Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A178F4E7

Protein Details
Accession A0A178F4E7    Localization Confidence High Confidence Score 17.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-35DPKPEAKKPNRQWYMVRPGDHydrophilic
706-732DEAVREREQRRRERRQEDERKLRQSRMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
545-560PKFKHKKIPRGPPSPP
649-688KEKAKKEEHLRQLAQKAREARAGASSSRNESRARSRSRSG
714-726QRRRERRQEDERK
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10.5, cyto 6.5, pero 3, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MCFGCVPYRALVVEDDPKPEAKKPNRQWYMVRPGDGFYPVNPTTAFLFPLITAWSSQVLVYHLQSEPGVISHPYSFAGTMGQFFQYGSVDPSRSRYSTCPQVQPGNEPTVYTYVPPQLHQNIQVGTGNPTGPPPPPPPPSASATVSPNGCLNGAPPGTAHSVSQTIQFGPQAGQAIQVPYISPAPLRPTYQVPAGTVPWLGPTRAEVDAQNIAVARATGAMRPQSMVPYRPAEGQQWWCREVDGSYTLRTTNDIMENLQPGLGSSMNHQTRIMLTNLSLSHNSQNQENTELSSFVTRSGSDCSTRHQRLIWFNFGLTLEAMASLSEGLFKSLPAPKYTGENEELPAHAQRRGPRVVGADAIDETQIVVKRAGPPPYGKRAGWRPRSLEDFGDGGAFPEIAVAQYPLDMGRKDTPNKSNALALQVDAEGKVKYDSIAKQGHNENRIVHASFKDLIPLRQRVDMGEISLDRPSQEEVNAQMEKTKAALEKLVTGAVSAQKPKNVATGKRSEPTFVRYTPANQMGNTNRKNDRIMKIVEKQVDPLEPPKFKHKKIPRGPPSPPPPVLHSPPRKLTAEDQEAWRIPPPVSNWKNPKGYTVPLDKRLAADGRGLQDVSINDKFAQFAEALFTADRHAREEVKQRAQMQQKLAEKEKAKKEEHLRQLAQKAREARAGASSSRNESRARSRSRSGSRSPSPYSSRSPTPDEEDEAVREREQRRRERRQEDERKLRQSRMGAERRVQVMAREQNRDISEKIALGLAKPTQSKETMYDSRLFNQTSGLQSGFNEDQPYDKPLFAAQDAINSIYRPRAQMDDDDENAGGAEMDRINRGNRFEVLGRAKEGFKGTEDAEAREGPVEFEKDTADPFGIDGMIAEVTGGQSSGGQKRYGIQEAESSQRGSKRARVDDDEDDDHYRRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.28
3 0.28
4 0.31
5 0.32
6 0.37
7 0.43
8 0.45
9 0.54
10 0.62
11 0.71
12 0.75
13 0.78
14 0.79
15 0.79
16 0.8
17 0.74
18 0.68
19 0.57
20 0.51
21 0.48
22 0.45
23 0.36
24 0.26
25 0.28
26 0.25
27 0.26
28 0.24
29 0.23
30 0.23
31 0.23
32 0.23
33 0.16
34 0.16
35 0.14
36 0.16
37 0.15
38 0.12
39 0.12
40 0.12
41 0.13
42 0.12
43 0.12
44 0.12
45 0.13
46 0.15
47 0.15
48 0.17
49 0.16
50 0.17
51 0.16
52 0.16
53 0.14
54 0.12
55 0.13
56 0.1
57 0.12
58 0.12
59 0.13
60 0.13
61 0.13
62 0.13
63 0.11
64 0.14
65 0.12
66 0.13
67 0.14
68 0.13
69 0.12
70 0.12
71 0.13
72 0.11
73 0.11
74 0.14
75 0.16
76 0.17
77 0.18
78 0.24
79 0.27
80 0.28
81 0.3
82 0.32
83 0.36
84 0.44
85 0.5
86 0.52
87 0.53
88 0.6
89 0.58
90 0.6
91 0.57
92 0.53
93 0.46
94 0.39
95 0.35
96 0.31
97 0.29
98 0.23
99 0.22
100 0.22
101 0.24
102 0.24
103 0.29
104 0.3
105 0.33
106 0.36
107 0.37
108 0.31
109 0.32
110 0.34
111 0.28
112 0.26
113 0.25
114 0.22
115 0.18
116 0.19
117 0.18
118 0.17
119 0.21
120 0.23
121 0.29
122 0.33
123 0.36
124 0.39
125 0.41
126 0.45
127 0.44
128 0.42
129 0.38
130 0.37
131 0.38
132 0.34
133 0.3
134 0.27
135 0.22
136 0.19
137 0.16
138 0.13
139 0.15
140 0.15
141 0.14
142 0.13
143 0.16
144 0.18
145 0.19
146 0.18
147 0.14
148 0.16
149 0.17
150 0.2
151 0.18
152 0.16
153 0.17
154 0.17
155 0.16
156 0.14
157 0.16
158 0.15
159 0.13
160 0.14
161 0.14
162 0.15
163 0.14
164 0.14
165 0.12
166 0.11
167 0.12
168 0.11
169 0.1
170 0.11
171 0.16
172 0.19
173 0.21
174 0.22
175 0.26
176 0.28
177 0.32
178 0.31
179 0.27
180 0.27
181 0.26
182 0.24
183 0.2
184 0.17
185 0.17
186 0.16
187 0.15
188 0.12
189 0.13
190 0.15
191 0.16
192 0.17
193 0.13
194 0.16
195 0.18
196 0.18
197 0.17
198 0.14
199 0.12
200 0.11
201 0.11
202 0.07
203 0.07
204 0.08
205 0.08
206 0.11
207 0.12
208 0.13
209 0.14
210 0.14
211 0.18
212 0.21
213 0.22
214 0.24
215 0.25
216 0.26
217 0.28
218 0.29
219 0.27
220 0.29
221 0.36
222 0.39
223 0.4
224 0.4
225 0.37
226 0.35
227 0.33
228 0.28
229 0.23
230 0.2
231 0.18
232 0.18
233 0.19
234 0.19
235 0.18
236 0.19
237 0.16
238 0.15
239 0.16
240 0.16
241 0.16
242 0.18
243 0.19
244 0.17
245 0.16
246 0.12
247 0.1
248 0.1
249 0.09
250 0.08
251 0.09
252 0.18
253 0.19
254 0.2
255 0.2
256 0.19
257 0.2
258 0.23
259 0.21
260 0.13
261 0.12
262 0.15
263 0.16
264 0.18
265 0.17
266 0.16
267 0.19
268 0.22
269 0.23
270 0.21
271 0.23
272 0.22
273 0.24
274 0.23
275 0.2
276 0.17
277 0.17
278 0.15
279 0.14
280 0.13
281 0.11
282 0.12
283 0.1
284 0.1
285 0.14
286 0.15
287 0.17
288 0.18
289 0.22
290 0.31
291 0.33
292 0.33
293 0.32
294 0.36
295 0.42
296 0.47
297 0.46
298 0.37
299 0.35
300 0.35
301 0.33
302 0.28
303 0.18
304 0.13
305 0.07
306 0.06
307 0.07
308 0.05
309 0.04
310 0.04
311 0.03
312 0.04
313 0.04
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.09
318 0.14
319 0.16
320 0.16
321 0.18
322 0.18
323 0.23
324 0.25
325 0.25
326 0.23
327 0.22
328 0.23
329 0.22
330 0.21
331 0.18
332 0.19
333 0.16
334 0.17
335 0.18
336 0.21
337 0.26
338 0.28
339 0.27
340 0.27
341 0.28
342 0.26
343 0.24
344 0.2
345 0.16
346 0.14
347 0.13
348 0.11
349 0.08
350 0.07
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.08
355 0.09
356 0.15
357 0.19
358 0.23
359 0.22
360 0.27
361 0.31
362 0.39
363 0.41
364 0.36
365 0.38
366 0.45
367 0.53
368 0.56
369 0.55
370 0.51
371 0.51
372 0.56
373 0.52
374 0.42
375 0.34
376 0.27
377 0.21
378 0.18
379 0.14
380 0.1
381 0.08
382 0.07
383 0.05
384 0.04
385 0.04
386 0.03
387 0.04
388 0.04
389 0.03
390 0.03
391 0.04
392 0.04
393 0.06
394 0.06
395 0.08
396 0.13
397 0.18
398 0.21
399 0.27
400 0.3
401 0.32
402 0.34
403 0.32
404 0.29
405 0.26
406 0.25
407 0.2
408 0.16
409 0.14
410 0.12
411 0.11
412 0.09
413 0.09
414 0.06
415 0.06
416 0.06
417 0.06
418 0.06
419 0.09
420 0.1
421 0.15
422 0.21
423 0.21
424 0.25
425 0.31
426 0.35
427 0.34
428 0.34
429 0.29
430 0.26
431 0.28
432 0.24
433 0.19
434 0.16
435 0.15
436 0.15
437 0.14
438 0.15
439 0.14
440 0.16
441 0.2
442 0.22
443 0.21
444 0.22
445 0.23
446 0.19
447 0.22
448 0.19
449 0.15
450 0.13
451 0.12
452 0.1
453 0.11
454 0.1
455 0.07
456 0.07
457 0.08
458 0.07
459 0.07
460 0.08
461 0.09
462 0.14
463 0.14
464 0.13
465 0.14
466 0.14
467 0.13
468 0.13
469 0.13
470 0.09
471 0.09
472 0.11
473 0.1
474 0.11
475 0.12
476 0.11
477 0.09
478 0.08
479 0.09
480 0.1
481 0.11
482 0.14
483 0.14
484 0.15
485 0.16
486 0.17
487 0.22
488 0.24
489 0.26
490 0.28
491 0.34
492 0.36
493 0.39
494 0.39
495 0.34
496 0.31
497 0.33
498 0.31
499 0.24
500 0.23
501 0.2
502 0.22
503 0.26
504 0.3
505 0.26
506 0.23
507 0.27
508 0.32
509 0.4
510 0.4
511 0.4
512 0.37
513 0.38
514 0.41
515 0.43
516 0.4
517 0.36
518 0.37
519 0.38
520 0.4
521 0.43
522 0.43
523 0.37
524 0.35
525 0.31
526 0.28
527 0.23
528 0.23
529 0.24
530 0.23
531 0.24
532 0.34
533 0.39
534 0.4
535 0.49
536 0.54
537 0.59
538 0.66
539 0.76
540 0.75
541 0.77
542 0.79
543 0.78
544 0.76
545 0.72
546 0.66
547 0.56
548 0.52
549 0.49
550 0.5
551 0.5
552 0.51
553 0.49
554 0.5
555 0.52
556 0.48
557 0.44
558 0.44
559 0.44
560 0.42
561 0.39
562 0.37
563 0.36
564 0.36
565 0.34
566 0.31
567 0.23
568 0.17
569 0.18
570 0.2
571 0.27
572 0.31
573 0.38
574 0.44
575 0.5
576 0.56
577 0.53
578 0.54
579 0.46
580 0.45
581 0.43
582 0.45
583 0.43
584 0.43
585 0.45
586 0.41
587 0.38
588 0.38
589 0.33
590 0.24
591 0.22
592 0.19
593 0.19
594 0.19
595 0.18
596 0.15
597 0.16
598 0.15
599 0.19
600 0.16
601 0.15
602 0.15
603 0.15
604 0.16
605 0.13
606 0.14
607 0.08
608 0.07
609 0.09
610 0.09
611 0.09
612 0.09
613 0.09
614 0.09
615 0.12
616 0.12
617 0.12
618 0.14
619 0.16
620 0.2
621 0.3
622 0.37
623 0.41
624 0.45
625 0.45
626 0.51
627 0.57
628 0.57
629 0.52
630 0.52
631 0.51
632 0.52
633 0.53
634 0.52
635 0.49
636 0.53
637 0.57
638 0.58
639 0.54
640 0.56
641 0.61
642 0.64
643 0.68
644 0.69
645 0.63
646 0.61
647 0.67
648 0.66
649 0.59
650 0.54
651 0.5
652 0.44
653 0.44
654 0.39
655 0.32
656 0.31
657 0.31
658 0.28
659 0.28
660 0.27
661 0.28
662 0.3
663 0.31
664 0.28
665 0.3
666 0.38
667 0.42
668 0.48
669 0.49
670 0.52
671 0.59
672 0.66
673 0.69
674 0.66
675 0.67
676 0.65
677 0.67
678 0.65
679 0.62
680 0.59
681 0.56
682 0.55
683 0.51
684 0.5
685 0.47
686 0.48
687 0.45
688 0.46
689 0.44
690 0.42
691 0.39
692 0.35
693 0.32
694 0.31
695 0.29
696 0.23
697 0.27
698 0.29
699 0.34
700 0.42
701 0.5
702 0.57
703 0.67
704 0.76
705 0.79
706 0.85
707 0.88
708 0.9
709 0.9
710 0.91
711 0.88
712 0.88
713 0.84
714 0.77
715 0.72
716 0.65
717 0.63
718 0.63
719 0.62
720 0.57
721 0.58
722 0.59
723 0.56
724 0.53
725 0.45
726 0.36
727 0.37
728 0.41
729 0.41
730 0.41
731 0.39
732 0.43
733 0.44
734 0.45
735 0.37
736 0.31
737 0.27
738 0.22
739 0.22
740 0.18
741 0.16
742 0.14
743 0.16
744 0.15
745 0.18
746 0.19
747 0.2
748 0.21
749 0.23
750 0.25
751 0.25
752 0.31
753 0.33
754 0.34
755 0.38
756 0.37
757 0.4
758 0.43
759 0.4
760 0.31
761 0.29
762 0.29
763 0.27
764 0.27
765 0.23
766 0.19
767 0.18
768 0.24
769 0.23
770 0.21
771 0.2
772 0.17
773 0.19
774 0.21
775 0.25
776 0.21
777 0.19
778 0.18
779 0.18
780 0.22
781 0.19
782 0.22
783 0.18
784 0.2
785 0.21
786 0.23
787 0.21
788 0.19
789 0.19
790 0.2
791 0.22
792 0.19
793 0.21
794 0.23
795 0.24
796 0.29
797 0.36
798 0.37
799 0.36
800 0.36
801 0.34
802 0.29
803 0.27
804 0.21
805 0.14
806 0.08
807 0.08
808 0.08
809 0.09
810 0.12
811 0.14
812 0.17
813 0.2
814 0.23
815 0.25
816 0.25
817 0.28
818 0.28
819 0.35
820 0.38
821 0.38
822 0.37
823 0.37
824 0.36
825 0.35
826 0.36
827 0.29
828 0.24
829 0.25
830 0.23
831 0.28
832 0.29
833 0.28
834 0.28
835 0.27
836 0.25
837 0.24
838 0.23
839 0.17
840 0.19
841 0.19
842 0.16
843 0.17
844 0.18
845 0.17
846 0.18
847 0.18
848 0.14
849 0.12
850 0.12
851 0.12
852 0.1
853 0.09
854 0.08
855 0.07
856 0.06
857 0.06
858 0.06
859 0.05
860 0.05
861 0.06
862 0.05
863 0.04
864 0.07
865 0.12
866 0.19
867 0.21
868 0.22
869 0.22
870 0.28
871 0.34
872 0.38
873 0.34
874 0.3
875 0.34
876 0.37
877 0.42
878 0.4
879 0.36
880 0.34
881 0.37
882 0.4
883 0.38
884 0.41
885 0.45
886 0.51
887 0.56
888 0.59
889 0.61
890 0.64
891 0.66
892 0.62
893 0.56
894 0.53