0.38
436 0.4
437 0.38
438 0.3
439 0.24
440 0.15
441 0.12
442 0.11
443 0.1
444 0.08
445 0.06
446 0.06
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.04
451 0.04
452 0.04
453 0.04
454 0.04
455 0.05
456 0.09
457 0.09
458 0.09
459 0.1
460 0.1
461 0.1
462 0.12
463 0.13
464 0.1
465 0.11
466 0.11
467 0.13
468 0.15
469 0.14
470 0.13
471 0.12
472 0.1
473 0.1
474 0.12
475 0.1
476 0.09
477 0.09
478 0.11
479 0.11
480 0.12
481 0.14
482 0.12
483 0.13
484 0.15
485 0.17
486 0.21
487 0.21
488 0.22
489 0.21
490 0.21
491 0.27
492 0.26
493 0.28
494 0.28
495 0.28
496 0.3
497 0.29
498 0.29
499 0.22
500 0.2
501 0.19
502 0.15
503 0.14
504 0.11
505 0.13
506 0.12
507 0.12
508 0.12
509 0.09
510 0.08
511 0.09
512 0.11
513 0.1
514 0.1
515 0.1
516 0.11
517 0.14
518 0.14
519 0.14
520 0.13
521 0.13
522 0.13
523 0.18
524 0.18
525 0.18
526 0.21
527 0.23
528 0.25
529 0.3
530 0.32
531 0.28
532 0.3
533 0.28
534 0.24
535 0.23
536 0.21
537 0.13
538 0.11
539 0.12
540 0.09
541 0.1
542 0.09
543 0.09
544 0.1
545 0.12
546 0.12
547 0.12
548 0.11
549 0.11
550 0.13
551 0.12
552 0.11
553 0.11
554 0.14
555 0.13
556 0.13
557 0.12
558 0.11
559 0.11
560 0.11
561 0.1
562 0.07
563 0.08
564 0.1
565 0.11
566 0.11
567 0.11
568 0.11
569 0.11
570 0.12
571 0.12
572 0.11
573 0.13
574 0.15
575 0.15
576 0.18
577 0.21
578 0.21
579 0.24
580 0.27
581 0.25
582 0.26
583 0.25
584 0.24
585 0.23
586 0.22
587 0.18
588 0.15
589 0.14
590 0.1
591 0.1
592 0.1
593 0.08
594 0.08
595 0.08
596 0.08
597 0.09
598 0.09
599 0.1
600 0.1
601 0.1
602 0.11
603 0.13
604 0.13
605 0.13
606 0.13
607 0.12
608 0.12
609 0.13
610 0.14
611 0.13
612 0.16
613 0.2
614 0.29
615 0.39
616 0.49
617 0.59
618 0.68
619 0.78
620 0.86
621 0.92
622 0.94
623 0.95
624 0.96
625 0.96
626 0.96
627 0.96
628 0.95
629 0.95
630 0.91
631 0.88
632 0.85
633 0.83
634 0.8
635 0.74
636 0.69
637 0.63
638 0.59
639 0.56
640 0.53
641 0.51
642 0.46
643 0.42
644 0.38
645 0.34
646 0.3
647 0.26
648 0.22