Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178F001

Protein Details
Accession A0A178F001    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-33PTTGWRPASSRLRLHRRQLHLAPHydrophilic
303-323PDAHVGKKKRAKINNSGKEAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
310-312KKR
Subcellular Location(s) mito 22.5, cyto_mito 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013785  Aldolase_TIM  
IPR040085  MJ0674-like  
IPR016431  Pyrv-formate_lyase-activ_prd  
IPR007197  rSAM  
Gene Ontology GO:0051536  F:iron-sulfur cluster binding  
GO:0016829  F:lyase activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04055  Radical_SAM  
CDD cd01335  Radical_SAM  
Amino Acid Sequences MPVGRPLSIIPTTGWRPASSRLRLHRRQLHLAPPFLLDTYIPRYHLLSSVDAAKKRSHAYAHLRNCNLCPRLCGVNRYEKTGHCLIGAETVKVNVIAPHFGEEPCIQGWNGSGSVFFSGCNLRCVFCQNHDIAHQRNGFDLTPEELAGWYMKLQTVGKVHNINLVTPEHVVPQVVLSILNARDMGLNIPIIYNTSSFDSLDSLKLLDGLVDIYLPDFKVWKDSTSKRLLKADNYTATAMESIKAMHAQVGDLSFTADGVAKQGVLLRHLVMPGMEDEGIEIVKWLANNVSKNMYVHIMEQYHPDAHVGKKKRAKINNSGKEAQTVRYSDINRHVTDKELGAVQLAAREAGFWRFCEPAEHGGFHL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.27
3 0.29
4 0.37
5 0.45
6 0.46
7 0.52
8 0.57
9 0.66
10 0.73
11 0.8
12 0.81
13 0.79
14 0.81
15 0.78
16 0.78
17 0.74
18 0.69
19 0.6
20 0.52
21 0.45
22 0.36
23 0.3
24 0.21
25 0.18
26 0.22
27 0.23
28 0.22
29 0.22
30 0.23
31 0.24
32 0.28
33 0.26
34 0.21
35 0.2
36 0.28
37 0.32
38 0.33
39 0.34
40 0.33
41 0.34
42 0.35
43 0.37
44 0.31
45 0.35
46 0.43
47 0.51
48 0.58
49 0.63
50 0.63
51 0.61
52 0.61
53 0.61
54 0.54
55 0.45
56 0.38
57 0.33
58 0.39
59 0.4
60 0.42
61 0.38
62 0.45
63 0.45
64 0.49
65 0.48
66 0.41
67 0.44
68 0.42
69 0.38
70 0.27
71 0.27
72 0.21
73 0.26
74 0.25
75 0.2
76 0.17
77 0.16
78 0.16
79 0.15
80 0.15
81 0.09
82 0.09
83 0.09
84 0.1
85 0.12
86 0.13
87 0.13
88 0.16
89 0.14
90 0.15
91 0.14
92 0.15
93 0.12
94 0.11
95 0.12
96 0.11
97 0.11
98 0.09
99 0.08
100 0.08
101 0.09
102 0.09
103 0.08
104 0.07
105 0.11
106 0.12
107 0.15
108 0.15
109 0.15
110 0.15
111 0.2
112 0.21
113 0.2
114 0.24
115 0.22
116 0.23
117 0.26
118 0.3
119 0.28
120 0.33
121 0.32
122 0.27
123 0.28
124 0.28
125 0.24
126 0.2
127 0.19
128 0.13
129 0.12
130 0.12
131 0.11
132 0.08
133 0.09
134 0.08
135 0.07
136 0.05
137 0.05
138 0.06
139 0.07
140 0.08
141 0.1
142 0.13
143 0.14
144 0.18
145 0.2
146 0.2
147 0.22
148 0.22
149 0.19
150 0.18
151 0.17
152 0.14
153 0.13
154 0.13
155 0.1
156 0.1
157 0.09
158 0.07
159 0.07
160 0.06
161 0.05
162 0.05
163 0.04
164 0.06
165 0.06
166 0.07
167 0.06
168 0.06
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.07
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.06
193 0.05
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.05
204 0.05
205 0.1
206 0.11
207 0.14
208 0.2
209 0.25
210 0.31
211 0.41
212 0.44
213 0.43
214 0.49
215 0.49
216 0.47
217 0.49
218 0.48
219 0.41
220 0.4
221 0.36
222 0.3
223 0.28
224 0.23
225 0.17
226 0.11
227 0.09
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.07
239 0.08
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.05
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.09
250 0.09
251 0.1
252 0.11
253 0.11
254 0.12
255 0.12
256 0.12
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.1
261 0.08
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.06
267 0.06
268 0.04
269 0.05
270 0.06
271 0.06
272 0.09
273 0.13
274 0.16
275 0.18
276 0.21
277 0.22
278 0.22
279 0.23
280 0.22
281 0.19
282 0.19
283 0.21
284 0.2
285 0.19
286 0.22
287 0.23
288 0.21
289 0.2
290 0.2
291 0.18
292 0.22
293 0.31
294 0.34
295 0.4
296 0.47
297 0.56
298 0.64
299 0.7
300 0.72
301 0.75
302 0.8
303 0.8
304 0.81
305 0.77
306 0.68
307 0.66
308 0.6
309 0.52
310 0.46
311 0.39
312 0.34
313 0.36
314 0.37
315 0.36
316 0.44
317 0.46
318 0.42
319 0.44
320 0.41
321 0.38
322 0.4
323 0.35
324 0.27
325 0.23
326 0.21
327 0.18
328 0.18
329 0.14
330 0.14
331 0.13
332 0.11
333 0.09
334 0.1
335 0.11
336 0.16
337 0.17
338 0.16
339 0.19
340 0.2
341 0.21
342 0.24
343 0.27
344 0.29
345 0.32