Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178F1I5

Protein Details
Accession A0A178F1I5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
292-319YLSSSAKRGKKGKRDKRRGKKGNIGTYGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
297-313AKRGKKGKRDKRRGKKG
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 14.5, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013907  Sds3  
Gene Ontology GO:0005654  C:nucleoplasm  
Pfam View protein in Pfam  
PF08598  Sds3  
Amino Acid Sequences MLANNTSIDLRFQAGSMPASLADAIDSDSRSSSLSDIDETLSHGQLDDLSPRPSKFASEIDSEAETERIEDSPHHNRDRDKASIVLSGVGGVFASPSKLAQSTTYDQLDEENEDEDDEAEDTEASPSKPPRSAKTNGTGNGNAHSEKESDFKSTKLSESQETLSLIKKRKRMNSTHDLAALPQDDDDREEPARKRRGSIAVEPSADDESAYPPAVQLLEEEDEDEGEGEAEAEAEAEAEAEADAEPEAEAEPEPEADVEAEVEAEDDEDKSKLNNADASKPTSPSPVSDETYLSSSAKRGKKGKRDKRRGKKGNIGTYGDSTPRAGSVVDSNGADATEEQTVDEALADTADGPEAAVKLEECKFSGAFELPHSEALRNEADWSATVTKKTTALDLLSDLERHFATLRDRIYDERISNINEELSQLSSPSPTHPEFLRQAAIVQSHINAKINHEKILHAYKFQALCVKSRAERAQCNSSYYQTVREIREAALDAVSEHQYKVQHDRFGGIGISCPGTGAGSSSYPGLAGPASGILADATSDAVTEYTIPFPTRLSKQIAHQAAYNREVSVLAGFAKYVGFPAAPSLKPSRAQETDEDLEKMGIRTRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.16
4 0.16
5 0.13
6 0.14
7 0.14
8 0.11
9 0.09
10 0.08
11 0.09
12 0.1
13 0.11
14 0.11
15 0.12
16 0.12
17 0.13
18 0.14
19 0.12
20 0.13
21 0.14
22 0.14
23 0.15
24 0.16
25 0.15
26 0.18
27 0.19
28 0.17
29 0.16
30 0.14
31 0.13
32 0.13
33 0.14
34 0.16
35 0.17
36 0.2
37 0.24
38 0.24
39 0.27
40 0.26
41 0.27
42 0.26
43 0.28
44 0.28
45 0.29
46 0.31
47 0.3
48 0.31
49 0.29
50 0.26
51 0.22
52 0.17
53 0.13
54 0.13
55 0.1
56 0.1
57 0.12
58 0.19
59 0.28
60 0.36
61 0.41
62 0.44
63 0.47
64 0.54
65 0.58
66 0.55
67 0.48
68 0.43
69 0.4
70 0.39
71 0.36
72 0.3
73 0.23
74 0.19
75 0.15
76 0.12
77 0.09
78 0.06
79 0.06
80 0.04
81 0.06
82 0.05
83 0.06
84 0.08
85 0.09
86 0.1
87 0.12
88 0.18
89 0.21
90 0.27
91 0.28
92 0.26
93 0.25
94 0.26
95 0.25
96 0.21
97 0.18
98 0.13
99 0.12
100 0.12
101 0.12
102 0.1
103 0.09
104 0.08
105 0.07
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.08
110 0.09
111 0.09
112 0.14
113 0.17
114 0.21
115 0.27
116 0.3
117 0.35
118 0.4
119 0.45
120 0.48
121 0.53
122 0.57
123 0.54
124 0.56
125 0.52
126 0.46
127 0.44
128 0.4
129 0.31
130 0.24
131 0.23
132 0.18
133 0.17
134 0.19
135 0.17
136 0.2
137 0.2
138 0.2
139 0.23
140 0.24
141 0.25
142 0.27
143 0.28
144 0.26
145 0.28
146 0.29
147 0.27
148 0.27
149 0.26
150 0.26
151 0.29
152 0.34
153 0.36
154 0.41
155 0.46
156 0.54
157 0.61
158 0.64
159 0.67
160 0.69
161 0.69
162 0.65
163 0.6
164 0.51
165 0.43
166 0.38
167 0.29
168 0.19
169 0.15
170 0.12
171 0.1
172 0.12
173 0.13
174 0.13
175 0.14
176 0.19
177 0.23
178 0.31
179 0.39
180 0.37
181 0.39
182 0.42
183 0.49
184 0.49
185 0.52
186 0.52
187 0.48
188 0.47
189 0.45
190 0.41
191 0.33
192 0.27
193 0.2
194 0.12
195 0.09
196 0.1
197 0.1
198 0.08
199 0.07
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.06
204 0.07
205 0.08
206 0.08
207 0.09
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.05
213 0.04
214 0.04
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.05
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.04
254 0.04
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.08
259 0.09
260 0.1
261 0.14
262 0.15
263 0.21
264 0.23
265 0.28
266 0.26
267 0.26
268 0.26
269 0.24
270 0.23
271 0.18
272 0.21
273 0.19
274 0.2
275 0.19
276 0.19
277 0.18
278 0.19
279 0.18
280 0.14
281 0.11
282 0.11
283 0.18
284 0.21
285 0.26
286 0.33
287 0.4
288 0.5
289 0.61
290 0.7
291 0.73
292 0.81
293 0.87
294 0.9
295 0.94
296 0.93
297 0.89
298 0.88
299 0.85
300 0.83
301 0.77
302 0.68
303 0.58
304 0.51
305 0.44
306 0.35
307 0.27
308 0.18
309 0.13
310 0.1
311 0.09
312 0.07
313 0.06
314 0.07
315 0.08
316 0.09
317 0.08
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.07
322 0.06
323 0.06
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.04
332 0.03
333 0.03
334 0.03
335 0.03
336 0.03
337 0.03
338 0.03
339 0.03
340 0.03
341 0.03
342 0.04
343 0.04
344 0.04
345 0.07
346 0.09
347 0.09
348 0.1
349 0.11
350 0.11
351 0.11
352 0.13
353 0.11
354 0.1
355 0.11
356 0.14
357 0.13
358 0.15
359 0.16
360 0.15
361 0.14
362 0.16
363 0.16
364 0.13
365 0.13
366 0.11
367 0.11
368 0.1
369 0.13
370 0.13
371 0.13
372 0.14
373 0.14
374 0.15
375 0.16
376 0.17
377 0.15
378 0.13
379 0.13
380 0.13
381 0.13
382 0.14
383 0.12
384 0.13
385 0.11
386 0.11
387 0.1
388 0.1
389 0.1
390 0.1
391 0.13
392 0.17
393 0.18
394 0.19
395 0.21
396 0.22
397 0.27
398 0.29
399 0.26
400 0.25
401 0.26
402 0.25
403 0.25
404 0.24
405 0.19
406 0.15
407 0.15
408 0.12
409 0.11
410 0.1
411 0.09
412 0.09
413 0.09
414 0.1
415 0.11
416 0.16
417 0.15
418 0.18
419 0.18
420 0.23
421 0.25
422 0.27
423 0.26
424 0.21
425 0.21
426 0.21
427 0.21
428 0.17
429 0.14
430 0.13
431 0.15
432 0.16
433 0.19
434 0.17
435 0.21
436 0.29
437 0.3
438 0.33
439 0.3
440 0.3
441 0.31
442 0.4
443 0.37
444 0.29
445 0.29
446 0.31
447 0.31
448 0.31
449 0.32
450 0.23
451 0.26
452 0.28
453 0.31
454 0.27
455 0.34
456 0.4
457 0.4
458 0.47
459 0.5
460 0.55
461 0.52
462 0.55
463 0.5
464 0.45
465 0.44
466 0.38
467 0.36
468 0.34
469 0.38
470 0.36
471 0.36
472 0.35
473 0.31
474 0.32
475 0.29
476 0.23
477 0.18
478 0.15
479 0.13
480 0.14
481 0.16
482 0.14
483 0.12
484 0.14
485 0.16
486 0.19
487 0.29
488 0.31
489 0.33
490 0.33
491 0.35
492 0.32
493 0.31
494 0.3
495 0.21
496 0.17
497 0.14
498 0.15
499 0.12
500 0.12
501 0.1
502 0.09
503 0.09
504 0.08
505 0.09
506 0.08
507 0.09
508 0.09
509 0.09
510 0.09
511 0.09
512 0.08
513 0.06
514 0.06
515 0.05
516 0.05
517 0.06
518 0.05
519 0.06
520 0.05
521 0.05
522 0.05
523 0.04
524 0.05
525 0.04
526 0.05
527 0.05
528 0.05
529 0.05
530 0.06
531 0.08
532 0.09
533 0.11
534 0.12
535 0.13
536 0.14
537 0.21
538 0.24
539 0.28
540 0.33
541 0.34
542 0.4
543 0.49
544 0.52
545 0.47
546 0.47
547 0.49
548 0.48
549 0.49
550 0.43
551 0.34
552 0.29
553 0.28
554 0.24
555 0.18
556 0.13
557 0.11
558 0.09
559 0.09
560 0.09
561 0.09
562 0.08
563 0.08
564 0.09
565 0.07
566 0.08
567 0.14
568 0.2
569 0.2
570 0.25
571 0.3
572 0.33
573 0.39
574 0.43
575 0.46
576 0.44
577 0.47
578 0.47
579 0.5
580 0.5
581 0.47
582 0.44
583 0.36
584 0.33
585 0.31
586 0.28