Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178F3Z5

Protein Details
Accession A0A178F3Z5    Localization Confidence Low Confidence Score 8.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-40SSWAQQHQQHQQHQQHQQQQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 8.5, cyto 5.5, mito 4, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR007216  CNOT9  
Gene Ontology GO:0030014  C:CCR4-NOT complex  
GO:0006402  P:mRNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF04078  Rcd1  
Amino Acid Sequences MLQSQAPHVFSHQHQYPQADSSWAQQHQQHQQHQQHQQQQHQSHFQSQQPQQHPSLAAQQHAQAQAAAAAAAAQHQQQQQQQHYSRIGMTGGVNSSSQTPGGQENGNGIAGNIDSGVSEENRKVLVWVAELLDPNRRESALMELSKKREQVPELALIIWHSFVCNALALLQCVASHNETRTLFLNAHIPLFLYPFLNTTSKSRPFEYLRLTSLGVIGALVKNDSSDVINFLLTTEIIPLCLRIMETGSELSKTVAIFIVQKILLDDIGLAYICATYERFYAVGTVLSNMVTQLVEQQTVRLLKHVVRCFLRLSDNNRAREALRQCLPEPLRDATFSSVLRDDAATKRCLAQLLINLSDNVVDGSNAGPGIVLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.44
3 0.44
4 0.41
5 0.4
6 0.34
7 0.3
8 0.3
9 0.34
10 0.32
11 0.34
12 0.35
13 0.42
14 0.49
15 0.57
16 0.59
17 0.61
18 0.68
19 0.74
20 0.79
21 0.8
22 0.8
23 0.78
24 0.78
25 0.78
26 0.75
27 0.73
28 0.72
29 0.65
30 0.64
31 0.62
32 0.58
33 0.58
34 0.58
35 0.61
36 0.58
37 0.61
38 0.54
39 0.53
40 0.5
41 0.42
42 0.45
43 0.37
44 0.33
45 0.3
46 0.3
47 0.31
48 0.3
49 0.28
50 0.19
51 0.17
52 0.16
53 0.14
54 0.11
55 0.06
56 0.05
57 0.05
58 0.06
59 0.06
60 0.06
61 0.11
62 0.13
63 0.17
64 0.21
65 0.29
66 0.33
67 0.42
68 0.45
69 0.46
70 0.46
71 0.44
72 0.4
73 0.34
74 0.29
75 0.21
76 0.18
77 0.15
78 0.13
79 0.12
80 0.12
81 0.11
82 0.12
83 0.11
84 0.11
85 0.09
86 0.09
87 0.1
88 0.13
89 0.13
90 0.12
91 0.13
92 0.14
93 0.14
94 0.12
95 0.1
96 0.08
97 0.07
98 0.07
99 0.05
100 0.04
101 0.03
102 0.04
103 0.05
104 0.06
105 0.07
106 0.08
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.1
112 0.11
113 0.1
114 0.11
115 0.11
116 0.12
117 0.13
118 0.14
119 0.17
120 0.17
121 0.18
122 0.17
123 0.16
124 0.15
125 0.15
126 0.2
127 0.21
128 0.23
129 0.26
130 0.29
131 0.33
132 0.35
133 0.36
134 0.32
135 0.29
136 0.28
137 0.28
138 0.28
139 0.27
140 0.25
141 0.24
142 0.21
143 0.18
144 0.16
145 0.12
146 0.09
147 0.05
148 0.04
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.04
153 0.05
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.08
161 0.08
162 0.09
163 0.09
164 0.14
165 0.14
166 0.15
167 0.16
168 0.16
169 0.15
170 0.15
171 0.18
172 0.14
173 0.14
174 0.12
175 0.11
176 0.1
177 0.1
178 0.1
179 0.06
180 0.06
181 0.07
182 0.09
183 0.1
184 0.1
185 0.13
186 0.2
187 0.25
188 0.27
189 0.28
190 0.31
191 0.34
192 0.38
193 0.4
194 0.36
195 0.32
196 0.31
197 0.3
198 0.25
199 0.22
200 0.16
201 0.1
202 0.07
203 0.06
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.05
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.05
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.09
234 0.09
235 0.09
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.09
240 0.09
241 0.08
242 0.08
243 0.09
244 0.09
245 0.12
246 0.11
247 0.11
248 0.11
249 0.11
250 0.1
251 0.08
252 0.08
253 0.04
254 0.05
255 0.05
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.05
262 0.05
263 0.06
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.08
268 0.08
269 0.09
270 0.09
271 0.09
272 0.08
273 0.09
274 0.09
275 0.08
276 0.08
277 0.06
278 0.06
279 0.1
280 0.11
281 0.12
282 0.12
283 0.13
284 0.17
285 0.2
286 0.2
287 0.17
288 0.18
289 0.22
290 0.31
291 0.35
292 0.37
293 0.37
294 0.39
295 0.39
296 0.4
297 0.44
298 0.41
299 0.44
300 0.48
301 0.53
302 0.54
303 0.53
304 0.52
305 0.45
306 0.47
307 0.44
308 0.42
309 0.4
310 0.41
311 0.4
312 0.47
313 0.48
314 0.44
315 0.43
316 0.39
317 0.36
318 0.33
319 0.34
320 0.28
321 0.31
322 0.28
323 0.27
324 0.24
325 0.22
326 0.22
327 0.21
328 0.21
329 0.23
330 0.27
331 0.26
332 0.26
333 0.28
334 0.29
335 0.3
336 0.28
337 0.26
338 0.28
339 0.32
340 0.34
341 0.32
342 0.3
343 0.29
344 0.27
345 0.22
346 0.16
347 0.11
348 0.07
349 0.07
350 0.07
351 0.08
352 0.08
353 0.07