Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178F1T8

Protein Details
Accession A0A178F1T8    Localization Confidence Low Confidence Score 9.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
203-222EPSQKKTQSQRSRKLKLQRKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto 9, mito 3, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008584  CXXC_Zn-binding_euk  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR047575  Sm  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
IPR034100  Sm_F  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF05907  CXXC_Zn-b_euk  
PF01423  LSM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52002  SM  
CDD cd01722  Sm_F  
Amino Acid Sequences MFTLTLSAQTSRVTDIRPQDTPEDPYYYTFKVQCTSCREVHLNWVNVSRFAVRFRRKMKNAFDFATYNLSTFLTAAPAFVKFHRYLIDFSTDRFYRSRMKFPEVEERQTSCGNAGSAGITAGPMAFDESKGLDGKGQKIIEFDCRGLEFTEFKADGKWEAKGTESGTKFSDISLEENEWYDFDEKQGEEVSITEVSWEIPAPEPSQKKTQSQRSRKLKLQRKSKQIQDDDDDDEQQQQEEEEDRALVNRIYAACCRELINEDIVVRLKWGQTEYKGRLISVDSYMNIQLSQTEEFIDGKNTGTLGEVLIRCNNVLWIGNAKGVEDKDVQMVEWRMEFLRIELECKESTAGFNNEQKVHPMKSYVTRYPPSAIGDMATA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.33
3 0.37
4 0.39
5 0.41
6 0.41
7 0.43
8 0.46
9 0.43
10 0.4
11 0.35
12 0.36
13 0.37
14 0.35
15 0.36
16 0.33
17 0.31
18 0.31
19 0.33
20 0.37
21 0.41
22 0.44
23 0.42
24 0.46
25 0.47
26 0.43
27 0.51
28 0.52
29 0.48
30 0.44
31 0.48
32 0.43
33 0.4
34 0.41
35 0.34
36 0.28
37 0.3
38 0.37
39 0.39
40 0.47
41 0.54
42 0.63
43 0.67
44 0.74
45 0.78
46 0.78
47 0.76
48 0.69
49 0.65
50 0.56
51 0.5
52 0.47
53 0.37
54 0.27
55 0.22
56 0.2
57 0.16
58 0.15
59 0.13
60 0.09
61 0.09
62 0.09
63 0.09
64 0.1
65 0.12
66 0.12
67 0.17
68 0.15
69 0.17
70 0.2
71 0.21
72 0.22
73 0.23
74 0.3
75 0.24
76 0.25
77 0.31
78 0.28
79 0.28
80 0.27
81 0.27
82 0.3
83 0.34
84 0.42
85 0.4
86 0.46
87 0.47
88 0.51
89 0.59
90 0.54
91 0.55
92 0.5
93 0.47
94 0.43
95 0.4
96 0.36
97 0.26
98 0.22
99 0.17
100 0.13
101 0.11
102 0.09
103 0.08
104 0.08
105 0.06
106 0.05
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.03
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.06
115 0.07
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.1
120 0.13
121 0.15
122 0.2
123 0.2
124 0.19
125 0.19
126 0.21
127 0.24
128 0.23
129 0.21
130 0.17
131 0.17
132 0.18
133 0.17
134 0.17
135 0.12
136 0.11
137 0.15
138 0.14
139 0.14
140 0.14
141 0.14
142 0.15
143 0.16
144 0.16
145 0.13
146 0.13
147 0.14
148 0.14
149 0.16
150 0.2
151 0.19
152 0.19
153 0.19
154 0.2
155 0.19
156 0.17
157 0.17
158 0.11
159 0.12
160 0.12
161 0.12
162 0.11
163 0.11
164 0.12
165 0.09
166 0.1
167 0.09
168 0.08
169 0.07
170 0.09
171 0.08
172 0.09
173 0.1
174 0.08
175 0.07
176 0.07
177 0.08
178 0.07
179 0.06
180 0.06
181 0.05
182 0.06
183 0.06
184 0.05
185 0.05
186 0.06
187 0.07
188 0.08
189 0.14
190 0.16
191 0.18
192 0.26
193 0.28
194 0.34
195 0.41
196 0.51
197 0.56
198 0.64
199 0.72
200 0.75
201 0.79
202 0.79
203 0.81
204 0.8
205 0.78
206 0.79
207 0.77
208 0.77
209 0.77
210 0.78
211 0.77
212 0.72
213 0.67
214 0.6
215 0.55
216 0.49
217 0.43
218 0.37
219 0.28
220 0.25
221 0.2
222 0.16
223 0.12
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.07
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.09
233 0.08
234 0.07
235 0.08
236 0.09
237 0.1
238 0.12
239 0.14
240 0.13
241 0.14
242 0.15
243 0.14
244 0.16
245 0.16
246 0.16
247 0.15
248 0.14
249 0.15
250 0.15
251 0.14
252 0.12
253 0.12
254 0.11
255 0.11
256 0.13
257 0.15
258 0.2
259 0.29
260 0.32
261 0.37
262 0.37
263 0.35
264 0.34
265 0.32
266 0.29
267 0.24
268 0.22
269 0.15
270 0.17
271 0.17
272 0.16
273 0.14
274 0.12
275 0.1
276 0.1
277 0.11
278 0.09
279 0.1
280 0.11
281 0.12
282 0.12
283 0.14
284 0.12
285 0.12
286 0.12
287 0.11
288 0.1
289 0.1
290 0.1
291 0.08
292 0.13
293 0.13
294 0.14
295 0.16
296 0.17
297 0.16
298 0.16
299 0.16
300 0.12
301 0.12
302 0.12
303 0.14
304 0.15
305 0.18
306 0.17
307 0.17
308 0.19
309 0.19
310 0.21
311 0.18
312 0.18
313 0.19
314 0.19
315 0.19
316 0.2
317 0.22
318 0.19
319 0.18
320 0.18
321 0.16
322 0.17
323 0.17
324 0.13
325 0.18
326 0.17
327 0.19
328 0.19
329 0.23
330 0.21
331 0.22
332 0.23
333 0.17
334 0.18
335 0.23
336 0.26
337 0.28
338 0.34
339 0.39
340 0.4
341 0.41
342 0.44
343 0.43
344 0.42
345 0.38
346 0.36
347 0.35
348 0.41
349 0.48
350 0.5
351 0.53
352 0.53
353 0.54
354 0.54
355 0.53
356 0.48
357 0.42
358 0.34