Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178F1J9

Protein Details
Accession A0A178F1J9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-52THSPEGQYRVVRKRNRVPVSCAPCRNRKLKCNRATPCENCVHydrophilic
58-78ASCSYAQSTNRRRHQNTQSVVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17, plas 6, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR007219  Transcription_factor_dom_fun  
IPR036864  Zn2-C6_fun-type_DNA-bd_sf  
IPR001138  Zn2Cys6_DnaBD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04082  Fungal_trans  
PF00076  RRM_1  
PF00172  Zn_clus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS00463  ZN2_CY6_FUNGAL_1  
PS50048  ZN2_CY6_FUNGAL_2  
CDD cd12148  fungal_TF_MHR  
cd00067  GAL4  
Amino Acid Sequences MSPTPPTTSPSTHSPEGQYRVVRKRNRVPVSCAPCRNRKLKCNRATPCENCVKRDDIASCSYAQSTNRRRHQNTQSVVSSPDDMQNRIDRLENLVLSLMTNGAQSAGPTAAIATVSGDGSIGSQGPQSASTNTVDIDLKDEESDTEQVTKSFGIMKVDNQSQKSYYVSEAHWSTILNDISEVKHFWATHKKQYEEQMQKVQATKQTQDLKGSALIFGAMSLPTEAEIMASFPSRYTADMLLRRFFATLDPSITLVHGPTFWKKYEAHWHDPSKTSMVWIAMVFAMLRLAMLSYHRERDEPPEFRGKSLDIAKTYRIAMAQGLVYSDFTKPHRYLLETLAFHLQAEYSQSCDSETSVWILVGMIVRLGMRMGYHRDSKMFPNISIFQGEMRRRLWMWVRQADLLFSFEAGLPSMIRTGDADTDFPRCLYDEDIDEDSKETPPERPFNQPAPIAYTIVHARLTTVFGRVLEQSQKLRGSSYEGVLELDRELRHAREVIPEWLRMKPLPECSHEPSTLIMNRIAVESIYHKAQCVLHRPYLTRARENPRYTLSHRACIDSSLELLRLQAMLHAEKTSGRRVLHPRYYTTSLTGHDFLLASTILALDLYHEAQLEANRRQGDSPYGWGCGMQEEMLATLRQSYNIWNELKDESMDAWKASSVLGLLLEKISCRRENRDATSMDSSFDPQDEKQSAAMTLGLLSSGLTPQGPTSPPQFGDSMIGIDRTSSAQQGGLPSNIDQLAGLNSPFGMFGQMPDMQPFNLDWEAWDNYIQSAALDPTNQNWADVNQRQDFQQAHQPQTTAENEPNMSIRPPTYPLRNGTYDANGNTSTHPTYMDNNISSTMISLRHAMYRAASAAGGSAARSFLPKPQAASSQLSQFTRVMGSQLWASQRRFFTEEAREPAVEEKKTMVRSVRNSFGLPPSRPEPQPKATVYVGNILFDITAADLKEYASKYGKVLGTRIIYDSRGLSRGFGYVKFESVEEAKKAIDEMHLSEYEGRKLSVNFAQVDLRDEQPQRKMEPTRTIFVGNIAHQVTDRDLHALFDDIPNVFDVRVAVDRRTGMPRGFAHAEFTDVESAIAGFEMLKGQAPYGRPLRLDYSHSARRPGEVDNSKAPAANLEGQAEAQQETNASPSEEAAPRAAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.49
3 0.51
4 0.53
5 0.52
6 0.54
7 0.61
8 0.67
9 0.69
10 0.71
11 0.76
12 0.81
13 0.84
14 0.81
15 0.79
16 0.81
17 0.82
18 0.81
19 0.8
20 0.77
21 0.77
22 0.79
23 0.79
24 0.78
25 0.79
26 0.81
27 0.82
28 0.84
29 0.85
30 0.86
31 0.86
32 0.86
33 0.81
34 0.79
35 0.79
36 0.73
37 0.65
38 0.62
39 0.56
40 0.47
41 0.49
42 0.43
43 0.36
44 0.37
45 0.35
46 0.32
47 0.3
48 0.3
49 0.27
50 0.28
51 0.34
52 0.39
53 0.48
54 0.55
55 0.64
56 0.69
57 0.76
58 0.82
59 0.82
60 0.8
61 0.78
62 0.72
63 0.63
64 0.59
65 0.51
66 0.43
67 0.34
68 0.33
69 0.28
70 0.26
71 0.28
72 0.32
73 0.32
74 0.31
75 0.32
76 0.27
77 0.3
78 0.34
79 0.3
80 0.24
81 0.24
82 0.22
83 0.19
84 0.18
85 0.13
86 0.08
87 0.08
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.08
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.06
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.07
108 0.06
109 0.06
110 0.07
111 0.08
112 0.09
113 0.11
114 0.12
115 0.13
116 0.15
117 0.16
118 0.16
119 0.15
120 0.17
121 0.16
122 0.14
123 0.17
124 0.16
125 0.15
126 0.15
127 0.15
128 0.13
129 0.15
130 0.17
131 0.14
132 0.16
133 0.16
134 0.16
135 0.16
136 0.15
137 0.13
138 0.16
139 0.17
140 0.19
141 0.2
142 0.24
143 0.3
144 0.37
145 0.41
146 0.38
147 0.39
148 0.36
149 0.36
150 0.34
151 0.3
152 0.26
153 0.24
154 0.23
155 0.26
156 0.26
157 0.25
158 0.24
159 0.22
160 0.2
161 0.23
162 0.23
163 0.17
164 0.16
165 0.17
166 0.17
167 0.19
168 0.19
169 0.14
170 0.17
171 0.17
172 0.22
173 0.31
174 0.36
175 0.44
176 0.51
177 0.52
178 0.54
179 0.62
180 0.67
181 0.65
182 0.65
183 0.65
184 0.6
185 0.6
186 0.58
187 0.53
188 0.49
189 0.45
190 0.41
191 0.4
192 0.45
193 0.44
194 0.45
195 0.42
196 0.37
197 0.36
198 0.35
199 0.26
200 0.18
201 0.16
202 0.11
203 0.11
204 0.09
205 0.06
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.06
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.06
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.09
220 0.1
221 0.11
222 0.12
223 0.15
224 0.21
225 0.27
226 0.3
227 0.3
228 0.3
229 0.3
230 0.28
231 0.24
232 0.2
233 0.18
234 0.17
235 0.17
236 0.17
237 0.17
238 0.17
239 0.17
240 0.15
241 0.11
242 0.1
243 0.09
244 0.11
245 0.16
246 0.19
247 0.19
248 0.23
249 0.23
250 0.28
251 0.38
252 0.44
253 0.47
254 0.52
255 0.57
256 0.58
257 0.6
258 0.57
259 0.49
260 0.41
261 0.33
262 0.27
263 0.22
264 0.19
265 0.16
266 0.14
267 0.11
268 0.11
269 0.09
270 0.07
271 0.06
272 0.04
273 0.04
274 0.03
275 0.03
276 0.04
277 0.05
278 0.11
279 0.14
280 0.18
281 0.19
282 0.2
283 0.22
284 0.29
285 0.37
286 0.35
287 0.36
288 0.42
289 0.42
290 0.42
291 0.43
292 0.36
293 0.32
294 0.35
295 0.35
296 0.28
297 0.3
298 0.3
299 0.3
300 0.3
301 0.25
302 0.2
303 0.16
304 0.13
305 0.12
306 0.11
307 0.09
308 0.09
309 0.08
310 0.09
311 0.09
312 0.1
313 0.11
314 0.12
315 0.18
316 0.18
317 0.22
318 0.24
319 0.26
320 0.28
321 0.3
322 0.36
323 0.3
324 0.32
325 0.3
326 0.28
327 0.25
328 0.22
329 0.16
330 0.09
331 0.12
332 0.11
333 0.1
334 0.11
335 0.11
336 0.11
337 0.12
338 0.12
339 0.1
340 0.1
341 0.09
342 0.09
343 0.09
344 0.09
345 0.08
346 0.08
347 0.07
348 0.07
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.04
355 0.04
356 0.06
357 0.11
358 0.14
359 0.19
360 0.2
361 0.22
362 0.24
363 0.27
364 0.34
365 0.31
366 0.28
367 0.29
368 0.3
369 0.29
370 0.28
371 0.24
372 0.19
373 0.24
374 0.25
375 0.24
376 0.22
377 0.23
378 0.23
379 0.27
380 0.3
381 0.3
382 0.36
383 0.38
384 0.39
385 0.39
386 0.39
387 0.35
388 0.3
389 0.24
390 0.16
391 0.11
392 0.1
393 0.08
394 0.08
395 0.07
396 0.07
397 0.05
398 0.06
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.07
404 0.09
405 0.1
406 0.11
407 0.11
408 0.13
409 0.13
410 0.13
411 0.12
412 0.1
413 0.11
414 0.11
415 0.12
416 0.11
417 0.14
418 0.16
419 0.16
420 0.15
421 0.15
422 0.14
423 0.14
424 0.13
425 0.11
426 0.13
427 0.17
428 0.22
429 0.24
430 0.31
431 0.35
432 0.38
433 0.41
434 0.38
435 0.34
436 0.34
437 0.33
438 0.26
439 0.22
440 0.2
441 0.16
442 0.16
443 0.16
444 0.1
445 0.1
446 0.1
447 0.12
448 0.1
449 0.11
450 0.1
451 0.1
452 0.12
453 0.12
454 0.13
455 0.14
456 0.16
457 0.16
458 0.19
459 0.21
460 0.19
461 0.19
462 0.18
463 0.21
464 0.19
465 0.19
466 0.16
467 0.15
468 0.16
469 0.15
470 0.15
471 0.09
472 0.1
473 0.08
474 0.09
475 0.1
476 0.1
477 0.11
478 0.12
479 0.12
480 0.15
481 0.17
482 0.21
483 0.22
484 0.24
485 0.24
486 0.24
487 0.25
488 0.2
489 0.2
490 0.18
491 0.24
492 0.25
493 0.28
494 0.32
495 0.36
496 0.4
497 0.37
498 0.35
499 0.28
500 0.28
501 0.26
502 0.22
503 0.17
504 0.13
505 0.14
506 0.13
507 0.12
508 0.08
509 0.07
510 0.08
511 0.09
512 0.1
513 0.1
514 0.09
515 0.11
516 0.14
517 0.17
518 0.22
519 0.25
520 0.27
521 0.3
522 0.31
523 0.35
524 0.41
525 0.41
526 0.38
527 0.41
528 0.45
529 0.52
530 0.53
531 0.49
532 0.44
533 0.46
534 0.43
535 0.47
536 0.41
537 0.38
538 0.37
539 0.36
540 0.32
541 0.29
542 0.27
543 0.17
544 0.16
545 0.1
546 0.1
547 0.08
548 0.08
549 0.07
550 0.06
551 0.05
552 0.06
553 0.07
554 0.07
555 0.07
556 0.07
557 0.07
558 0.1
559 0.12
560 0.14
561 0.16
562 0.16
563 0.22
564 0.29
565 0.36
566 0.41
567 0.42
568 0.41
569 0.43
570 0.46
571 0.41
572 0.36
573 0.3
574 0.24
575 0.24
576 0.22
577 0.17
578 0.13
579 0.13
580 0.1
581 0.09
582 0.08
583 0.05
584 0.04
585 0.04
586 0.03
587 0.03
588 0.03
589 0.03
590 0.04
591 0.04
592 0.05
593 0.05
594 0.05
595 0.06
596 0.08
597 0.12
598 0.13
599 0.16
600 0.16
601 0.17
602 0.17
603 0.18
604 0.19
605 0.16
606 0.19
607 0.16
608 0.17
609 0.16
610 0.16
611 0.15
612 0.12
613 0.11
614 0.06
615 0.05
616 0.04
617 0.05
618 0.06
619 0.05
620 0.05
621 0.07
622 0.07
623 0.07
624 0.08
625 0.1
626 0.12
627 0.17
628 0.18
629 0.16
630 0.18
631 0.18
632 0.18
633 0.16
634 0.13
635 0.09
636 0.11
637 0.11
638 0.09
639 0.08
640 0.08
641 0.08
642 0.07
643 0.06
644 0.04
645 0.04
646 0.05
647 0.05
648 0.05
649 0.05
650 0.05
651 0.05
652 0.08
653 0.11
654 0.14
655 0.17
656 0.22
657 0.3
658 0.36
659 0.41
660 0.45
661 0.43
662 0.43
663 0.45
664 0.39
665 0.32
666 0.26
667 0.22
668 0.17
669 0.16
670 0.14
671 0.09
672 0.14
673 0.14
674 0.14
675 0.14
676 0.14
677 0.14
678 0.12
679 0.12
680 0.07
681 0.07
682 0.06
683 0.05
684 0.04
685 0.04
686 0.04
687 0.04
688 0.04
689 0.04
690 0.04
691 0.04
692 0.07
693 0.08
694 0.09
695 0.12
696 0.15
697 0.15
698 0.17
699 0.17
700 0.15
701 0.17
702 0.15
703 0.13
704 0.11
705 0.11
706 0.09
707 0.08
708 0.08
709 0.08
710 0.08
711 0.08
712 0.07
713 0.08
714 0.09
715 0.12
716 0.12
717 0.12
718 0.12
719 0.11
720 0.13
721 0.12
722 0.11
723 0.08
724 0.07
725 0.08
726 0.08
727 0.08
728 0.06
729 0.06
730 0.06
731 0.06
732 0.05
733 0.05
734 0.05
735 0.05
736 0.09
737 0.11
738 0.11
739 0.12
740 0.13
741 0.11
742 0.12
743 0.12
744 0.12
745 0.11
746 0.1
747 0.09
748 0.13
749 0.14
750 0.14
751 0.14
752 0.11
753 0.11
754 0.11
755 0.1
756 0.06
757 0.06
758 0.07
759 0.07
760 0.07
761 0.08
762 0.09
763 0.14
764 0.14
765 0.13
766 0.13
767 0.14
768 0.21
769 0.24
770 0.29
771 0.26
772 0.27
773 0.27
774 0.3
775 0.3
776 0.25
777 0.31
778 0.31
779 0.32
780 0.33
781 0.33
782 0.29
783 0.33
784 0.33
785 0.26
786 0.22
787 0.21
788 0.2
789 0.21
790 0.21
791 0.17
792 0.15
793 0.14
794 0.13
795 0.13
796 0.17
797 0.2
798 0.25
799 0.29
800 0.32
801 0.36
802 0.37
803 0.37
804 0.35
805 0.35
806 0.32
807 0.28
808 0.27
809 0.22
810 0.21
811 0.2
812 0.2
813 0.18
814 0.15
815 0.15
816 0.14
817 0.17
818 0.21
819 0.24
820 0.21
821 0.21
822 0.22
823 0.2
824 0.19
825 0.16
826 0.13
827 0.1
828 0.1
829 0.11
830 0.11
831 0.14
832 0.15
833 0.15
834 0.14
835 0.14
836 0.14
837 0.13
838 0.12
839 0.09
840 0.08
841 0.08
842 0.07
843 0.06
844 0.06
845 0.06
846 0.06
847 0.08
848 0.08
849 0.12
850 0.18
851 0.2
852 0.22
853 0.25
854 0.3
855 0.32
856 0.36
857 0.33
858 0.34
859 0.37
860 0.34
861 0.34
862 0.29
863 0.26
864 0.22
865 0.2
866 0.16
867 0.12
868 0.13
869 0.11
870 0.14
871 0.19
872 0.24
873 0.26
874 0.3
875 0.31
876 0.34
877 0.36
878 0.34
879 0.35
880 0.39
881 0.43
882 0.42
883 0.44
884 0.4
885 0.38
886 0.43
887 0.42
888 0.33
889 0.28
890 0.26
891 0.28
892 0.3
893 0.32
894 0.31
895 0.32
896 0.39
897 0.45
898 0.47
899 0.44
900 0.44
901 0.44
902 0.46
903 0.46
904 0.4
905 0.39
906 0.36
907 0.4
908 0.42
909 0.47
910 0.46
911 0.45
912 0.51
913 0.47
914 0.49
915 0.45
916 0.45
917 0.39
918 0.39
919 0.34
920 0.27
921 0.25
922 0.19
923 0.17
924 0.14
925 0.12
926 0.06
927 0.07
928 0.06
929 0.07
930 0.07
931 0.07
932 0.12
933 0.13
934 0.16
935 0.18
936 0.19
937 0.19
938 0.26
939 0.29
940 0.26
941 0.27
942 0.29
943 0.28
944 0.28
945 0.3
946 0.26
947 0.24
948 0.23
949 0.24
950 0.21
951 0.21
952 0.2
953 0.19
954 0.17
955 0.21
956 0.21
957 0.2
958 0.23
959 0.21
960 0.22
961 0.22
962 0.21
963 0.2
964 0.21
965 0.24
966 0.2
967 0.2
968 0.18
969 0.18
970 0.18
971 0.17
972 0.16
973 0.14
974 0.15
975 0.19
976 0.19
977 0.2
978 0.24
979 0.26
980 0.26
981 0.25
982 0.23
983 0.21
984 0.22
985 0.26
986 0.25
987 0.27
988 0.25
989 0.25
990 0.28
991 0.26
992 0.29
993 0.27
994 0.25
995 0.27
996 0.3
997 0.33
998 0.37
999 0.41
1000 0.4
1001 0.46
1002 0.5
1003 0.51
1004 0.58
1005 0.57
1006 0.55
1007 0.53
1008 0.51
1009 0.43
1010 0.41
1011 0.37
1012 0.28
1013 0.28
1014 0.24
1015 0.22
1016 0.21
1017 0.22
1018 0.2
1019 0.18
1020 0.17
1021 0.15
1022 0.14
1023 0.15
1024 0.15
1025 0.16
1026 0.15
1027 0.14
1028 0.16
1029 0.13
1030 0.14
1031 0.14
1032 0.14
1033 0.12
1034 0.11
1035 0.1
1036 0.11
1037 0.17
1038 0.18
1039 0.19
1040 0.21
1041 0.24
1042 0.27
1043 0.32
1044 0.33
1045 0.28
1046 0.33
1047 0.33
1048 0.37
1049 0.4
1050 0.36
1051 0.36
1052 0.32
1053 0.33
1054 0.27
1055 0.28
1056 0.22
1057 0.18
1058 0.17
1059 0.12
1060 0.12
1061 0.09
1062 0.08
1063 0.06
1064 0.04
1065 0.05
1066 0.06
1067 0.06
1068 0.09
1069 0.09
1070 0.1
1071 0.14
1072 0.16
1073 0.23
1074 0.28
1075 0.31
1076 0.29
1077 0.33
1078 0.39
1079 0.38
1080 0.42
1081 0.42
1082 0.45
1083 0.51
1084 0.52
1085 0.55
1086 0.5
1087 0.5
1088 0.46
1089 0.44
1090 0.46
1091 0.44
1092 0.47
1093 0.46
1094 0.49
1095 0.46
1096 0.45
1097 0.4
1098 0.32
1099 0.3
1100 0.31
1101 0.26
1102 0.24
1103 0.24
1104 0.23
1105 0.25
1106 0.23
1107 0.19
1108 0.14
1109 0.12
1110 0.11
1111 0.11
1112 0.13
1113 0.13
1114 0.13
1115 0.12
1116 0.13
1117 0.19
1118 0.21
1119 0.22