FuNGI

A0A178F2U6

Protein Details

Accession

A0A178F2U6

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
323-346	TLGGTPVRKKKRKGAKTNPSAYSM	Hydrophilic
430-455	LDKWDDRRVHAKRKGAQGRRGKNGNE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
330-338	RKKKRKGAK
438-451	VHAKRKGAQGRRGK

Subcellular Location(s)

nucl 17, mito 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPTKQWIDKKSATKYQLFHRSQNDPLIHDPEAEDRILHVVGRPGPASSIKSSSKRETRTLRELDEEFKSATRKNEGEAANYGIFYDDTKYDYMQHLRGLGEGVGDAHFVEARTKGKEKKGMKLEDALKEISLDGDGAESFTYGDANDDILSTASSYIRKATYQDQQDVPDAIAGFQPDMDPRLREALEALEDDAYVDEECDEDIFDNLVAGGHDAEVDPDEWRDTYIEDHDEGWESDATEKAPVQHDTSTDSQLPTASDDKGNSVTSSQPPNDDQIPDVEEHEGDWLKDFAKYKKDMKANKVAAKVDDSASELRTTASTLFTLGGTPVRKKKRKGAKTNPSAYSMTSSSLARTEGHRLLDDRFERMEALYALDEGEEYEGSSMADDMSVASGVSRFSRFSKLSQAPSLVANDRNTTLRSDFNDVMDGFLDKWDDRRVHAKRKGAQGRRGKNGNEVIGMRMLDEVRQGLGPPKLSTNAFGKV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.7
2	0.67
3	0.69
4	0.72
5	0.68
6	0.66
7	0.64
8	0.63
9	0.61
10	0.65
11	0.58
12	0.51
13	0.5
14	0.48
15	0.42
16	0.37
17	0.33
18	0.29
19	0.29
20	0.25
21	0.2
22	0.15
23	0.17
24	0.17
25	0.15
26	0.13
27	0.16
28	0.19
29	0.22
30	0.21
31	0.19
32	0.21
33	0.24
34	0.26
35	0.24
36	0.28
37	0.32
38	0.38
39	0.44
40	0.51
41	0.57
42	0.58
43	0.64
44	0.67
45	0.68
46	0.71
47	0.71
48	0.65
49	0.62
50	0.58
51	0.54
52	0.48
53	0.42
54	0.33
55	0.3
56	0.3
57	0.27
58	0.3
59	0.32
60	0.29
61	0.29
62	0.36
63	0.35
64	0.35
65	0.34
66	0.35
67	0.28
68	0.27
69	0.25
70	0.18
71	0.16
72	0.13
73	0.13
74	0.09
75	0.11
76	0.12
77	0.13
78	0.14
79	0.19
80	0.23
81	0.23
82	0.23
83	0.24
84	0.23
85	0.23
86	0.22
87	0.16
88	0.12
89	0.1
90	0.09
91	0.07
92	0.07
93	0.07
94	0.06
95	0.06
96	0.06
97	0.08
98	0.1
99	0.13
100	0.17
101	0.23
102	0.29
103	0.36
104	0.44
105	0.47
106	0.54
107	0.61
108	0.61
109	0.58
110	0.61
111	0.6
112	0.55
113	0.54
114	0.45
115	0.35
116	0.3
117	0.27
118	0.19
119	0.13
120	0.08
121	0.05
122	0.05
123	0.05
124	0.05
125	0.05
126	0.05
127	0.04
128	0.04
129	0.05
130	0.04
131	0.05
132	0.05
133	0.06
134	0.06
135	0.06
136	0.06
137	0.06
138	0.06
139	0.05
140	0.06
141	0.07
142	0.08
143	0.08
144	0.1
145	0.11
146	0.12
147	0.14
148	0.19
149	0.25
150	0.29
151	0.33
152	0.33
153	0.34
154	0.35
155	0.33
156	0.28
157	0.22
158	0.17
159	0.12
160	0.11
161	0.09
162	0.07
163	0.07
164	0.07
165	0.06
166	0.08
167	0.09
168	0.09
169	0.09
170	0.13
171	0.13
172	0.13
173	0.13
174	0.12
175	0.12
176	0.12
177	0.11
178	0.08
179	0.07
180	0.08
181	0.07
182	0.06
183	0.05
184	0.04
185	0.04
186	0.04
187	0.04
188	0.04
189	0.04
190	0.03
191	0.04
192	0.04
193	0.04
194	0.04
195	0.04
196	0.04
197	0.04
198	0.04
199	0.04
200	0.03
201	0.03
202	0.03
203	0.04
204	0.04
205	0.05
206	0.05
207	0.05
208	0.05
209	0.05
210	0.06
211	0.06
212	0.06
213	0.07
214	0.08
215	0.09
216	0.09
217	0.1
218	0.1
219	0.1
220	0.1
221	0.1
222	0.09
223	0.08
224	0.07
225	0.08
226	0.07
227	0.07
228	0.07
229	0.08
230	0.1
231	0.11
232	0.12
233	0.13
234	0.13
235	0.16
236	0.18
237	0.19
238	0.17
239	0.16
240	0.15
241	0.14
242	0.14
243	0.12
244	0.12
245	0.11
246	0.11
247	0.11
248	0.12
249	0.14
250	0.14
251	0.12
252	0.11
253	0.12
254	0.15
255	0.18
256	0.17
257	0.18
258	0.18
259	0.21
260	0.22
261	0.19
262	0.16
263	0.14
264	0.15
265	0.13
266	0.13
267	0.11
268	0.09
269	0.09
270	0.1
271	0.09
272	0.08
273	0.08
274	0.08
275	0.08
276	0.11
277	0.14
278	0.16
279	0.22
280	0.26
281	0.31
282	0.38
283	0.45
284	0.49
285	0.53
286	0.6
287	0.61
288	0.62
289	0.62
290	0.55
291	0.49
292	0.45
293	0.4
294	0.3
295	0.23
296	0.2
297	0.16
298	0.15
299	0.14
300	0.12
301	0.1
302	0.1
303	0.1
304	0.09
305	0.08
306	0.08
307	0.08
308	0.08
309	0.08
310	0.08
311	0.08
312	0.11
313	0.12
314	0.17
315	0.25
316	0.35
317	0.42
318	0.47
319	0.56
320	0.63
321	0.72
322	0.78
323	0.81
324	0.82
325	0.85
326	0.89
327	0.82
328	0.76
329	0.66
330	0.55
331	0.47
332	0.37
333	0.28
334	0.21
335	0.19
336	0.15
337	0.15
338	0.15
339	0.13
340	0.14
341	0.19
342	0.2
343	0.22
344	0.23
345	0.23
346	0.24
347	0.31
348	0.3
349	0.26
350	0.24
351	0.23
352	0.22
353	0.21
354	0.21
355	0.13
356	0.14
357	0.11
358	0.1
359	0.1
360	0.09
361	0.08
362	0.06
363	0.07
364	0.05
365	0.05
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.06
370	0.05
371	0.04
372	0.04
373	0.04
374	0.04
375	0.04
376	0.05
377	0.04
378	0.04
379	0.05
380	0.06
381	0.08
382	0.09
383	0.11
384	0.13
385	0.21
386	0.22
387	0.24
388	0.34
389	0.38
390	0.43
391	0.45
392	0.45
393	0.39
394	0.4
395	0.41
396	0.34
397	0.32
398	0.29
399	0.27
400	0.27
401	0.28
402	0.27
403	0.27
404	0.25
405	0.26
406	0.27
407	0.32
408	0.31
409	0.3
410	0.34
411	0.3
412	0.29
413	0.24
414	0.22
415	0.15
416	0.14
417	0.15
418	0.11
419	0.14
420	0.2
421	0.21
422	0.23
423	0.34
424	0.41
425	0.5
426	0.57
427	0.64
428	0.64
429	0.74
430	0.81
431	0.8
432	0.81
433	0.81
434	0.83
435	0.83
436	0.83
437	0.74
438	0.72
439	0.7
440	0.63
441	0.57
442	0.49
443	0.42
444	0.37
445	0.35
446	0.27
447	0.22
448	0.19
449	0.15
450	0.16
451	0.14
452	0.12
453	0.13
454	0.14
455	0.17
456	0.21
457	0.24
458	0.24
459	0.27
460	0.3
461	0.3
462	0.33

A0A178F2U6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer