Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178F6H2

Protein Details
Accession A0A178F6H2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
232-255GEAVTKKKRKSCFDKSMKRKVDYDHydrophilic
262-288LGEADSSKEKKKKKKRKVNVIDDIFAGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
269-278KEKKKKKKRK
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 12, cyto 10, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047205  RMP1  
IPR047204  RMP1_RBD  
Gene Ontology GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
CDD cd22573  RMP1_RBD  
Amino Acid Sequences MKGEKEEEELIRRESSFYRCQIHVAEGMSQGTVPGTNVGGCPFTGSVRQYFDMGETPPGDIRSIHRTLHLLYHHNKNQHRCTKWWKWLNMLRRWTLNLACEIEKIEKFEDVLGADGSDEHPFAPVWKIMRYLHDELIPRCYRAFSTVVADVQFCSLGIALLATLAEVFNVVQINKGELSNIASELGDEKGPETIPRSASNVTVDEDFGEVIRRSEVDSHVRTTVDTVVSTDGEAVTKKKRKSCFDKSMKRKVDYDTSMTASLGEADSSKEKKKKKKRKVNVIDDIFAGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.33
3 0.35
4 0.38
5 0.4
6 0.38
7 0.41
8 0.4
9 0.39
10 0.36
11 0.3
12 0.27
13 0.23
14 0.23
15 0.2
16 0.18
17 0.15
18 0.11
19 0.1
20 0.08
21 0.07
22 0.07
23 0.07
24 0.08
25 0.09
26 0.1
27 0.09
28 0.11
29 0.1
30 0.11
31 0.15
32 0.16
33 0.18
34 0.22
35 0.23
36 0.21
37 0.21
38 0.22
39 0.2
40 0.19
41 0.19
42 0.15
43 0.16
44 0.17
45 0.17
46 0.16
47 0.14
48 0.17
49 0.21
50 0.23
51 0.23
52 0.23
53 0.24
54 0.25
55 0.3
56 0.3
57 0.3
58 0.32
59 0.41
60 0.44
61 0.5
62 0.54
63 0.56
64 0.63
65 0.65
66 0.64
67 0.61
68 0.66
69 0.69
70 0.73
71 0.74
72 0.66
73 0.66
74 0.7
75 0.73
76 0.71
77 0.67
78 0.6
79 0.54
80 0.52
81 0.46
82 0.41
83 0.33
84 0.28
85 0.25
86 0.22
87 0.2
88 0.2
89 0.19
90 0.18
91 0.18
92 0.16
93 0.13
94 0.13
95 0.13
96 0.12
97 0.09
98 0.09
99 0.07
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.06
110 0.08
111 0.09
112 0.1
113 0.11
114 0.14
115 0.14
116 0.18
117 0.23
118 0.24
119 0.24
120 0.26
121 0.27
122 0.25
123 0.32
124 0.29
125 0.24
126 0.21
127 0.2
128 0.17
129 0.17
130 0.18
131 0.11
132 0.13
133 0.13
134 0.14
135 0.14
136 0.13
137 0.11
138 0.09
139 0.08
140 0.06
141 0.05
142 0.04
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.02
147 0.02
148 0.02
149 0.02
150 0.02
151 0.02
152 0.02
153 0.02
154 0.02
155 0.03
156 0.04
157 0.04
158 0.06
159 0.07
160 0.08
161 0.09
162 0.09
163 0.08
164 0.08
165 0.1
166 0.08
167 0.09
168 0.08
169 0.07
170 0.07
171 0.08
172 0.09
173 0.07
174 0.06
175 0.06
176 0.07
177 0.07
178 0.08
179 0.1
180 0.13
181 0.15
182 0.16
183 0.19
184 0.19
185 0.2
186 0.22
187 0.2
188 0.18
189 0.16
190 0.15
191 0.12
192 0.12
193 0.1
194 0.08
195 0.1
196 0.08
197 0.08
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.12
202 0.16
203 0.2
204 0.23
205 0.25
206 0.26
207 0.26
208 0.25
209 0.24
210 0.23
211 0.17
212 0.15
213 0.13
214 0.13
215 0.13
216 0.13
217 0.12
218 0.09
219 0.09
220 0.1
221 0.12
222 0.2
223 0.27
224 0.32
225 0.39
226 0.48
227 0.57
228 0.66
229 0.74
230 0.75
231 0.79
232 0.85
233 0.88
234 0.91
235 0.89
236 0.83
237 0.76
238 0.71
239 0.69
240 0.63
241 0.58
242 0.52
243 0.47
244 0.43
245 0.39
246 0.33
247 0.24
248 0.2
249 0.15
250 0.11
251 0.08
252 0.1
253 0.16
254 0.2
255 0.28
256 0.35
257 0.43
258 0.54
259 0.65
260 0.74
261 0.79
262 0.87
263 0.9
264 0.94
265 0.96
266 0.96
267 0.96
268 0.91
269 0.82